73 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sputcn32_3388 on replicon NC_009438
Organism: Shewanella putrefaciens CN-32



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009438  Sputcn32_3388  hypothetical protein  100 
 
 		 116 aa  239  9e-63  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1158  hypothetical protein  74.14 
 
 		 114 aa  179  1e-44  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2786  hypothetical protein  68.97 
 
 		 113 aa  170  5.999999999999999e-42  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.12053 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3182  hypothetical protein  63.33 
 
 		 118 aa  157  6e-38  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3693  hypothetical protein  64.17 
 
 		 118 aa  153  9e-37  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.799168  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3617  hypothetical protein  55.17 
 
 		 137 aa  99  2e-20  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3683  hypothetical protein  55.17 
 
 		 137 aa  97.1  7e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0942  hypothetical protein  48.35 
 
 		 172 aa  85.1  3e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1004  hypothetical protein  47.37 
 
 		 165 aa  84.3  4e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0887  hypothetical protein  40.37 
 
 		 136 aa  71.6  0.000000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.590211  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3535  tetraheme cytochrome c  36.04 
 
 		 119 aa  67.8  0.00000000005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1491  tetraheme cytochrome c  33.62 
 
 		 127 aa  62.8  0.000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2229  tetraheme cytochrome c  36.61 
 
 		 117 aa  62  0.000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.257402 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2152  tetraheme cytochrome c  36.61 
 
 		 117 aa  61.2  0.000000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.738839  normal  0.0741814 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1860  hypothetical protein  36 
 
 		 221 aa  61.6  0.000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1781  hypothetical protein  36 
 
 		 221 aa  61.2  0.000000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.531778  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2097  hypothetical protein  38.61 
 
 		 150 aa  59.7  0.00000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.206741  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3056  tetraheme cytochrome c  32.2 
 
 		 127 aa  60.1  0.00000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0276  tetraheme cytochrome c  35.71 
 
 		 117 aa  58.9  0.00000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000156346 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3597  flavocytochrome c  37.93 
 
 		 591 aa  57  0.00000009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3112  flavocytochrome c  31.67 
 
 		 596 aa  56.2  0.0000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000541974 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3938  tetraheme cytochrome c  33.93 
 
 		 117 aa  56.6  0.0000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0274  tetraheme cytochrome c  31.53 
 
 		 117 aa  56.2  0.0000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00010475 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3769  hypothetical protein  36.71 
 
 		 155 aa  56.6  0.0000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3690  flavocytochrome c  33.33 
 
 		 583 aa  55.5  0.0000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0611  fumarate reductase flavoprotein subunit precursor  31.62 
 
 		 593 aa  54.7  0.0000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.755689 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0137  fumarate reductase flavoprotein subunit  33.04 
 
 		 130 aa  54.3  0.0000006  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.100425  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3896  tetraheme cytochrome c  38.67 
 
 		 117 aa  54.3  0.0000006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.486536  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3776  flavocytochrome c  34.48 
 
 		 596 aa  53.9  0.0000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00235124 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3877  succinate dehydrogenase  32.79 
 
 		 596 aa  53.9  0.0000007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00000270258  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0509  tetraheme cytochrome c  35.29 
 
 		 118 aa  53.5  0.0000009  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1445  flavocytochrome c heme subunit  33.7 
 
 		 153 aa  53.5  0.0000009  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.390446  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3628  flavocytochrome c  33.61 
 
 		 596 aa  53.1  0.000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3505  flavocytochrome c  33.61 
 
 		 596 aa  53.1  0.000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0342  tetraheme cytochrome c  38.27 
 
 		 126 aa  53.5  0.000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0722  flavocytochrome c  34.65 
 
 		 596 aa  52.8  0.000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0905  flavocytochrome c  32.2 
 
 		 597 aa  53.1  0.000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.604755  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0859  flavocytochrome c  33.61 
 
 		 596 aa  53.1  0.000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0255  tetraheme cytochrome c  40 
 
 		 101 aa  53.1  0.000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3318  flavocytochrome c  32.2 
 
 		 596 aa  53.1  0.000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.5959  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3433  flavocytochrome c  33.61 
 
 		 596 aa  53.1  0.000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3215  flavocytochrome c  34.45 
 
 		 596 aa  53.5  0.000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.57421 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0808  flavocytochrome c  34.45 
 
 		 596 aa  53.1  0.000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.587828  normal  0.0624147 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0257  tetraheme cytochrome c  38.67 
 
 		 117 aa  52  0.000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0970  fumarate reductase flavoprotein subunit precursor  32.2 
 
 		 596 aa  51.6  0.000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3370  tetraheme cytochrome c  32.74 
 
 		 126 aa  52  0.000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.656549  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2085  flavocytochrome c heme subunit  35.42 
 
 		 146 aa  52  0.000003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.952774  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2279  tetraheme cytochrome c  37.04 
 
 		 126 aa  51.6  0.000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0855381  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2430  tetraheme cytochrome c  35.8 
 
 		 135 aa  50.8  0.000007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.439789  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4179  tetraheme cytochrome c  30 
 
 		 120 aa  50.4  0.000008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.717177 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3541  flavocytochrome c  34.34 
 
 		 589 aa  50.1  0.00001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000144139  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1444  fumarate reductase flavoprotein subunit precursor  34.29 
 
 		 114 aa  48.9  0.00002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000626372 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2510  tetraheme cytochrome c  25.21 
 
 		 122 aa  48.5  0.00003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3623  tetraheme cytochrome c  31.62 
 
 		 116 aa  47.8  0.00005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4188  chaperone protein HtpG  31.4 
 
 		 218 aa  47.8  0.00005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2535  tetraheme cytochrome c, putative  26.5 
 
 		 122 aa  47.4  0.00006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.091656  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4185  tetraheme cytochrome c, putative  30.67 
 
 		 122 aa  47.4  0.00007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.17754 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2402  tetraheme cytochrome c, putative  26.02 
 
 		 122 aa  47  0.00008  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0946  fumarate reductase flavoprotein subunit precursor  31.36 
 
 		 122 aa  46.6  0.0001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3625  flavocytochrome c  35.05 
 
 		 596 aa  45.4  0.0003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2540  hypothetical protein  32.5 
 
 		 194 aa  44.7  0.0004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1575  cytochrome c family protein  28.95 
 
 		 479 aa  44.7  0.0004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1413  tetraheme cytochrome c, putative  29.33 
 
 		 123 aa  44.3  0.0006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0275  tetraheme cytochrome c, putative  28 
 
 		 122 aa  42.4  0.002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000173309 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0300  tetraheme cytochrome c, putative  28 
 
 		 123 aa  42.4  0.002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.42786  normal  0.0669072 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1830  flavocytochrome c heme subunit  33.77 
 
 		 144 aa  42.7  0.002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0324  tetraheme cytochrome c, putative  28 
 
 		 122 aa  42.4  0.002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3300  cytochrome c  25.23 
 
 		 126 aa  42.4  0.002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2586  flavocytochrome c  28.32 
 
 		 588 aa  41.6  0.003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.110511  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1988  TPR repeat-containing protein  36.59 
 
 		 764 aa  41.6  0.003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.645033 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0454  cytochrome c family protein  32.14 
 
 		 897 aa  42  0.003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.523502  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04270  hypothetical protein  29.17 
 
 		 182 aa  41.2  0.004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.379993  normal  0.356103 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0339  cytochrome c  26.79 
 
 		 116 aa  40.8  0.007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>