76 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppro_1307 on replicon NC_008609
Organism: Pelobacter propionicus DSM 2379



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008609  Ppro_1307  Allergen V5/Tpx-1 family protein  100 
 
 		 440 aa  904    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000813036  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2157  fibronectin, type III domain-containing protein  65.66 
 
 		 1141 aa  262  6.999999999999999e-69  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.445714  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2061  hypothetical protein  55.12 
 
 		 356 aa  213  4.9999999999999996e-54  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000264827  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1020  copper amine oxidase domain protein  44.85 
 
 		 481 aa  140  3e-32  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.514045  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5158  hypothetical protein  32.72 
 
 		 274 aa  79.7  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000040982 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0372  response regulator receiver protein  33.9 
 
 		 340 aa  65.9  0.000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.463682  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2742  CheC domain protein  31.86 
 
 		 288 aa  63.2  0.000000009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00482165  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0690  hypothetical protein  31.63 
 
 		 241 aa  56.6  0.0000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1554  type II secretion system protein E  48.21 
 
 		 553 aa  55.8  0.000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.185461 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0301  type II secretion system protein E  46.43 
 
 		 554 aa  55.1  0.000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0263  type II secretion system protein E  28.86 
 
 		 891 aa  52.8  0.00001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.198237  normal  0.68743 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2573  hypothetical protein  34.65 
 
 		 249 aa  52.4  0.00001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00254  putative Mannose-sensitive agglutinin (MSHA) biogenesis protein MshE (pilus type IV)  51.85 
 
 		 570 aa  51.6  0.00003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3271  type II secretion system protein E  45 
 
 		 574 aa  49.7  0.0001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0858  Beta-ketoacyl synthase  44.12 
 
 		 2725 aa  49.7  0.0001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2605  hypothetical protein  29.2 
 
 		 218 aa  48.9  0.0002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.103693 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1725  general secretory pathway protein E  44.07 
 
 		 553 aa  48.9  0.0002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0879  type II secretion system protein E  47.17 
 
 		 569 aa  49.3  0.0002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.13472 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0117  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  32.29 
 
 		 571 aa  48.9  0.0002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00247138  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0090  type II secretion system protein E  28.1 
 
 		 567 aa  48.5  0.0002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000779667  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3960  hypothetical protein  30.83 
 
 		 168 aa  48.1  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2969  type II secretory pathway ATPase PulE/Tfp pilus assembly pathway ATPase PilB  36.26 
 
 		 841 aa  48.1  0.0003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.515104  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0934  Allergen V5/Tpx-1 related  27.22 
 
 		 353 aa  48.1  0.0003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.876847  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1606  hypothetical protein  30.7 
 
 		 287 aa  47.8  0.0004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000014118  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002371  MSHA biogenesis protein MshE  42.86 
 
 		 574 aa  47.8  0.0004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.46391  n/a   
 
 
-
 
NC_013930  TK90_2860  type II secretion system protein E  44.44 
 
 		 491 aa  47.4  0.0005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.898794  normal  0.474728 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2562  type II secretion system protein E  47.37 
 
 		 555 aa  47.4  0.0005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1293  Allergen V5/Tpx-1 related  25.6 
 
 		 335 aa  47.4  0.0005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.224237  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3765  type II secretion system protein E  50 
 
 		 577 aa  47.4  0.0005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.238087  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2414  type II secretion system protein E  41.07 
 
 		 564 aa  47  0.0006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1124  general secretion pathway protein E  41.38 
 
 		 1017 aa  47  0.0006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.553401 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3748  type II secretion system protein E  51.85 
 
 		 586 aa  47.4  0.0006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.307926  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1168  type II secretion system protein E  51.11 
 
 		 561 aa  47  0.0006  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1345  ATPases involved in pili biogenesis, PilB-like  43.75 
 
 		 563 aa  47.4  0.0006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.931675  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3397  hypothetical protein  45.07 
 
 		 226 aa  47  0.0007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4160  general secretory pathway protein E  42.42 
 
 		 578 aa  46.6  0.0008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00895585 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0688  general secretory pathway protein E  42.86 
 
 		 578 aa  46.2  0.001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0831226 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1154  AAA ATPase  49.02 
 
 		 480 aa  46.2  0.001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4414  type II secretion system protein E  50 
 
 		 585 aa  45.8  0.001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0327101  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0173  type II secretion system protein E  49.06 
 
 		 637 aa  45.8  0.001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2922  hypothetical protein  34.06 
 
 		 265 aa  46.6  0.001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0126105  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0392  type II secretion system protein E  48.15 
 
 		 586 aa  46.2  0.001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2149  type II secretory pathway, ATPase PulE/Tfp pilus assembly pathway, ATPase PilB  31.68 
 
 		 566 aa  46.6  0.001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.365322  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1884  type II secretion system protein E  37.93 
 
 		 570 aa  45.4  0.002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.000000626903  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3127  response regulator receiver protein  34.41 
 
 		 283 aa  45.1  0.002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1996  type II secretion system protein E  41.51 
 
 		 567 aa  45.8  0.002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0594  type II secretion system protein E  26.6 
 
 		 888 aa  45.8  0.002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0229677 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16020  hypothetical protein  35.79 
 
 		 228 aa  45.4  0.002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0394744  normal  0.745254 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0111  general secretory system II, protein E-like  57.14 
 
 		 370 aa  45.4  0.002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00145913  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0090  type II secretion system protein E  36.62 
 
 		 566 aa  45.1  0.002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1322  type II secretion system protein E  45.28 
 
 		 553 aa  45.1  0.003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0787535 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4573  MSHA biogenesis protein MshE  46.3 
 
 		 570 aa  44.7  0.003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4274  General secretory system II protein E domain protein  42.59 
 
 		 479 aa  44.3  0.004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.532323  normal  0.0350224 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2722  hypothetical protein  23.81 
 
 		 398 aa  44.7  0.004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.266732  n/a   
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4206  type II secretion system protein E  30.43 
 
 		 621 aa  44.3  0.004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1041  type II secretion system protein E  39.13 
 
 		 547 aa  44.3  0.004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05970  Tfp pilus assembly protein PilB  45.28 
 
 		 558 aa  44.3  0.005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0873  general secretory pathway protein E  40 
 
 		 871 aa  44.3  0.005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0162  General secretory system II protein E domain protein  54.76 
 
 		 387 aa  43.9  0.005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.049981 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1135  response regulator receiver protein  34.41 
 
 		 283 aa  44.3  0.005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0387  hypothetical protein  35.48 
 
 		 371 aa  43.9  0.006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.527792  hitchhiker  0.000473152 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0180  General secretory system II protein E domain protein  54.76 
 
 		 391 aa  43.9  0.006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2985  hypothetical protein  31.88 
 
 		 249 aa  43.5  0.007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0275079  hitchhiker  0.000737309 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0949  type II secretion system protein E  29.25 
 
 		 885 aa  43.5  0.007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.14742  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0314  general secretion pathway protein E  48.84 
 
 		 367 aa  43.5  0.008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1491  type IV pilus biogenesis protein PilB  46.3 
 
 		 568 aa  43.5  0.008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.10563  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0861  type II secretion system protein E  28.12 
 
 		 642 aa  43.5  0.008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2823  MSHA biogenesis protein MshE  40.35 
 
 		 575 aa  43.1  0.009  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1276  type II secretion system protein E  43.48 
 
 		 563 aa  43.1  0.009  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03695  hypothetical protein  39.29 
 
 		 574 aa  43.5  0.009  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1281  hypothetical protein  31.62 
 
 		 230 aa  43.1  0.01  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.582719 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3618  bacteriophage N4 adsorption protein B  31.13 
 
 		 703 aa  43.1  0.01  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1966  type II secretion system protein E  42.31 
 
 		 642 aa  43.1  0.01  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.56575  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3928  General secretory system II protein E domain protein  45.83 
 
 		 345 aa  43.1  0.01  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00083498  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3097  type II secretion system protein E  44.26 
 
 		 578 aa  43.1  0.01  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4695  bacteriophage N4 adsorption protein B  31.13 
 
 		 703 aa  43.1  0.01  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0225348  normal  0.13115 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>