185 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppro_0992 on replicon NC_008609
Organism: Pelobacter propionicus DSM 2379



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008609  Ppro_0992  type IV pilus assembly protein PilM  100 
 
 		 351 aa  712    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1640  type IV pilus assembly protein PilM  69.14 
 
 		 352 aa  497  1e-139  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1810  type IV pilus assembly protein PilM  66.29 
 
 		 350 aa  484  1e-136  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2032  type IV pilus biogenesis protein PilM  64.57 
 
 		 351 aa  484  1e-135  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1546  type IV pilus assembly protein PilM  65.14 
 
 		 350 aa  478  1e-134  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0971  Type IV pilus assembly protein PilM  63.71 
 
 		 351 aa  479  1e-134  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2669  type IV pilus assembly protein PilM  65.14 
 
 		 350 aa  479  1e-134  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000583624 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0675  type IV pilus assembly protein PilM  52.29 
 
 		 352 aa  375  1e-103  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0675  type IV pilus assembly protein PilM  52.29 
 
 		 352 aa  376  1e-103  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0641  type IV pilus assembly protein PilM  52.57 
 
 		 352 aa  362  8e-99  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0686  type IV pilus assembly protein PilM  52.42 
 
 		 351 aa  357  9.999999999999999e-98  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2138  Tfp pilus assembly protein, ATPase PilM  45.3 
 
 		 354 aa  335  5.999999999999999e-91  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000719379  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0248  type IV pilus assembly protein PilM  41.95 
 
 		 348 aa  279  5e-74  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0333  type IV pilus assembly protein PilM  39.2 
 
 		 351 aa  261  1e-68  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.872889  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1469  type IV pilus assembly protein PilM  40.34 
 
 		 350 aa  257  3e-67  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.11937  normal  0.330674 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0537  type IV pilus assembly protein PilM  39.49 
 
 		 350 aa  243  3e-63  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.539462  normal  0.619899 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0325  type 4 fimbrial biogenesis protein PilM  32.39 
 
 		 380 aa  207  3e-52  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0834  type IV pilus assembly protein PilM  33.24 
 
 		 358 aa  196  5.000000000000001e-49  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0202  Type IV pilus assembly protein PilM  32.27 
 
 		 362 aa  191  2e-47  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.466889 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0210  Type IV pilus assembly protein PilM  33.24 
 
 		 361 aa  189  5e-47  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.150692  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0826  type IV pilus assembly protein PilM  30.84 
 
 		 354 aa  184  2.0000000000000003e-45  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.491116  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1984  type IV pilus assembly protein PilM  32.76 
 
 		 350 aa  184  2.0000000000000003e-45  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0434865  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3023  type IV pilus assembly protein PilM  30.4 
 
 		 353 aa  184  3e-45  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2203  type IV pilus assembly protein PilM  35.38 
 
 		 325 aa  184  3e-45  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2755  type IV pilus assembly protein PilM  29.49 
 
 		 355 aa  181  2e-44  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0335  type IV pilus assembly protein PilM  31.14 
 
 		 359 aa  179  5.999999999999999e-44  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2691  response regulator receiver domain-containing protein  30.66 
 
 		 355 aa  178  1e-43  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000000540139  hitchhiker  0.00311169 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3703  type IV pilus assembly protein PilM  32.01 
 
 		 359 aa  178  1e-43  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.288222  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0242  type IV pilus assembly protein PilM  32.01 
 
 		 359 aa  178  1e-43  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.662587  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3899  type IV pilus assembly protein PilM  32.01 
 
 		 359 aa  178  1e-43  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00788991  normal  0.338087 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0247  Type IV pilus assembly protein PilM  30.09 
 
 		 372 aa  178  2e-43  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.291692  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0281  type IV pilus biogenesis protein PilM  31.73 
 
 		 359 aa  176  4e-43  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0233  type IV pilus assembly protein PilM  31.71 
 
 		 359 aa  176  5e-43  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4089  type IV pilus assembly protein PilM  31.16 
 
 		 359 aa  175  9e-43  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4207  type IV pilus assembly protein PilM  31.16 
 
 		 359 aa  175  9e-43  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2461  type IV pilus assembly protein PilM  31.93 
 
 		 356 aa  175  9.999999999999999e-43  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0275  type IV pilus assembly protein PilM  28.25 
 
 		 355 aa  174  2.9999999999999996e-42  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.309267 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4008  type IV pilus assembly protein PilM  30.88 
 
 		 359 aa  173  5e-42  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4270  type IV pilus assembly protein PilM  30.57 
 
 		 359 aa  172  9e-42  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.482312 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5581  type IV pilus assembly protein PilM  31.53 
 
 		 359 aa  172  9e-42  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.940333 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45300  Type IV pilus assembly protein  31.64 
 
 		 360 aa  171  2e-41  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4118  type IV pilus assembly protein PilM  30.59 
 
 		 359 aa  171  2e-41  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.171759  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3373  type IV pilus biogenesis protein PilM  30.31 
 
 		 359 aa  170  3e-41  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0745498  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3711  type IV pilus assembly protein PilM  31.16 
 
 		 359 aa  169  6e-41  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.480813  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1883  type IV pilus assembly protein  32.47 
 
 		 351 aa  169  8e-41  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.685272  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2173  type IV pilus assembly protein PilM  32.47 
 
 		 351 aa  169  8e-41  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.227783  normal  0.447657 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3240  type IV pilus assembly protein PilM  30.52 
 
 		 352 aa  167  2e-40  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0730  type IV pilus assembly protein PilM  32.1 
 
 		 356 aa  167  2e-40  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0208  type IV pilus assembly protein PilM  31.71 
 
 		 359 aa  167  2e-40  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00996609 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0370  type IV pilus assembly protein PilM  30 
 
 		 359 aa  167  2.9999999999999998e-40  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.519151  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0699  type IV pilus assembly protein PilM  31.82 
 
 		 356 aa  166  5.9999999999999996e-40  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1140  type IV pilus assembly protein PilM  30.4 
 
 		 359 aa  164  2.0000000000000002e-39  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.267286  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0996  type IV pilus assembly protein PilM  30.97 
 
 		 359 aa  164  2.0000000000000002e-39  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0256  type IV pilus assembly protein PilM  30.03 
 
 		 359 aa  164  3e-39  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0022  type IV pilus assembly protein PilM  31.82 
 
 		 359 aa  162  1e-38  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.738489 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2739  type IV pilus assembly protein PilM  29.32 
 
 		 378 aa  160  3e-38  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0739  type IV pilus assembly protein PilM  29.48 
 
 		 354 aa  159  7e-38  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.506498  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0781  type IV pilus assembly protein PilM  30.4 
 
 		 359 aa  158  1e-37  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.377138  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1313  type IV pilus assembly protein PilM  29.65 
 
 		 354 aa  158  1e-37  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.269732  decreased coverage  0.00550758 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1336  type IV pilus assembly protein PilM  29.08 
 
 		 379 aa  157  2e-37  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.384487  normal  0.906324 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66660  type 4 fimbrial biogenesis protein PilM  29.75 
 
 		 354 aa  157  2e-37  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.753266  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0158  type IV pilus assembly protein PilM  30.03 
 
 		 354 aa  157  3e-37  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1789  type IV pilus assembly protein PilM  29.34 
 
 		 352 aa  157  3e-37  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.739852  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1860  fimbrial assembly membrane protein  29.34 
 
 		 352 aa  157  4e-37  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.151761  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5781  type 4 fimbrial biogenesis protein PilM  29.14 
 
 		 362 aa  157  4e-37  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2919  type IV pilus assembly protein PilM  30.23 
 
 		 345 aa  156  6e-37  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.813091  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1725  type IV pilus assembly protein PilM  28.31 
 
 		 392 aa  155  7e-37  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.0148781 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0608  type IV pilus assembly protein PilM  30.03 
 
 		 356 aa  155  1e-36  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.159327  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0542  type IV pilus assembly protein PilM  29.43 
 
 		 354 aa  155  1e-36  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3113  fimbrial assembly protein  30.4 
 
 		 358 aa  153  2.9999999999999998e-36  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.401806 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06050  Tfp pilus assembly protein, ATPase PilM  29.09 
 
 		 352 aa  154  2.9999999999999998e-36  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00515  putative Type IV pilus biogenesis protein PilM  30.11 
 
 		 355 aa  153  5e-36  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0672  type IV pilus assembly protein PilM  29.83 
 
 		 359 aa  151  1e-35  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0670531 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3019  type IV pilus assembly protein PilM  29.36 
 
 		 348 aa  151  1e-35  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.24952 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0403  Type IV pilus assembly protein PilM  28.57 
 
 		 354 aa  151  2e-35  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0405  Type IV pilus assembly protein PilM  28.86 
 
 		 354 aa  151  2e-35  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000417469  normal  0.357527 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0467  type IV pilus biogenesis protein PilM  28.57 
 
 		 359 aa  150  3e-35  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.183586  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3407  type IV pilus assembly protein PilM  31.23 
 
 		 352 aa  150  4e-35  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0209183 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0989  Tfp pilus assembly protein, ATPase PilM  27.84 
 
 		 354 aa  147  2.0000000000000003e-34  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0958  Tfp pilus assembly protein, ATPase PilM  27.84 
 
 		 354 aa  147  2.0000000000000003e-34  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5132  type IV pilus biogenesis protein PilM  28.57 
 
 		 354 aa  147  3e-34  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.569259  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1937  type IV pilus assembly protein PilM  29.32 
 
 		 365 aa  144  3e-33  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2100  type IV pilus assembly protein PilM  29.89 
 
 		 347 aa  140  3.9999999999999997e-32  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1718  type IV pilus assembly protein PilM  27.87 
 
 		 334 aa  139  6e-32  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17820  type IV pilus assembly protein PilM  28.08 
 
 		 353 aa  134  3e-30  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.61643 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02355  fimbrial assembly membrane protein  30.32 
 
 		 318 aa  133  5e-30  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.813602  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0975  type IV pilus assembly protein PilM  25.71 
 
 		 374 aa  124  3e-27  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1762  type IV pilus assembly protein PilM  26.17 
 
 		 362 aa  123  4e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.35494  normal  0.818253 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2453  type IV pilus assembly protein PilM  25.68 
 
 		 359 aa  121  1.9999999999999998e-26  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.237184  hitchhiker  0.0000000165118 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0671  type IV pilus assembly protein PilM  25 
 
 		 376 aa  121  1.9999999999999998e-26  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1465  type IV pilus assembly protein PilM  23.82 
 
 		 379 aa  120  3.9999999999999996e-26  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00540652  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1029  type IV pilus assembly protein PilM  25.8 
 
 		 343 aa  119  7e-26  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0322  type IV pilus assembly protein PilM  25.56 
 
 		 374 aa  117  3e-25  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4212  type IV pilus assembly protein PilM  26.65 
 
 		 369 aa  116  5e-25  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.175207  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4173  type IV pilus assembly protein PilM  26.65 
 
 		 369 aa  116  5e-25  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3686  Type IV pilus assembly protein PilM  25.2 
 
 		 369 aa  114  4.0000000000000004e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1514  Tfp pilus assembly protein ATPase PilM-like protein  28.76 
 
 		 319 aa  112  8.000000000000001e-24  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.87892  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1037  type IV pilus assembly protein PilM  22.66 
 
 		 348 aa  111  2.0000000000000002e-23  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0998  type IV pilus assembly protein PilM  25.48 
 
 		 361 aa  110  4.0000000000000004e-23  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1830  type IV pilus assembly protein PilM  25.21 
 
 		 354 aa  110  4.0000000000000004e-23  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0258246  normal  0.367696 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>