68 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppro_0661 on replicon NC_008609
Organism: Pelobacter propionicus DSM 2379



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008609  Ppro_0661  transport-associated  100 
 
 		 275 aa  566  1e-160  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1325  transport-associated protein  65.09 
 
 		 275 aa  362  3e-99  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0768925  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2809  transport-associated protein  57.88 
 
 		 273 aa  326  2.0000000000000001e-88  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00612028  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1979  transport-associated protein  57.88 
 
 		 273 aa  324  9e-88  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000154767  normal  0.0601452 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1925  transport-associated domain-containing protein  59.19 
 
 		 273 aa  322  4e-87  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.237586  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2312  transport-associated  56.04 
 
 		 271 aa  311  7.999999999999999e-84  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.0000000102264  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1911  transport-associated protein  55.68 
 
 		 271 aa  306  2.0000000000000002e-82  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.551319 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4490  transport-associated  28.52 
 
 		 278 aa  97.1  3e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.947907  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0569  cytidylate kinase  27.27 
 
 		 204 aa  90.5  2e-17  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0009  hypothetical protein  26.1 
 
 		 273 aa  86.7  4e-16  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1509  response regulator receiver protein  27.48 
 
 		 278 aa  86.7  4e-16  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00063151  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2398  response regulator receiver protein  27.14 
 
 		 271 aa  81.3  0.00000000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2798  transport-associated  26.02 
 
 		 277 aa  80.1  0.00000000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.549341  normal  0.297998 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2114  hypothetical protein  26.98 
 
 		 202 aa  76.3  0.0000000000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000150815  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3706  hypothetical protein  24.29 
 
 		 204 aa  75.1  0.000000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0901  putative cytidylate kinase, putative  26.09 
 
 		 214 aa  74.3  0.000000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00118892  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3716  hypothetical protein  26.84 
 
 		 238 aa  72.4  0.000000000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3811  hypothetical protein  26.84 
 
 		 238 aa  72  0.00000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0658  putative cytidylate kinase  24.88 
 
 		 207 aa  68.9  0.00000000008  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0106  cytidylate kinase  27.27 
 
 		 201 aa  65.5  0.0000000008  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3531  hypothetical protein  23.2 
 
 		 209 aa  65.5  0.0000000008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0110536  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3455  hypothetical protein  28.27 
 
 		 231 aa  63.5  0.000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0288  hypothetical protein  26.42 
 
 		 252 aa  62.8  0.000000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.511661  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2397  hypothetical protein  23.61 
 
 		 270 aa  62  0.00000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1652  hypothetical protein  27.13 
 
 		 229 aa  60.8  0.00000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000202399  normal  0.336802 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_20820  predicted membrane protein  27.53 
 
 		 428 aa  60.1  0.00000004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.716498  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1486  hypothetical protein  24.1 
 
 		 234 aa  58.9  0.00000009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1793  hypothetical protein  22.89 
 
 		 236 aa  56.6  0.0000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.00000475363  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1957  membrane protein-like protein  25 
 
 		 473 aa  56.2  0.0000005  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.217761  hitchhiker  0.00755155 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2332  hypothetical protein  23.28 
 
 		 245 aa  55.1  0.000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.38203  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0672  hypothetical protein  23.96 
 
 		 236 aa  54.3  0.000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0471907  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3903  hypothetical protein  24.5 
 
 		 210 aa  53.9  0.000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00027123  normal  0.0133719 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2646  hypothetical protein  25.82 
 
 		 229 aa  52.8  0.000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0168  putative hypoxanthine phosphoribosyl transferase with additional GAF motif  20.3 
 
 		 310 aa  52.4  0.000009  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0365  hypothetical protein  24.66 
 
 		 242 aa  49.7  0.00005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0656462  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1109  cytidylate kinase  28.25 
 
 		 184 aa  48.9  0.00008  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0377  hypothetical protein  22.28 
 
 		 234 aa  48.9  0.00008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0626  cytidylate kinase  29.1 
 
 		 187 aa  48.9  0.00009  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1226  transport-associated protein  33.03 
 
 		 217 aa  48.5  0.0001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.528686  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1734  cytidylate kinase  25.51 
 
 		 192 aa  48.5  0.0001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.165208 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1813  cytidylate kinase  25.91 
 
 		 192 aa  48.1  0.0002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.147241  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2321  cytidylate kinase  24.37 
 
 		 192 aa  47.8  0.0002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2047  transport-associated protein  32.35 
 
 		 104 aa  47  0.0003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.186123  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43670  Transport-associated protein  32.71 
 
 		 120 aa  47  0.0003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.226738  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2837  hypothetical protein  24.48 
 
 		 236 aa  46.6  0.0004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000106697  hitchhiker  2.88656e-20 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1653  hypothetical protein  24.06 
 
 		 229 aa  46.2  0.0005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  unclonable  0.000000000117481  normal  0.338305 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0357  hypothetical protein  21.76 
 
 		 234 aa  46.2  0.0005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000646753 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2048  transport-associated  28.57 
 
 		 104 aa  45.1  0.001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2319  phospholipid-binding domain-containing protein  28.57 
 
 		 104 aa  45.1  0.001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0654  response regulator receiver protein  23.51 
 
 		 413 aa  45.1  0.001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.113697  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0922  hypothetical protein  24.27 
 
 		 209 aa  45.4  0.001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.681802  normal  0.791137 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1939  phospholipid-binding domain-containing protein  28.57 
 
 		 104 aa  45.1  0.001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.315443  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1193  transport-associated protein  36.17 
 
 		 199 aa  44.3  0.002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5083  transport-associated protein  33.82 
 
 		 151 aa  44.7  0.002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1485  hypothetical protein  22.4 
 
 		 234 aa  44.3  0.002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.520074  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0063  transport-associated  35.62 
 
 		 110 aa  44.7  0.002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.37402  normal  0.306207 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0073  transport-associated  23.08 
 
 		 196 aa  43.9  0.003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA3022  hypothetical protein  23.12 
 
 		 276 aa  43.9  0.003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3585  periplasmic protein  26.47 
 
 		 218 aa  43.9  0.003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2407  transport-associated protein  36.76 
 
 		 104 aa  43.9  0.003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00333473  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1705  hypothetical protein  23.19 
 
 		 209 aa  43.5  0.004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.298807 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4919  periplasmic protein  30.43 
 
 		 201 aa  43.5  0.004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.618733  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0278  periplasmic or secreted lipoprotein  35.29 
 
 		 103 aa  43.1  0.005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.406104  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1671  transport-associated  30.99 
 
 		 105 aa  43.1  0.005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1788  transport-associated  32.84 
 
 		 103 aa  43.1  0.005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0663263  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2542  transport-associated protein  29.58 
 
 		 105 aa  42.7  0.006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000702242 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0010  transport-associated  38.36 
 
 		 101 aa  42.4  0.008  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5303  transport-associated  36.76 
 
 		 112 aa  42.4  0.008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.320232  normal  0.0505821 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>