266 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppha_2788 on replicon NC_011060
Organism: Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011060  Ppha_2788  large-conductance mechanosensitive channel  100 
 
 		 151 aa  301  3.0000000000000004e-81  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.43697  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0025  large-conductance mechanosensitive channel  77.63 
 
 		 155 aa  238  2e-62  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.00280832  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1202  large-conductance mechanosensitive channel  70.2 
 
 		 150 aa  214  4e-55  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00425466  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1107  large-conductance mechanosensitive channel  72.48 
 
 		 161 aa  207  3e-53  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.545228 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1262  large conductance mechanosensitive channel protein  64.43 
 
 		 148 aa  196  1.0000000000000001e-49  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0108  large conductance mechanosensitive channel protein  54.97 
 
 		 156 aa  182  1.0000000000000001e-45  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.0747555 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1671  large conductance mechanosensitive channel protein  59.06 
 
 		 150 aa  181  4.0000000000000006e-45  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0394869  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2606  large conductance mechanosensitive channel protein  56.67 
 
 		 148 aa  179  9.000000000000001e-45  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1168  large conductance mechanosensitive channel, MscL family  55.77 
 
 		 157 aa  178  2e-44  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00000144587  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1197  large-conductance mechanosensitive channel  54.55 
 
 		 154 aa  171  1.9999999999999998e-42  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.932903  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0163  large-conductance mechanosensitive channel  51.32 
 
 		 155 aa  171  1.9999999999999998e-42  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0167  large-conductance mechanosensitive channel  50.66 
 
 		 152 aa  170  5.999999999999999e-42  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2522  large-conductance mechanosensitive channel  51.68 
 
 		 145 aa  169  1e-41  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000515588  normal  0.121482 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2794  large-conductance mechanosensitive channel  52.7 
 
 		 143 aa  166  9e-41  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2860  large conductance mechanosensitive channel protein  51.68 
 
 		 151 aa  158  2e-38  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3260  large conductance mechanosensitive channel protein  51.68 
 
 		 151 aa  158  2e-38  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1689  large conductance mechanosensitive channel protein  55.7 
 
 		 145 aa  158  3e-38  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.606027  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0647  large conductance mechanosensitive channel protein  66.67 
 
 		 139 aa  155  2e-37  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0532  large conductance mechanosensitive channel protein  43.51 
 
 		 154 aa  154  3e-37  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0381  large conductance mechanosensitive channel protein  49.33 
 
 		 144 aa  154  5.0000000000000005e-37  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2389  large-conductance mechanosensitive channel  50 
 
 		 150 aa  152  2e-36  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000367491  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0387  large conductance mechanosensitive channel protein  49.32 
 
 		 144 aa  152  2e-36  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0376217  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0647  large conductance mechanosensitive channel protein  59.83 
 
 		 144 aa  151  4e-36  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.409185  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0172  large conductance mechanosensitive channel protein  52.67 
 
 		 147 aa  149  1e-35  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.505473  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0747  large conductance mechanosensitive channel protein  55.41 
 
 		 146 aa  137  7.999999999999999e-32  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0109  large conductance mechanosensitive channel protein  47.62 
 
 		 153 aa  135  2e-31  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0379  large conductance mechanosensitive channel protein  47.3 
 
 		 142 aa  133  7.000000000000001e-31  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0181396  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0352  large conductance mechanosensitive channel protein  48.78 
 
 		 141 aa  132  9.999999999999999e-31  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.559193  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1750  large conductance mechanosensitive channel protein  50.77 
 
 		 133 aa  132  9.999999999999999e-31  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4276  large-conductance mechanosensitive channel  57.6 
 
 		 148 aa  132  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.348387  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4641  large conductance mechanosensitive channel protein  54.48 
 
 		 148 aa  131  3e-30  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41090  large-conductance mechanosensitive channel  51.37 
 
 		 136 aa  131  3e-30  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.629414  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3793  large-conductance mechanosensitive channel  50.41 
 
 		 137 aa  130  6e-30  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.832034  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4645  large-conductance mechanosensitive channel  56.59 
 
 		 139 aa  129  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.51742 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4639  large-conductance mechanosensitive channel  56.59 
 
 		 139 aa  129  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0312  large-conductance mechanosensitive channel  49.62 
 
 		 134 aa  128  2.0000000000000002e-29  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.929299  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0611  large-conductance mechanosensitive channel  49.62 
 
 		 137 aa  128  3e-29  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0263138  normal  0.217178 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0410  large-conductance mechanosensitive channel  46.1 
 
 		 137 aa  128  3e-29  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1288  large conductance mechanosensitive channel protein  43.05 
 
 		 136 aa  128  3e-29  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3886  large-conductance mechanosensitive channel  49.62 
 
 		 137 aa  128  3e-29  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00283568  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3972  large-conductance mechanosensitive channel  49.59 
 
 		 137 aa  128  3e-29  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0532201  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4515  large-conductance mechanosensitive channel  50.86 
 
 		 138 aa  127  4.0000000000000003e-29  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00658327  hitchhiker  0.00000531483 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4507  large-conductance mechanosensitive channel  55.81 
 
 		 139 aa  127  6e-29  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4887  large-conductance mechanosensitive channel  55.81 
 
 		 154 aa  127  7.000000000000001e-29  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06660  large conductance mechanosensitive channel protein  44.08 
 
 		 146 aa  126  9.000000000000001e-29  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.00600968  normal  0.0734515 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03141  large-conductance mechanosensitive channel  48.44 
 
 		 136 aa  125  3e-28  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0423  large conductance mechanosensitive channel protein  48.44 
 
 		 136 aa  125  3e-28  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3774  large-conductance mechanosensitive channel  48.44 
 
 		 136 aa  125  3e-28  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0382022  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03092  hypothetical protein  48.44 
 
 		 136 aa  125  3e-28  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3586  large-conductance mechanosensitive channel  48.44 
 
 		 136 aa  125  3e-28  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.515412  normal  0.131611 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3677  large-conductance mechanosensitive channel  48.44 
 
 		 136 aa  125  3e-28  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1626  large conductance mechanosensitive channel protein  49.18 
 
 		 134 aa  125  3e-28  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000392194  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1381  large conductance mechanosensitive channel protein  51.64 
 
 		 132 aa  125  3e-28  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0423  large-conductance mechanosensitive channel  48.44 
 
 		 136 aa  125  3e-28  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.465174  hitchhiker  0.0000168159 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4613  large-conductance mechanosensitive channel  48.44 
 
 		 136 aa  125  3e-28  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000924287  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3484  large-conductance mechanosensitive channel  48.44 
 
 		 136 aa  125  3e-28  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.175922  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5255  large-conductance mechanosensitive channel  50.76 
 
 		 137 aa  124  4.0000000000000003e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.861371  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61050  large-conductance mechanosensitive channel  53.66 
 
 		 137 aa  124  4.0000000000000003e-28  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3339  large-conductance mechanosensitive channel  49.62 
 
 		 136 aa  124  4.0000000000000003e-28  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0318  large-conductance mechanosensitive channel  50 
 
 		 138 aa  124  5e-28  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.384644  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0435  large conductance mechanosensitive channel protein  50.86 
 
 		 135 aa  124  6e-28  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3971  large-conductance mechanosensitive channel  47.97 
 
 		 136 aa  123  8.000000000000001e-28  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3845  large-conductance mechanosensitive channel  47.97 
 
 		 136 aa  123  8.000000000000001e-28  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3789  large-conductance mechanosensitive channel  47.97 
 
 		 136 aa  123  8.000000000000001e-28  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0480  large-conductance mechanosensitive channel  47.97 
 
 		 136 aa  123  8.000000000000001e-28  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0334  large-conductance mechanosensitive channel  49.17 
 
 		 138 aa  123  9e-28  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0803754  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6045  large conductance mechanosensitive channel protein  51.52 
 
 		 163 aa  122  1e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3722  large-conductance mechanosensitive channel  45.8 
 
 		 137 aa  122  1e-27  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.459106  hitchhiker  0.00604869 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0522  large-conductance mechanosensitive channel  46.27 
 
 		 136 aa  122  2e-27  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0006  large conductance mechanosensitive channel protein  43.05 
 
 		 138 aa  122  2e-27  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0404291  normal  0.33248 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0521  large-conductance mechanosensitive channel  48.09 
 
 		 136 aa  122  2e-27  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3511  large-conductance mechanosensitive channel  48.09 
 
 		 136 aa  122  2e-27  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0793  large-conductance mechanosensitive channel  56.03 
 
 		 139 aa  121  3e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.312074  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0554  large-conductance mechanosensitive channel  48.85 
 
 		 136 aa  121  3e-27  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000110723  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3196  large-conductance mechanosensitive channel  50.86 
 
 		 134 aa  121  3e-27  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.977942  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0037  large-conductance mechanosensitive channel  48.7 
 
 		 131 aa  121  3e-27  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0520  large-conductance mechanosensitive channel  47.33 
 
 		 136 aa  121  3e-27  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2607  large conductance mechanosensitive channel protein  49.17 
 
 		 142 aa  120  6e-27  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.526175  normal  0.681771 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1285  large-conductance mechanosensitive channel  44.22 
 
 		 131 aa  120  8e-27  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000347005  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3035  large conductance mechanosensitive channel protein  52.17 
 
 		 135 aa  120  9e-27  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2521  large-conductance mechanosensitive channel  47.58 
 
 		 199 aa  119  9.999999999999999e-27  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.334793  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4693  large-conductance mechanosensitive channel  47.48 
 
 		 138 aa  119  9.999999999999999e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0941617 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2579  large conductance mechanosensitive channel protein  45.45 
 
 		 141 aa  119  9.999999999999999e-27  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3512  large conductance mechanosensitive channel protein  44.22 
 
 		 154 aa  119  9.999999999999999e-27  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.178106  normal  0.287508 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2802  large conductance mechanosensitive channel protein  45.45 
 
 		 141 aa  119  9.999999999999999e-27  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.21352  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1501  large-conductance mechanosensitive channel  47.58 
 
 		 143 aa  119  1.9999999999999998e-26  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.917907  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2079  large-conductance mechanosensitive channel  47.58 
 
 		 143 aa  119  1.9999999999999998e-26  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.449669  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2000  large-conductance mechanosensitive channel  47.58 
 
 		 143 aa  119  1.9999999999999998e-26  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3310  large-conductance mechanosensitive channel  47.58 
 
 		 143 aa  119  1.9999999999999998e-26  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.00104042  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2373  large-conductance mechanosensitive channel  47.58 
 
 		 143 aa  119  1.9999999999999998e-26  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.140991  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2415  large-conductance mechanosensitive channel  47.58 
 
 		 143 aa  119  1.9999999999999998e-26  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.258205  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1272  large-conductance mechanosensitive channel  47.58 
 
 		 143 aa  119  1.9999999999999998e-26  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.404097  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0712  large-conductance mechanosensitive channel  52.21 
 
 		 142 aa  118  3e-26  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.268263  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1928  large-conductance mechanosensitive channel  46.92 
 
 		 139 aa  117  3.9999999999999996e-26  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.425698 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2379  large-conductance mechanosensitive channel  46.67 
 
 		 146 aa  117  7e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.567154 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2265  large conductance mechanosensitive channel protein  53.98 
 
 		 145 aa  117  7.999999999999999e-26  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.898824  normal  0.534464 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1256  large conductance mechanosensitive channel protein  49.12 
 
 		 136 aa  116  9.999999999999999e-26  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  decreased coverage  0.00104806  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0437  large-conductance mechanosensitive channel  47.58 
 
 		 133 aa  116  9.999999999999999e-26  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.000628379  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01831  large-conductance mechanosensitive channel  44.44 
 
 		 140 aa  115  1.9999999999999998e-25  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.514761  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0724  large-conductance mechanosensitive channel  45.93 
 
 		 146 aa  115  1.9999999999999998e-25  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>