More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppha_2186 on replicon NC_011060
Organism: Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011060  Ppha_2427  putative signal transduction protein with Nacht domain  44.48 
 
 		 1044 aa  771    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.509479  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2344  protein of unknown function DUF323  45.78 
 
 		 1190 aa  682    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0364  signal transduction protein  48.43 
 
 		 960 aa  731    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0856  hypothetical protein  52.67 
 
 		 923 aa  891    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1553  putative signal transduction protein with Nacht domain  63.68 
 
 		 1023 aa  1283    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0972336  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2349  protein of unknown function DUF323  45.17 
 
 		 1186 aa  703    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.719002  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1452  protein of unknown function DUF323  44.47 
 
 		 1053 aa  862    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1047  putative signal transduction protein with Nacht domain  54.39 
 
 		 1183 aa  856    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.598608  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1565  putative signal transduction protein with Nacht domain  63.52 
 
 		 1041 aa  1051    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1562  putative signal transduction protein with Nacht domain  57.54 
 
 		 1044 aa  910    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2186  protein of unknown function DUF323  100 
 
 		 1007 aa  2094    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000553602  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2192  protein of unknown function DUF323  63.89 
 
 		 1049 aa  1320    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1587  protein of unknown function DUF323  44.79 
 
 		 1064 aa  837    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0457  signal transduction protein  49.39 
 
 		 1049 aa  955    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0460  hypothetical protein  45.6 
 
 		 965 aa  684    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0102271  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1299  hypothetical protein  49.75 
 
 		 1492 aa  901    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1893  hypothetical protein  52.38 
 
 		 1581 aa  844    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0735  protein of unknown function DUF323  45.09 
 
 		 1201 aa  729    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0068  hypothetical protein  33.87 
 
 		 1200 aa  408  1.0000000000000001e-112  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2339  protein of unknown function DUF323  47.51 
 
 		 775 aa  216  9.999999999999999e-55  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1598  hypothetical protein  30.94 
 
 		 644 aa  212  2e-53  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1037  hypothetical protein  55.75 
 
 		 174 aa  182  2.9999999999999997e-44  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007595  Synpcc7942_B2655  hypothetical protein  38.86 
 
 		 278 aa  144  9e-33  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0589168  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3090  putative signal transduction protein with Nacht domain  28.16 
 
 		 908 aa  128  5e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.624689  normal  0.76371 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5123  hypothetical protein  24.09 
 
 		 949 aa  118  5e-25  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0904  hypothetical protein  41.36 
 
 		 251 aa  117  8.999999999999998e-25  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000158237 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3236  hypothetical protein  25.11 
 
 		 957 aa  114  6e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0602  protein of unknown function DUF323  36.57 
 
 		 273 aa  114  8.000000000000001e-24  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0325143  normal  0.360547 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2563  putative signal transduction protein with Nacht domain  27.14 
 
 		 997 aa  111  8.000000000000001e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.238788  normal  0.0710109 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1634  hypothetical protein  39.63 
 
 		 263 aa  110  2e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4092  hypothetical protein  33.65 
 
 		 253 aa  108  5e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.189106  normal  0.479505 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4811  putative signal transduction protein with Nacht domain  25.92 
 
 		 1067 aa  107  1e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.382069  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2449  putative signal transduction protein with Nacht domain  25.48 
 
 		 888 aa  106  2e-21  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.152058  normal  0.158989 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4765  putative signal transduction protein with Nacht domain protein  25.72 
 
 		 887 aa  105  3e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2222  serine/threonine protein kinase  36.87 
 
 		 1818 aa  105  6e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.943108  normal  1 
 
 
-
 
NC_002620  TC0422  hypothetical protein  30.27 
 
 		 614 aa  103  1e-20  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.385064  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2650  hypothetical protein  27.94 
 
 		 439 aa  103  2e-20  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.112589  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3177  protein of unknown function DUF323  34.38 
 
 		 416 aa  102  3e-20  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2940  Non-specific serine/threonine protein kinase  34.38 
 
 		 416 aa  102  4e-20  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.279621  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3508  signal transduction protein  23.88 
 
 		 1148 aa  100  1e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.139224 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3131  GUN4 domain protein  26.21 
 
 		 818 aa  100  2e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2098  hypothetical protein  37.5 
 
 		 586 aa  100  2e-19  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.092784 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4586  putative signal transduction protein with Nacht domain  27.15 
 
 		 1086 aa  99.4  3e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3346  adenylate/guanylate cyclase  34.43 
 
 		 1392 aa  99.4  3e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0911306  normal  0.84372 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3248  hypothetical protein  38.37 
 
 		 416 aa  99  5e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.0000238215  normal  0.26381 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4881  hypothetical protein  27.4 
 
 		 436 aa  98.2  7e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.546495  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5249  hypothetical protein  27.4 
 
 		 436 aa  98.2  7e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4970  hypothetical protein  27.4 
 
 		 436 aa  98.2  7e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2380  protein of unknown function DUF323  35.2 
 
 		 417 aa  97.8  9e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0897  hypothetical protein  37.21 
 
 		 291 aa  97.1  2e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.000129772  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2077  hypothetical protein  34.92 
 
 		 636 aa  95.9  4e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.189777  normal  0.779158 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0638  protein of unknown function DUF323  33.15 
 
 		 446 aa  95.1  5e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.749121 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4476  signal transduction protein  25.77 
 
 		 1237 aa  94.7  7e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.62278  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3220  hypothetical protein  35.29 
 
 		 395 aa  94.7  9e-18  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0717  serine/threonine protein kinase  28.77 
 
 		 861 aa  94.4  1e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000196708  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1473  putative signal transduction protein with Nacht domain  24.49 
 
 		 762 aa  93.6  2e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2751  putative signal transduction protein with Nacht domain protein  26.75 
 
 		 942 aa  93.6  2e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1500  putative signal transduction protein with Nacht domain  24.49 
 
 		 762 aa  93.6  2e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7301  hypothetical protein  30.42 
 
 		 506 aa  92.4  3e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0388032 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4550  hypothetical protein  35.56 
 
 		 287 aa  92.8  3e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.864231 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6045  serine/threonine protein kinase  27.4 
 
 		 842 aa  92  5e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3640  protein of unknown function DUF323  27.97 
 
 		 442 aa  91.7  6e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.530686  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0331  hypothetical protein  29.41 
 
 		 433 aa  91.3  7e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.188129  normal  0.943613 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1731  hypothetical protein  34.48 
 
 		 877 aa  91.3  8e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0171  gliding motility-related protein  30.92 
 
 		 344 aa  91.3  9e-17  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.346305 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2919  hypothetical protein  30.68 
 
 		 1080 aa  90.1  2e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0125  hypothetical protein  33.17 
 
 		 781 aa  90.5  2e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.871876  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2498  signal transduction protein  26.35 
 
 		 1349 aa  90.5  2e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2507  protein of unknown function DUF323  32.84 
 
 		 538 aa  89.7  3e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2257  hypothetical protein  34.3 
 
 		 444 aa  89.7  3e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.689177  normal  0.0943468 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4578  hypothetical protein  39.17 
 
 		 852 aa  89.4  3e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.54262  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2114  hypothetical protein  33.53 
 
 		 444 aa  89.4  3e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0420844 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22460  conserved hypothetical protein TIGR03440  34.32 
 
 		 468 aa  89  5e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.599861 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1040  protein of unknown function DUF323  26.73 
 
 		 517 aa  88.6  5e-16  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0229948  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0887  hypothetical protein  33.54 
 
 		 240 aa  88.2  6e-16  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0165  hypothetical protein  35.95 
 
 		 605 aa  88.2  7e-16  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000147879  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3529  hypothetical protein  34.83 
 
 		 929 aa  88.2  8e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2123  protein of unknown function DUF323  33.14 
 
 		 442 aa  87.4  0.000000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2027  hypothetical protein  30.93 
 
 		 314 aa  87.4  0.000000000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.883912  normal  0.0681298 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1696  hypothetical protein  30.41 
 
 		 751 aa  87  0.000000000000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0869805  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3102  protein of unknown function DUF323  37.43 
 
 		 740 aa  86.7  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1048  signal transduction protein  24.55 
 
 		 1216 aa  86.7  0.000000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.958943  normal  0.02885 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4101  protein of unknown function DUF323  35.29 
 
 		 358 aa  86.3  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.664344  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3565  protein of unknown function DUF323  33.33 
 
 		 925 aa  87  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.233339 
 
 
-
 
NC_002950  PG0288  putative lipoprotein  34.21 
 
 		 491 aa  85.9  0.000000000000003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4280  hypothetical protein  32.35 
 
 		 412 aa  86.3  0.000000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5325  putative signal transduction protein with Nacht domain protein  24.26 
 
 		 805 aa  85.5  0.000000000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2847  hypothetical cytosolic protein  35.36 
 
 		 226 aa  85.5  0.000000000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0545564  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4512  hypothetical protein  32.8 
 
 		 487 aa  85.5  0.000000000000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.720233  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0687  hypothetical protein  26.69 
 
 		 437 aa  85.5  0.000000000000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3050  NTPase (NACHT family)-like protein  23.12 
 
 		 2216 aa  85.5  0.000000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.512729 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4985  signal transduction protein  23.78 
 
 		 1345 aa  85.5  0.000000000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.266997  normal  1 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5122  signal transduction protein  22.94 
 
 		 953 aa  85.5  0.000000000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1081  protein of unknown function DUF323  33.15 
 
 		 447 aa  85.1  0.000000000000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2998  protein of unknown function DUF323  34.9 
 
 		 351 aa  85.1  0.000000000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.012467  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2496  signal transduction protein  25.24 
 
 		 1339 aa  85.1  0.000000000000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2805  putative cytoplasmic protein  35.84 
 
 		 226 aa  84.7  0.000000000000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1853  hypothetical protein  31.8 
 
 		 464 aa  84.3  0.000000000000009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2548  methyltransferase  28.06 
 
 		 766 aa  84.3  0.000000000000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2136  hypothetical protein  29.09 
 
 		 1911 aa  84  0.00000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>