74 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnuc_1343 on replicon NC_009379
Organism: Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009379  Pnuc_1343  transglutaminase domain-containing protein  100 
 
 
369 aa  764    Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0642  transglutaminase domain protein  47.54 
 
 
383 aa  324  2e-87  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2938  transglutaminase domain-containing protein  45.03 
 
 
373 aa  306  3e-82  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.135746  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2861  transglutaminase domain-containing protein  42.97 
 
 
366 aa  294  2e-78  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.816183  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2413  transglutaminase-like  43.97 
 
 
369 aa  285  7e-76  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.329453  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0665  transglutaminase domain-containing protein  43.95 
 
 
371 aa  281  1e-74  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.713396  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1221  transglutaminase-like  40.18 
 
 
432 aa  243  3.9999999999999997e-63  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.416266 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2128  transglutaminase domain protein  38.76 
 
 
362 aa  226  5.0000000000000005e-58  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3586  transglutaminase domain-containing protein  39.73 
 
 
363 aa  226  7e-58  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0119  hypothetical protein  37.57 
 
 
361 aa  207  3e-52  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2064  DNA-binding response regulator  37.27 
 
 
359 aa  202  6e-51  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0699486  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2907  hypothetical protein  38.69 
 
 
301 aa  196  4.0000000000000005e-49  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.850064  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2790  twin-arginine translocation pathway signal  33.16 
 
 
379 aa  194  2e-48  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2969  transglutaminase domain-containing protein  32.73 
 
 
379 aa  192  9e-48  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2873  twin-arginine translocation pathway signal  33.07 
 
 
379 aa  192  9e-48  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1405  transglutaminase family protein  32.9 
 
 
379 aa  191  2e-47  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1303  transglutaminase domain protein  36.36 
 
 
380 aa  181  1e-44  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.403098  normal  0.79746 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3074  transglutaminase domain-containing protein  35.87 
 
 
380 aa  181  2e-44  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.926673  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3060  transglutaminase domain-containing protein  35.87 
 
 
380 aa  181  2e-44  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3217  transglutaminase domain-containing protein  33.42 
 
 
380 aa  181  2.9999999999999997e-44  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.177861  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2537  transglutaminase domain-containing protein  36.36 
 
 
337 aa  179  5.999999999999999e-44  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.243337  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1086  transglutaminase-like  35.1 
 
 
338 aa  177  4e-43  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000506332  hitchhiker  0.0000050405 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2177  transglutaminase domain protein  34.95 
 
 
336 aa  170  3e-41  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2041  transglutaminase domain protein  34.24 
 
 
336 aa  163  5.0000000000000005e-39  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04340  transglutaminase-like enzyme, predicted cysteine protease  32.15 
 
 
392 aa  150  4e-35  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00550212 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2396  transglutaminase-like  25.7 
 
 
328 aa  92.4  1e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0138  transglutaminase domain protein  29.13 
 
 
320 aa  88.6  1e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.792413  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11690  hypothetical protein  25.49 
 
 
310 aa  72.8  0.000000000009  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.556512  normal  0.379907 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0260  transglutaminase domain-containing protein  27.09 
 
 
350 aa  70.9  0.00000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.20446  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2371  copper amine oxidase domain protein  31.4 
 
 
1305 aa  65.9  0.000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0089  transglutaminase-like domain-containing protein  27.04 
 
 
559 aa  60.1  0.00000006  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.890892  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1555  transglutaminase-like  24.82 
 
 
500 aa  58.2  0.0000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.047572  normal  0.368889 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1902  transglutaminase domain protein  29.41 
 
 
631 aa  56.2  0.0000009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.37601  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0165  transglutaminase domain protein  23.92 
 
 
436 aa  54.3  0.000003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.665704  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1168  transglutaminase domain-containing protein  40.3 
 
 
634 aa  54.3  0.000004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3234  transglutaminase domain-containing protein  31.54 
 
 
818 aa  52.8  0.00001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00597045 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3364  transglutaminase domain-containing protein  31.78 
 
 
795 aa  50.8  0.00003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0562  transglutaminase domain protein  33.6 
 
 
398 aa  51.2  0.00003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.567565  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0171  transglutaminase domain-containing protein  26.22 
 
 
340 aa  50.1  0.00006  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0013  transglutaminase domain protein  44.44 
 
 
376 aa  49.7  0.00008  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.854186  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1137  transglutaminase domain-containing protein  27.97 
 
 
507 aa  48.9  0.0002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2424  transglutaminase domain-containing protein  27.33 
 
 
639 aa  48.5  0.0002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000343547  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3183  putative membrane-bound protease  29.63 
 
 
742 aa  48.5  0.0002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2132  putative membrane-bound protease  28.95 
 
 
742 aa  47.4  0.0004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0341  transglutaminase domain protein  27.63 
 
 
453 aa  47  0.0005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.896818 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2272  putative membrane-bound protease  28.34 
 
 
635 aa  45.4  0.001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2120  membrane-bound protease  27.13 
 
 
742 aa  45.1  0.002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.901767  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2238  transglutaminase-like  40 
 
 
274 aa  44.7  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.912675  normal  0.353146 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2155  putative membrane-bound protease  27.13 
 
 
742 aa  45.1  0.002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0938  transglutaminase domain-containing protein  30.1 
 
 
438 aa  45.1  0.002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.522596  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1972  membrane-bound protease  27.13 
 
 
742 aa  45.1  0.002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.608731  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1943  transglutaminase-like  34.62 
 
 
767 aa  44.7  0.003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.444996  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2594  transglutaminase-like  30.3 
 
 
216 aa  44.3  0.003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.727338  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2049  transglutaminase domain-containing protein  29.73 
 
 
734 aa  44.3  0.003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2096  transglutaminase domain-containing protein  29.73 
 
 
734 aa  44.3  0.004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0916  transglutaminase domain-containing protein  30.1 
 
 
438 aa  44.3  0.004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1927  transglutaminase superfamily protease  35.14 
 
 
742 aa  43.9  0.005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0890481  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1951  transglutaminase superfamily protease  26.98 
 
 
742 aa  43.9  0.005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5565  transglutaminase-like  34.83 
 
 
676 aa  43.9  0.005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.633958  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2277  transglutaminase domain-containing protein  29.73 
 
 
739 aa  43.9  0.005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4563  hypothetical protein  29.73 
 
 
739 aa  43.9  0.005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2289  transglutaminase domain protein  31.07 
 
 
707 aa  43.5  0.006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0224849  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1118  transglutaminase domain-containing protein  32.74 
 
 
685 aa  43.5  0.006  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1212  hypothetical protein  32.74 
 
 
685 aa  43.5  0.006  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.558928  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3218  transglutaminase-like  37.14 
 
 
274 aa  43.1  0.008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.90869 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02438  hypothetical protein  38.24 
 
 
635 aa  43.1  0.008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03011  hypothetical protein  40 
 
 
681 aa  43.1  0.008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3856  transglutaminase domain protein  37.65 
 
 
674 aa  42.7  0.009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3379  transglutaminase domain protein  40.58 
 
 
673 aa  42.7  0.009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.207314  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3970  transglutaminase domain protein  37.65 
 
 
674 aa  42.7  0.009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0817675 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2519  transglutaminase-like  39.13 
 
 
645 aa  42.7  0.009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.135415 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1966  transglutaminase domain-containing protein  35.14 
 
 
742 aa  42.7  0.009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.524806  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1056  transglutaminase-like protein  33.33 
 
 
890 aa  42.7  0.009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0998  transglutaminase domain-containing protein  30.56 
 
 
762 aa  42.7  0.01  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.2813 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>