112 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnuc_1180 on replicon NC_009379
Organism: Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009379  Pnuc_1180  putative ABC transporter, periplasmic protein  100 
 
 
323 aa  650    Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2778  NMT1/THI5 like domain protein  66.45 
 
 
325 aa  424  1e-117  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6301  NMT1/THI5-like domain-containing protein  38.41 
 
 
325 aa  181  2e-44  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.789298  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0619  NMT1/THI5 like domain protein  34.38 
 
 
339 aa  166  4e-40  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2293  membrane lipoprotein lipid attachment site  25.08 
 
 
336 aa  87.8  2e-16  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4555  NMT1/THI5 like domain protein  21.66 
 
 
337 aa  79.3  0.00000000000009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2575  hypothetical protein  22.32 
 
 
336 aa  70.1  0.00000000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.225151  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11510  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport system, periplasmic component  21.79 
 
 
336 aa  69.3  0.00000000009  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000048144  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3279  hypothetical protein  24.16 
 
 
332 aa  68.6  0.0000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.000646762  normal  0.0750217 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1347  NMT1/THI5-like domain-containing protein  22.11 
 
 
330 aa  68.9  0.0000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0878  hypothetical protein  22.37 
 
 
329 aa  66.2  0.0000000007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0057402  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4675  ABC transporter substrate-binding protein  21.82 
 
 
338 aa  65.5  0.000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4533  ABC transporter, substrate-binding protein  25.19 
 
 
335 aa  65.5  0.000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5036  ABC transporter substrate-binding protein  21.82 
 
 
325 aa  65.5  0.000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.647768  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4613  NMT1/THI5-like domain-containing protein  25.19 
 
 
335 aa  65.1  0.000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0337  putative ABC transporter, substrate-binding protein  24.06 
 
 
335 aa  64.7  0.000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4900  putative ABC transporter, substrate-binding protein  24.81 
 
 
335 aa  64.7  0.000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2950  multi-sensor hybrid histidine kinase  25.37 
 
 
1004 aa  63.9  0.000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1273  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  27.45 
 
 
1004 aa  63.9  0.000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4514  ABC transporter, substrate-binding protein  24.5 
 
 
335 aa  63.5  0.000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4921  putative ABC transporter, substrate-binding protein  24.5 
 
 
335 aa  63.5  0.000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4901  putative ABC transporter, substrate-binding protein  23.68 
 
 
335 aa  63.2  0.000000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4767  NlpA lipoprotein  27.76 
 
 
348 aa  61.6  0.00000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0925  NMT1/THI5 like domain protein  23.55 
 
 
311 aa  60.1  0.00000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0676609  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4935  ABC transporter, substrate-binding protein, putative  24.47 
 
 
325 aa  59.7  0.00000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3454  ABC transporter, substrate-binding protein  24.73 
 
 
334 aa  59.3  0.00000008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2782  ABC transporter substrate-binding protein  23.02 
 
 
332 aa  59.3  0.00000009  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0465  ABC transporter, substrate-binding protein, aliphatic sulphonates  25.93 
 
 
347 aa  58.5  0.0000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.176308  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3333  extracellular solute-binding protein  26.91 
 
 
341 aa  57.8  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.686225  normal  0.192968 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1836  ABC-type nitrate/sulfonate/taurine/bicarbonate transport systems, periplasmic component  21.77 
 
 
340 aa  58.2  0.0000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2701  NMT1/THI5-like domain-containing protein  25.91 
 
 
331 aa  57.8  0.0000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3213  NMT1/THI5-like domain-containing protein  26.41 
 
 
338 aa  57.4  0.0000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.581977  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4102  NMT1/THI5-like domain-containing protein  23.65 
 
 
336 aa  56.6  0.0000006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000394257 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3748  ABC transporter, substrate binding protein  26.53 
 
 
339 aa  55.8  0.0000008  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0325  NMT1/THI5 like domain protein  26.24 
 
 
313 aa  55.1  0.000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.358073  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1814  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems periplasmic components-like protein  27.7 
 
 
322 aa  54.3  0.000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.641284  normal  0.673988 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0036  NlpA lipoprotein  22.51 
 
 
323 aa  53.9  0.000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2277  NMT1/THI5-like domain-containing protein  25.68 
 
 
313 aa  53.9  0.000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.191617  normal  0.0563961 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2258  NMT1/THI5 like domain protein  32.16 
 
 
340 aa  53.5  0.000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2511  diguanylate cyclase  24.48 
 
 
686 aa  53.1  0.000006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.315227  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3168  ABC transporter, periplasmic binding protein  24.76 
 
 
343 aa  52.4  0.00001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.479162  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3083  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems periplasmic components-like protein  25.15 
 
 
328 aa  52.4  0.00001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.261971  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3906  WD-40 repeat-containing protein  24.76 
 
 
343 aa  52.4  0.00001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3589  NMT1/THI5-like domain-containing protein  25.69 
 
 
346 aa  51.2  0.00002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34300  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport system, periplasmic component  25.88 
 
 
319 aa  50.8  0.00003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3350  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems periplasmic components-like protein  20.45 
 
 
364 aa  50.8  0.00003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000374426  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0284  ABC transporter, periplasmic binding protein, putative  25.93 
 
 
346 aa  50.4  0.00004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3602  conserved hypothetical signal peptide protein  26.29 
 
 
349 aa  50.1  0.00005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3175  NMT1/THI5-like domain-containing protein  23.42 
 
 
367 aa  49.7  0.00007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.311198  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4931  putative sulfonate/nitrate transport system substrate-binding protein  25.94 
 
 
325 aa  49.3  0.00009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.658628 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2543  putative binding protein  25.23 
 
 
352 aa  49.3  0.00009  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.721383 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2108  extracellular solute-binding protein  30.52 
 
 
341 aa  48.9  0.0001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009959  Dshi_4165  NMT1/THI5-like domain-containing protein  25.27 
 
 
331 aa  48.9  0.0001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0994431  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1820  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems periplasmic components-like protein  25.37 
 
 
327 aa  48.9  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.246405 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0248  histidine kinase  24.12 
 
 
1065 aa  48.1  0.0002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2561  NLPA lipoprotein  26.34 
 
 
339 aa  48.5  0.0002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.79068 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0889  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems periplasmic components-like  25.53 
 
 
390 aa  48.1  0.0002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.390575  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06841  nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems, periplasmic components  25 
 
 
337 aa  48.1  0.0002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2952  NMT1/THI5 like domain protein  29.5 
 
 
318 aa  48.5  0.0002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3391  putative signal peptide protein  26.01 
 
 
328 aa  47.8  0.0003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5731  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems periplasmic components-like protein  20 
 
 
329 aa  47.4  0.0003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6066  ABC transporter substrate-binding protein  29.73 
 
 
342 aa  47.4  0.0003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0938445  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3081  NMT1/THI5 like domain protein  26.98 
 
 
326 aa  47.4  0.0003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0652  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems periplasmic components-like protein  29.36 
 
 
261 aa  47.8  0.0003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5352  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems periplasmic components-like protein  20 
 
 
329 aa  47.4  0.0004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5441  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems periplasmic components-like protein  20 
 
 
329 aa  47.4  0.0004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.558403 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000866  hydroxymethylpyrimidine ABC transporter substrate-binding component  23.68 
 
 
316 aa  47.4  0.0004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3280  putative signal peptide protein  25.69 
 
 
349 aa  47.4  0.0004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4669  NMT1/THI5 like domain protein  26.06 
 
 
335 aa  46.6  0.0005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3812  NMT1/THI5 like domain protein  28.1 
 
 
365 aa  47  0.0005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.424332 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6455  ABC transporter substrate-binding protein  27.19 
 
 
314 aa  46.6  0.0006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.871345  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0354  NMT1/THI5 like domain protein  27.67 
 
 
316 aa  46.6  0.0006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1800  NLPA lipoprotein  39.06 
 
 
325 aa  46.2  0.0007  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0425  aliphatic sulfonates family ABC transporter, periplasmic ligand-binding protein  32.74 
 
 
348 aa  46.2  0.0007  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.313806  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4899  twin-arginine translocation pathway signal  25 
 
 
361 aa  46.2  0.0008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.992021  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2960  sulfonate ABC transporter, sulfonate-binding protein, putative  21.47 
 
 
328 aa  45.4  0.001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.641077  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2838  twin-arginine translocation pathway signal  20.93 
 
 
318 aa  45.8  0.001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.884222  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2219  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter periplasmic protein  29.22 
 
 
341 aa  45.1  0.001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0766615  normal  0.160433 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3655  NLPA lipoprotein  20.83 
 
 
311 aa  45.4  0.001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.59768  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0402  NMT1/THI5 like domain protein  25.71 
 
 
360 aa  45.4  0.001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3874  aliphatic sulfonate ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  27.72 
 
 
343 aa  45.8  0.001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1964  NMT1/THI5-like domain-containing protein  29.32 
 
 
344 aa  45.1  0.001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0999952  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5403  hypothetical protein  21.58 
 
 
329 aa  45.4  0.001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.164568  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2085  hydroxymethylpyrimidine-binding protein  22.98 
 
 
328 aa  44.7  0.002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4881  substrate-binding region of ABC-type glycine betaine transport system  28.42 
 
 
333 aa  44.7  0.002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.730601  normal  0.999131 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0041  aliphatic sulfonate ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  27.18 
 
 
338 aa  44.7  0.002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.487407 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1430  NMT1/THI5-like domain-containing protein  27.05 
 
 
314 aa  44.7  0.002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1042  NMT1/THI5 like domain protein  28.27 
 
 
349 aa  44.7  0.002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.778479 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1134  NMT1/THI5 like domain protein  28.27 
 
 
349 aa  44.7  0.002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0977895  normal  0.576381 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1513  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  22.22 
 
 
1075 aa  44.7  0.002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.533351  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2713  sulfonate ABC transporter sulfonate-binding protein  22.29 
 
 
328 aa  43.9  0.003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.38086  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2921  sulfonate ABC transporter sulfonate-binding protein  22.29 
 
 
328 aa  43.9  0.003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2330  NMT1/THI5 like domain-containing protein  22.22 
 
 
314 aa  43.9  0.003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2255  NMT1/THI5 like domain protein  28.57 
 
 
340 aa  44.3  0.003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.387928  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0212  hypothetical protein  26.67 
 
 
325 aa  43.9  0.004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.0000000728433  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1973  NLPA lipoprotein  25.79 
 
 
335 aa  43.9  0.004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.000000000524772  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3159  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  30.18 
 
 
346 aa  43.9  0.004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.338207 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0909  NMT1/THI5 like domain protein  23.26 
 
 
311 aa  43.9  0.004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0643839  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1390  NMT1/THI5 like domain protein  29.59 
 
 
346 aa  43.9  0.004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.530017  hitchhiker  0.00234319 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2312  putative sulfonate ABC transporter, sulfonate-binding protein  23.53 
 
 
328 aa  43.9  0.004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.355114  hitchhiker  0.0000000431055 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>