More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnec_1351 on replicon NC_010531
Organism: Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010531  Pnec_1351  Peptidase M23  100 
 
 		 467 aa  970    Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.749113  hitchhiker  0.00315116 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0464  peptidase M23B  80.82 
 
 		 484 aa  744    Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0696  M24/M37 family peptidase  34.33 
 
 		 388 aa  127  4.0000000000000003e-28  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0489006  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0910  peptidase M23B  38.65 
 
 		 479 aa  124  4e-27  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.217217  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0437  peptidase M23B  31.72 
 
 		 513 aa  121  1.9999999999999998e-26  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  hitchhiker  0.000637591  normal  0.0934933 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2472  metalloendopeptidase-like membrane protein  35 
 
 		 441 aa  120  3.9999999999999996e-26  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000271454  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0727  peptidase M23B  41.25 
 
 		 465 aa  120  3.9999999999999996e-26  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3928  peptidase M23B  36.42 
 
 		 475 aa  120  3.9999999999999996e-26  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  decreased coverage  0.0000103245  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0465  peptidase M23B  35.15 
 
 		 473 aa  120  6e-26  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000494323  normal  0.161916 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0468  peptidase M23B  35.15 
 
 		 473 aa  120  6e-26  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.000910103  hitchhiker  0.00126388 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2080  Peptidase M23  40.51 
 
 		 441 aa  120  6e-26  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0435  M24/M37 family peptidase  35.15 
 
 		 475 aa  120  7e-26  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.269158  normal  0.0460462 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4768  peptidase M23B  35.15 
 
 		 472 aa  120  7e-26  Pseudomonas putida W619  Bacteria  decreased coverage  0.000000282967  normal  0.90661 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0505  peptidase M23B  38.6 
 
 		 465 aa  119  7.999999999999999e-26  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0607  peptidase, M23/M37 family  34.57 
 
 		 474 aa  119  9.999999999999999e-26  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0513451  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0172  Peptidase M23  35.9 
 
 		 465 aa  118  1.9999999999999998e-25  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0593266  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46000  metallopeptidase  35.15 
 
 		 480 aa  118  1.9999999999999998e-25  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.064748  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4566  peptidase M23B  34.57 
 
 		 475 aa  118  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00491492  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1228  M24/M37 family peptidase  36.55 
 
 		 386 aa  118  1.9999999999999998e-25  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.00112662  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1350  M24/M37 family peptidase  36.55 
 
 		 386 aa  118  3e-25  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3506  peptidase M23B  37.11 
 
 		 741 aa  117  3e-25  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  unclonable  0.00000124744  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5099  peptidase M23B  34.57 
 
 		 503 aa  117  3.9999999999999997e-25  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000186305  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2139  Peptidase M23  34.36 
 
 		 490 aa  116  6.9999999999999995e-25  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00671131  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08540  hypothetical protein  35.19 
 
 		 447 aa  116  7.999999999999999e-25  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000156584  decreased coverage  0.00000000118926 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0514  M24/M37 family peptidase  36.04 
 
 		 386 aa  115  1.0000000000000001e-24  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.000380878  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0008  peptidase M23B  33.92 
 
 		 417 aa  116  1.0000000000000001e-24  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3446  peptidase M23B  38.01 
 
 		 464 aa  115  1.0000000000000001e-24  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0198039 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0416  peptidase M23B  33.98 
 
 		 464 aa  115  1.0000000000000001e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.749321  normal  0.0708981 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0808  hypothetical protein  35.19 
 
 		 468 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0111068  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3151  hypothetical protein  34.38 
 
 		 460 aa  114  3e-24  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.696817  hitchhiker  0.00198036 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2406  Peptidase M23  34.74 
 
 		 517 aa  114  4.0000000000000004e-24  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  unclonable  0.00000297595  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0554  peptidase M23B  38.46 
 
 		 457 aa  114  4.0000000000000004e-24  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0864407  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0877  peptidase M23B  36.46 
 
 		 503 aa  114  4.0000000000000004e-24  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0472829  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1220  peptidase, M23/M37 family  38.61 
 
 		 385 aa  114  5e-24  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.000900007  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4107  peptidase M23B  37.35 
 
 		 457 aa  113  6e-24  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4673  Peptidase M23  35.67 
 
 		 446 aa  113  7.000000000000001e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6410  peptidase M23B  28.81 
 
 		 491 aa  112  1.0000000000000001e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.101162  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0063  peptidase M23B  34.39 
 
 		 448 aa  112  1.0000000000000001e-23  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000000736446  normal  0.441172 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1590  Peptidase M23  34.78 
 
 		 390 aa  112  1.0000000000000001e-23  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2213  Peptidase M23  36.02 
 
 		 457 aa  112  1.0000000000000001e-23  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.987255  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1236  Peptidase M23  34.62 
 
 		 441 aa  111  2.0000000000000002e-23  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.747064  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2644  peptidase M23B  33.86 
 
 		 462 aa  111  4.0000000000000004e-23  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.107778  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0002  Peptidase M23  37.34 
 
 		 523 aa  110  5e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2030  Peptidase M23  31.16 
 
 		 470 aa  110  8.000000000000001e-23  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0483  M23/M37 peptidase domain-containing protein  43.93 
 
 		 312 aa  109  1e-22  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.0302091  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2136  Peptidase M23  35.8 
 
 		 437 aa  109  1e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2905  Peptidase M23  51.46 
 
 		 468 aa  109  1e-22  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0458  peptidase family protein  33.33 
 
 		 438 aa  108  2e-22  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0151813  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0352  peptidase M23B  31.14 
 
 		 430 aa  108  2e-22  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1368  peptidase M23  36.48 
 
 		 434 aa  107  4e-22  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1980  Peptidase M23  38.36 
 
 		 460 aa  107  4e-22  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  decreased coverage  0.00339871  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3784  M24/M37 family peptidase  30.26 
 
 		 439 aa  107  5e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1754  peptidase M23B  34.57 
 
 		 569 aa  107  6e-22  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.598264 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02939  membrane-bound metalloendopeptidase  30.5 
 
 		 472 aa  106  7e-22  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0610  Peptidase M23  33.71 
 
 		 454 aa  106  8e-22  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.492921  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0631  peptidase M23B  33.71 
 
 		 454 aa  106  8e-22  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0370  peptidase M23B  46.53 
 
 		 402 aa  106  8e-22  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.890076  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5906  peptidase M23B  36.05 
 
 		 464 aa  105  1e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0732  M24/M37 family peptidase  27.4 
 
 		 353 aa  105  2e-21  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.056304  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1101  Peptidase M23  51.04 
 
 		 375 aa  104  3e-21  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.000000000152343  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0141  metallopeptidase  34.38 
 
 		 471 aa  104  4e-21  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  hitchhiker  0.000148736  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0475  peptidase M23B  31.58 
 
 		 464 aa  103  6e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0764227  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0770  peptidase M23B  32.91 
 
 		 533 aa  103  7e-21  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2732  Peptidase M23  31.6 
 
 		 440 aa  102  1e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.169167  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0124  peptidase M23  33.75 
 
 		 471 aa  102  1e-20  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.000771684  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0504  peptidase M23B  40.87 
 
 		 419 aa  102  1e-20  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1227  peptidase M23B  31.6 
 
 		 437 aa  102  1e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4275  peptidase M23B  45.92 
 
 		 695 aa  102  1e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0353482 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2111  peptidase M23B  45.92 
 
 		 362 aa  102  1e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.315561 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2638  Peptidase M23  31.6 
 
 		 440 aa  102  1e-20  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.388995  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0191  M24/M37 family peptidase  44.76 
 
 		 399 aa  102  2e-20  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0189  M24/M37 family peptidase  44.76 
 
 		 399 aa  102  2e-20  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1331  M23 peptidase domain-containing protein  43.56 
 
 		 389 aa  102  2e-20  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1433  peptidase M23B  32.9 
 
 		 380 aa  102  2e-20  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.484783  normal  0.146294 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4046  peptidase M23B  33.15 
 
 		 453 aa  101  3e-20  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.42477 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4919  Peptidase M23  44.9 
 
 		 676 aa  101  3e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0609  Peptidase M23  44.76 
 
 		 412 aa  100  4e-20  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  unclonable  1.01787e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4740  Peptidase M23  47.62 
 
 		 377 aa  100  4e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4245  peptidase M23B  43.88 
 
 		 680 aa  100  6e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.442759 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4092  peptidase M23B  43.88 
 
 		 681 aa  100  6e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0419  peptidase M23  43.14 
 
 		 695 aa  100  7e-20  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.0620331 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2055  peptidase  48.45 
 
 		 512 aa  99.4  1e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.485622  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1618  peptidase M23B  35.4 
 
 		 412 aa  99.4  1e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.278524  normal  0.127445 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1887  M24/M37 family peptidase  48.45 
 
 		 472 aa  99.4  1e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0768301  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1900  M24/M37 family peptidase  48.45 
 
 		 471 aa  99.4  1e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0520216  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2345  peptidase M23B  42.48 
 
 		 452 aa  99.4  1e-19  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000378681  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2568  putative membrane associated peptidase  33.33 
 
 		 436 aa  99.4  1e-19  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0102631  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3297  peptidase M23B  45.13 
 
 		 448 aa  99.4  1e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00235812  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1196  putative metalloendopeptidase  43.88 
 
 		 687 aa  99.8  1e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.336043  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2163  Peptidase M23  35.78 
 
 		 453 aa  99.4  1e-19  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5107  peptidase M23B  48.11 
 
 		 345 aa  99.4  1e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  decreased coverage  0.0000871581  decreased coverage  0.00235334 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0567  peptidase M23B  42.86 
 
 		 692 aa  99  2e-19  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3257  peptidase M23  47.17 
 
 		 450 aa  98.6  2e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  decreased coverage  0.000000116683  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0994  peptidase M23B  29.95 
 
 		 470 aa  98.6  2e-19  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000818534  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4473  peptidase M23B  42.02 
 
 		 491 aa  98.6  2e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0627  hypothetical protein  34.87 
 
 		 477 aa  98.2  3e-19  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0610  hypothetical protein  34.87 
 
 		 477 aa  98.2  3e-19  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0321  metallopeptidase  48.45 
 
 		 509 aa  98.2  3e-19  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.255107  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1658  peptidase M23B  47.71 
 
 		 265 aa  98.2  3e-19  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.508498  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2811  peptidase M23B  33.12 
 
 		 472 aa  97.8  3e-19  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000654378  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>