198 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnap_1827 on replicon NC_008781
Organism: Polaromonas naphthalenivorans CJ2



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008781  Pnap_1827  OmpW family protein  100 
 
 		 229 aa  470  1e-132  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.507852 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1940  outer membrane protein W  30.36 
 
 		 211 aa  94.4  1e-18  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.218273  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2322  outer membrane protein W  30.36 
 
 		 211 aa  94.4  1e-18  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000903  outer membrane protein W precursor  31.11 
 
 		 214 aa  93.6  2e-18  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2589  outer membrane protein W  28.7 
 
 		 214 aa  93.6  2e-18  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000746821  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2049  outer membrane protein W  30.22 
 
 		 211 aa  93.6  2e-18  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1371  outer membrane protein W  29.06 
 
 		 213 aa  92.4  5e-18  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.0573693 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1673  outer membrane protein W  29.52 
 
 		 214 aa  92.4  6e-18  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2601  outer membrane protein W  30.84 
 
 		 215 aa  92.4  6e-18  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.00000011484  decreased coverage  0.0000000556975 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2668  outer membrane protein W  30.84 
 
 		 215 aa  92.4  6e-18  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000483878  normal  0.0120446 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4473  OmpW  29.83 
 
 		 228 aa  90.9  1e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2775  outer membrane protein W  29.96 
 
 		 218 aa  91.3  1e-17  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.00794049  decreased coverage  0.0000209029 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2787  outer membrane protein W  28.19 
 
 		 215 aa  89.7  3e-17  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0424619  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1521  outer membrane protein W  28.19 
 
 		 214 aa  88.6  6e-17  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.00262855  normal  0.530215 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1485  outer membrane protein W  28.19 
 
 		 214 aa  88.6  6e-17  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0850248  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2554  outer membrane protein W  28.44 
 
 		 213 aa  88.6  8e-17  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.030228  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2861  outer membrane protein W  31.28 
 
 		 214 aa  88.2  9e-17  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00340553  unclonable  0.0000000000012731 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1334  outer membrane protein W  27.83 
 
 		 215 aa  88.2  1e-16  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.000150593  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4566  OmpW family protein  27.52 
 
 		 230 aa  87.4  1e-16  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1490  outer membrane protein W  31.28 
 
 		 215 aa  88.2  1e-16  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.0000649255  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00029  outer membrane protein OmpW  27.04 
 
 		 224 aa  86.7  3e-16  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.25785  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1469  outer membrane protein W  29.07 
 
 		 215 aa  86.7  3e-16  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.000000900043  hitchhiker  0.0000643724 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06904  outer membrane protein W  26.67 
 
 		 213 aa  85.9  4e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3207  outer membrane protein W  29.39 
 
 		 214 aa  86.3  4e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.0000387398  unclonable  0.0000000173343 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2674  outer membrane protein W  28.38 
 
 		 223 aa  85.9  5e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000169515 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1392  outer membrane protein W  28.19 
 
 		 215 aa  82.8  0.000000000000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00591184  n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5480  OmpW  28.16 
 
 		 234 aa  82.8  0.000000000000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.479641 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0370  outer membrane protein W  27.04 
 
 		 217 aa  81.6  0.000000000000008  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2180  outer membrane protein W  26.75 
 
 		 210 aa  81.3  0.00000000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.41802  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0979  OmpW family protein  27.75 
 
 		 223 aa  79.7  0.00000000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0238  OmpW  27.04 
 
 		 209 aa  79.7  0.00000000000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1299  OmpW family protein  29.49 
 
 		 202 aa  78.6  0.00000000000007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0529248  normal  0.202577 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2534  outer membrane protein W  28.39 
 
 		 218 aa  78.6  0.00000000000007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11270  outer membrane protein OprG precursor  27.54 
 
 		 232 aa  78.6  0.00000000000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1035  outer membrane protein OprG precursor  27.54 
 
 		 232 aa  78.6  0.00000000000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0700  OmpW family protein  26.64 
 
 		 202 aa  78.2  0.0000000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.496076  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2000  outer membrane protein W  27.35 
 
 		 210 aa  76.3  0.0000000000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06590  OmpW family outer membrane porin  25.64 
 
 		 224 aa  76.3  0.0000000000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1086  OmpW family protein  29.82 
 
 		 216 aa  75.9  0.0000000000005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.832301 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06610  OmpW family outer membrane porin  26.5 
 
 		 226 aa  75.9  0.0000000000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0319  OmpW  31.28 
 
 		 233 aa  75.5  0.0000000000006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.110155  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1596  outer membrane protein W  27.68 
 
 		 212 aa  74.3  0.000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.597068 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1859  outer membrane protein W  27.68 
 
 		 212 aa  74.3  0.000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1939  outer membrane protein W  26.99 
 
 		 210 aa  74.3  0.000000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.940404  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01230  outer membrane protein W  29.06 
 
 		 212 aa  73.6  0.000000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2392  OmpW family protein  29.06 
 
 		 212 aa  73.6  0.000000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.160177  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3873  OmpW family protein  29.76 
 
 		 227 aa  73.9  0.000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.627912 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2371  outer membrane protein W  29.06 
 
 		 212 aa  73.6  0.000000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.535822  hitchhiker  0.00000160145 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01240  hypothetical protein  29.06 
 
 		 212 aa  73.6  0.000000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1864  outer membrane protein W  27.68 
 
 		 212 aa  73.9  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.904155 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1922  outer membrane protein W  27.68 
 
 		 212 aa  73.9  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0854242  hitchhiker  0.00107444 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1365  outer membrane protein W  29.06 
 
 		 212 aa  73.6  0.000000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0200008  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1876  outer membrane protein W  29.06 
 
 		 212 aa  73.6  0.000000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000262717 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2299  outer membrane protein W  25.65 
 
 		 210 aa  73.2  0.000000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0595  OmpW family protein  30.05 
 
 		 206 aa  72.8  0.000000000005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.761797  hitchhiker  0.00324214 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4189  OmpW family protein  29.18 
 
 		 236 aa  72.4  0.000000000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.370837  normal  0.570233 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3286  OmpW family protein  26.92 
 
 		 224 aa  72.4  0.000000000005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.208435  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2283  outer membrane protein W  26.64 
 
 		 211 aa  72.4  0.000000000006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.300617 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1236  OmpW family protein  29.13 
 
 		 203 aa  72.4  0.000000000006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1425  outer membrane protein W  30.84 
 
 		 212 aa  71.6  0.000000000009  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0528971  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1414  outer membrane protein W  27.23 
 
 		 212 aa  71.6  0.000000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.157023  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1743  outer membrane protein W  30.84 
 
 		 212 aa  71.6  0.000000000009  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000000820415  hitchhiker  0.000840764 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0679  outer membrane protein OmpW  26.32 
 
 		 228 aa  70.9  0.00000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0029  OmpW family outer membrane protein  27.64 
 
 		 237 aa  70.1  0.00000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1414  outer membrane protein W  30.62 
 
 		 212 aa  69.7  0.00000000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0785515  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0504  OmpW family protein  32 
 
 		 227 aa  66.6  0.0000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.00488825  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0549  OmpW family protein  32 
 
 		 227 aa  66.6  0.0000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.742148 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1265  outer membrane protein precursor  27.38 
 
 		 209 aa  66.2  0.0000000004  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  unclonable  0.00000000128049  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0915  OmpW family protein  28.44 
 
 		 217 aa  66.2  0.0000000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5082  OmpW  30.15 
 
 		 241 aa  65.5  0.0000000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.133195  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5778  OmpW family protein  30.15 
 
 		 241 aa  65.5  0.0000000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.923655 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4400  OmpW family protein  30.15 
 
 		 241 aa  65.5  0.0000000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3378  OmpW  26.98 
 
 		 241 aa  64.7  0.000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.68852  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3221  OmpW family protein  30.04 
 
 		 239 aa  63.9  0.000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0030  OmpW  24.89 
 
 		 227 aa  64.3  0.000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.109784  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3545  OmpW family protein  30.04 
 
 		 239 aa  63.5  0.000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.506265 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0116  OmpW family protein  28.22 
 
 		 198 aa  63.9  0.000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0772399 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0539  OmpW family protein  31.2 
 
 		 227 aa  63.2  0.000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.870065 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0976  OmpW family protein  26.58 
 
 		 210 aa  61.2  0.00000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.591363 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0557  OmpW family protein  29.6 
 
 		 227 aa  60.8  0.00000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.841642  normal  0.443014 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3443  OmpW  27.62 
 
 		 282 aa  60.1  0.00000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.021221  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0273  OmpW family outer membrane porin  25.65 
 
 		 274 aa  59.3  0.00000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000012547  unclonable  0.000000709917 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0363  OmpW family outer membrane porin  28.07 
 
 		 241 aa  58.5  0.00000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.814411  normal  0.160886 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3350  putative outer membrane W signal peptide protein  27.62 
 
 		 241 aa  58.2  0.00000009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.539621  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3509  OmpW family protein  31.01 
 
 		 246 aa  57.8  0.0000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.694204  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1968  OmpW family protein  31.41 
 
 		 228 aa  57  0.0000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.135565 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3824  OmpW family protein  26.4 
 
 		 237 aa  57.4  0.0000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2010  OmpW family outer membrane protein  28.69 
 
 		 274 aa  57  0.0000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5040  OmpW family protein  27.43 
 
 		 274 aa  57  0.0000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.29501  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1433  OmpW family outer membrane protein  27.74 
 
 		 274 aa  56.6  0.0000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3683  OmpW family protein  25.65 
 
 		 274 aa  56.6  0.0000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.0000000286443  unclonable  0.0000000000000106929 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4515  OmpW family protein  27.43 
 
 		 274 aa  57  0.0000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.144856  normal  0.41171 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3636  OmpW family protein  27.93 
 
 		 211 aa  56.6  0.0000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.779637  normal  0.905473 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1875  OmpW family outer membrane protein  28.69 
 
 		 290 aa  57  0.0000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.253498  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0901  OmpW family outer membrane protein  28.69 
 
 		 290 aa  57  0.0000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1490  putative outer membrane signal peptide protein  30.58 
 
 		 228 aa  56.6  0.0000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.709079 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2734  OmpW family outer membrane protein  28.69 
 
 		 290 aa  57  0.0000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.355181  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3131  OmpW family outer membrane protein  28.69 
 
 		 290 aa  57  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0411  OmpW family protein  25.98 
 
 		 308 aa  56.2  0.0000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0130302 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3220  OmpW family protein  26.96 
 
 		 209 aa  56.2  0.0000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.185502  normal  0.270879 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>