More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmob_0869 on replicon NC_010003
Organism: Petrotoga mobilis SJ95



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010003  Pmob_0869  histidine kinase  100 
 
 
413 aa  827    Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1017  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.66 
 
 
1323 aa  145  9e-34  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0385374  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0592  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  35.11 
 
 
1113 aa  144  2e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0114606 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1712  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  33.33 
 
 
1173 aa  143  5e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0980923  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0264  Signal transduction histidine kinase-like  38.11 
 
 
666 aa  142  8e-33  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.0170548 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3243  PAS sensor protein  34.85 
 
 
1323 aa  142  8e-33  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5667  histidine kinase  36.12 
 
 
1140 aa  142  9e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3731  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  36.12 
 
 
1140 aa  142  9.999999999999999e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4637  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  36.12 
 
 
1140 aa  142  9.999999999999999e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.619414  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2208  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.77 
 
 
823 aa  141  1.9999999999999998e-32  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.73393 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5184  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.76 
 
 
939 aa  140  3e-32  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.584953  normal  0.0776559 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1703  histidine kinase  33.59 
 
 
1346 aa  140  3e-32  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2495  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  36.44 
 
 
1362 aa  140  4.999999999999999e-32  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4177  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  36.52 
 
 
490 aa  139  7.999999999999999e-32  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1446  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase A, N-terminal  34.67 
 
 
1131 aa  138  1e-31  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.705679  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2674  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  31.05 
 
 
585 aa  138  2e-31  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.239294  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1722  histidine kinase  36.03 
 
 
1361 aa  137  3.0000000000000003e-31  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.169999 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1117  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  34.71 
 
 
770 aa  137  3.0000000000000003e-31  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1526  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.55 
 
 
975 aa  137  5e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1688  PAS sensor protein  32.71 
 
 
823 aa  136  6.0000000000000005e-31  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2393  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  31.95 
 
 
676 aa  135  9.999999999999999e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00822967 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2403  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  37.28 
 
 
371 aa  135  9.999999999999999e-31  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0100  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.33 
 
 
1182 aa  135  9.999999999999999e-31  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1926  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  34.38 
 
 
697 aa  134  1.9999999999999998e-30  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0496  histidine kinase  36.77 
 
 
554 aa  135  1.9999999999999998e-30  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000434752 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4152  histidine kinase  34.3 
 
 
662 aa  135  1.9999999999999998e-30  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2953  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.38 
 
 
1202 aa  134  1.9999999999999998e-30  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.999143  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3573  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  32.48 
 
 
1120 aa  134  3e-30  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6547  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.6 
 
 
865 aa  134  3e-30  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.325935 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05352  histidine kinase  33.61 
 
 
859 aa  134  3.9999999999999996e-30  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2746  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  32.61 
 
 
596 aa  133  6e-30  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.313231  normal 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5320  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.33 
 
 
903 aa  133  6e-30  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.544718  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3270  histidine kinase  35.02 
 
 
565 aa  133  6.999999999999999e-30  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1142  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  29.64 
 
 
631 aa  132  7.999999999999999e-30  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0589  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.71 
 
 
581 aa  132  7.999999999999999e-30  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4254  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  30.2 
 
 
681 aa  132  7.999999999999999e-30  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.0000333563  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1840  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  32.33 
 
 
641 aa  132  7.999999999999999e-30  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.870294  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1484  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.54 
 
 
1002 aa  132  9e-30  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1511  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.54 
 
 
1002 aa  132  9e-30  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06167  sensor protein LuxQ  33.77 
 
 
594 aa  132  1.0000000000000001e-29  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3382  ATPase domain-containing protein  32.48 
 
 
1071 aa  132  1.0000000000000001e-29  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.525319  normal  0.740946 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0171  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.94 
 
 
868 aa  132  1.0000000000000001e-29  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.766824  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2985  fused histidine kinase sensor/response regulator  33.33 
 
 
1121 aa  132  1.0000000000000001e-29  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.446873 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2225  histidine kinase  36.96 
 
 
845 aa  131  2.0000000000000002e-29  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.0086849  normal  0.197777 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0072  histidine kinase  31.72 
 
 
810 aa  131  2.0000000000000002e-29  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3691  histidine kinase  32.48 
 
 
1071 aa  132  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2163  histidine kinase  36.96 
 
 
845 aa  131  2.0000000000000002e-29  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1012  multi-sensor signal transduction histidine kinase  36.77 
 
 
418 aa  130  3e-29  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1855  GAF sensor hybrid histidine kinase  34.55 
 
 
1285 aa  131  3e-29  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0012  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.88 
 
 
2783 aa  130  4.0000000000000003e-29  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.296104 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4225  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.41 
 
 
1322 aa  130  4.0000000000000003e-29  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0229  histidine kinase  34.85 
 
 
724 aa  130  4.0000000000000003e-29  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0610831  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1012  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.75 
 
 
1029 aa  130  5.0000000000000004e-29  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.135444  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2888  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  34.85 
 
 
606 aa  129  7.000000000000001e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.459565  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4529  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.49 
 
 
989 aa  129  7.000000000000001e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5145  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  35.25 
 
 
603 aa  129  9.000000000000001e-29  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0179  histidine kinase  33.73 
 
 
758 aa  129  1.0000000000000001e-28  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0653  sensor histidine kinase  33.47 
 
 
1124 aa  128  1.0000000000000001e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.450749  normal  0.469118 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0786  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.77 
 
 
582 aa  129  1.0000000000000001e-28  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0140  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.68 
 
 
620 aa  128  1.0000000000000001e-28  Methanococcus vannielii SB  Archaea  hitchhiker  0.000754265  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0186  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  31.22 
 
 
657 aa  129  1.0000000000000001e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00908915 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1730  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  32.89 
 
 
1195 aa  129  1.0000000000000001e-28  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.479441  normal  0.752594 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2520  hybrid sensory histidine kinase BarA  32.45 
 
 
929 aa  128  2.0000000000000002e-28  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.314221  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07851  hybrid sensory kinase  36 
 
 
730 aa  128  2.0000000000000002e-28  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000536  autoinducer 2 sensor kinase/phosphatase LuxQ  32.92 
 
 
858 aa  128  2.0000000000000002e-28  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_6017  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32.59 
 
 
1044 aa  127  2.0000000000000002e-28  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2948  histidine kinase  30.36 
 
 
800 aa  128  2.0000000000000002e-28  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.549542  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3458  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.78 
 
 
958 aa  128  2.0000000000000002e-28  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3041  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  30.4 
 
 
873 aa  128  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.616698  normal  0.0609988 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5222  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  34.68 
 
 
601 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.747802  normal 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5292  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  31.58 
 
 
524 aa  128  2.0000000000000002e-28  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3203  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.27 
 
 
765 aa  128  2.0000000000000002e-28  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0763722 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0924  aerobic respiration control sensor protein ArcB  34.47 
 
 
753 aa  128  2.0000000000000002e-28  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.178911  normal  0.270801 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3498  two component sensor kinase  34.6 
 
 
1125 aa  128  2.0000000000000002e-28  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0996  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.65 
 
 
832 aa  128  2.0000000000000002e-28  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1762  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  30.38 
 
 
1146 aa  127  3e-28  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.468259  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1839  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  34.96 
 
 
423 aa  127  3e-28  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00841086  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43120  periplasmic sensory histidine protein kinase  31.2 
 
 
830 aa  127  3e-28  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1250  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.98 
 
 
936 aa  127  3e-28  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4418  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  33.62 
 
 
587 aa  127  4.0000000000000003e-28  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1885  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.67 
 
 
792 aa  127  4.0000000000000003e-28  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5513  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  31.11 
 
 
1124 aa  127  4.0000000000000003e-28  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.168644  normal  0.269782 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4243  GAF sensor hybrid histidine kinase  27.78 
 
 
653 aa  127  5e-28  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.506182  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0819  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.2 
 
 
844 aa  126  5e-28  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4800  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  34.3 
 
 
610 aa  127  5e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3368  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  34.3 
 
 
610 aa  127  5e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0390016  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4148  histidine kinase  34.3 
 
 
610 aa  127  5e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.425201  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0848  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.2 
 
 
844 aa  126  6e-28  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000354  sensor histidine kinase  32.27 
 
 
785 aa  126  6e-28  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.407699  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0961  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  36.24 
 
 
1154 aa  126  6e-28  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.544458  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4428  PAS sensor protein  31.25 
 
 
693 aa  126  6e-28  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.426756 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0074  histidine kinase  34.91 
 
 
493 aa  126  7e-28  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.376042  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2453  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.42 
 
 
969 aa  126  7e-28  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.19952  normal  0.304956 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0491  signal transduction histidine kinase-like protein  30.45 
 
 
617 aa  126  7e-28  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.146334  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02943  two-component system sensor protein  35.56 
 
 
727 aa  126  8.000000000000001e-28  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00726909  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4917  Signal transduction histidine kinase-like protein  31.62 
 
 
486 aa  126  8.000000000000001e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2327  ATP-binding region ATPase domain protein  32.79 
 
 
758 aa  126  9e-28  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3612  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  33.33 
 
 
770 aa  126  9e-28  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.019984 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0463  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.05 
 
 
1314 aa  126  9e-28  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.332875  normal  0.985136 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01273  putative two-component sensor histidine kinase and response regulator hybrid  34.4 
 
 
702 aa  125  1e-27  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>