More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmob_0507 on replicon NC_010003
Organism: Petrotoga mobilis SJ95



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010003  Pmob_0507  ABC transporter related  100 
 
 
251 aa  509  1e-143  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00548242  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0375  high-affinity branched-chain amino acid transport ATP-binding protein livG  43.6 
 
 
273 aa  216  2e-55  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.529081  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0261  ABC transporter related  43.2 
 
 
306 aa  215  4e-55  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1895  ABC transporter related  42.91 
 
 
264 aa  215  4e-55  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.045423 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4240  ABC transporter related  43.65 
 
 
266 aa  215  5.9999999999999996e-55  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1472  ABC transporter-like protein  41.9 
 
 
261 aa  214  8e-55  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.723691  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3533  ABC transporter related  44.8 
 
 
252 aa  214  8e-55  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.594682  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0261  ATPase  41.67 
 
 
255 aa  214  9.999999999999999e-55  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2959  leucine/isoleucine/valine transport system ATP- binding protein  41.11 
 
 
271 aa  214  9.999999999999999e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0671  ABC transporter related  43.65 
 
 
252 aa  214  9.999999999999999e-55  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2737  ABC transporter related  43.14 
 
 
268 aa  213  1.9999999999999998e-54  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2856  ABC transporter related protein  41.5 
 
 
276 aa  213  1.9999999999999998e-54  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00458274  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3555  ABC transporter related  42.86 
 
 
265 aa  214  1.9999999999999998e-54  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.520716  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3054  ABC transporter related protein  43.03 
 
 
259 aa  213  1.9999999999999998e-54  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2218  ABC transporter related  42.4 
 
 
274 aa  213  1.9999999999999998e-54  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0289  ABC transporter related  40.94 
 
 
612 aa  213  2.9999999999999995e-54  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.92204  normal  0.8343 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1744  ABC transporter related  42.29 
 
 
265 aa  213  2.9999999999999995e-54  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.0853683 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1128  ABC transporter related  41.83 
 
 
256 aa  212  4.9999999999999996e-54  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.79034  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0357  ABC transporter related  40.94 
 
 
261 aa  211  9e-54  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2278  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  42 
 
 
279 aa  211  1e-53  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0953  ABC transporter related  42 
 
 
274 aa  211  1e-53  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.513158  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0519  ABC transporter related  42.29 
 
 
255 aa  211  1e-53  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.295822  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2364  high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  43.03 
 
 
256 aa  209  2e-53  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3541  ABC transporter related  40.96 
 
 
260 aa  210  2e-53  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0215  ABC transporter-related protein  41.83 
 
 
313 aa  210  2e-53  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2978  ABC transporter related  43.24 
 
 
265 aa  210  2e-53  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0049  ABC transporter related  42.8 
 
 
269 aa  210  2e-53  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.643651 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7076  high-affinity branched-chain amino acid transport protein  42.8 
 
 
265 aa  209  3e-53  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0549  ABC transporter related  42.06 
 
 
265 aa  209  3e-53  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.505535  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0250  ABC transporter related  42.8 
 
 
260 aa  209  4e-53  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.830264  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2724  ABC transporter related  43.2 
 
 
277 aa  209  4e-53  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.407856 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1163  ABC transporter related  41.96 
 
 
255 aa  209  4e-53  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1068  ABC transporter related  42.75 
 
 
273 aa  208  5e-53  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.711539  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5536  ABC transporter related  41.9 
 
 
258 aa  208  6e-53  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3364  ABC transporter related  40.16 
 
 
274 aa  208  8e-53  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1481  ABC transporter related  41.43 
 
 
259 aa  208  8e-53  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0530  ABC transporter related  46.22 
 
 
257 aa  207  9e-53  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000384964  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0365  ABC transporter related  41.53 
 
 
253 aa  207  1e-52  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000174953  unclonable  0.0000000581692 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20630  ABC-type branched-chain amino acid transport systems, ATPase component  40.32 
 
 
333 aa  207  1e-52  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.172871  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4010  ABC transporter related  41.2 
 
 
272 aa  207  1e-52  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3057  ABC transporter related  41.5 
 
 
334 aa  206  2e-52  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0799758  hitchhiker  0.0000824418 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1001  ABC transporter related  44.31 
 
 
268 aa  206  2e-52  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19620  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  41.8 
 
 
255 aa  207  2e-52  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.00232655  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3392  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  42.4 
 
 
256 aa  206  4e-52  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0603  ABC transporter related  40.71 
 
 
260 aa  206  4e-52  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.15363  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0401  ABC-type branched-chain amino acid transport system, ATPase component  42.17 
 
 
254 aa  205  4e-52  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0837  ABC transporter related  40.24 
 
 
255 aa  206  4e-52  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1085  ABC transporter related  41.96 
 
 
277 aa  206  4e-52  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0894019  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0857  ABC transporter related  41.11 
 
 
257 aa  205  5e-52  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2394  ABC transporter related  41.92 
 
 
262 aa  205  5e-52  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0407  ABC transporter-like protein  40.71 
 
 
273 aa  205  7e-52  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.139894  normal  0.382796 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3374  ABC transporter related  38.06 
 
 
302 aa  204  7e-52  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0660253 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0614  ABC transporter related  42.63 
 
 
259 aa  205  7e-52  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.417292  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0613  ABC transporter related  42.52 
 
 
259 aa  204  9e-52  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4794  ABC transporter related  44.27 
 
 
259 aa  204  9e-52  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.130359  normal  0.133792 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3102  ABC transporter related protein  40 
 
 
256 aa  204  1e-51  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1860  ABC transporter related  40.4 
 
 
259 aa  204  1e-51  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.180905  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1894  branched-chain amino acid ABC transporter ATPase  38.34 
 
 
286 aa  203  2e-51  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0274473  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1864  ABC transporter related  40.64 
 
 
251 aa  203  2e-51  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2495  ABC transporter related protein  44.98 
 
 
271 aa  203  2e-51  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.503368  normal  0.0315467 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1245  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  42.86 
 
 
255 aa  204  2e-51  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.592579 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5007  ABC transporter related  39.76 
 
 
261 aa  203  2e-51  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0566  ABC transporter related  42.42 
 
 
277 aa  203  2e-51  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3205  ABC transporter related  40.08 
 
 
255 aa  202  3e-51  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1579  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  44.58 
 
 
254 aa  203  3e-51  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2753  ABC transporter related  39.29 
 
 
255 aa  203  3e-51  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2474  ABC transporter related  39.22 
 
 
257 aa  202  3e-51  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3848  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  41.34 
 
 
255 aa  202  4e-51  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0319236  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0935  ABC transporter related  41.83 
 
 
259 aa  202  4e-51  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000526687  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0463  ABC transporter related protein  41.2 
 
 
252 aa  202  4e-51  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1723  ABC transporter related  40.4 
 
 
256 aa  202  4e-51  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4111  high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  41.34 
 
 
255 aa  202  5e-51  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.277717  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1406  ABC transporter related  41.27 
 
 
254 aa  202  5e-51  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.260319  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2553  ABC transporter related  40.24 
 
 
255 aa  202  5e-51  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1583  ABC transporter related  39.84 
 
 
240 aa  201  6e-51  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2127  ABC transporter related  40.8 
 
 
250 aa  202  6e-51  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2251  ABC transporter related  40.08 
 
 
255 aa  201  8e-51  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2431  ABC transporter related protein  41.6 
 
 
252 aa  201  9e-51  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0103052  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2653  ABC transporter-like protein  42.57 
 
 
268 aa  201  9e-51  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.000291563  hitchhiker  0.00412304 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2309  ABC transporter related protein  39.36 
 
 
271 aa  201  9e-51  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.937555  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23020  ABC-type branched-chain amino acid transport systems, ATPase component  40.16 
 
 
291 aa  200  9.999999999999999e-51  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.0484452 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2954  ABC transporter related  40.55 
 
 
280 aa  201  9.999999999999999e-51  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.824965  normal  0.161436 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4818  ABC transporter related  41.27 
 
 
274 aa  201  9.999999999999999e-51  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.177699  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0356  ABC transporter related  41.67 
 
 
290 aa  201  9.999999999999999e-51  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3147  ABC transporter related  37.72 
 
 
307 aa  201  9.999999999999999e-51  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.32124  normal  0.601015 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1783  ABC-type branched-chain amino acid transport systems ATPase component  41.13 
 
 
264 aa  200  1.9999999999999998e-50  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0473168  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2502  ABC transporter related protein  41.13 
 
 
254 aa  200  1.9999999999999998e-50  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1820  ABC transporter-related protein  40.56 
 
 
250 aa  199  1.9999999999999998e-50  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0114  ABC transporter related  41.37 
 
 
272 aa  200  1.9999999999999998e-50  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.95101  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0684  ABC transporter related protein  43.08 
 
 
255 aa  200  1.9999999999999998e-50  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.003005  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0469  ABC transporter related  40.4 
 
 
261 aa  199  3e-50  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.331272  normal  0.304191 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3435  ABC transporter-related protein  39.36 
 
 
264 aa  199  3e-50  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000808082 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1518  ABC transporter related  42 
 
 
253 aa  199  3e-50  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.121559  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1877  ABC transporter-related protein  39.11 
 
 
260 aa  199  3e-50  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.271075  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2610  ABC transporter related  40.15 
 
 
270 aa  199  3.9999999999999996e-50  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1155  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  41.27 
 
 
255 aa  198  5e-50  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0154079 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3571  ABC transporter related  39.76 
 
 
283 aa  199  5e-50  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0233348 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1384  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  41.34 
 
 
255 aa  199  5e-50  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0818364  normal  0.420206 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3030  ABC transporter related protein  41.77 
 
 
274 aa  198  6e-50  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.096709  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1172  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  40.87 
 
 
255 aa  198  6e-50  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.333486  normal  0.875323 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>