More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmen_4393 on replicon NC_009439
Organism: Pseudomonas mendocina ymp



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009439  Pmen_4393  lysine exporter protein LysE/YggA  100 
 
 		 205 aa  384  1e-106  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.140673 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70510  hypothetical protein  64.56 
 
 		 206 aa  224  5.0000000000000005e-58  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6117  hypothetical protein  64.56 
 
 		 206 aa  223  1e-57  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3021  amino acid transporter LysE  40.62 
 
 		 204 aa  112  3e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.196294  normal  0.164035 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0493  lysine exporter protein LysE/YggA  33.16 
 
 		 219 aa  111  9e-24  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2724  lysine exporter protein LysE/YggA  40.3 
 
 		 204 aa  111  9e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.138868 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2658  lysine exporter protein LysE/YggA  40.1 
 
 		 204 aa  109  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.53678  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3142  amino acid transporter LysE  33.66 
 
 		 218 aa  108  5e-23  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.142315  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2800  lysine exporter protein LysE/YggA  40.43 
 
 		 204 aa  105  6e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.208295  normal  0.25716 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1664  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  37.68 
 
 		 209 aa  93.6  2e-18  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0862458  normal  0.0704615 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0042  lysine exporter protein LysE/YggA  40.57 
 
 		 216 aa  90.9  1e-17  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3488  lysine exporter protein LysE/YggA  33.67 
 
 		 223 aa  90.9  1e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0194  threonine efflux system  34.11 
 
 		 207 aa  89.7  2e-17  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0335584  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1905  lysine exporter protein LysE/YggA  32.67 
 
 		 215 aa  87.8  1e-16  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03702  threonine efflux system  31.25 
 
 		 206 aa  86.3  3e-16  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4190  threonine efflux system  31.25 
 
 		 206 aa  86.3  3e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00587316 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4290  threonine efflux system  31.25 
 
 		 206 aa  86.3  3e-16  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03651  hypothetical protein  31.25 
 
 		 206 aa  86.3  3e-16  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4185  threonine efflux system  31.25 
 
 		 206 aa  86.3  3e-16  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.485697 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4156  homoserine/threonine efflux pump  31.25 
 
 		 206 aa  85.9  4e-16  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3973  threonine efflux system  30.52 
 
 		 206 aa  85.5  5e-16  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.137764  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4047  threonine efflux system  31.22 
 
 		 204 aa  85.1  6e-16  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0989  lysine exporter protein LysE/YggA  31.19 
 
 		 210 aa  85.1  7e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4344  threonine efflux system  31.22 
 
 		 204 aa  85.1  7e-16  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4710  lysine exporter protein LysE/YggA  31.37 
 
 		 209 aa  84.7  8e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.142665 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5264  threonine efflux system  31.22 
 
 		 204 aa  84.7  8e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.613043 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1147  transporter, LysE family  30.69 
 
 		 210 aa  84.3  0.000000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4239  threonine efflux system  29.33 
 
 		 206 aa  84.3  0.000000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.588967  normal  0.890135 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4286  threonine efflux system  30 
 
 		 206 aa  84.7  0.000000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.492935 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2912  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  35.79 
 
 		 215 aa  84.3  0.000000000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4188  threonine efflux system  30 
 
 		 206 aa  84.3  0.000000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4346  threonine efflux system  30 
 
 		 206 aa  84.7  0.000000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.459932  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4167  threonine efflux system  30 
 
 		 206 aa  84.7  0.000000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4153  threonine efflux system  34.98 
 
 		 207 aa  83.6  0.000000000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.000179823  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0243  threonine efflux system  33.17 
 
 		 206 aa  83.2  0.000000000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.569169  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3963  threonine efflux system  34.98 
 
 		 207 aa  83.2  0.000000000000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.245678  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4189  lysine exporter protein LysE/YggA  28.91 
 
 		 212 aa  82.4  0.000000000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3663  lysine exporter protein LysE/YggA  30.88 
 
 		 209 aa  82.4  0.000000000000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4142  lysine exporter protein LysE/YggA  32.12 
 
 		 211 aa  82  0.000000000000006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000225003  hitchhiker  0.0000840644 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1841  lysine exporter protein LysE/YggA  32.67 
 
 		 216 aa  82  0.000000000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000006365 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0009  lysine exporter protein LysE/YggA  28.39 
 
 		 245 aa  81.6  0.000000000000007  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.0108149 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0476  lysine exporter protein LysE/YggA  26.09 
 
 		 209 aa  80.1  0.00000000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0556  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  32.68 
 
 		 204 aa  80.1  0.00000000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3997  threonine efflux system  33.17 
 
 		 206 aa  79.7  0.00000000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5142  lysine exporter protein LysE/YggA  29.47 
 
 		 204 aa  79.7  0.00000000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02071  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  30.43 
 
 		 208 aa  79.7  0.00000000000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0424528  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0717  lysine exporter protein LysE/YggA  34.3 
 
 		 204 aa  79.3  0.00000000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.392476 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1550  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  37.63 
 
 		 225 aa  79.3  0.00000000000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0219  threonine efflux system  33.17 
 
 		 206 aa  79  0.00000000000005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0100  lysine exporter protein LysE/YggA  26.6 
 
 		 213 aa  78.6  0.00000000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0556  threonine efflux system  33.17 
 
 		 206 aa  79  0.00000000000005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2958  threonine efflux protein  27.88 
 
 		 214 aa  78.6  0.00000000000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.10248  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3987  hypothetical protein  36.31 
 
 		 204 aa  78.6  0.00000000000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.178555  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2059  lysine exporter protein LysE/YggA  27.89 
 
 		 211 aa  78.2  0.00000000000007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2482  lysine exporter protein LysE/YggA  34.75 
 
 		 224 aa  78.2  0.00000000000008  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2572  hypothetical protein  29.29 
 
 		 222 aa  78.2  0.00000000000008  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0194  threonine efflux system  31.58 
 
 		 208 aa  77.8  0.0000000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.331917  normal  0.247253 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0233  RhtB family transporter  30.05 
 
 		 209 aa  77  0.0000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0618  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  28.37 
 
 		 211 aa  76.3  0.0000000000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29100  hypothetical protein  36.72 
 
 		 204 aa  75.9  0.0000000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00136638 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2743  lysine exporter protein LysE/YggA  27.78 
 
 		 214 aa  75.5  0.0000000000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0265185  normal  0.024176 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3839  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  33.33 
 
 		 204 aa  75.5  0.0000000000005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06605  putative threonine efflux protein  28.35 
 
 		 203 aa  75.1  0.0000000000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0732  lysine exporter protein LysE/YggA  28.8 
 
 		 204 aa  74.7  0.0000000000008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.831174 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0936  lysine exporter protein LysE/YggA  25.13 
 
 		 212 aa  74.7  0.0000000000008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.950459  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0699  amino acid transporter LysE  28.27 
 
 		 204 aa  74.7  0.0000000000009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0691811  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3644  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  32.55 
 
 		 204 aa  74.3  0.000000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1213  hypothetical protein  30.3 
 
 		 219 aa  73.9  0.000000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3653  hypothetical protein  36 
 
 		 213 aa  74.7  0.000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.345331  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1219  hypothetical protein  30.3 
 
 		 219 aa  73.6  0.000000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3097  lysine exporter protein LysE/YggA  26.7 
 
 		 215 aa  73.6  0.000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3404  lysine exporter protein LysE/YggA  29.02 
 
 		 211 aa  73.2  0.000000000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.325379  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1060  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  30.6 
 
 		 209 aa  71.6  0.000000000008  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.741251  normal  0.078929 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3743  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  25.94 
 
 		 205 aa  71.2  0.000000000009  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4485  lysine exporter protein LysE/YggA  28.49 
 
 		 203 aa  70.9  0.00000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.955446 
 
 
-
 
NC_004310  BR1920  amino acid transporter LysE  26.15 
 
 		 212 aa  71.2  0.00000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007323  GBAA_pXO2_0078  amino acid efflux protein  25.95 
 
 		 205 aa  70.5  0.00000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6528  lysine exporter protein LysE/YggA  29.84 
 
 		 205 aa  71.2  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.28884 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4781  transporter LysE family  36.55 
 
 		 213 aa  70.9  0.00000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.917767  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43570  hypothetical protein  33.02 
 
 		 213 aa  70.9  0.00000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.443465  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1849  amino acid transporter LysE  26.15 
 
 		 212 aa  71.2  0.00000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.402974  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2977  amino acid transporter LysE  28.23 
 
 		 228 aa  70.5  0.00000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2768  lysine exporter protein LysE/YggA  28.85 
 
 		 221 aa  70.5  0.00000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6400  lysine exporter protein LysE/YggA  25.24 
 
 		 215 aa  70.1  0.00000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.436888 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2617  lysine exporter protein LysE/YggA  26.84 
 
 		 204 aa  70.5  0.00000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.635296 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2939  lysine exporter protein LysE/YggA  27.04 
 
 		 214 aa  70.5  0.00000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.419308  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5915  LysE family transporter  29.35 
 
 		 204 aa  70.1  0.00000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.723016 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5674  lysine exporter protein LysE/YggA  29.32 
 
 		 205 aa  70.5  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5694  lysine exporter protein LysE/YggA  30.89 
 
 		 205 aa  70.1  0.00000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.666323 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6038  lysine exporter protein LysE/YggA  29.32 
 
 		 205 aa  70.5  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.133303 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3976  lysine exporter protein LysE/YggA  29.03 
 
 		 205 aa  70.1  0.00000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0215233 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3293  threonine efflux protein, putative  25.82 
 
 		 217 aa  69.7  0.00000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0246  LysE family translocator protein  25.82 
 
 		 217 aa  69.7  0.00000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0428  LysE type translocator  25.82 
 
 		 217 aa  69.7  0.00000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0377494  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2959  putative threonine efflux protein  25.82 
 
 		 217 aa  69.7  0.00000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3387  putative threonine efflux protein  25.82 
 
 		 217 aa  69.7  0.00000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2129  putative threonine efflux protein  25.82 
 
 		 217 aa  69.7  0.00000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4118  RhtB family transporter  24.87 
 
 		 213 aa  69.7  0.00000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1641  lysine exporter protein LysE/YggA  25.71 
 
 		 212 aa  69.3  0.00000000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.950543  normal  0.4347 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3366  lysine exporter protein LysE/YggA  29.49 
 
 		 234 aa  69.3  0.00000000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>