More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plut_1136 on replicon NC_007512
Organism: Chlorobium luteolum DSM 273



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007512  Plut_1136  FecCD transport family protein  100 
 
 
322 aa  605  9.999999999999999e-173  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.500551  normal  0.214464 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1268  transport system permease protein  80.46 
 
 
345 aa  482  1e-135  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1070  transport system permease protein  76.88 
 
 
342 aa  474  1e-133  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1121  transport system permease protein  80.13 
 
 
343 aa  471  1.0000000000000001e-131  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0754  FecCD transport family protein  77.08 
 
 
345 aa  455  1e-127  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.671626  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1266  transport system permease protein  72.79 
 
 
344 aa  427  1e-118  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.594883  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1513  transport system permease protein  70.5 
 
 
341 aa  395  1e-109  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2740  transport system permease protein  46.13 
 
 
333 aa  223  4e-57  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1933  transport system permease protein  39.3 
 
 
330 aa  214  9.999999999999999e-55  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00180  transport system permease protein  38.92 
 
 
337 aa  214  9.999999999999999e-55  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000507964  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0297  transport system permease protein  38.34 
 
 
330 aa  211  9e-54  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.256229  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2061  transport system permease protein  42.91 
 
 
337 aa  209  4e-53  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0286946  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0561  transport system permease protein  41.53 
 
 
346 aa  199  6e-50  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0456  hemin ABC transporter, permease protein  42.01 
 
 
366 aa  195  7e-49  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.288239  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3271  transport system permease protein  39.93 
 
 
370 aa  194  1e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00536194 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0557  transport system permease protein  42.76 
 
 
355 aa  192  4e-48  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3566  transport system permease protein  39.62 
 
 
354 aa  190  2e-47  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4371  transport system permease protein  40.13 
 
 
358 aa  190  2.9999999999999997e-47  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1377  hypothetical protein  37.38 
 
 
315 aa  190  2.9999999999999997e-47  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.0000118421  hitchhiker  0.00624005 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1420  transport system permease protein  41.36 
 
 
361 aa  189  5.999999999999999e-47  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0415  transport system permease protein  41.34 
 
 
357 aa  189  7e-47  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.920967 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_589  ABC-type cobalamin/Fe3+ siderophore transport system, permease component  39.93 
 
 
363 aa  188  9e-47  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0262833  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2366  transport system permease protein  42.12 
 
 
353 aa  188  1e-46  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0591  transport system permease protein  40.45 
 
 
336 aa  187  2e-46  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.26629  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3020  transport system permease protein  39.66 
 
 
370 aa  187  2e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.277606  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0125  transport system permease protein  38.56 
 
 
356 aa  187  2e-46  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0132273  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0986  transport system permease protein  39.07 
 
 
315 aa  186  3e-46  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.991097  normal  0.212421 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0076  transport system permease protein  39.52 
 
 
452 aa  186  5e-46  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0651  ABC-type cobalamin/Fe3+-siderophores transport systems, permease component  39.73 
 
 
334 aa  186  6e-46  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0685  ABC-type cobalamin/Fe3+-siderophores transport systems, permease component  39.73 
 
 
334 aa  186  6e-46  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1546  ABC transporter, inner membrane subunit  38.8 
 
 
387 aa  186  6e-46  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2735  ABC transporter membrane spanning protein (hemin)  38.54 
 
 
361 aa  185  7e-46  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1316  transport system permease protein  43.21 
 
 
338 aa  185  7e-46  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3808  iron chelate ABC transporter permease  39.02 
 
 
330 aa  185  9e-46  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.0360927 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0186  transport system permease protein  35.35 
 
 
362 aa  185  1.0000000000000001e-45  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.129161  normal  0.828954 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2080  transport system permease protein  37.66 
 
 
368 aa  185  1.0000000000000001e-45  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2340  transport system permease protein  40.14 
 
 
371 aa  184  1.0000000000000001e-45  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0621  transport system permease protein  39.04 
 
 
363 aa  184  2.0000000000000003e-45  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.050627  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1942  transport system permease protein  40.07 
 
 
347 aa  184  2.0000000000000003e-45  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.543931  normal  0.0358565 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3892  transport system permease protein  39.52 
 
 
334 aa  183  3e-45  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3306  transport system permease protein  40.19 
 
 
354 aa  183  3e-45  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.205104  hitchhiker  0.000395648 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3804  hemin ABC transporter, permease protein HmuU  39.52 
 
 
334 aa  183  3e-45  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0647  hemin transport system permease HmuU  39.52 
 
 
334 aa  183  3e-45  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.466649 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4865  ABC transporter, iron chelate uptake transporter (FeCT) family, permease protein  39.02 
 
 
318 aa  183  4.0000000000000006e-45  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.737377 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1895  transport system permease protein  36.25 
 
 
336 aa  181  2e-44  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00113354  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2100  transport system permease protein  40.62 
 
 
334 aa  180  2e-44  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1173  iron ABC transporter, permease protein  36.62 
 
 
356 aa  180  2.9999999999999997e-44  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1738  transport system permease protein  38.46 
 
 
330 aa  180  2.9999999999999997e-44  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.922017  normal  0.205881 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3203  transport system permease protein  34.73 
 
 
350 aa  180  4e-44  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0447  transport system permease protein  35.95 
 
 
340 aa  179  4e-44  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.279756  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0256  transport system permease protein  37.54 
 
 
329 aa  180  4e-44  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000493486  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2616  transport system permease protein  37.8 
 
 
367 aa  179  4.999999999999999e-44  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1392  transport system permease protein  38.48 
 
 
340 aa  178  9e-44  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.748601  normal  0.0461748 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2821  transport system permease protein  40.82 
 
 
322 aa  177  2e-43  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.141731  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1473  transport system permease protein  34.73 
 
 
359 aa  176  4e-43  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.766975  normal  0.204191 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3203  putative transmembrane ABC transporter protein,permease  41.96 
 
 
354 aa  176  5e-43  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3251  transport system permease protein  41.36 
 
 
345 aa  176  5e-43  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000970776  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0583  transport system permease protein  33.75 
 
 
331 aa  176  6e-43  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.777741  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0323  putative hemin ABC transporter, permease protein  39.12 
 
 
343 aa  176  6e-43  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00139931  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2166  transport system permease protein  40.28 
 
 
334 aa  176  7e-43  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.514643  normal  0.141154 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4204  transport system permease protein  41.61 
 
 
358 aa  175  7e-43  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.570844  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3606  transport system permease protein  41.84 
 
 
367 aa  175  9.999999999999999e-43  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.438147  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09840  ABC-type Fe3+-siderophore transport system, permease component  39.87 
 
 
390 aa  175  9.999999999999999e-43  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.125008  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0605  transport system permease protein  45.36 
 
 
340 aa  174  1.9999999999999998e-42  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4564  transport system permease protein  41 
 
 
340 aa  174  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1565  transport system permease protein  37.98 
 
 
355 aa  174  2.9999999999999996e-42  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.435862  normal  0.696259 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1297  iron chelate ABC transporter permease protein  35.87 
 
 
343 aa  173  2.9999999999999996e-42  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0147613  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2874  transport system permease protein  38.69 
 
 
360 aa  173  3.9999999999999995e-42  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3536  transport system permease protein  37.41 
 
 
368 aa  173  3.9999999999999995e-42  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.764032  normal  0.443076 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1932  transport system permease protein  37.07 
 
 
356 aa  172  5.999999999999999e-42  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1943  transport system permease protein  35.79 
 
 
338 aa  172  5.999999999999999e-42  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0868  transport system permease protein  37.58 
 
 
322 aa  172  5.999999999999999e-42  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1538  transport system permease protein  36.27 
 
 
341 aa  172  6.999999999999999e-42  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2167  transport system permease protein  40.07 
 
 
341 aa  172  1e-41  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0116294  normal  0.228639 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0603  transport system permease protein  38.54 
 
 
316 aa  171  1e-41  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.39796  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0443  transport system permease protein  39.3 
 
 
355 aa  172  1e-41  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0152  transport system permease protein  40.91 
 
 
351 aa  171  2e-41  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1606  transport system permease protein  36.56 
 
 
368 aa  171  2e-41  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  unclonable  0.000000330558 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2211  transport system permease protein  39.22 
 
 
350 aa  171  2e-41  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0039  transport system permease protein  37.05 
 
 
323 aa  171  2e-41  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00831442  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1753  transport system permease protein  40.64 
 
 
348 aa  171  2e-41  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000172591  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0252  transport system permease protein  40.79 
 
 
312 aa  171  2e-41  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2385  FecCD-family membrane transport protein  36 
 
 
367 aa  170  3e-41  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.567541  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0845  transport system permease protein  37.26 
 
 
322 aa  170  3e-41  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1121  transport system permease protein  36.65 
 
 
372 aa  170  3e-41  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0471477  hitchhiker  0.00000000101745 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1116  ABC transporter permease  34.65 
 
 
343 aa  170  3e-41  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0402  transport system permease protein  39.38 
 
 
352 aa  169  5e-41  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0167  transport system permease protein  39.65 
 
 
361 aa  169  6e-41  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4112  iron compound ABC transporter, permease  37.71 
 
 
345 aa  169  7e-41  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3104  iron compound ABC transporter, permease protein  40.48 
 
 
359 aa  169  7e-41  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1290  hypothetical protein  37.41 
 
 
350 aa  169  8e-41  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.385136 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0749  iron compound ABC transporter, permease protein  38.72 
 
 
342 aa  168  9e-41  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2493  corrinoid ABC transporter permease  39.12 
 
 
373 aa  168  1e-40  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0179  transport system permease protein  38.94 
 
 
326 aa  167  2e-40  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4487  iron compound ABC transporter, permease protein  38.26 
 
 
342 aa  167  2e-40  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7223  transport system permease protein  40 
 
 
351 aa  167  2e-40  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4501  iron compound ABC transporter, permease protein  37.37 
 
 
342 aa  167  2e-40  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0445  transport system permease protein  37.63 
 
 
336 aa  167  2e-40  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1968  transport system permease protein  38.52 
 
 
365 aa  167  2.9999999999999998e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0417  transport system permease protein  40.56 
 
 
344 aa  167  2.9999999999999998e-40  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>