94 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plut_1003 on replicon NC_007512
Organism: Chlorobium luteolum DSM 273



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007512  Plut_1003  hypothetical protein  100 
 
 
196 aa  401  1e-111  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.117242 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1216  protein of unknown function DUF218  56.12 
 
 
196 aa  249  1e-65  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000413314  decreased coverage  0.000114911 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1349  protein of unknown function DUF218  60.96 
 
 
196 aa  247  9e-65  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0844  hypothetical protein  54.59 
 
 
219 aa  238  2.9999999999999997e-62  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.527132  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0953  protein of unknown function DUF218  55.61 
 
 
197 aa  237  5.999999999999999e-62  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.954298  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1378  protein of unknown function DUF218  59.2 
 
 
196 aa  234  7e-61  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.2531  hitchhiker  0.00903728 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1489  hypothetical protein  56.42 
 
 
235 aa  226  1e-58  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000603911  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0467  hypothetical protein  29.21 
 
 
264 aa  84.3  0.000000000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1152  protein of unknown function DUF218  29.17 
 
 
245 aa  64.3  0.000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.104953  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0369  Bme2 protein  36.07 
 
 
205 aa  63.9  0.000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.16316  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0426  Bme2 protein  36.07 
 
 
205 aa  63.9  0.000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0911545  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2339  protein of unknown function DUF218  35.96 
 
 
190 aa  61.6  0.000000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.196018 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03633  hypothetical protein  31.82 
 
 
205 aa  60.5  0.00000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2729  protein of unknown function DUF218  35.96 
 
 
192 aa  60.5  0.00000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  decreased coverage  0.00326918  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2730  protein of unknown function DUF218  32.43 
 
 
279 aa  60.1  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.111496 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0820  hypothetical protein  31.36 
 
 
182 aa  58.2  0.00000008  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0924  hypothetical protein  31.36 
 
 
182 aa  58.2  0.00000008  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1340  protein of unknown function DUF218  28.28 
 
 
208 aa  57.8  0.00000009  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3653  hypothetical protein  28.57 
 
 
191 aa  57.8  0.0000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4635  hypothetical protein  31.76 
 
 
189 aa  57  0.0000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.940029  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2982  hypothetical protein  29.07 
 
 
258 aa  57  0.0000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.216517  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1343  hypothetical protein  27.55 
 
 
213 aa  57  0.0000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.747417 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1127  hypothetical protein  34.33 
 
 
252 aa  56.2  0.0000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3520  hypothetical protein  29.13 
 
 
263 aa  55.8  0.0000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2460  putative transmembrane protein  38.2 
 
 
185 aa  55.5  0.0000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.919961  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2482  hypothetical protein  29.85 
 
 
218 aa  55.5  0.0000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.341723 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1684  protein of unknown function DUF218  27.59 
 
 
195 aa  53.9  0.000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2611  hypothetical protein  29.56 
 
 
202 aa  53.9  0.000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2193  hypothetical protein  27.06 
 
 
245 aa  53.5  0.000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.123189  normal  0.691165 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0643  hypothetical protein  27.43 
 
 
192 aa  53.9  0.000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3378  hypothetical protein  32.81 
 
 
206 aa  53.5  0.000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.620452  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1976  protein of unknown function DUF218  25.85 
 
 
199 aa  52.8  0.000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.05946  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0485  hypothetical protein  29.12 
 
 
225 aa  52.8  0.000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2846  hypothetical protein  31.1 
 
 
280 aa  52.4  0.000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4400  hypothetical protein  26.37 
 
 
273 aa  52  0.000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.846693  normal  0.269801 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2597  hypothetical protein  28.31 
 
 
207 aa  51.2  0.000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2970  protein of unknown function DUF218  29.94 
 
 
211 aa  51.2  0.00001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.606259  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0399  hypothetical protein  26.77 
 
 
263 aa  50.4  0.00002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.30478 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0237  hypothetical protein  28 
 
 
210 aa  50.1  0.00002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2287  protein of unknown function DUF218  32.33 
 
 
259 aa  50.1  0.00002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1119  hypothetical protein  30.46 
 
 
237 aa  50.1  0.00002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0242849  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0732  hypothetical protein  26.21 
 
 
211 aa  50.1  0.00002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0925  hypothetical protein  25.18 
 
 
215 aa  50.1  0.00002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.816716  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1708  hypothetical protein  32.52 
 
 
190 aa  50.4  0.00002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.100199  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1302  hypothetical protein  24.34 
 
 
215 aa  49.3  0.00003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0955164  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1020  protein of unknown function DUF218  32.2 
 
 
242 aa  49.3  0.00004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3480  H+/gluconate symporter and related permease-like protein  27.27 
 
 
187 aa  48.9  0.00004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.266773 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4689  protein of unknown function DUF218  29.85 
 
 
262 aa  49.3  0.00004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.584502  normal  0.95613 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1189  hypothetical protein  32.61 
 
 
258 aa  49.3  0.00004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4260  hypothetical protein  26.9 
 
 
193 aa  48.5  0.00006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0049  protein of unknown function DUF218  24.6 
 
 
185 aa  48.5  0.00007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.291592  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0864  hypothetical protein  26.17 
 
 
315 aa  48.1  0.00008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.898014  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1689  hypothetical protein  29.23 
 
 
176 aa  47.4  0.0001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.143634  normal  0.399616 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4822  hypothetical protein  24.29 
 
 
215 aa  47.4  0.0001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.953087  normal  0.244929 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0105  putative secreted protein  40.82 
 
 
249 aa  47.8  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0103  hypothetical protein  40.82 
 
 
237 aa  47.4  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.501432  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4472  hypothetical protein  33.7 
 
 
263 aa  47.4  0.0001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.875685  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1158  hypothetical protein  29.8 
 
 
237 aa  47.8  0.0001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00819427  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4868  hypothetical protein  28.85 
 
 
202 aa  47.8  0.0001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2261  protein of unknown function DUF218  32.22 
 
 
181 aa  46.6  0.0002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0104  putative secreted protein  40.82 
 
 
206 aa  47  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.900889  normal  0.196325 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3832  protein of unknown function DUF218  27.68 
 
 
210 aa  47.4  0.0002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2233  hypothetical protein  23.27 
 
 
199 aa  47  0.0002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0295734  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3157  hypothetical protein  22.89 
 
 
199 aa  46.6  0.0002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000253328  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0110  putative secreted protein  40.82 
 
 
206 aa  46.2  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.741627 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0454  protein of unknown function DUF218  27.56 
 
 
265 aa  46.2  0.0003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.28276  normal  0.0360985 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2322  hypothetical protein  23 
 
 
200 aa  46.2  0.0003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000278714  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0441  protein of unknown function DUF218  27.56 
 
 
265 aa  46.2  0.0003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1019  hypothetical protein  27.43 
 
 
461 aa  45.1  0.0007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000506367  unclonable  0.00000000514024 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3127  hypothetical protein  30.09 
 
 
210 aa  45.1  0.0007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.226539  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0452  protein of unknown function DUF218  25.98 
 
 
260 aa  45.1  0.0007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3129  hypothetical protein  30.09 
 
 
210 aa  44.3  0.001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00135729  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2141  hypothetical protein  29.41 
 
 
210 aa  44.3  0.001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1666  hypothetical protein  27.48 
 
 
246 aa  43.9  0.001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2819  hypothetical protein  30.09 
 
 
210 aa  44.3  0.001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1055  protein of unknown function DUF218  24.12 
 
 
195 aa  44.3  0.001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000273108 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0148  hypothetical protein  25.58 
 
 
251 aa  43.5  0.002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.692112  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3095  hypothetical protein  28.57 
 
 
210 aa  43.5  0.002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.937684  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2890  hypothetical protein  28.57 
 
 
210 aa  43.5  0.002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00431016  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2858  hypothetical protein  28.57 
 
 
210 aa  43.5  0.002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00183972  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2122  hypothetical protein  30.09 
 
 
228 aa  43.1  0.002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0673185  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3103  protein of unknown function DUF218  26.12 
 
 
256 aa  43.1  0.002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  unclonable  0.0000000000000591337  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0699  hypothetical protein  25.16 
 
 
182 aa  43.5  0.002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.514208  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3110  hypothetical protein  28.57 
 
 
210 aa  43.5  0.002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3106  hypothetical protein  28.57 
 
 
210 aa  43.5  0.002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.866641  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1256  hypothetical protein  27.69 
 
 
195 aa  42.7  0.003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.202454  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3011  hypothetical protein  32 
 
 
177 aa  43.1  0.003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3208  protein of unknown function DUF218  22.05 
 
 
196 aa  42.4  0.004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.00000000349402  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2882  hypothetical protein  29.2 
 
 
210 aa  42.4  0.004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0452063  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1763  hypothetical protein  34.07 
 
 
252 aa  42.7  0.004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.478051 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1366  hypothetical protein  29.1 
 
 
266 aa  42.4  0.004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.90388  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2745  protein of unknown function DUF218  19.59 
 
 
230 aa  41.6  0.008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4882  hypothetical protein  28.81 
 
 
219 aa  41.2  0.01  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000000000206501 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0578  hypothetical protein  25.38 
 
 
241 aa  41.2  0.01  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>