More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_3807 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014148  Plim_3807  MotA/TolQ/ExbB proton channel  100 
 
 
324 aa  644    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3762  MotA/TolQ/ExbB proton channel  39.63 
 
 
268 aa  157  2e-37  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.457209  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3131  MotA/TolQ/ExbB proton channel  34.33 
 
 
274 aa  136  6.0000000000000005e-31  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1238  MotA/TolQ/ExbB proton channel  33.51 
 
 
263 aa  95.5  1e-18  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.426551  normal  0.407525 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1521  MotA/TolQ/ExbB proton channel  32.94 
 
 
238 aa  93.2  5e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.565129  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06640  putative biopolymer transport protein  31.79 
 
 
228 aa  92  1e-17  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.304214  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2890  MotA/TolQ/ExbB proton channel  32.94 
 
 
257 aa  90.9  3e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000981257 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0746  MotA/TolQ/ExbB proton channel  27.82 
 
 
339 aa  90.1  4e-17  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4455  MotA/TolQ/ExbB proton channel  30.37 
 
 
226 aa  89  9e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1369  MotA/TolQ/ExbB proton channel  31.86 
 
 
206 aa  86.7  5e-16  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2673  MotA/TolQ/ExbB proton channel  30.6 
 
 
253 aa  85.5  0.000000000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1976  MotA/TolQ/ExbB proton channel  31.07 
 
 
234 aa  84.7  0.000000000000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.254375  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1436  MotA/TolQ/ExbB proton channel  29.91 
 
 
218 aa  82.8  0.000000000000008  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.383265  normal  0.726638 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4446  MotA/TolQ/ExbB proton channel  29.38 
 
 
224 aa  80.1  0.00000000000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4310  MotA/TolQ/ExbB proton channel  29.38 
 
 
224 aa  80.1  0.00000000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4465  MotA/TolQ/ExbB proton channel  29.38 
 
 
224 aa  80.1  0.00000000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.163965  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11810  MotA/TolQ/ExbB proton channel  35.78 
 
 
216 aa  79.7  0.00000000000006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0591  MotA/TolQ/ExbB proton channel  30.05 
 
 
214 aa  79.3  0.00000000000008  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.0990686 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0460  MotA/TolQ/ExbB proton channel  27 
 
 
230 aa  79  0.00000000000009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0548  MotA/TolQ/ExbB proton channel  31.61 
 
 
263 aa  78.6  0.0000000000001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.477361  normal  0.119792 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3563  ATPase  36.36 
 
 
220 aa  77.8  0.0000000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.363023  normal  0.586206 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0561  MotA/TolQ/ExbB proton channel  37.5 
 
 
199 aa  78.2  0.0000000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.305166 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2119  Tol-Pal system TolQ  44.33 
 
 
241 aa  77.4  0.0000000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.145493  normal  0.278172 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2566  MotA/TolQ/ExbB proton channel  30.26 
 
 
208 aa  77.4  0.0000000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.11709  decreased coverage  0.00204386 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0537  MotA/TolQ/ExbB proton channel  31.58 
 
 
206 aa  77.4  0.0000000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000000013307  unclonable  0.0000000588107 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2553  MotA/TolQ/ExbB proton channel  32.26 
 
 
192 aa  77.4  0.0000000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00158299 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3572  MotA/TolQ/ExbB proton channel  31.12 
 
 
210 aa  77.4  0.0000000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0594941  decreased coverage  0.0034613 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2643  MotA/TolQ/ExbB proton channel  28.36 
 
 
210 aa  77  0.0000000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.232186  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3217  MotA/TolQ/ExbB proton channel  29.73 
 
 
202 aa  76.6  0.0000000000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.581955  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1153  MotA/TolQ/ExbB proton channel family protein  33.92 
 
 
457 aa  76.3  0.0000000000006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2150  MotA/TolQ/ExbB proton channel  27.94 
 
 
208 aa  76.3  0.0000000000007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.162411  normal  0.347505 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3906  MotA/TolQ/ExbB proton channel  26.9 
 
 
196 aa  75.5  0.000000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.286845  normal  0.293846 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4405  MotA/TolQ/ExbB proton channel  33.82 
 
 
221 aa  75.5  0.000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0344768  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1588  MotA/TolQ/ExbB proton channel family protein  29.32 
 
 
248 aa  75.5  0.000000000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.0169562 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0331  MotA/TolQ/ExbB proton channel  32.39 
 
 
232 aa  75.1  0.000000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0399463  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1248  MotA/TolQ/ExbB proton channel  27.93 
 
 
210 aa  74.7  0.000000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2391  biopolymer transport protein  33.15 
 
 
234 aa  74.7  0.000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6479  MotA/TolQ/ExbB proton channel  28.97 
 
 
237 aa  75.1  0.000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.691155  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0631  MotA/TolQ/ExbB proton channel family protein  29.38 
 
 
204 aa  74.3  0.000000000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.793155  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2153  transport protein TolQ-like  27.08 
 
 
474 aa  74.3  0.000000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.337835  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0904  Biopolymer transport protein TolR  30.43 
 
 
453 aa  73.9  0.000000000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0485  MotA/TolQ/ExbB proton channel family protein  31.29 
 
 
206 aa  73.6  0.000000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.18294  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0645  MotA/TolQ/ExbB proton channel  31.29 
 
 
206 aa  73.6  0.000000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.557109  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06759  hypothetical protein  31.79 
 
 
455 aa  73.6  0.000000000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2483  putative biopolymer transport exbB-like transmembrane protein  29 
 
 
213 aa  73.2  0.000000000006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0658113  normal  0.425168 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3210  MotA/TolQ/ExbB proton channel  29.05 
 
 
201 aa  73.2  0.000000000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000028591  normal  0.177382 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0442  MotA/TolQ/ExbB proton channel  30.82 
 
 
211 aa  73.2  0.000000000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3073  MotA/TolQ/ExbB proton channel  30.19 
 
 
211 aa  73.2  0.000000000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2092  MotA/TolQ/ExbB proton channel  29.73 
 
 
204 aa  73.2  0.000000000006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0117508  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0595  MotA/TolQ/ExbB proton channel  33.73 
 
 
231 aa  72  0.00000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.0000000225479  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1556  MotA/TolQ/ExbB proton channel  27.27 
 
 
212 aa  72  0.00000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.25632  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0112  biopolymer transport protein TolR  29.9 
 
 
451 aa  71.6  0.00000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1464  hypothetical protein  26.42 
 
 
229 aa  72.4  0.00000000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2303  MotA/TolQ/ExbB proton channel  27.27 
 
 
212 aa  72  0.00000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.466313  normal  0.0952346 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2214  MotA/TolQ/ExbB proton channel  29.72 
 
 
232 aa  72.4  0.00000000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0436  MotA/TolQ/ExbB proton channel family protein  39.68 
 
 
403 aa  71.6  0.00000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0887055  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2941  protein TolQ  28.7 
 
 
236 aa  71.6  0.00000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3153  MotA/TolQ/ExbB proton channel  26.21 
 
 
221 aa  71.2  0.00000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2061  MotA/TolQ/ExbB proton channel  34.62 
 
 
209 aa  71.6  0.00000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.590103 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0136  protein TolQ  31.11 
 
 
232 aa  71.2  0.00000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1810  MotA/TolQ/ExbB proton channel  31.44 
 
 
235 aa  70.9  0.00000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.894281  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5938  MotA/TolQ/ExbB proton channel  25.14 
 
 
236 aa  70.9  0.00000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000847  MotA/TolQ/ExbB proton channel family protein  39.32 
 
 
455 aa  70.9  0.00000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2528  biopolymer transport EXBB-like transmembrane protein  27.6 
 
 
206 aa  70.1  0.00000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.0033963  normal  0.0481325 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2261  protein TolQ  30.05 
 
 
233 aa  70.5  0.00000000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.267713  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2771  MotA/TolQ/ExbB proton channel  30.05 
 
 
233 aa  70.5  0.00000000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.978169 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1754  MotA/TolQ/ExbB proton channel  31.96 
 
 
230 aa  70.5  0.00000000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.0443122 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0633  MotA/TolQ/ExbB proton channel  33.75 
 
 
248 aa  70.1  0.00000000005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3975  tolQ protein  32.51 
 
 
231 aa  69.7  0.00000000007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0234616  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1412  MotA/TolQ/ExbB proton channel  32.51 
 
 
231 aa  69.7  0.00000000007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0108204  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1510  exbB-like biopolymer transport  28.42 
 
 
201 aa  69.7  0.00000000007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.232406  normal  0.284557 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3253  tolQ protein  29.76 
 
 
262 aa  69.3  0.00000000009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02770  MotA/TolQ/ExbB proton channel family protein  30.3 
 
 
246 aa  68.9  0.0000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1532  hypothetical protein  33.58 
 
 
224 aa  68.6  0.0000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1451  hypothetical protein  33.58 
 
 
224 aa  68.6  0.0000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4648  MotA/TolQ/ExbB proton channel  25.81 
 
 
218 aa  68.9  0.0000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.388023  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00636  biopolymer transport protein  35.21 
 
 
453 aa  68.9  0.0000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1738  MotA/TolQ/ExbB proton channel  37.93 
 
 
576 aa  68.9  0.0000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000125272  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0245  MotA/TolQ/ExbB proton channel  28.22 
 
 
235 aa  68.9  0.0000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1219  biopolymer transport protein TolQ  35.95 
 
 
231 aa  67.8  0.0000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.712744  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4891  MotA/TolQ/ExbB proton channel  30.88 
 
 
216 aa  68.6  0.0000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.333569 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1376  tolQ protein  28.5 
 
 
225 aa  68.6  0.0000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0482994  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4199  protein TolQ  35.95 
 
 
231 aa  67.8  0.0000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.40323  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3996  protein TolQ  35.95 
 
 
231 aa  67.8  0.0000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.523638  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0390  MotA/TolQ/ExbB proton channel  38.78 
 
 
227 aa  68.2  0.0000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2957  biopolymer transport proteins-like  29.3 
 
 
242 aa  68.2  0.0000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1248  Tol-Pal system, TolQ  35.95 
 
 
231 aa  67.8  0.0000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.216384  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0830  tolQ protein  28.02 
 
 
225 aa  67.8  0.0000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3238  MotA/TolQ/ExbB proton channel family protein  28.02 
 
 
225 aa  67.8  0.0000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.923457  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2664  tolQ protein  28.02 
 
 
225 aa  67.8  0.0000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2078  tolQ protein  28.02 
 
 
225 aa  67.8  0.0000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001857  MotA/TolQ/ExbB proton channel family protein  35.11 
 
 
453 aa  67.4  0.0000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3200  MotA/TolQ/ExbB proton channel family protein  28.02 
 
 
225 aa  67.8  0.0000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.949255  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1654  MotA/TolQ/ExbB proton channel  28.21 
 
 
480 aa  67.4  0.0000000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.759397  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1946  tolQ protein  28.02 
 
 
225 aa  67.8  0.0000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0732  TOLQ-like transport transmembrane protein  30.59 
 
 
230 aa  67  0.0000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.682761 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2227  MotA/TolQ/ExbB proton channel  29.38 
 
 
233 aa  67  0.0000000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.260682  hitchhiker  0.000349255 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2178  putative tolQ-type transport protein  29.34 
 
 
211 aa  67  0.0000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25490  putative tolQ-type transport protein  29.34 
 
 
211 aa  67  0.0000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0178753  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2232  TolQ protein  28.24 
 
 
228 aa  67  0.0000000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>