More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_1844 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014148  Plim_1844  AAA ATPase central domain protein  100 
 
 		 665 aa  1335    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3749  AAA ATPase central domain-containing protein  37.65 
 
 		 503 aa  335  1e-90  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1047  AAA ATPase, central region  38.83 
 
 		 506 aa  335  2e-90  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.696597  normal  0.0936811 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0893  AAA ATPase central domain protein  37.93 
 
 		 504 aa  329  1.0000000000000001e-88  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.549048  normal  0.168181 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3458  AAA ATPase central domain protein  38.28 
 
 		 503 aa  326  8.000000000000001e-88  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2646  AAA ATPase central domain protein  38.28 
 
 		 503 aa  326  8.000000000000001e-88  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0291  AAA ATPase  39.44 
 
 		 512 aa  322  9.999999999999999e-87  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.678882  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4640  AAA ATPase central domain protein  38.26 
 
 		 503 aa  322  9.999999999999999e-87  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.0000000053789 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0302  AAA ATPase central domain protein  39 
 
 		 512 aa  321  3e-86  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0417  ATPase  39.22 
 
 		 502 aa  318  2e-85  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0313  AAA ATPase central domain protein  38.83 
 
 		 512 aa  317  3e-85  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3615  AAA ATPase central domain protein  38.51 
 
 		 553 aa  315  1.9999999999999998e-84  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.109268  hitchhiker  0.000690649 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4767  AAA ATPase, central region  36.98 
 
 		 503 aa  313  5.999999999999999e-84  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1022  ATPase central domain-containing protein  36.94 
 
 		 545 aa  305  1.0000000000000001e-81  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4713  AAA ATPase, central region  35.53 
 
 		 499 aa  301  2e-80  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.291026  normal  0.652481 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1180  AAA ATPase central domain protein  36.42 
 
 		 550 aa  301  3e-80  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.66329 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_13801  AAA family ATPase  35.31 
 
 		 488 aa  296  1e-78  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_13591  AAA family ATPase  36.38 
 
 		 488 aa  296  1e-78  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  decreased coverage  0.00808857  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1288  ATPase  35.31 
 
 		 488 aa  290  4e-77  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.478688  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_13881  ATPase  35.31 
 
 		 488 aa  289  9e-77  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.522356  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1374  AAA ATPase  34.29 
 
 		 492 aa  289  9e-77  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3488  AAA ATPase central domain protein  34.87 
 
 		 507 aa  289  1e-76  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2426  AAA ATPase central domain protein  35.85 
 
 		 515 aa  287  5e-76  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0261644 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1939  ATPase central domain-containing protein  36.4 
 
 		 552 aa  287  5.999999999999999e-76  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.208257  normal  0.282616 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_12741  AAA family ATPase  36.38 
 
 		 492 aa  286  1.0000000000000001e-75  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00599105 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1248  AAA ATPase, central region  33.07 
 
 		 503 aa  285  1.0000000000000001e-75  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0962  AAA ATPase central domain protein  32.14 
 
 		 504 aa  285  2.0000000000000002e-75  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.20227 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1789  ATPase  38.65 
 
 		 496 aa  284  4.0000000000000003e-75  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.255516  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0575  ATPase  38.65 
 
 		 496 aa  283  5.000000000000001e-75  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1719  AAA ATPase central domain protein  33.06 
 
 		 504 aa  280  6e-74  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0693  AAA ATPase central domain-containing protein  33.67 
 
 		 503 aa  280  6e-74  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1743  AAA ATPase central domain protein  33.06 
 
 		 504 aa  280  6e-74  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0806  ATPase  36.88 
 
 		 492 aa  278  2e-73  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.438855  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1285  AAA ATPase  42.13 
 
 		 499 aa  278  2e-73  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.248545  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_16611  ATPase  36.69 
 
 		 492 aa  278  2e-73  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0345103  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4098  AAA ATPase central domain protein  35.6 
 
 		 537 aa  277  6e-73  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.344452  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0681  putative AAA ATPase  34.13 
 
 		 495 aa  274  5.000000000000001e-72  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0097  AAA ATPase central domain protein  36.84 
 
 		 494 aa  273  1e-71  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0174447  decreased coverage  0.00506367 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1620  ATPase  35.12 
 
 		 501 aa  270  4e-71  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.0766271 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5282  AAA ATPase central domain-containing protein  35.02 
 
 		 512 aa  270  5.9999999999999995e-71  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2671  AAA ATPase central domain protein  40.92 
 
 		 499 aa  270  8.999999999999999e-71  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.258289  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2575  AAA ATPase central domain protein  40.92 
 
 		 499 aa  269  1e-70  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.63307  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3939  ATPase central domain-containing protein  35.09 
 
 		 493 aa  268  2e-70  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3100  ATPase central domain-containing protein  33.4 
 
 		 495 aa  268  2.9999999999999995e-70  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.316847 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3297  AAA ATPase central domain protein  33.6 
 
 		 503 aa  267  4e-70  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.968695 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1062  ATPase central domain-containing protein  33.4 
 
 		 516 aa  266  8e-70  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3019  ATPase central domain-containing protein  33.2 
 
 		 521 aa  266  8.999999999999999e-70  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0530491 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1095  ATPase central domain-containing protein  33.4 
 
 		 503 aa  266  1e-69  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.457957 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1233  AAA ATPase central domain protein  38.97 
 
 		 510 aa  265  1e-69  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.627441  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2804  AAA family ATPase  33.33 
 
 		 490 aa  265  2e-69  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1030  AAA ATPase central domain protein  38.73 
 
 		 512 aa  264  3e-69  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0992  ATPase central domain-containing protein  33.2 
 
 		 503 aa  264  4e-69  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3196  ATPase central domain-containing protein  33 
 
 		 519 aa  264  4e-69  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.201508 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3611  AAA family ATPase  34.34 
 
 		 495 aa  263  8e-69  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2260  ATPase central domain-containing protein  38.21 
 
 		 512 aa  262  2e-68  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1322  AAA ATPase central domain protein  37.35 
 
 		 517 aa  261  2e-68  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00704863 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_06071  ATPase  36.38 
 
 		 496 aa  258  2e-67  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.15425 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08430  putative ATPase  37.32 
 
 		 493 aa  255  2.0000000000000002e-66  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000435848 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0798  putative ATPase  37.32 
 
 		 493 aa  252  2e-65  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0892  ATPase central domain-containing protein  33.07 
 
 		 489 aa  251  2e-65  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0191229  normal  0.946519 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2480  ATPase central domain-containing protein  39.81 
 
 		 500 aa  251  3e-65  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.13902 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0874  ATPase central domain-containing protein  34.47 
 
 		 491 aa  249  1e-64  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000104928  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0908  AAA family ATPase  31.94 
 
 		 509 aa  248  3e-64  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0977  ATPase central domain-containing protein  32.21 
 
 		 489 aa  246  9.999999999999999e-64  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.30192  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2170  ATPase central domain-containing protein  35.21 
 
 		 498 aa  244  3e-63  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1025  ATPase central domain-containing protein  32.73 
 
 		 489 aa  241  2.9999999999999997e-62  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0837246  normal  0.0386673 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0759  putative ATPase  31.88 
 
 		 497 aa  241  5e-62  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.313507 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1957  ATPase central domain-containing protein  32.6 
 
 		 517 aa  237  4e-61  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2745  AAA family ATPase  34.74 
 
 		 495 aa  236  1.0000000000000001e-60  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0905  AAA ATPase, central region  31.8 
 
 		 491 aa  234  3e-60  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00241142 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2247  AAA ATPase central domain protein  35.75 
 
 		 499 aa  202  9.999999999999999e-51  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.130366  decreased coverage  0.000121298 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0267  ATPase  35.14 
 
 		 540 aa  200  7.999999999999999e-50  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.775608  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1090  AAA ATPase central domain protein  30.41 
 
 		 501 aa  197  6e-49  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3041  AAA ATPase central domain protein  30.82 
 
 		 492 aa  194  5e-48  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.649178  n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5692  AAA ATPase central domain protein  31.93 
 
 		 509 aa  167  5.9999999999999996e-40  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.698279 
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5453  AAA ATPase central domain protein  31.93 
 
 		 509 aa  167  5.9999999999999996e-40  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.821178 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2214  AAA ATPase, central region  31.41 
 
 		 534 aa  162  3e-38  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.17049 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5394  AAA ATPase central domain protein  30.67 
 
 		 471 aa  147  4.0000000000000006e-34  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0036  ATPase  28.71 
 
 		 548 aa  137  6.0000000000000005e-31  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.503133  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0030  ATPase  32.36 
 
 		 545 aa  131  4.0000000000000003e-29  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.141323 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2407  AAA ATPase, central region  27.08 
 
 		 540 aa  118  3e-25  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0784  putative cell division protein FtsH  30.13 
 
 		 538 aa  115  3e-24  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.331758  n/a   
 
 
-
 
NC_009045  PICST_32083  AAA ATPase  31.78 
 
 		 832 aa  114  8.000000000000001e-24  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.190339 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1023  cell division protein FtsH, putative  30.63 
 
 		 538 aa  112  3e-23  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.343665  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0634  ATPase central domain-containing protein  32.29 
 
 		 599 aa  110  7.000000000000001e-23  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.527117  normal  0.730431 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_67138  Cell division control protein 48  33.49 
 
 		 829 aa  109  1e-22  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.0876334 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7058  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  30.08 
 
 		 704 aa  107  6e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1809  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  29.03 
 
 		 736 aa  107  7e-22  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006679  CNJ02750  MMS2, putative  29.06 
 
 		 810 aa  107  7e-22  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2570  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  32.35 
 
 		 754 aa  107  1e-21  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0681  AAA ATPase central domain protein  27.66 
 
 		 567 aa  106  1e-21  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00704471  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1068  putative cell division protease FtsH-like protein  28.57 
 
 		 556 aa  107  1e-21  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.427704  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0215  vesicle-fusing ATPase  32.82 
 
 		 513 aa  107  1e-21  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2321  cell division control protein 48 AAA family protein  30.71 
 
 		 775 aa  105  2e-21  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1780  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  27.04 
 
 		 740 aa  106  2e-21  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.363046  normal  0.250339 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1085  cell division protein FtsH, putative  30.63 
 
 		 538 aa  105  3e-21  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1658  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  29.58 
 
 		 737 aa  105  3e-21  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.814127 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1351  M41 family peptidase  28.57 
 
 		 558 aa  105  3e-21  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  unclonable  0.000179169  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2344  Vesicle-fusing ATPase  31.21 
 
 		 703 aa  104  4e-21  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.935246  normal  1 
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_50978  predicted protein  28.68 
 
 		 930 aa  105  4e-21  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>