More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_2642 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009719  Plav_2642  enoyl-CoA hydratase/isomerase  100 
 
 
235 aa  463  1e-129  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.627312  normal  0.778271 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02638  Enoyl-CoA hydratase/carnithine racemase  48.11 
 
 
218 aa  195  4.0000000000000005e-49  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3560  enoyl-CoA hydratase  43.84 
 
 
229 aa  180  2e-44  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2045  enoyl-CoA hydratase  41.55 
 
 
230 aa  177  1e-43  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.159168  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41950  enoyl-CoA hydratase  44.29 
 
 
229 aa  177  2e-43  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2108  enoyl-CoA hydratase  42.6 
 
 
229 aa  174  8e-43  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.430525  normal  0.0139564 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1845  enoyl-CoA hydratase  46.01 
 
 
229 aa  169  4e-41  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.429815  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3865  enoyl-CoA hydratase  45.54 
 
 
229 aa  168  7e-41  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.522354  normal  0.0342792 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2282  enoyl-CoA hydratase  41.23 
 
 
237 aa  164  1.0000000000000001e-39  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.669843  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1423  enoyl-CoA hydratase  45.54 
 
 
229 aa  163  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.293032  normal  0.655993 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1454  enoyl-CoA hydratase  42.59 
 
 
229 aa  163  3e-39  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3837  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  48.39 
 
 
238 aa  162  4.0000000000000004e-39  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2912  enoyl-CoA hydratase  39.55 
 
 
252 aa  159  3e-38  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00810936  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1744  enoyl-CoA hydratase  41.55 
 
 
229 aa  158  7e-38  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.216387  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0587  enoyl-CoA hydratase  42.29 
 
 
229 aa  157  2e-37  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2065  enoyl-CoA hydratase/isomerase family protein  39.55 
 
 
229 aa  153  2e-36  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0898876  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1875  enoyl-CoA hydratase  38.18 
 
 
229 aa  147  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0736  enoyl-CoA hydratase  36.65 
 
 
231 aa  136  3.0000000000000003e-31  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.788882  normal  0.311118 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10643  enoyl-CoA hydratase  36.73 
 
 
231 aa  134  9.999999999999999e-31  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000313119  normal  0.0554136 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5125  enoyl-CoA hydratase  38.63 
 
 
233 aa  129  6e-29  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1226  enoyl-CoA hydratase  38.26 
 
 
233 aa  123  2e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.146612  normal  0.418232 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0928  enoyl-CoA hydratase  37.18 
 
 
248 aa  120  9.999999999999999e-27  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0911  enoyl-CoA hydratase  37.18 
 
 
248 aa  120  9.999999999999999e-27  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0918  enoyl-CoA hydratase  37.18 
 
 
232 aa  121  9.999999999999999e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0381394 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0225  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  28.24 
 
 
253 aa  92.8  4e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4783  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  30.81 
 
 
248 aa  89.4  5e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_18064  predicted protein  29.39 
 
 
298 aa  89  6e-17  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0650  putative crotonase  30.24 
 
 
252 aa  75.9  0.0000000000005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2946  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  27.91 
 
 
220 aa  74.3  0.000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000350804  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20200  Enoyl-CoA hydratase  30.25 
 
 
261 aa  73.9  0.000000000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3474  enoyl-CoA hydratase/isomerase  29.35 
 
 
225 aa  73.2  0.000000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.800872  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0639  enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.89 
 
 
225 aa  73.2  0.000000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.56971  normal  0.569972 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1739  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  29.53 
 
 
242 aa  71.2  0.00000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0873  enoyl-CoA hydratase/isomerase  30.21 
 
 
258 aa  70.9  0.00000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3172  enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.14 
 
 
259 aa  69.7  0.00000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2071  short chain enoyl-CoA hydratase  34.45 
 
 
260 aa  69.7  0.00000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000637715  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1380  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.04 
 
 
260 aa  69.7  0.00000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.871476 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1781  enoyl-CoA hydratase/isomerase  30.96 
 
 
260 aa  68.9  0.00000000007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.655694  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3779  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.58 
 
 
260 aa  68.6  0.00000000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.834377  normal  0.388082 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1743  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase NAD-binding  30.84 
 
 
663 aa  68.6  0.00000000009  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.987316  normal  0.330149 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1738  enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.49 
 
 
259 aa  67  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.0269497 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2627  enoyl-CoA hydratase  31.44 
 
 
257 aa  66.6  0.0000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000218794  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1789  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.21 
 
 
235 aa  66.6  0.0000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1480  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.49 
 
 
259 aa  66.6  0.0000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.857901  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10710  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  30.81 
 
 
258 aa  66.6  0.0000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2833  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.98 
 
 
260 aa  66.2  0.0000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.511976  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2001  short chain enoyl-CoA hydratase  26.07 
 
 
259 aa  66.2  0.0000000004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2597  fatty acid oxidation complex, alpha subunit FadJ  28.02 
 
 
714 aa  65.9  0.0000000005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3179  enoyl-CoA hydratase/isomerase  27.57 
 
 
275 aa  65.9  0.0000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.608848  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3640  enoyl-CoA hydratase/isomerase  29.63 
 
 
256 aa  66.2  0.0000000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0644  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.79 
 
 
260 aa  65.9  0.0000000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2864  enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.05 
 
 
257 aa  65.9  0.0000000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.28043  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0614  enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.25 
 
 
262 aa  65.5  0.0000000007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.246951  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2453  short chain enoyl-CoA hydratase / 3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase  29.31 
 
 
702 aa  65.1  0.0000000009  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.889679  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1492  enoyl-CoA hydratase/isomerase  29.82 
 
 
259 aa  65.1  0.0000000009  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.992582  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2046  enoyl-CoA hydratase/isomerase family protein  30.06 
 
 
258 aa  64.7  0.000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.577666  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1202  enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.37 
 
 
261 aa  65.1  0.000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.255383  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5442  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase NAD-binding  34.15 
 
 
692 aa  64.3  0.000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1341  fatty acid oxidation complex, alpha subunit FadJ  30.05 
 
 
732 aa  64.7  0.000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2765  short chain enoyl-CoA hydratase  28.85 
 
 
274 aa  64.7  0.000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.421066 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2377  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  29.31 
 
 
260 aa  64.7  0.000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0806  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.02 
 
 
273 aa  65.1  0.000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0669988  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3731  short chain enoyl-CoA hydratase  32.59 
 
 
238 aa  64.3  0.000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.326497 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2522  enoyl-CoA hydratase/isomerase  30.46 
 
 
238 aa  63.5  0.000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.218751  normal  0.701795 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1666  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.2 
 
 
259 aa  64.3  0.000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.458425  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3041  enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.04 
 
 
260 aa  63.9  0.000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0775149  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3658  short chain enoyl-CoA hydratase  32.59 
 
 
238 aa  64.3  0.000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.220941  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09590  short chain enoyl-CoA hydratase  31.75 
 
 
268 aa  63.9  0.000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0374629  normal  0.0718522 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1558  enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.79 
 
 
258 aa  63.2  0.000000003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4819  enoyl-CoA hydratase  31.22 
 
 
263 aa  63.2  0.000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.944357  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1544  putative enoyl-CoA hydratase/isomerase family protein  28.64 
 
 
223 aa  63.5  0.000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.776241  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1813  short chain enoyl-CoA hydratase  30.19 
 
 
288 aa  63.2  0.000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1666  short chain enoyl-CoA hydratase  34.45 
 
 
260 aa  63.5  0.000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3557  enoyl-CoA hydratase/isomerase  27.8 
 
 
259 aa  63.2  0.000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.203643  normal  0.505075 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3456  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase NAD-binding protein  32.23 
 
 
752 aa  63.2  0.000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0405944 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2217  enoyl-CoA hydratase/isomerase  29.44 
 
 
257 aa  62.8  0.000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.47616  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1815  enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.51 
 
 
268 aa  62.8  0.000000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1376  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.98 
 
 
259 aa  62.8  0.000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.821912  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3521  enoyl-CoA hydratase/isomerase  29.44 
 
 
257 aa  62.8  0.000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.759702  normal  0.0494202 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1908  enoyl-CoA hydratase/isomerase  27.32 
 
 
259 aa  63.2  0.000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2252  enoyl-CoA hydratase/isomerase  30.1 
 
 
259 aa  62.4  0.000000005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0401  enoyl-CoA hydratase/isomerase  30.46 
 
 
260 aa  62.4  0.000000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1843  enoyl-CoA hydratase/isomerase  29.44 
 
 
257 aa  62.4  0.000000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0607617  normal  0.0948943 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1595  enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.66 
 
 
265 aa  62.4  0.000000006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2135  enoyl-CoA hydratase/isomerase  29.82 
 
 
260 aa  62.4  0.000000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.322719 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2165  enoyl-CoA hydratase  35.96 
 
 
280 aa  62.4  0.000000006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5263  hypothetical protein  28.36 
 
 
223 aa  62  0.000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.458705  normal  0.0706788 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0094  enoyl-CoA hydratase/isomerase  24.57 
 
 
255 aa  62  0.000000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2856  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  29.72 
 
 
260 aa  62  0.000000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0434  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  29.17 
 
 
266 aa  62  0.000000009  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0828  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.94 
 
 
255 aa  61.2  0.00000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.724185  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2708  enoyl-CoA hydratase  27.16 
 
 
263 aa  61.6  0.00000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1877  short chain enoyl-CoA hydratase  28.29 
 
 
262 aa  61.6  0.00000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0147635  normal  0.173046 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1114  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.1 
 
 
258 aa  61.2  0.00000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.258792  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0267  short chain enoyl-CoA hydratase  35.38 
 
 
257 aa  61.6  0.00000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0796269  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28460  short chain enoyl-CoA hydratase  31.93 
 
 
259 aa  61.6  0.00000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.528871  normal  0.841191 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28240  enoyl-CoA hydratase/carnithine racemase  25.35 
 
 
220 aa  61.2  0.00000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2111  short chain enoyl-CoA hydratase / 3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase  28.64 
 
 
714 aa  61.2  0.00000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.344014 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3671  short chain enoyl-CoA hydratase  32.16 
 
 
256 aa  61.2  0.00000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.120291  normal  0.634678 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3454  enoyl-CoA hydratase/isomerase  28.93 
 
 
257 aa  61.2  0.00000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.73615  normal  0.177072 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>