More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ping_2083 on replicon NC_008709
Organism: Psychromonas ingrahamii 37



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008709  Ping_2083  amino acid transport integral membrane protein  100 
 
 		 553 aa  1106    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.842232  normal  0.31431 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1808  putative sodium:alanine symporter family protein  73.93 
 
 		 512 aa  744    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.921517  normal  0.308528 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0020  amino acid carrier protein  71.12 
 
 		 518 aa  728    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.000295702  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1871  amino acid carrier protein  57.23 
 
 		 524 aa  582  1.0000000000000001e-165  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.766139  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2069  amino acid carrier protein  57.75 
 
 		 502 aa  572  1.0000000000000001e-162  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0217883  normal  0.403865 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06955  Na(+)-linked D-alanine glycine permease  53 
 
 		 509 aa  505  9.999999999999999e-143  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0544446  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0495  Na+ linked D-alanine glycine permease component  51.92 
 
 		 504 aa  504  1e-141  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.304972  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00095  putative Na(+)-linked D-alanine glycine permease  52.21 
 
 		 542 aa  489  1e-137  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.82713  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0403  amino acid carrier protein  55.12 
 
 		 493 aa  472  1.0000000000000001e-131  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2725  sodium:alanine symporter  49.18 
 
 		 502 aa  450  1e-125  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.415567 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4787  amino acid carrier protein  49.32 
 
 		 499 aa  446  1.0000000000000001e-124  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.617016 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09140  amino acid carrier protein  47.06 
 
 		 523 aa  439  9.999999999999999e-123  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.406042  normal  0.17016 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04350  amino acid carrier protein  47.31 
 
 		 513 aa  412  1e-114  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0222  Sodium:alanine symporter  44.61 
 
 		 481 aa  414  1e-114  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.00785043  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18860  amino acid carrier protein  44.76 
 
 		 558 aa  393  1e-108  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.280752  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3339  amino acid carrier protein  46.37 
 
 		 470 aa  369  1e-101  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0637643  normal  0.327079 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2763  amino acid carrier protein  46.15 
 
 		 470 aa  366  1e-100  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4786  amino acid carrier protein  44.1 
 
 		 472 aa  363  5.0000000000000005e-99  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.361968 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1604  amino acid carrier protein  44.89 
 
 		 498 aa  354  2e-96  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000273653 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4425  amino acid carrier protein  38.39 
 
 		 467 aa  332  1e-89  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0799  sodium/alanine symporter  43.3 
 
 		 458 aa  330  6e-89  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2492  sodium/alanine symporter  43.36 
 
 		 448 aa  314  1.9999999999999998e-84  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2979  sodium/alanine symporter family protein  41.43 
 
 		 455 aa  311  2e-83  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.626895 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2346  sodium/alanine symporter family protein  41.89 
 
 		 455 aa  310  2.9999999999999997e-83  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2481  sodium/alanine symporter family protein  41.21 
 
 		 455 aa  308  2.0000000000000002e-82  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.624372  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2411  sodium/alanine symporter family protein  41 
 
 		 455 aa  308  2.0000000000000002e-82  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2156  Na(+)-linked D-alanine glycine permease  41 
 
 		 455 aa  308  2.0000000000000002e-82  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.185543  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2140  Na(+)-linked D-alanine glycine permease  41.21 
 
 		 455 aa  308  2.0000000000000002e-82  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.889677  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4149  amino acid carrier protein  49.44 
 
 		 553 aa  308  2.0000000000000002e-82  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.306456  normal  0.0111576 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2217  sodium/alanine symporter family protein  41 
 
 		 455 aa  307  4.0000000000000004e-82  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00259878  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2381  sodium/alanine symporter family protein  41 
 
 		 455 aa  307  4.0000000000000004e-82  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2399  sodium/alanine symporter family protein  41 
 
 		 455 aa  306  7e-82  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0573  amino acid carrier protein  40.77 
 
 		 443 aa  305  1.0000000000000001e-81  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2187  amino acid carrier protein  40.78 
 
 		 455 aa  305  1.0000000000000001e-81  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.617077  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0607  amino acid carrier protein  40.73 
 
 		 456 aa  296  8e-79  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3886  amino acid carrier protein  41.16 
 
 		 459 aa  294  3e-78  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00728667  normal  0.343174 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1483  amino acid carrier protein  42.31 
 
 		 445 aa  294  3e-78  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.511941  hitchhiker  0.0000051081 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3308  amino acid carrier protein  41.43 
 
 		 452 aa  294  4e-78  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0685  amino acid carrier protein  39.65 
 
 		 449 aa  293  5e-78  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0152054  normal  0.458275 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0714  amino acid carrier protein  41.43 
 
 		 452 aa  293  8e-78  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3420  amino acid carrier protein  41 
 
 		 452 aa  290  3e-77  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1796  sodium/alanine symporter  39.39 
 
 		 460 aa  290  3e-77  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.466203  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0134  amino acid carrier protein  40.59 
 
 		 459 aa  291  3e-77  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.183257 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1649  amino acid carrier protein  50.62 
 
 		 575 aa  290  5.0000000000000004e-77  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.889938  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3541  amino acid carrier protein  40.33 
 
 		 457 aa  290  6e-77  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3333  amino acid carrier protein  41.12 
 
 		 458 aa  286  5.999999999999999e-76  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4913  amino acid carrier protein  35.78 
 
 		 454 aa  286  5.999999999999999e-76  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.176306 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3143  amino acid carrier protein  40.48 
 
 		 452 aa  286  7e-76  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0858  sodium:alanine symporter family protein  40.79 
 
 		 452 aa  286  9e-76  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0834  amino acid carrier protein  40.48 
 
 		 452 aa  286  9e-76  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0869  amino acid carrier protein  40.48 
 
 		 452 aa  286  9e-76  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0857  amino acid carrier protein  40.48 
 
 		 452 aa  286  9e-76  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3842  amino acid/cation symporter  40.28 
 
 		 460 aa  285  1.0000000000000001e-75  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.489392  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3506  amino acid carrier protein  40.48 
 
 		 452 aa  286  1.0000000000000001e-75  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3785  amino acid carrier protein  39.74 
 
 		 457 aa  284  3.0000000000000004e-75  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000668387  hitchhiker  0.0000307467 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0498  amino acid carrier protein  40.18 
 
 		 458 aa  283  7.000000000000001e-75  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3952  amino acid carrier protein  40.18 
 
 		 458 aa  283  7.000000000000001e-75  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1695  amino acid carrier protein  40.53 
 
 		 458 aa  283  8.000000000000001e-75  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.374608  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1722  amino acid carrier protein  41.18 
 
 		 471 aa  283  8.000000000000001e-75  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.878155 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3770  amino acid carrier protein  39.95 
 
 		 458 aa  282  1e-74  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3734  amino acid carrier protein  39.63 
 
 		 459 aa  282  1e-74  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3826  amino acid carrier protein  39.95 
 
 		 458 aa  282  1e-74  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4884  amino acid carrier protein  41.97 
 
 		 460 aa  280  5e-74  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.182378  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2247  amino acid carrier protein  42.54 
 
 		 443 aa  280  7e-74  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.308467  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0649  amino acid carrier protein  39.58 
 
 		 456 aa  279  8e-74  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1046  sodium/alanine symporter family protein  37.12 
 
 		 488 aa  279  9e-74  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.15016  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2155  amino acid carrier protein  38.84 
 
 		 464 aa  277  3e-73  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.733934  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0757  amino acid carrier protein  38.95 
 
 		 453 aa  277  3e-73  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.537285  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2852  amino acid carrier protein  36.82 
 
 		 463 aa  277  4e-73  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0792  amino acid carrier protein  40.4 
 
 		 443 aa  276  5e-73  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.839726  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2953  sodium:alanine symporter family protein  38.11 
 
 		 464 aa  276  5e-73  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.206004 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1161  amino acid carrier protein  39.91 
 
 		 453 aa  276  5e-73  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0819225  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0064  amino acid carrier protein  40.92 
 
 		 435 aa  276  6e-73  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.194531  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1814  amino acid carrier protein  42.63 
 
 		 461 aa  276  7e-73  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.135362  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1846  amino acid carrier protein  40.81 
 
 		 445 aa  276  9e-73  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.256454  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2026  amino acid carrier protein  38.05 
 
 		 433 aa  275  2.0000000000000002e-72  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0424  amino acid carrier protein  40.14 
 
 		 457 aa  275  2.0000000000000002e-72  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0195  amino acid carrier protein  39.07 
 
 		 460 aa  274  3e-72  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0715  amino acid carrier protein  40.74 
 
 		 456 aa  274  3e-72  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.734479  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0259  amino acid carrier protein  42.66 
 
 		 446 aa  274  3e-72  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1821  amino acid carrier protein  38.1 
 
 		 467 aa  274  4.0000000000000004e-72  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1032  sodium/alanine symporter  38.26 
 
 		 456 aa  273  4.0000000000000004e-72  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.065178  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_06131  Na+/alanine symporter  38.48 
 
 		 447 aa  273  5.000000000000001e-72  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.407748  normal  0.332279 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01260  Na(+)-linked D-alanine glycine permease  47.15 
 
 		 543 aa  273  7e-72  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.291122  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0255  amino acid carrier protein  41.12 
 
 		 453 aa  273  7e-72  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0092  amino acid carrier protein  39.19 
 
 		 455 aa  273  8.000000000000001e-72  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4364  amino acid carrier protein  39.44 
 
 		 459 aa  273  9e-72  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0284  sodium/alanine symporter  35.76 
 
 		 477 aa  272  1e-71  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0834  Sodium:alanine symporter  38.94 
 
 		 456 aa  272  1e-71  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0910  amino acid carrier protein  41.74 
 
 		 454 aa  271  2e-71  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000627243  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0823  amino acid carrier protein  41.69 
 
 		 424 aa  271  2.9999999999999997e-71  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1578  amino acid carrier protein  40.49 
 
 		 441 aa  270  4e-71  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.152771  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0294  Sodium:alanine symporter  33.92 
 
 		 460 aa  270  4e-71  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18710  amino acid carrier protein  39.35 
 
 		 476 aa  270  5.9999999999999995e-71  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.961427  normal  0.254894 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0584  amino acid carrier protein  40.69 
 
 		 459 aa  268  2e-70  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000603825 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003625  sodium/alanine symporter  39.04 
 
 		 458 aa  268  2.9999999999999995e-70  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1336  amino acid carrier protein  38.38 
 
 		 457 aa  267  5e-70  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000270325  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1973  amino acid carrier protein  39.24 
 
 		 458 aa  265  1e-69  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.123631 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0993  Na+/alanine symporter  37.58 
 
 		 447 aa  266  1e-69  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.000614522  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0496  amino acid carrier protein  38.78 
 
 		 457 aa  265  2e-69  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>