188 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_1802 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013061  Phep_1802  Thioredoxin domain protein  100 
 
 		 596 aa  1224    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.868278  hitchhiker  0.0000561667 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3953  Thioredoxin domain  34.59 
 
 		 162 aa  89  3e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0388  Thioredoxin domain protein  26.6 
 
 		 466 aa  85.5  0.000000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.848154 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4066  Thioredoxin domain protein  31.61 
 
 		 157 aa  85.1  0.000000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0061  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  28.03 
 
 		 901 aa  75.9  0.000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3212  hypothetical protein  31.84 
 
 		 198 aa  75.1  0.000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4611  hypothetical protein  25 
 
 		 306 aa  70.1  0.0000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.313343  normal  0.415256 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2364  Thioredoxin domain protein  28.89 
 
 		 465 aa  70.1  0.0000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.352412 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6051  thioredoxin domain protein  27.42 
 
 		 148 aa  67.4  0.0000000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0119737  normal  0.502924 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4309  hypothetical protein  24.12 
 
 		 416 aa  63.5  0.00000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.147931  normal  0.0295343 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0805  Thioredoxin domain protein  33.33 
 
 		 270 aa  62.4  0.00000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04810  hypothetical protein  31.67 
 
 		 179 aa  61.6  0.00000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.543485  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0131  thioredoxin domain-containing protein  29.17 
 
 		 149 aa  62  0.00000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000222115  n/a   
 
 
-
 
NC_013733  Slin_7011  Thioredoxin domain protein  27.05 
 
 		 326 aa  60.8  0.00000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.817681  normal  0.78664 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0217  protein of unknown function DUF255  27.05 
 
 		 517 aa  59.7  0.0000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0517  Highly conserved protein containing a thioredoxin domain  30.84 
 
 		 148 aa  59.3  0.0000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00166074  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2780  thioredoxin-related protein-like protein  24.86 
 
 		 391 aa  59.3  0.0000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0175859  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0583  thiol:disulfide interchange protein precursor  33.83 
 
 		 610 aa  59.3  0.0000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7116  thioredoxin domain protein  25 
 
 		 161 aa  58.9  0.0000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2274  protein of unknown function DUF255  23.31 
 
 		 552 aa  58.2  0.0000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.134722 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1636  Thiol:disulfide interchange protein-like protein  24.81 
 
 		 176 aa  57.8  0.0000006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32590  thiol:disulfide interchange protein  33.33 
 
 		 589 aa  57.4  0.0000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.426474  normal  0.0965179 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0787  hypothetical protein  32.61 
 
 		 650 aa  57.4  0.0000007  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.86498  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2760  thiol:disulfide interchange protein  31.11 
 
 		 589 aa  56.6  0.000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.364714  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0134  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  25.28 
 
 		 884 aa  55.8  0.000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3194  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  28.93 
 
 		 905 aa  55.8  0.000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.163194  normal  0.106396 
 
 
-
 
NC_011686  PHATRDRAFT_48539  thioredoxin h  35.45 
 
 		 165 aa  55.8  0.000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3936  protein-disulfide reductase  31.82 
 
 		 577 aa  55.5  0.000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.327412  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1204  hypothetical protein  34.26 
 
 		 661 aa  55.1  0.000003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.139299  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0722  hypothetical protein  29.93 
 
 		 586 aa  54.3  0.000006  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3559  thioredoxin  27.35 
 
 		 229 aa  54.3  0.000007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.254418 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0822  Highly conserved protein containing a thioredoxin domain  28.46 
 
 		 590 aa  54.3  0.000007  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0928635  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0701  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  26.79 
 
 		 616 aa  53.9  0.000008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0529075  hitchhiker  0.000000140832 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0545  thiol:disulfide interchange protein DsbD  26.79 
 
 		 616 aa  53.9  0.000008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.221768  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2293  thioredoxin family protein  31.37 
 
 		 183 aa  53.9  0.000009  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1653  hypothetical protein  33.04 
 
 		 449 aa  53.1  0.00001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1683  thiol:disulfide interchange protein DsbD  26.62 
 
 		 624 aa  53.1  0.00001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.424941  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0491  protein of unknown function DUF255  26.26 
 
 		 549 aa  53.1  0.00001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0084  thiol:disulfide interchange protein precursor  30.21 
 
 		 592 aa  53.1  0.00001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03921  thiol:disulfide interchange protein precursor  32.17 
 
 		 631 aa  53.1  0.00001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3559  protein-disulfide reductase  32.95 
 
 		 570 aa  53.1  0.00001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0023  protein of unknown function DUF255  34.44 
 
 		 643 aa  52.4  0.00002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0741  hypothetical protein  29.2 
 
 		 586 aa  52.4  0.00002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0538  thiol:disulfide interchange protein precursor  27.22 
 
 		 607 aa  52.8  0.00002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.126162  decreased coverage  0.00471183 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2329  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  31.53 
 
 		 606 aa  53.1  0.00002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0733929  normal  0.104839 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3622  hypothetical protein  32.38 
 
 		 680 aa  52.4  0.00003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.250871  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0636  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  29.57 
 
 		 466 aa  52  0.00003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.619274 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0591  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region/thioredoxin-related  29.82 
 
 		 471 aa  51.6  0.00004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.945166  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2384  hypothetical protein  37.5 
 
 		 705 aa  51.6  0.00004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.249366  normal  0.331232 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1441  Redoxin domain protein  27.72 
 
 		 158 aa  51.6  0.00004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1629  protein-disulfide reductase  31.82 
 
 		 571 aa  51.6  0.00004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.120841  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4235  protein-disulfide reductase  31.82 
 
 		 571 aa  51.6  0.00005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.892987 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2029  hypothetical protein  25.21 
 
 		 178 aa  51.2  0.00005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.213181  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0806  protein of unknown function DUF255  26.83 
 
 		 274 aa  50.8  0.00006  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.862822  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0659  thiol:disulfide interchange protein precursor  30.51 
 
 		 619 aa  50.8  0.00007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2821  hypothetical protein  29.84 
 
 		 569 aa  50.8  0.00007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.642839  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5565  thiol:disulfide interchange protein precursor  30.77 
 
 		 591 aa  50.4  0.00008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4015  thiol:disulfide interchange protein precursor  31.54 
 
 		 611 aa  50.4  0.00008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000000287322 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1855  protein of unknown function DUF255  28.07 
 
 		 172 aa  50.4  0.00009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2790  putative electron transfer protein  28.7 
 
 		 184 aa  50.4  0.0001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1646  hypothetical protein  32.14 
 
 		 449 aa  50.1  0.0001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2683  protein-disulfide reductase  26.71 
 
 		 654 aa  50.1  0.0001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3681  thiol:disulfide interchange protein precursor  29.69 
 
 		 595 aa  50.1  0.0001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.576987  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0728  thiol:disulfide interchange protein precursor  29.69 
 
 		 595 aa  50.1  0.0001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3801  protein-disulfide reductase  30.68 
 
 		 571 aa  50.1  0.0001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3828  thiol:disulfide interchange protein precursor  29.69 
 
 		 595 aa  50.1  0.0001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.368823  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0416  thiol:disulfide interchange protein precursor  26.97 
 
 		 624 aa  49.7  0.0002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.136243  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3406  thiol:disulfide interchange protein precursor  33.64 
 
 		 613 aa  48.9  0.0002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0237355 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0546  thiol:disulfide interchange protein precursor  33.64 
 
 		 613 aa  49.3  0.0002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0488882  normal  0.137935 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3726  thiol:disulfide interchange protein precursor  29.66 
 
 		 619 aa  49.3  0.0002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.53604  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3266  thiol:disulfide interchange protein precursor  31.13 
 
 		 602 aa  48.9  0.0002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00603996 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2790  thiol:disulfide interchange protein DsbD  30.09 
 
 		 589 aa  48.5  0.0003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1595  thioredoxin  23.22 
 
 		 287 aa  48.9  0.0003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.385204  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3576  thiol:disulfide interchange protein precursor  33.64 
 
 		 613 aa  48.9  0.0003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.784092 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3247  thiol:disulfide interchange protein precursor  34.09 
 
 		 604 aa  48.5  0.0003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1362  hypothetical protein  23.38 
 
 		 396 aa  48.9  0.0003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0034  thioredoxin  33 
 
 		 104 aa  48.1  0.0004  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4599  thioredoxin family protein  26.85 
 
 		 158 aa  48.5  0.0004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0696  thiol:disulfide interchange protein precursor  31.82 
 
 		 610 aa  48.5  0.0004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4103  protein of unknown function DUF255  32.35 
 
 		 185 aa  48.5  0.0004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.57841  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3292  Redoxin domain protein  24.66 
 
 		 453 aa  48.1  0.0004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.000000783621  hitchhiker  0.000211392 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3992  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  25.36 
 
 		 376 aa  48.1  0.0004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.984971  normal  1 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_37354  predicted protein  28.12 
 
 		 131 aa  48.1  0.0004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0644454  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0588  hypothetical protein  46 
 
 		 692 aa  48.1  0.0004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.155052  normal  0.0633893 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2038  Thioredoxin domain protein  27.18 
 
 		 357 aa  48.5  0.0004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.571694  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1055  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  26.74 
 
 		 626 aa  48.1  0.0005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000114598  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3288  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  27.12 
 
 		 624 aa  48.1  0.0005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14280  thioredoxin  29 
 
 		 102 aa  47.8  0.0005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.978477  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0669  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  28.45 
 
 		 810 aa  48.1  0.0005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4158  thiol:disulfide interchange protein precursor  29.25 
 
 		 609 aa  47.8  0.0006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.18513 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3415  disulfide reductase  25.95 
 
 		 623 aa  47.8  0.0006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.189847 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0081  protein-disulfide reductase  31.58 
 
 		 558 aa  47.8  0.0006  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0323  thiol:disulfide interchange protein precursor  30.77 
 
 		 563 aa  47.8  0.0006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000046864 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0953  thiol:disulfide interchange protein precursor  35.23 
 
 		 608 aa  47.4  0.0007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.447642  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4605  thiol:disulfide interchange protein precursor  30.77 
 
 		 565 aa  47.4  0.0008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  0.0011627  normal  0.838171 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3062  thioredoxin-like protein  29.66 
 
 		 180 aa  47.4  0.0008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4377  thiol:disulfide interchange protein precursor  30.77 
 
 		 565 aa  47.4  0.0008  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0111987  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4691  thiol:disulfide interchange protein precursor  30.77 
 
 		 565 aa  47.4  0.0008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04006  thiol:disulfide interchange protein precursor  30.77 
 
 		 565 aa  47.4  0.0009  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5652  thiol:disulfide interchange protein precursor  30.77 
 
 		 565 aa  47  0.0009  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000390549  normal  0.76636 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>