More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_1552 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013061  Phep_1552  SsrA-binding protein  100 
 
 		 149 aa  303  7e-82  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.350256 
 
 
-
 
NC_002950  PG0502  SsrA-binding protein  53.38 
 
 		 153 aa  172  9.999999999999999e-43  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.237827 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5661  SsrA-binding protein  53.19 
 
 		 153 aa  167  3e-41  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.409469  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09086  SsrA-binding protein  54 
 
 		 152 aa  164  4e-40  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1955  SsrA-binding protein  54.93 
 
 		 153 aa  163  5.9999999999999996e-40  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.436569  normal  0.0440292 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3480  SsrA-binding protein  53.52 
 
 		 152 aa  162  1.0000000000000001e-39  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.010322  normal  0.585109 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0670  SsrA-binding protein  52.86 
 
 		 150 aa  159  2e-38  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000585556  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0694  SsrA-binding protein  52.86 
 
 		 150 aa  159  2e-38  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.000000543524  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3663  SsrA-binding protein  53.15 
 
 		 145 aa  158  3e-38  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0818654 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2134  SsrA-binding protein  52.41 
 
 		 151 aa  154  4e-37  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2342  SsrA-binding protein  51.06 
 
 		 156 aa  148  3e-35  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0903697 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2984  SsrA-binding protein  49.29 
 
 		 161 aa  146  9e-35  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000114855  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07720  SsrA-binding protein  45.45 
 
 		 160 aa  146  1.0000000000000001e-34  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2476  SsrA-binding protein  47.52 
 
 		 160 aa  145  2.0000000000000003e-34  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.472283  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3721  SsrA-binding protein  46.1 
 
 		 154 aa  144  3e-34  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.516097  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0771  SsrA-binding protein  45.58 
 
 		 161 aa  144  4.0000000000000006e-34  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0749395  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3680  SsrA-binding protein  46.04 
 
 		 163 aa  140  6e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.535779  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3738  SsrA-binding protein  45.32 
 
 		 163 aa  140  6e-33  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.294641  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3821  SsrA-binding protein  45.32 
 
 		 163 aa  140  6e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3443  SsrA-binding protein  52.35 
 
 		 151 aa  140  6e-33  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0691  SsrA-binding protein  50.35 
 
 		 161 aa  140  8e-33  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0862  SsrA-binding protein  43.17 
 
 		 157 aa  139  9e-33  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0801  SsrA-binding protein  46.43 
 
 		 159 aa  139  9.999999999999999e-33  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0162  SsrA-binding protein  46.76 
 
 		 156 aa  139  9.999999999999999e-33  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2766  SsrA-binding protein  43.45 
 
 		 177 aa  139  9.999999999999999e-33  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.277216 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0529  SsrA-binding protein  44.37 
 
 		 157 aa  138  3e-32  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.41549  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1455  SmpB protein  45.39 
 
 		 155 aa  137  4.999999999999999e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.773196 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3672  SsrA-binding protein  48.94 
 
 		 155 aa  137  4.999999999999999e-32  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.35402  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0815  SsrA-binding protein  44.06 
 
 		 157 aa  136  7.999999999999999e-32  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.0017945  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1728  SsrA-binding protein  44.6 
 
 		 159 aa  136  8.999999999999999e-32  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1464  SsrA-binding protein  47.89 
 
 		 154 aa  136  1e-31  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4955  SsrA-binding protein  48.23 
 
 		 155 aa  136  1e-31  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000000570818  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4806  SsrA-binding protein  48.23 
 
 		 155 aa  136  1e-31  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000144098  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4817  SsrA-binding protein  48.23 
 
 		 155 aa  136  1e-31  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000561916  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3807  SsrA-binding protein  44.68 
 
 		 165 aa  136  1e-31  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0298581 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5332  SsrA-binding protein  48.23 
 
 		 155 aa  136  1e-31  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000321328  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5212  SsrA-binding protein  48.23 
 
 		 155 aa  136  1e-31  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0795  SsrA-binding protein  45 
 
 		 160 aa  136  1e-31  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.387755  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0366  SsrA-binding protein  44.68 
 
 		 150 aa  135  2e-31  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4582  SsrA-binding protein  46.81 
 
 		 160 aa  135  2e-31  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.307442 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1824  SsrA-binding protein  49.29 
 
 		 150 aa  134  3.0000000000000003e-31  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.00000000470623  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2697  SsrA-binding protein  45.14 
 
 		 162 aa  134  3.0000000000000003e-31  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5231  SsrA-binding protein  47.52 
 
 		 155 aa  134  4e-31  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5277  SsrA-binding protein  47.52 
 
 		 155 aa  134  4e-31  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000417052  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5242  SsrA-binding protein  47.52 
 
 		 155 aa  134  4e-31  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.275752  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1434  SsrA-binding protein  43.54 
 
 		 158 aa  134  4e-31  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.373269  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0920  SsrA-binding protein  44.2 
 
 		 159 aa  134  5e-31  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.624021  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0275  SsrA-binding protein  43.57 
 
 		 155 aa  134  6.0000000000000005e-31  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000343962  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1314  SsrA-binding protein  46.43 
 
 		 152 aa  134  6.0000000000000005e-31  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00672101  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25160  SsrA-binding protein  44.29 
 
 		 176 aa  133  7.000000000000001e-31  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0256  SsrA-binding protein  45.07 
 
 		 153 aa  133  7.000000000000001e-31  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00851918  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3124  SsrA-binding protein  44.68 
 
 		 155 aa  133  8e-31  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1493  SsrA-binding protein  41.89 
 
 		 150 aa  132  9.999999999999999e-31  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0661081  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0002  SsrA-binding protein  46.81 
 
 		 155 aa  132  9.999999999999999e-31  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.185549  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0244  SsrA-binding protein  45 
 
 		 147 aa  132  9.999999999999999e-31  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.750258  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4003  SsrA-binding protein  43.88 
 
 		 162 aa  132  1.9999999999999998e-30  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0441  SsrA-binding protein  46.85 
 
 		 150 aa  132  1.9999999999999998e-30  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.634743  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0984  SsrA-binding protein  44.2 
 
 		 159 aa  132  1.9999999999999998e-30  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.458725  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4865  SsrA-binding protein  45.39 
 
 		 157 aa  131  3e-30  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1162  SsrA-binding protein  42.25 
 
 		 157 aa  131  3e-30  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0771  SsrA-binding protein  46.43 
 
 		 147 aa  131  3e-30  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.401658  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0867  SsrA-binding protein  46.81 
 
 		 176 aa  130  5e-30  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.609087  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1508  SsrA-binding protein  42.14 
 
 		 149 aa  130  6e-30  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_10450  SsrA-binding protein  43.24 
 
 		 167 aa  130  6.999999999999999e-30  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.668094  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2662  SsrA-binding protein  46.43 
 
 		 156 aa  130  9e-30  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0252069  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1038  SsrA-binding protein  45.71 
 
 		 177 aa  129  1.0000000000000001e-29  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.102132  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0990  SsrA-binding protein  41.78 
 
 		 159 aa  128  2.0000000000000002e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.910775  normal  0.605905 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1280  ssrA binding protein (smpB)  45.71 
 
 		 154 aa  129  2.0000000000000002e-29  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000661775  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4920  SsrA-binding protein  45.39 
 
 		 155 aa  129  2.0000000000000002e-29  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00075072  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1272  SsrA-binding protein  43.57 
 
 		 159 aa  128  2.0000000000000002e-29  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.352347  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1709  SsrA-binding protein  41.89 
 
 		 153 aa  128  3e-29  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0149731  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0767  SsrA-binding protein  41.38 
 
 		 149 aa  128  3e-29  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2954  SsrA-binding protein  43.26 
 
 		 155 aa  128  3e-29  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000670079  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1092  SsrA-binding protein  42.57 
 
 		 152 aa  128  3e-29  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0947  SsrA-binding protein  41.3 
 
 		 161 aa  128  3e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1143  SsrA-binding protein  41.5 
 
 		 159 aa  127  4.0000000000000003e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1869  SsrA-binding protein  43.88 
 
 		 159 aa  127  5.0000000000000004e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0315571  normal  0.12343 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1629  SsrA-binding protein  45.77 
 
 		 154 aa  127  5.0000000000000004e-29  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.765691  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1730  SsrA-binding protein  42.86 
 
 		 161 aa  127  5.0000000000000004e-29  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.890336  normal  0.795485 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0938  SsrA-binding protein  46.15 
 
 		 158 aa  127  6e-29  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0538951  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2325  SsrA-binding protein  43.26 
 
 		 155 aa  127  6e-29  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.595693  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1646  SsrA-binding protein  41.89 
 
 		 172 aa  127  6e-29  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.281559  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1247  SsrA-binding protein  43.57 
 
 		 158 aa  127  7.000000000000001e-29  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1584  SsrA-binding protein  42.47 
 
 		 168 aa  126  8.000000000000001e-29  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.687182  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1613  SsrA-binding protein  42.47 
 
 		 168 aa  126  8.000000000000001e-29  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0710  SsrA-binding protein  45.26 
 
 		 144 aa  126  8.000000000000001e-29  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1638  SsrA-binding protein  42.47 
 
 		 168 aa  126  8.000000000000001e-29  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.223466  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0524  SsrA-binding protein  45.71 
 
 		 157 aa  126  9.000000000000001e-29  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.00169636  normal  0.364367 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1069  SsrA-binding protein  43.84 
 
 		 165 aa  126  1.0000000000000001e-28  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.439427 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2397  SsrA-binding protein  46.27 
 
 		 158 aa  126  1.0000000000000001e-28  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.013671 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0811  SsrA-binding protein  44.53 
 
 		 147 aa  125  1.0000000000000001e-28  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09100  SsrA-binding protein  39.72 
 
 		 155 aa  125  1.0000000000000001e-28  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.971292  normal  0.0787138 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0942  SsrA-binding protein  43.57 
 
 		 155 aa  126  1.0000000000000001e-28  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0373189  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0281  SsrA-binding protein  42.25 
 
 		 157 aa  126  1.0000000000000001e-28  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000000135529  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0086  SsrA-binding protein  40.69 
 
 		 148 aa  125  2.0000000000000002e-28  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3779  SsrA-binding protein  42.45 
 
 		 156 aa  125  2.0000000000000002e-28  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.735326 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2083  SsrA-binding protein  43.24 
 
 		 151 aa  125  2.0000000000000002e-28  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1582  SsrA-binding protein  44.29 
 
 		 156 aa  125  2.0000000000000002e-28  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0563704  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0819  SsrA-binding protein  43.06 
 
 		 154 aa  125  2.0000000000000002e-28  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.796399  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1916  SsrA-binding protein  40.41 
 
 		 165 aa  125  2.0000000000000002e-28  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0329726  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>