54 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_1157 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013061  Phep_1157  Pectinesterase  100 
 
 		 322 aa  666    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3049  Pectinesterase  57.82 
 
 		 326 aa  388  1e-107  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4438  Pectinesterase  54.67 
 
 		 391 aa  358  6e-98  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0674523  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1812  Pectinesterase  48 
 
 		 326 aa  295  5e-79  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4248  pectate lyase  47.71 
 
 		 666 aa  291  1e-77  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.38518  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1149  Pectinesterase  47.46 
 
 		 345 aa  290  2e-77  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.862833  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0486  Pectinesterase  43.03 
 
 		 644 aa  265  8e-70  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.536234  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4096  pectinesterase  45.23 
 
 		 338 aa  259  5.0000000000000005e-68  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.557872  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4273  pectinesterase  40.37 
 
 		 571 aa  257  2e-67  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4787  Pectinesterase  42.67 
 
 		 337 aa  252  5.000000000000001e-66  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.669677  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2949  pectinesterase  45.48 
 
 		 567 aa  250  2e-65  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.765546  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1301  pectinesterase  39.53 
 
 		 345 aa  237  2e-61  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1246  Pectinesterase  44.3 
 
 		 560 aa  226  3e-58  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1391  Pectinesterase  36.39 
 
 		 347 aa  183  4.0000000000000006e-45  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.161325  hitchhiker  0.00169458 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4964  Pectinesterase  37.66 
 
 		 794 aa  180  2.9999999999999997e-44  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.467463  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4198  Pectinesterase  37.66 
 
 		 487 aa  180  2.9999999999999997e-44  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.018397  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0496  Pectinesterase  34.71 
 
 		 686 aa  167  1e-40  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00164542 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0447  pectinesterase  32.96 
 
 		 376 aa  166  5.9999999999999996e-40  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.361706  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0501  pectinesterase  35.91 
 
 		 447 aa  164  3e-39  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2469  Pectinesterase  33.83 
 
 		 746 aa  162  6e-39  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.151342  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0433  Pectinesterase  39.93 
 
 		 457 aa  161  1e-38  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.825978  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2766  Pectinesterase  35.84 
 
 		 366 aa  157  2e-37  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.422306  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1843  Pectate lyase/Amb allergen  33.95 
 
 		 730 aa  157  2e-37  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.5236  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1087  Pectinesterase  34.51 
 
 		 366 aa  147  2.0000000000000003e-34  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.925496  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3047  Pectinesterase  32.44 
 
 		 368 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1228  Pectinesterase  31.87 
 
 		 368 aa  146  4.0000000000000006e-34  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3820  Pectinesterase  35.59 
 
 		 627 aa  145  1e-33  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3639  pectinesterase  31.11 
 
 		 361 aa  143  4e-33  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0844  pectinesterase A  31.11 
 
 		 361 aa  143  4e-33  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0740  pectinesterase  30.85 
 
 		 865 aa  143  4e-33  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3511  pectinesterase A  31.11 
 
 		 361 aa  143  4e-33  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.12966  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03390  Pectinesterase (EC 3.1.1.11) [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q5B7U0]  34.56 
 
 		 325 aa  125  1e-27  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0409748  normal  0.798545 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4663  Pectinesterase  31.43 
 
 		 334 aa  120  3e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0682309  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0138  putative pectinesterase  31.85 
 
 		 439 aa  113  4.0000000000000004e-24  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.356938  normal  1 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04860  pectin methyl esterase (Eurofung)  28.61 
 
 		 389 aa  93.2  6e-18  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0944  ribosomal protein L30  26.05 
 
 		 389 aa  88.2  2e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000748406 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3447  pectin methylesterase-like  30.34 
 
 		 1081 aa  81.3  0.00000000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.000110016  hitchhiker  0.000230846 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00373  putative pectinesterase  27.07 
 
 		 393 aa  80.5  0.00000000000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.350288  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4146  putative pectinesterase  27.86 
 
 		 400 aa  75.1  0.000000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4090  pectinesterase  27.61 
 
 		 469 aa  73.6  0.000000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  hitchhiker  0.00169247  normal  0.786788 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2469  putative pectinesterase  26.04 
 
 		 434 aa  72  0.00000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.895258  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4427  putative pectinesterase  27.51 
 
 		 400 aa  68.2  0.0000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.681186  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_07966  conserved hypothetical protein  42.42 
 
 		 209 aa  54.3  0.000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.488758  normal  0.390044 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0434  Serine/threonine protein kinase  23.83 
 
 		 674 aa  50.1  0.00005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  unclonable  0.000000000341904  normal  0.409693 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00700  hypothetical protein  25.66 
 
 		 427 aa  47  0.0004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0117403  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00725  predicted pectinesterase  25.66 
 
 		 427 aa  47  0.0004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00760581  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2890  putative pectinesterase  25.66 
 
 		 427 aa  47  0.0004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0446001  normal  0.0752938 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0826  putative pectinesterase  25.66 
 
 		 427 aa  47  0.0005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0907325  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0799  putative pectinesterase  25.66 
 
 		 427 aa  47  0.0005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2870  Pectinesterase  25.66 
 
 		 427 aa  47  0.0005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2580  putative pectinesterase  25.66 
 
 		 427 aa  47  0.0005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.390355  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0876  putative pectinesterase  25.66 
 
 		 427 aa  47  0.0005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1259  putative pectinesterase  25.97 
 
 		 427 aa  46.6  0.0006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0795  putative pectinesterase  25 
 
 		 427 aa  45.1  0.001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.253968  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>