54 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pecwa_2495 on replicon NC_013421
Organism: Pectobacterium wasabiae WPP163



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013421  Pecwa_2495  TM2 domain containing protein  100 
 
 		 99 aa  201  2e-51  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.2077  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2995  TM2 domain-containing protein  53.92 
 
 		 116 aa  111  3e-24  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2773  hypothetical protein  55.79 
 
 		 247 aa  103  9e-22  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  3.00177e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0289  hypothetical protein  47.12 
 
 		 118 aa  84  6e-16  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.0163105 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0660  hypothetical protein  50 
 
 		 128 aa  75.5  0.0000000000002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1421  TM2 domain containing protein  60.94 
 
 		 149 aa  75.1  0.0000000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0216087  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4098  TM2 domain-containing protein  39.22 
 
 		 124 aa  74.7  0.0000000000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2064  hypothetical protein  41.05 
 
 		 364 aa  72.4  0.000000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00393707  normal  0.614114 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0975  TM2 domain containing protein  50 
 
 		 252 aa  67.4  0.00000000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.334071  normal  0.148819 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0948  TM2 domain containing protein  50 
 
 		 252 aa  67.4  0.00000000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3393  TM2 domain-containing protein  37 
 
 		 113 aa  67  0.00000000009  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_204  hypothetical protein  39.6 
 
 		 107 aa  63.2  0.000000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1837  TM2  53.42 
 
 		 148 aa  63.5  0.000000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.535212  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2649  TM2 domain containing protein  55.77 
 
 		 100 aa  62  0.000000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0528638  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1298  TM2 domain-containing protein  49.18 
 
 		 92 aa  60.8  0.000000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1273  TM2 domain-containing protein  49.18 
 
 		 92 aa  60.8  0.000000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0888  TM2 domain-containing protein  42.86 
 
 		 154 aa  60.8  0.000000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.155279 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0125  TM2 domain-containing protein  40 
 
 		 107 aa  60.1  0.000000009  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0780  hypothetical protein  48.15 
 
 		 67 aa  59.7  0.00000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0230  TM2 domain-containing protein  38.95 
 
 		 107 aa  59.7  0.00000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0254008  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0837  TM2 domain-containing protein  38.27 
 
 		 92 aa  59.3  0.00000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3752  TM2 domain-containing protein  39.53 
 
 		 97 aa  58.5  0.00000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11420  predicted membrane protein  54 
 
 		 71 aa  58.5  0.00000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.45156  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0591  TM2 domain containing protein  37.76 
 
 		 133 aa  56.6  0.0000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000337836  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1098  TM2 domain-containing protein  49.09 
 
 		 71 aa  55.8  0.0000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.0000223693  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1121  TM2 domain-containing protein  49.09 
 
 		 71 aa  55.8  0.0000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000186837  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35490  predicted membrane protein  36.59 
 
 		 212 aa  55.8  0.0000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0353  hypothetical protein  37.97 
 
 		 181 aa  53.5  0.0000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00000372967  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1224  TM2 domain-containing protein  41.79 
 
 		 125 aa  53.1  0.000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0929  hypothetical protein  41.79 
 
 		 124 aa  53.5  0.000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0612  hypothetical protein  46 
 
 		 53 aa  52  0.000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0822  TM2 domain containing protein  44.12 
 
 		 161 aa  52.8  0.000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.966716  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0828  TM2 domain containing protein  38.24 
 
 		 265 aa  51.2  0.000004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1652  TM2 domain-containing protein  33.33 
 
 		 108 aa  51.2  0.000005  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.503869  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0125  hypothetical protein  62.5 
 
 		 118 aa  49.7  0.00001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.827385 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23650  predicted membrane protein  33.78 
 
 		 336 aa  50.1  0.00001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.360975 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0624  hypothetical protein  62.86 
 
 		 71 aa  48.5  0.00003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.317815  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0279  hypothetical protein  76 
 
 		 118 aa  48.5  0.00003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53630  hypothetical protein  45.16 
 
 		 111 aa  47.8  0.00005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0142273  hitchhiker  0.000532666 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4699  hypothetical protein  43.55 
 
 		 111 aa  47  0.00009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0597  hypothetical protein  62.07 
 
 		 137 aa  46.6  0.0001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2984  TM2 domain containing protein  36.84 
 
 		 305 aa  45.4  0.0002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.39909  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3451  hypothetical protein  33.33 
 
 		 106 aa  44.7  0.0004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.950641  normal  0.149126 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01500  predicted membrane protein  36.36 
 
 		 265 aa  44.7  0.0005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.138392  normal  0.440212 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0126  hypothetical protein  28.95 
 
 		 146 aa  43.5  0.0009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.845594 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0604  TM2 domain protein  38.1 
 
 		 190 aa  43.1  0.001  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0278  hypothetical protein  68 
 
 		 146 aa  42.4  0.002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.951062  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03530  predicted membrane protein  32.89 
 
 		 159 aa  41.6  0.003  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.0851449 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2397  TM2 domain containing protein  38.1 
 
 		 113 aa  41.6  0.004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  2.25927e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2315  hypothetical protein  35.06 
 
 		 146 aa  40.8  0.006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4736  hypothetical protein  35.53 
 
 		 128 aa  40.4  0.008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0156129 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4395  hypothetical protein  36.11 
 
 		 132 aa  40.4  0.009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0941957 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1469  hypothetical protein  61.54 
 
 		 206 aa  40  0.01  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.22306  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_27311  hypothetical protein  29.73 
 
 		 92 aa  40  0.01  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.848779 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>