72 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_3085 on replicon NC_008687
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008687  Pden_3085  hypothetical protein  100 
 
 		 135 aa  276  7e-74  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.174539 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1768  hypothetical protein  47.79 
 
 		 135 aa  136  8.999999999999999e-32  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.784006  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3894  hypothetical protein  47.76 
 
 		 134 aa  133  9.999999999999999e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2486  hypothetical protein  44.12 
 
 		 135 aa  123  7e-28  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.635228  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0482  hypothetical protein  53.4 
 
 		 226 aa  120  4e-27  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0496  hypothetical protein  47.41 
 
 		 136 aa  120  4e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1653  hypothetical protein  48.48 
 
 		 134 aa  120  6e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.186504  normal  0.287849 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3773  hypothetical protein  46.15 
 
 		 134 aa  118  3e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.574363  normal  0.482694 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4003  hypothetical protein  46.56 
 
 		 134 aa  118  3e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.806978  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4364  hypothetical protein  46.56 
 
 		 134 aa  118  3e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.765035  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5990  hypothetical protein  46.88 
 
 		 134 aa  117  4.9999999999999996e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4247  hypothetical protein  45.38 
 
 		 134 aa  115  9.999999999999999e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0712  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4459  hypothetical protein  49.51 
 
 		 138 aa  111  3e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4257  hypothetical protein  44.7 
 
 		 135 aa  111  4.0000000000000004e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.1125  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1540  hypothetical protein  49.09 
 
 		 131 aa  108  2.0000000000000002e-23  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0815668 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0365  protein of unknown function DUF1311  44.96 
 
 		 134 aa  107  8.000000000000001e-23  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.12825 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1197  hypothetical protein  43.28 
 
 		 131 aa  98.6  3e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1232  putative secreted protein  43.28 
 
 		 131 aa  97.8  5e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.565671 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1187  putative secreted protein  43.28 
 
 		 131 aa  97.8  5e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.252053  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1082  putative secreted protein  43.28 
 
 		 131 aa  97.8  5e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1217  putative secreted protein  43.28 
 
 		 131 aa  97.4  6e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.446531 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1480  hypothetical protein  38.17 
 
 		 128 aa  97.4  6e-20  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.947904  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2321  hypothetical protein  34.62 
 
 		 144 aa  76.3  0.0000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.395744 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4773  hypothetical protein  37.04 
 
 		 135 aa  74.7  0.0000000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1843  hypothetical protein  38.46 
 
 		 128 aa  73.6  0.000000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.308935 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2033  lipoprotein, putative  36.15 
 
 		 128 aa  71.6  0.000000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.151249  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4365  hypothetical protein  30.65 
 
 		 128 aa  69.7  0.00000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.751601  normal  0.995062 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2385  hypothetical protein  38.18 
 
 		 140 aa  69.7  0.00000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.953868  normal  0.33796 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0848  hypothetical protein  33.07 
 
 		 128 aa  65.1  0.0000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.796587 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0821  hypothetical protein  33.07 
 
 		 136 aa  64.7  0.0000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.163557  normal  0.0923221 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2195  hypothetical protein  34.92 
 
 		 142 aa  63.2  0.000000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1748  hypothetical protein  36.46 
 
 		 119 aa  62.4  0.000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.447697  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3256  protein of unknown function DUF1311  35.16 
 
 		 130 aa  62.8  0.000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.591181  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0862  hypothetical protein  30.16 
 
 		 128 aa  61.2  0.000000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3053  protein of unknown function DUF1311  35.48 
 
 		 135 aa  59.7  0.00000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.460673  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3309  protein of unknown function DUF1311  35.48 
 
 		 135 aa  59.3  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0737  protein of unknown function DUF1311  35.29 
 
 		 136 aa  57.4  0.00000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3481  hypothetical protein  31.82 
 
 		 136 aa  56.2  0.0000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1738  hypothetical protein  37.08 
 
 		 170 aa  56.2  0.0000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2382  hypothetical protein  27.82 
 
 		 140 aa  51.2  0.000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0377326  normal  0.0757693 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0404  hypothetical protein  31.18 
 
 		 205 aa  50.8  0.000006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2187  hypothetical protein  30.65 
 
 		 134 aa  49.3  0.00002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.063502  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03300  putative periplasmic protein  26.72 
 
 		 124 aa  48.1  0.00004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3694  hypothetical protein  32.97 
 
 		 133 aa  47  0.00009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.560567  normal  0.0810528 
 
 
-
 
NC_009777  VIBHAR_p08272  hypothetical protein  27.59 
 
 		 129 aa  45.4  0.0002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02014  hypothetical protein  27.59 
 
 		 129 aa  45.4  0.0003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3022  hypothetical protein  35.65 
 
 		 148 aa  44.7  0.0005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.848645  normal  0.207775 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3370  protein of unknown function DUF1311  26.52 
 
 		 137 aa  44.3  0.0005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5211  hypothetical protein  29.09 
 
 		 131 aa  44.3  0.0006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008761  Pnap_4780  hypothetical protein  32.65 
 
 		 133 aa  43.9  0.0007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.533353  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4896  hypothetical protein  33.73 
 
 		 129 aa  43.9  0.0007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3470  hypothetical protein  33.73 
 
 		 129 aa  43.9  0.0007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5207  hypothetical protein  30 
 
 		 131 aa  43.9  0.0009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5390  hypothetical protein  33.73 
 
 		 129 aa  43.5  0.001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.653277 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0963  protein of unknown function DUF1311  28.57 
 
 		 129 aa  43.1  0.001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.113016  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4900  hypothetical protein  24.44 
 
 		 138 aa  42.7  0.002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.418097  normal  0.436154 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02135  hypothetical protein  25.21 
 
 		 138 aa  42.4  0.002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1755  hypothetical protein  29.2 
 
 		 162 aa  41.6  0.003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01848  hypothetical protein  33.78 
 
 		 162 aa  41.6  0.003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.738926  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3634  hypothetical protein  33.62 
 
 		 179 aa  42  0.003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.258453  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01837  hypothetical protein  33.78 
 
 		 162 aa  41.6  0.003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.832343  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1763  protein of unknown function DUF1311  33.78 
 
 		 162 aa  41.6  0.004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.894769  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2109  hypothetical protein  33.78 
 
 		 162 aa  41.6  0.004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2614  hypothetical protein  29.09 
 
 		 162 aa  41.2  0.005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000390538 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2138  hypothetical protein  26.02 
 
 		 129 aa  41.2  0.006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.268038  normal  0.206157 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2912  hypothetical protein  40.82 
 
 		 162 aa  40.4  0.007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.176537  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3647  protein of unknown function DUF1311  27.27 
 
 		 140 aa  40.8  0.007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.412163 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1972  hypothetical protein  33.78 
 
 		 162 aa  40.8  0.007  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0307  hypothetical protein  28.57 
 
 		 143 aa  40.4  0.008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00224199 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0813  hypothetical protein  32.14 
 
 		 129 aa  40.4  0.009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.540849  normal  0.347559 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5565  hypothetical protein  27.97 
 
 		 251 aa  40  0.01  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.769998 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0554  protein of unknown function DUF1311  31.94 
 
 		 293 aa  40  0.01  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>