More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_2323 on replicon NC_008686
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008686  Pden_2323  putative methyltransferase  100 
 
 		 198 aa  386  1e-107  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.419537 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0901  N-6 adenine-specific DNA methylase  67.03 
 
 		 184 aa  233  1.0000000000000001e-60  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2560  putative methyltransferase  65.95 
 
 		 184 aa  232  2.0000000000000002e-60  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.776175  normal  0.998026 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3005  putative methyltransferase  65.41 
 
 		 184 aa  229  2e-59  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.297488 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0441  hypothetical protein  65.22 
 
 		 185 aa  224  6e-58  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2470  hypothetical protein  61.75 
 
 		 185 aa  213  9.999999999999999e-55  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.499986  normal  0.0264181 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0115  putative methyltransferase  58.38 
 
 		 185 aa  196  1.0000000000000001e-49  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3093  putative methyltransferase  54.84 
 
 		 183 aa  178  4.999999999999999e-44  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.927458  normal  0.392693 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1702  putative methyltransferase  52.94 
 
 		 184 aa  176  2e-43  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.49519  normal  0.330366 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6590  methyltransferase  54.79 
 
 		 185 aa  173  9.999999999999999e-43  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6054  methyltransferase  54.55 
 
 		 185 aa  171  5e-42  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.345289  normal  0.293014 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2549  hypothetical protein  51.32 
 
 		 184 aa  169  3e-41  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.059553  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1357  methyltransferase  50.53 
 
 		 188 aa  167  9e-41  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.318254  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0068  methyltransferase  52.94 
 
 		 185 aa  167  1e-40  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0438519  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0417  putative methyltransferase  52.38 
 
 		 186 aa  167  1e-40  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.591396 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1172  hypothetical protein  48.96 
 
 		 187 aa  165  4e-40  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.701207  normal  0.577502 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1274  hypothetical protein  49.2 
 
 		 185 aa  165  5e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.647229 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0906  hypothetical protein  50.78 
 
 		 188 aa  161  5.0000000000000005e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.273789  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4642  methyltransferase  49.21 
 
 		 187 aa  159  2e-38  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.471552  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0643  putative methyltransferase  50 
 
 		 189 aa  160  2e-38  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3037  putative methyltransferase  50 
 
 		 187 aa  159  3e-38  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  hitchhiker  0.00442708  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0429  putative methyltransferase  48.39 
 
 		 186 aa  158  5e-38  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3170  hypothetical protein  50 
 
 		 184 aa  157  9e-38  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.293392  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0207  hypothetical protein  49.74 
 
 		 187 aa  154  6e-37  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0186  hypothetical protein  49.74 
 
 		 187 aa  154  6e-37  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0907  hypothetical protein  48.15 
 
 		 186 aa  150  1e-35  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2873  methyltransferase  47.15 
 
 		 191 aa  148  5e-35  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.02993 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4320  methyltransferase  50.54 
 
 		 184 aa  145  4.0000000000000006e-34  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.29385  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0523  methyltransferase  46.63 
 
 		 186 aa  144  8.000000000000001e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.741734 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3860  methyltransferase  51.85 
 
 		 184 aa  143  1e-33  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.139739 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4169  methyltransferase  51.85 
 
 		 184 aa  142  3e-33  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.6354 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0617  putative methyltransferase  42.27 
 
 		 186 aa  139  1.9999999999999998e-32  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.0722721 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2378  methyltransferase  42.63 
 
 		 190 aa  139  3e-32  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0432651  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0653  hypothetical protein  48.44 
 
 		 192 aa  135  3.0000000000000003e-31  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.833107  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1209  putative methyltransferase  42.63 
 
 		 185 aa  132  3e-30  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.211028  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0478  methyltransferase  46.91 
 
 		 186 aa  131  6e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.742693  normal  0.414709 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1348  methyltransferase  34.9 
 
 		 186 aa  122  3e-27  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.329844  normal  0.198697 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2008  methyltransferase  45.45 
 
 		 197 aa  120  1.9999999999999998e-26  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0520777  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1760  hypothetical protein  38.78 
 
 		 188 aa  120  1.9999999999999998e-26  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000750881  normal  0.0782311 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2499  putative methyltransferase  37.82 
 
 		 207 aa  119  3e-26  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000314964  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2740  putative methyltransferase  38.66 
 
 		 207 aa  117  9e-26  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.695102  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1277  putative methyltransferase  36.98 
 
 		 210 aa  117  9.999999999999999e-26  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00000114874  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1639  methyltransferase, putative  36.68 
 
 		 194 aa  115  3.9999999999999997e-25  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000207531  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2991  putative methyltransferase  42.41 
 
 		 185 aa  115  3.9999999999999997e-25  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.153926  normal  0.592673 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3033  putative methyltransferase  42.41 
 
 		 185 aa  115  3.9999999999999997e-25  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.70701  normal  0.532082 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1479  putative methyltransferase  41.08 
 
 		 185 aa  112  3e-24  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.275427  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10130  putative methyltransferase  36.9 
 
 		 178 aa  112  5e-24  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0668622  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2085  putative methyltransferase  35.79 
 
 		 184 aa  110  1.0000000000000001e-23  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1244  methyltransferase, putative  38.86 
 
 		 187 aa  110  2.0000000000000002e-23  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0116  methyltransferase  36.55 
 
 		 189 aa  109  2.0000000000000002e-23  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0936  methyltransferase small  42.11 
 
 		 192 aa  108  4.0000000000000004e-23  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000732019  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2308  putative methyltransferase  42.56 
 
 		 196 aa  108  4.0000000000000004e-23  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1737  putative methyltransferase  30.53 
 
 		 186 aa  108  4.0000000000000004e-23  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.575329  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3830  methyltransferase  36.46 
 
 		 180 aa  108  6e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000264244  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1892  methyltransferase  39.79 
 
 		 193 aa  108  7.000000000000001e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1871  methyltransferase  38.42 
 
 		 198 aa  107  1e-22  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2375  hypothetical protein  39.74 
 
 		 199 aa  107  1e-22  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0161405  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1226  methyltransferase  30.85 
 
 		 184 aa  106  2e-22  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2633  putative methyltransferase  34.21 
 
 		 188 aa  105  3e-22  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.000000213912  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1649  methyltransferase  34.41 
 
 		 189 aa  105  3e-22  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1296  hypothetical protein  40.54 
 
 		 180 aa  104  7e-22  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.318441  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2317  methyltransferase  39.15 
 
 		 193 aa  104  8e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1167  methyltransferase  35.48 
 
 		 183 aa  103  1e-21  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.46316 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0999  methyltransferase  37.11 
 
 		 189 aa  103  1e-21  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000716702  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0640  putative methyltransferase  34.21 
 
 		 187 aa  103  2e-21  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000429938  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2656  putative methyltransferase  41.82 
 
 		 192 aa  103  2e-21  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00467361 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4970  methyltransferase  39.38 
 
 		 191 aa  102  4e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.176899 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2191  putative methyltransferase  35.05 
 
 		 187 aa  102  4e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000000224666  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1604  methyltransferase  44.68 
 
 		 187 aa  101  8e-21  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.169342  normal  0.911119 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0632  putative methyltransferase  37.24 
 
 		 187 aa  100  1e-20  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000476134  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1983  putative methyltransferase  35.03 
 
 		 185 aa  100  1e-20  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1171  putative methyltransferase  41.4 
 
 		 187 aa  100  2e-20  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0883292  hitchhiker  0.00000463151 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0714  hypothetical protein  33.51 
 
 		 180 aa  100  2e-20  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.162596  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1336  methyltransferase  40 
 
 		 184 aa  99.8  2e-20  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3700  methyltransferase  44.21 
 
 		 180 aa  99.8  2e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0293121  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1372  hypothetical protein  40 
 
 		 177 aa  100  2e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.196321  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1701  methyltransferase, putative  34.52 
 
 		 185 aa  100  2e-20  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1592  N6-adenine-specific methylase  34.55 
 
 		 184 aa  100  2e-20  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0819075  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0255  methyltransferase  41.58 
 
 		 182 aa  99  4e-20  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.472506  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1881  methyltransferase  31.05 
 
 		 187 aa  99.4  4e-20  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.524785  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1676  methyltransferase  40 
 
 		 186 aa  99  4e-20  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2104  putative methyltransferase  36.93 
 
 		 193 aa  99  4e-20  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0220  methyltransferase  36.93 
 
 		 193 aa  99  4e-20  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1770  methyltransferase  36.17 
 
 		 189 aa  98.6  6e-20  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.00583813  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0172  methyltransferase  40.72 
 
 		 190 aa  98.2  8e-20  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000370992 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1183  putative methyltransferase  33.68 
 
 		 180 aa  97.8  9e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0816757  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1205  putative methyltransferase  33.68 
 
 		 180 aa  97.8  9e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000476793  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1600  putative methyltransferase  39.38 
 
 		 190 aa  97.8  9e-20  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4031  putative methyltransferase  32.11 
 
 		 188 aa  97.8  9e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.10166  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2067  methyltransferase  42.17 
 
 		 187 aa  97.1  1e-19  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2600  hypothetical protein  35.4 
 
 		 181 aa  97.4  1e-19  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1208  putative methyltransferase  32.11 
 
 		 188 aa  97.8  1e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.101765  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2727  hypothetical protein  35.4 
 
 		 181 aa  96.3  2e-19  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5969  methyltransferase  40.22 
 
 		 188 aa  96.7  2e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2278  methyltransferase  43.86 
 
 		 184 aa  96.7  2e-19  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1281  putative methyltransferase  40.86 
 
 		 187 aa  96.3  2e-19  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.816139  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3747  putative methyltransferase  39.06 
 
 		 211 aa  96.7  2e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3598  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  40.37 
 
 		 202 aa  97.1  2e-19  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.547416  normal  0.0837793 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0321  RNA methyltransferase, RsmD family  34.95 
 
 		 194 aa  96.3  3e-19  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.657175 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00281  N6-adenine-specific methylase  36.53 
 
 		 199 aa  96.3  3e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>