More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcal_1397 on replicon NC_009073
Organism: Pyrobaculum calidifontis JCM 11548



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009073  Pcal_1397  ABC transporter related  100 
 
 		 225 aa  454  1e-127  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0983365 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1507  ABC transporter related  73.27 
 
 		 223 aa  284  9e-76  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0976  ABC transporter related  69.05 
 
 		 225 aa  274  8e-73  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.136497 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0057  ABC transporter related  67.62 
 
 		 217 aa  271  8.000000000000001e-72  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.268272  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0526  ABC transporter related protein  37.91 
 
 		 314 aa  112  7.000000000000001e-24  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0396747  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3702  ABC transporter related  40.22 
 
 		 357 aa  107  1e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4913  ABC transporter related  39.71 
 
 		 353 aa  107  1e-22  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.801745 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2335  ABC transporter  41.67 
 
 		 342 aa  107  2e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.321614  normal  0.595854 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1180  ABC transporter related  37.56 
 
 		 312 aa  107  2e-22  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.584734 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2123  ABC transporter related  42.7 
 
 		 542 aa  105  5e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6630  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  37.02 
 
 		 363 aa  105  6e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00510446  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2524  ABC transporter, ATP-binding protein  38.5 
 
 		 342 aa  105  7e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.340978  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0860  ABC transporter related  38.38 
 
 		 353 aa  103  2e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3264  Sigma 54 interacting domain protein  32.55 
 
 		 231 aa  103  2e-21  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000265903  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4680  ABC transporter related  42.55 
 
 		 358 aa  103  2e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3000  ABC transporter related  38.76 
 
 		 356 aa  103  3e-21  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2598  ABC transporter related  39.89 
 
 		 375 aa  102  4e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.375786  normal  0.576276 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2597  ABC transporter related  37.04 
 
 		 373 aa  102  4e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.236865  normal  0.853595 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2558  ABC transporter related  37.04 
 
 		 371 aa  102  4e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2603  ABC transporter related  37.04 
 
 		 371 aa  102  4e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.758316  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1770  ABC transporter related  41.79 
 
 		 405 aa  102  5e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0636101  decreased coverage  0.00357448 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0750  polyamine/opine/phosphonate ABC transporter ATPase  37.82 
 
 		 363 aa  102  5e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0659663  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1959  ABC transporter for sugar ATP-binding protein  39.23 
 
 		 367 aa  102  5e-21  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0133693  normal  0.34648 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7593  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  35.15 
 
 		 397 aa  102  7e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6516  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  38.39 
 
 		 406 aa  100  1e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.268585 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3588  ABC transporter related  38.62 
 
 		 362 aa  101  1e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.819948  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4431  ABC transporter related  37.5 
 
 		 363 aa  101  1e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.140949  normal  0.44138 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3853  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  35.21 
 
 		 357 aa  101  1e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5458  ABC transporter related  42.02 
 
 		 416 aa  101  1e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.665559 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4672  ABC transporter related  38.55 
 
 		 219 aa  100  1e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.592834 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5058  ABC transporter related  35.19 
 
 		 360 aa  100  2e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.309189  normal  0.0933032 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1980  ABC transporter related  40.4 
 
 		 349 aa  100  2e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.262332  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4920  ABC transporter related  38.71 
 
 		 378 aa  100  2e-20  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03320  ABC transporter related  36.32 
 
 		 368 aa  100  2e-20  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3943  ABC transporter related  39.44 
 
 		 403 aa  100  2e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.39994  normal  0.0172807 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2026  ABC transporter related  40.4 
 
 		 349 aa  100  2e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1960  ABC transporter related  40.4 
 
 		 349 aa  100  2e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.256367  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0023  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  40.66 
 
 		 447 aa  100  2e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.222017  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1031  ABC transporter related  39.89 
 
 		 371 aa  100  2e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.865528  normal  0.0793172 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1537  ABC transporter related  38.54 
 
 		 355 aa  100  2e-20  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0442847  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0053  ABC transporter related  33.33 
 
 		 309 aa  99.8  3e-20  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.916211  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7050  ABC transporter related  35.68 
 
 		 356 aa  99.8  3e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.348083 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2559  ABC transporter related  39.33 
 
 		 375 aa  99.8  3e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2331  ABC transporter related protein  39.89 
 
 		 404 aa  99.8  3e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.048634  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2604  ABC transporter related  39.33 
 
 		 375 aa  99.8  3e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1407  ABC transporter related protein  41.11 
 
 		 358 aa  99.4  4e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1669  ABC transporter related  38.65 
 
 		 392 aa  99.4  4e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.730035  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0488  2-aminoethylphosphonate ABC transporter ATP-binding component PhnT  40.32 
 
 		 369 aa  99  5e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3541  ABC transporter related  37.81 
 
 		 360 aa  99  5e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2833  ABC transporter related  38.07 
 
 		 415 aa  99  5e-20  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4361  spermidine/putrescine ABC transporter ATP-binding subunit  37.2 
 
 		 362 aa  99  5e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.0000264978  normal  0.276396 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5376  ABC transporter related  37.81 
 
 		 360 aa  99  5e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.628457 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1586  ABC transporter related  38.02 
 
 		 355 aa  99  5e-20  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1699  ABC transporter related  41.67 
 
 		 355 aa  99  6e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4352  ABC transporter related  39.01 
 
 		 369 aa  98.6  7e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000333427 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3816  ABC transporter related protein  41.08 
 
 		 351 aa  98.6  7e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.111196  hitchhiker  0.00416634 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0467  2-aminoethylphosphonate ABC transport system, ATP-binding component PhnT  40.32 
 
 		 369 aa  98.6  8e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0243  ABC transporter related  37.74 
 
 		 342 aa  98.2  8e-20  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.251428 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1247  ABC transporter related  37.56 
 
 		 364 aa  98.2  9e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.198053  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5094  ABC transporter related protein  39.57 
 
 		 408 aa  98.2  9e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.344366 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4651  ABC transporter related  38.12 
 
 		 367 aa  98.2  9e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1152  ABC transporter related  33.33 
 
 		 312 aa  97.8  1e-19  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3120  ABC transporter, ATPase subunit  40.91 
 
 		 348 aa  97.4  1e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.726424  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4913  ABC transporter related  39.13 
 
 		 383 aa  97.8  1e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.700005  normal  0.675349 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2068  ABC transporter related  39.29 
 
 		 364 aa  97.8  1e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3314  ABC transporter related  41.11 
 
 		 348 aa  97.4  1e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.761425  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0807  molybdate ABC transporter, ATPase subunit  34.08 
 
 		 369 aa  98.2  1e-19  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4944  ABC transporter related  39.46 
 
 		 364 aa  98.2  1e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1063  ABC transporter related  38.83 
 
 		 360 aa  98.2  1e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.413058  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3205  ABC transporter related  40.21 
 
 		 339 aa  97.4  1e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2094  ABC transporter related  39.13 
 
 		 367 aa  97.8  1e-19  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0094  ABC sorbitol/mannitol transporter, ATPase subunit  39.13 
 
 		 332 aa  97.1  2e-19  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3448  ABC sugar transporter, ATPase subunit  38.76 
 
 		 371 aa  96.7  2e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0130307  normal  1 
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3796  ABC transporter related  36.96 
 
 		 332 aa  96.7  2e-19  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.680907 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1570  molybdate ABC transporter, ATPase subunit  40.2 
 
 		 356 aa  97.1  2e-19  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.849947  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4728  ABC transporter related  36.23 
 
 		 360 aa  97.1  2e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.871256  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3635  ABC transporter related  36.23 
 
 		 360 aa  97.1  2e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.340284 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3228  ABC transporter-related protein  41.11 
 
 		 348 aa  97.1  2e-19  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1050  ABC transporter related  36.07 
 
 		 356 aa  97.4  2e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.125219  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1170  ABC transporter related  40.84 
 
 		 347 aa  97.4  2e-19  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.257531  normal  0.0522399 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0387  ABC transporter related  31.1 
 
 		 367 aa  96.7  2e-19  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1730  ABC transporter related  39.13 
 
 		 332 aa  97.4  2e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.072502  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1979  ABC transporter related protein  31.96 
 
 		 324 aa  96.3  3e-19  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2355  ABC transporter related  36.54 
 
 		 333 aa  96.3  3e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.297181  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4422  ABC transporter related protein  38.25 
 
 		 398 aa  96.3  3e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.945238  normal  0.406817 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1027  ABC transporter related  37.26 
 
 		 370 aa  96.7  3e-19  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.0361894 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0661  glycerol-3-phosphate ABC transporter, ATP-binding protein  36.17 
 
 		 368 aa  96.3  3e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000119  molybdenum transport ATP-binding protein ModC  33.64 
 
 		 368 aa  96.3  3e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.40487  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0790  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  37.5 
 
 		 372 aa  96.7  3e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.279429 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4895  ABC transporter related  37.23 
 
 		 393 aa  96.7  3e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0973  molybdate ABC transporter ATP-binding protein  37.44 
 
 		 365 aa  96.7  3e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5328  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  37.5 
 
 		 391 aa  96.3  3e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1165  ABC transporter related  37.28 
 
 		 363 aa  96.7  3e-19  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.191612  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1716  ABC transporter related  38.04 
 
 		 365 aa  96.3  4e-19  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5516  molybdate ABC transporter, ATPase subunit  39.91 
 
 		 358 aa  96.3  4e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.929695 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4290  ABC transporter related  39.67 
 
 		 360 aa  96.3  4e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.439892  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4268  ABC transporter-related protein  39.67 
 
 		 360 aa  96.3  4e-19  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12730  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  35.83 
 
 		 361 aa  96.3  4e-19  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.306152  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1237  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  37.37 
 
 		 370 aa  96.3  4e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3711  molybdate ABC transporter, ATPase subunit  40.37 
 
 		 358 aa  95.9  4e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>