More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mkms_2604 on replicon NC_008705
Organism: Mycobacterium sp. KMS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009077  Mjls_2598  ABC transporter related  98.93 
 
 
375 aa  738    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.375786  normal  0.576276 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2559  ABC transporter related  100 
 
 
375 aa  750    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2604  ABC transporter related  100 
 
 
375 aa  750    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2094  ABC transporter related  67.21 
 
 
367 aa  469  1.0000000000000001e-131  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4070  ABC transporter related protein  53.42 
 
 
360 aa  363  4e-99  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.522742  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2492  ABC transporter related protein  46.76 
 
 
370 aa  291  1e-77  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.469403  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0852  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  44.2 
 
 
351 aa  282  7.000000000000001e-75  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.520251  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1063  ABC transporter related  44.77 
 
 
360 aa  278  2e-73  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.413058  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5080  ABC transporter related  43.37 
 
 
368 aa  275  1.0000000000000001e-72  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.199927 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1262  ABC transporter related  44.48 
 
 
357 aa  275  1.0000000000000001e-72  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03330  ABC transporter related  41.67 
 
 
378 aa  272  6e-72  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0788  ABC transporter related  43.65 
 
 
335 aa  271  2e-71  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0859  ABC transporter related  43.65 
 
 
335 aa  270  2e-71  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.928128 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06399  hypothetical protein  42.15 
 
 
385 aa  270  2.9999999999999997e-71  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0329  ABC transporter related  41.19 
 
 
379 aa  268  1e-70  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.939732 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1537  ABC transporter related  42.74 
 
 
355 aa  268  1e-70  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0442847  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1586  ABC transporter related  42.74 
 
 
355 aa  267  2e-70  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1942  ABC transporter ATP-binding protein  40.87 
 
 
386 aa  266  4e-70  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4367  ABC transporter-like  39.89 
 
 
386 aa  265  7e-70  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.201589  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1878  ABC transporter related  43.67 
 
 
371 aa  265  1e-69  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.229415  normal  0.103205 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2947  ABC transporter related  41.08 
 
 
356 aa  264  2e-69  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.196762  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0365  ABC transporter related protein  42.82 
 
 
374 aa  264  2e-69  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.343115  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4132  ABC transporter related  41.21 
 
 
357 aa  264  2e-69  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.751697  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3481  ABC transporter related  42.66 
 
 
352 aa  264  2e-69  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2333  ABC transporter related protein  41.26 
 
 
361 aa  264  2e-69  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5360  ABC transporter related  42.31 
 
 
368 aa  263  3e-69  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0987368  normal  0.364959 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3618  ABC transporter related  43.05 
 
 
361 aa  263  4e-69  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_4019  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  42.19 
 
 
349 aa  263  4e-69  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1556  maltose ABC transporter, ATP-binding protein, putative  40.21 
 
 
379 aa  263  4e-69  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.257646  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3878  ABC transporter related protein  40 
 
 
382 aa  262  6e-69  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2583  ABC transporter related  41.76 
 
 
353 aa  262  6.999999999999999e-69  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0115601  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3396  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  43.09 
 
 
382 aa  261  1e-68  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1641  ABC transporter related  42.38 
 
 
353 aa  261  1e-68  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0717047  normal  0.0310282 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1016  ABC transporter related  40.69 
 
 
384 aa  261  1e-68  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03320  ABC transporter related  37.84 
 
 
368 aa  261  1e-68  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3048  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  41.33 
 
 
372 aa  260  2e-68  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.061373  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3082  ABC transporter, ATP-binding component  40.47 
 
 
379 aa  260  2e-68  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3287  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  41.92 
 
 
349 aa  260  2e-68  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.241244  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2713  ABC transporter related  40.83 
 
 
366 aa  260  2e-68  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4163  ABC transporter related  41.53 
 
 
361 aa  261  2e-68  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.308021  normal  0.489611 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2994  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  41.33 
 
 
372 aa  260  2e-68  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.68586  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3753  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  40.16 
 
 
351 aa  260  3e-68  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6115  ABC transporter related  40.55 
 
 
360 aa  260  3e-68  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.914553 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1158  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  40.22 
 
 
372 aa  260  3e-68  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3677  ABC sugar transporter, ATPase subunit  39.89 
 
 
359 aa  259  4e-68  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0492  ABC transporter related  40.8 
 
 
372 aa  259  4e-68  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.495421  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23010  putative ATP-binding component of ABC transporter  40.65 
 
 
386 aa  260  4e-68  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0424351 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0971  ABC transporter related  40.8 
 
 
372 aa  259  4e-68  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3523  ABC transporter related  39.29 
 
 
363 aa  259  4e-68  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0932  ABC transporter related  40.8 
 
 
372 aa  259  4e-68  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1587  ABC transporter related protein  39.07 
 
 
367 aa  259  4e-68  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5155  ABC transporter related protein  40.56 
 
 
395 aa  259  5.0000000000000005e-68  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.766387 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3906  ABC transporter related  42.28 
 
 
361 aa  259  5.0000000000000005e-68  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.294989 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4206  ABC transporter related  40.11 
 
 
384 aa  259  6e-68  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3412  ABC transporter related  39.89 
 
 
359 aa  259  7e-68  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1407  ABC transporter related protein  44.07 
 
 
358 aa  259  7e-68  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2052  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  42.12 
 
 
367 aa  259  7e-68  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.117618  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1981  ABC transporter related  40.33 
 
 
368 aa  259  7e-68  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.114074  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6527  ABC transporter related  40 
 
 
360 aa  259  7e-68  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.146695 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2591  ABC transporter related  40.33 
 
 
368 aa  259  7e-68  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0994309  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1719  ABC transporter related  45.89 
 
 
364 aa  259  8e-68  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.430519 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2126  maltose ABC transporter, ATP-binding protein, putative  41.33 
 
 
372 aa  259  8e-68  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.210369  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4074  ABC sugar transporter, ATPase subunit  40.53 
 
 
372 aa  258  8e-68  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.785195  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5922  ABC sugar transporter, fused ATPase subunits  40.27 
 
 
369 aa  258  8e-68  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1994  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  41.33 
 
 
372 aa  259  8e-68  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.630648  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0786  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  41.33 
 
 
372 aa  259  8e-68  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.243222  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2618  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  41.33 
 
 
372 aa  259  8e-68  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.654814  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3282  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  42.38 
 
 
349 aa  258  9e-68  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.434692  normal  0.636051 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2507  ABC transporter related  39.62 
 
 
369 aa  258  9e-68  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0382888  normal  0.462927 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03299  glycerol-3-phosphate transporter subunit  39.5 
 
 
356 aa  258  1e-67  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.90322  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03252  hypothetical protein  39.5 
 
 
356 aa  258  1e-67  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.913245  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0947  ATPase  41.48 
 
 
355 aa  258  1e-67  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3647  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  39.5 
 
 
356 aa  258  1e-67  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0631  ABC transporter related  39.84 
 
 
371 aa  258  1e-67  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2639  ABC transporter related  39.62 
 
 
369 aa  258  1e-67  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.716845  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0266  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  39.5 
 
 
356 aa  258  1e-67  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0202281  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2427  ABC transporter related  40.53 
 
 
372 aa  258  2e-67  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1116  ABC transporter:TOBE  38.69 
 
 
389 aa  257  2e-67  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.110421  normal  0.561117 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2049  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  41.4 
 
 
369 aa  258  2e-67  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1260  ABC transporter component  42.55 
 
 
372 aa  257  2e-67  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0843  ABC transporter related  40.37 
 
 
371 aa  257  2e-67  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.811214  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3928  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  39.5 
 
 
356 aa  258  2e-67  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1098  ABC transporter related  44.97 
 
 
352 aa  257  2e-67  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2710  ABC transporter related  40.9 
 
 
333 aa  257  2e-67  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1716  ABC transporter related  38.75 
 
 
365 aa  258  2e-67  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0831  ABC transporter related  40.37 
 
 
371 aa  257  2e-67  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2096  ABC transporter ATP-binding protein  39.13 
 
 
373 aa  257  2e-67  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.425612 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2615  ABC transporter related  40.33 
 
 
369 aa  257  2e-67  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2015  ABC transporter related  40.21 
 
 
395 aa  257  2e-67  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.432172 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1959  ABC transporter for sugar ATP-binding protein  43.19 
 
 
367 aa  257  3e-67  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0133693  normal  0.34648 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2913  ABC transporter for sugar/spermidine/putrescine/iron/thiamine ATP-binding protein  38.95 
 
 
366 aa  256  3e-67  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.129164 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4913  ABC transporter related  41.79 
 
 
383 aa  256  4e-67  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.700005  normal  0.675349 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0364  ABC transporter related  39.89 
 
 
365 aa  256  4e-67  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.915388 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3707  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  39.73 
 
 
349 aa  256  4e-67  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.151489  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1018  sugar ABC transporter, ATP-binding subunit  39.63 
 
 
384 aa  256  5e-67  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3229  putative sugar ABC transporter, ATP-binding protein  46.13 
 
 
369 aa  256  5e-67  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.301475  normal  0.329257 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2640  ABC transporter related  43.3 
 
 
349 aa  256  5e-67  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0268682  normal  0.013734 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1031  ABC transporter related  40.64 
 
 
371 aa  256  5e-67  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.865528  normal  0.0793172 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0254  ABC transporter related  41.1 
 
 
353 aa  256  5e-67  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1056  ABC transporter related  39.47 
 
 
384 aa  256  5e-67  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.112143  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>