More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_4070 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013947  Snas_4070  ABC transporter related protein  100 
 
 
360 aa  715    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.522742  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2094  ABC transporter related  56.42 
 
 
367 aa  378  1e-104  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2598  ABC transporter related  53.85 
 
 
375 aa  363  2e-99  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.375786  normal  0.576276 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2559  ABC transporter related  53.42 
 
 
375 aa  363  3e-99  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2604  ABC transporter related  53.42 
 
 
375 aa  363  3e-99  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2583  ABC transporter related  45 
 
 
353 aa  305  8.000000000000001e-82  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0115601  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3116  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  45.73 
 
 
369 aa  287  2e-76  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1878  ABC transporter related  44.81 
 
 
371 aa  287  2e-76  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.229415  normal  0.103205 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5338  ABC transporter related  44.11 
 
 
355 aa  286  2.9999999999999996e-76  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.708738  normal  0.0411085 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0973  ABC transporter related protein  43.5 
 
 
364 aa  286  2.9999999999999996e-76  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2845  ABC transporter related  47.25 
 
 
379 aa  285  1.0000000000000001e-75  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.649643  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3141  sugar ABC transporter  44.17 
 
 
352 aa  284  2.0000000000000002e-75  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.204703  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3388  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  44.9 
 
 
369 aa  283  2.0000000000000002e-75  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.745344  normal  0.270179 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4327  ABC transporter related  43.09 
 
 
355 aa  280  2e-74  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0513882 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4122  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  39.84 
 
 
366 aa  279  4e-74  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0138965  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5712  ABC transporter related  42.35 
 
 
355 aa  280  4e-74  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.268173 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03330  ABC transporter related  41.51 
 
 
378 aa  279  4e-74  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0603  putative glycerol-3-phosphate ABC transporter, ATP-binding protein  40.6 
 
 
365 aa  280  4e-74  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0629  glycerol-3-phosphate ABC transporter, ATP-binding protein, putative  40.87 
 
 
376 aa  279  6e-74  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1063  ABC transporter related  42.27 
 
 
360 aa  279  6e-74  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.413058  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0697  putative glycerol-3-phosphate ABC transporter, ATP-binding protein  40.6 
 
 
365 aa  278  7e-74  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3778  ABC transporter related  46.59 
 
 
356 aa  278  9e-74  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.37317  normal  0.759953 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0339  ABC transporter related  42.86 
 
 
364 aa  278  9e-74  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.835031  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4120  sn-glycerol 3-phosphate ABC transporter ATP-binding protein  43.13 
 
 
366 aa  278  9e-74  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0441125  normal  0.732793 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4736  putative glycerol-3-phosphate ABC transporter, ATP-binding protein  40.95 
 
 
365 aa  278  1e-73  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.925673  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4747  ABC transporter related  41.8 
 
 
356 aa  278  1e-73  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.155462 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2913  ABC transporter for sugar/spermidine/putrescine/iron/thiamine ATP-binding protein  43.13 
 
 
366 aa  278  1e-73  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.129164 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0535  glycerol-3-phosphate ABC transporter ATP-binding protein  41.42 
 
 
376 aa  277  2e-73  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0622  putative glycerol-3-phosphate ABC transporter, ATP-binding protein  41.42 
 
 
365 aa  277  2e-73  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1262  ABC transporter related  46.8 
 
 
357 aa  277  2e-73  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0566  glycerol-3-phosphate ABC transporter ATP-binding protein  41.42 
 
 
376 aa  277  2e-73  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1117  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  39.57 
 
 
366 aa  277  2e-73  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000190219  normal  0.407597 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0375  sugar ABC transporter ATP-binding protein  43.12 
 
 
364 aa  277  2e-73  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.445668  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0477  glycerol-3-phosphate ABC transporter ATP-binding protein  41.42 
 
 
376 aa  276  3e-73  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4067  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  40.05 
 
 
366 aa  276  4e-73  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.041099  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3925  sugar ABC transporter ATP-binding protein  40.05 
 
 
366 aa  276  4e-73  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0573898  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3757  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  40.05 
 
 
366 aa  276  4e-73  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.305831  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3773  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  40.05 
 
 
366 aa  276  4e-73  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0367372  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4035  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  40.05 
 
 
366 aa  276  4e-73  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4232  sugar ABC transporter ATP-binding protein  40.05 
 
 
366 aa  276  4e-73  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.253901  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0789  ABC transporter  43.09 
 
 
362 aa  276  5e-73  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4498  ABC transporter related protein  42.01 
 
 
381 aa  276  6e-73  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0512744  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2099  sn-glycerol-3-phosphate import ATP-binding protein UgpC  40.7 
 
 
367 aa  275  7e-73  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0157125  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5504  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  42.59 
 
 
381 aa  275  8e-73  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0296  ABC transporter related  42.82 
 
 
362 aa  275  9e-73  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.459609  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1250  ABC transporter related  44.84 
 
 
351 aa  275  9e-73  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.440423 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4666  ABC transporter related  40.98 
 
 
356 aa  275  1.0000000000000001e-72  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.47492 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2640  ABC transporter related  44.23 
 
 
349 aa  275  1.0000000000000001e-72  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0268682  normal  0.013734 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1412  ABC transporter related  42.97 
 
 
364 aa  275  1.0000000000000001e-72  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2907  ABC transporter related  47.14 
 
 
366 aa  274  1.0000000000000001e-72  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.147416  normal  0.101064 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4141  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  39.78 
 
 
366 aa  275  1.0000000000000001e-72  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.000074393  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3844  ABC transporter related  39.25 
 
 
366 aa  275  1.0000000000000001e-72  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00035196  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6516  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  48.54 
 
 
406 aa  274  1.0000000000000001e-72  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.268585 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2549  ABC transporter related  46.91 
 
 
366 aa  274  2.0000000000000002e-72  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.071435  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1532  ABC transporter related  43.4 
 
 
360 aa  274  2.0000000000000002e-72  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1942  ABC transporter ATP-binding protein  43.4 
 
 
386 aa  273  3e-72  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12847  sn-glycerol-3-phosphate transport ATP-binding protein ABC transporter ugpC  43.87 
 
 
360 aa  273  3e-72  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000196891  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2893  ABC transporter related  45.05 
 
 
353 aa  273  3e-72  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.401174  normal  0.250176 
 
 
-
 
NC_007488  RSP_3948  ABC sugar transporter, ATPase subunit  46.2 
 
 
373 aa  273  4.0000000000000004e-72  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.32305  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1424  ABC transporter related protein  41.13 
 
 
370 aa  273  4.0000000000000004e-72  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0607  ABC transporter related  40.98 
 
 
355 aa  273  4.0000000000000004e-72  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000630486 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0479  glycerol-3-phosphate ABC transporter ATP-binding protein  40.87 
 
 
376 aa  273  5.000000000000001e-72  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2717  ABC transporter-related protein  39.25 
 
 
366 aa  272  6e-72  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00458164  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3229  putative sugar ABC transporter, ATP-binding protein  43.8 
 
 
369 aa  272  6e-72  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.301475  normal  0.329257 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8165  ABC transporter related  42.97 
 
 
364 aa  272  7e-72  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0480  ABC transporter related  39.78 
 
 
365 aa  272  7e-72  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1641  ABC transporter related  46.81 
 
 
353 aa  272  7e-72  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0717047  normal  0.0310282 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4342  ABC transporter related  39.95 
 
 
366 aa  272  8.000000000000001e-72  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.949394 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1586  ABC transporter related  44.64 
 
 
355 aa  271  1e-71  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1116  ABC transporter:TOBE  40.96 
 
 
389 aa  271  1e-71  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.110421  normal  0.561117 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1804  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  44.69 
 
 
360 aa  271  1e-71  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.438286  normal 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3878  ABC transporter related protein  40.22 
 
 
382 aa  271  1e-71  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1537  ABC transporter related  44.64 
 
 
355 aa  271  1e-71  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0442847  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00607  sugar ABC transporter ATP-binding protein  44.14 
 
 
365 aa  270  2e-71  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1632  multiple sugar-binding transport, ATP-binding protein  39.73 
 
 
367 aa  270  2e-71  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4829  ABC transporter-like  41.96 
 
 
366 aa  270  2e-71  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0222578 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0329  ABC transporter related  43.28 
 
 
379 aa  271  2e-71  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.939732 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0359  ABC transporter related  42.59 
 
 
362 aa  271  2e-71  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.348394 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0621  ABC transporter related  41.67 
 
 
370 aa  270  2e-71  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0838339  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1869  ABC transporter related  42.2 
 
 
357 aa  270  2e-71  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.443333 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1963  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  44.69 
 
 
360 aa  271  2e-71  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.70286 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4521  ABC transporter related  43.81 
 
 
352 aa  271  2e-71  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.116859  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1688  ABC transporter related  48.65 
 
 
357 aa  271  2e-71  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.350685  normal  0.966803 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01295  putative sugar transport protein  44.37 
 
 
360 aa  270  2.9999999999999997e-71  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.215586  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2307  ABC transporter related  44.37 
 
 
360 aa  270  2.9999999999999997e-71  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.384254  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4220  ABC transporter related  43.09 
 
 
363 aa  270  2.9999999999999997e-71  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.886813 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01306  hypothetical protein  44.37 
 
 
360 aa  270  2.9999999999999997e-71  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.157147  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0946  ABC transporter related  42.74 
 
 
366 aa  270  4e-71  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.309285 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3645  hypothetical protein  44.93 
 
 
374 aa  270  4e-71  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.563408  normal  0.0436872 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0823  ABC transporter related  42.43 
 
 
364 aa  269  5e-71  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3526  ABC transporter related protein  44.32 
 
 
355 aa  269  5.9999999999999995e-71  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2947  ABC transporter related  43.01 
 
 
356 aa  269  5.9999999999999995e-71  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.196762  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4657  ABC transporter related  42.82 
 
 
363 aa  269  5.9999999999999995e-71  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.400776  normal  0.472803 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0142  ABC transporter related  44.9 
 
 
363 aa  269  5.9999999999999995e-71  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3768  ABC transporter related  43.35 
 
 
351 aa  269  7e-71  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1897  multiple sugar-binding transport ATP-binding protein  39.47 
 
 
367 aa  268  8e-71  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.105891  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3396  ABC transporter related  40.54 
 
 
364 aa  268  8e-71  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.304213  normal  0.67181 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2198  ABC transporter-like protein  46.31 
 
 
405 aa  268  8e-71  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.829082  normal  0.643805 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3167  ABC transporter related  40.9 
 
 
370 aa  268  8e-71  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2139  ABC transporter related  41.38 
 
 
384 aa  268  8e-71  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.724946  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>