More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcal_0846 on replicon NC_009073
Organism: Pyrobaculum calidifontis JCM 11548



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009073  Pcal_0846  inner-membrane translocator  100 
 
 		 321 aa  614  1e-175  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.643705 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0448  inner-membrane translocator  76.32 
 
 		 320 aa  473  1e-132  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1522  inner-membrane translocator  78.19 
 
 		 321 aa  468  1.0000000000000001e-131  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  hitchhiker  0.0000276655  normal  0.429613 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0547  inner-membrane translocator  78.19 
 
 		 321 aa  461  1e-129  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.182866  hitchhiker  0.0000429252 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0115  inner-membrane translocator  33.33 
 
 		 325 aa  116  6e-25  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3647  inner-membrane translocator  32.04 
 
 		 315 aa  115  1.0000000000000001e-24  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0606167  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5640  inner-membrane translocator  31.85 
 
 		 317 aa  112  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3835  ABC transporter related  35.37 
 
 		 830 aa  111  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2238  inner-membrane translocator  33.44 
 
 		 326 aa  108  2e-22  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5338  ABC transporter related  37.04 
 
 		 823 aa  105  1e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.591038  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0312  inner-membrane translocator  31.89 
 
 		 326 aa  104  2e-21  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.950676  normal  0.481983 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4851  ABC transporter related  37.04 
 
 		 823 aa  103  5e-21  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.356064  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1582  inner-membrane translocator  34.42 
 
 		 313 aa  102  1e-20  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1480  inner-membrane translocator  30.66 
 
 		 407 aa  102  1e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0006  inner-membrane translocator  28.79 
 
 		 344 aa  101  2e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.273042  hitchhiker  0.0000215345 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3735  putative branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  30.66 
 
 		 333 aa  100  3e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2301  inner-membrane translocator  29.47 
 
 		 328 aa  100  4e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.281867 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1471  inner-membrane translocator  30.85 
 
 		 376 aa  99.4  7e-20  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.959824  normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5535  inner-membrane translocator  32.03 
 
 		 361 aa  98.6  1e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.875545  hitchhiker  0.00000782274 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1097  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  30.74 
 
 		 315 aa  98.6  1e-19  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.701299  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1259  inner-membrane translocator  31.4 
 
 		 357 aa  98.6  1e-19  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3556  inner-membrane translocator  33.09 
 
 		 340 aa  97.8  2e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0669576  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3058  inner-membrane translocator  30.81 
 
 		 408 aa  97.4  2e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.12681  hitchhiker  0.000339523 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2142  inner-membrane translocator  32.01 
 
 		 324 aa  98.2  2e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.711821 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0462  inner-membrane translocator  28.47 
 
 		 331 aa  97.4  3e-19  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0897  inner-membrane translocator  30.2 
 
 		 357 aa  96.7  4e-19  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2426  inner-membrane translocator  30.75 
 
 		 352 aa  96.7  5e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS01987  amino-acid transmembrane ABC transporter protein  32.18 
 
 		 299 aa  96.3  6e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.130303  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1385  leucine/isoleucine/valine transporter permease subunit  29.94 
 
 		 423 aa  95.9  8e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.121753  normal  0.219132 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3288  hypothetical protein  30.1 
 
 		 332 aa  95.5  9e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.334199  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5160  inner-membrane translocator  29.47 
 
 		 332 aa  95.1  1e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.767449  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2958  ABC-type branched-chain amino acid transport system permease component-like protein  28.57 
 
 		 389 aa  95.1  1e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2025  inner-membrane translocator  32.04 
 
 		 339 aa  95.1  1e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1090  inner-membrane translocator  30.45 
 
 		 359 aa  95.5  1e-18  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.538994  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1139  leucine/isoleucine/valine transporter permease subunit  30.58 
 
 		 418 aa  94.4  2e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.268722  normal  0.229928 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1427  inner-membrane translocator  30.82 
 
 		 286 aa  94.4  2e-18  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.732914  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2711  inner-membrane translocator  34.85 
 
 		 358 aa  94.4  2e-18  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0272  inner-membrane translocator  35.32 
 
 		 353 aa  94  3e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.337151  normal  0.772291 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0527  inner-membrane translocator  33.22 
 
 		 562 aa  94  3e-18  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.142697  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1173  leucine/isoleucine/valine transporter permease subunit  30.28 
 
 		 418 aa  94  3e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.556835  normal  0.907427 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7433  ABC transporter membrane spanning protein (branched chain amino acid)  32.87 
 
 		 363 aa  94  3e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2203  inner-membrane translocator  31.62 
 
 		 302 aa  93.6  4e-18  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0625  inner-membrane translocator  29.68 
 
 		 352 aa  93.6  4e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.580095  normal  0.15639 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1580  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  28.44 
 
 		 317 aa  93.2  5e-18  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.571371  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1156  leucine/isoleucine/valine transporter permease subunit  30.18 
 
 		 418 aa  93.6  5e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.652627  normal  0.0268072 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1124  putative transport system permease protein  36.19 
 
 		 368 aa  93.2  5e-18  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.101102  normal  0.0627537 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3363  inner-membrane translocator  34.35 
 
 		 358 aa  93.2  5e-18  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.585542 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1876  inner-membrane translocator  35.85 
 
 		 358 aa  93.2  6e-18  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.255765  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2609  inner-membrane translocator  30.8 
 
 		 415 aa  92.8  7e-18  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2235  inner-membrane translocator  30.12 
 
 		 327 aa  92.8  7e-18  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.344649  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4278  leucine/isoleucine/valine transporter permease subunit  30.28 
 
 		 418 aa  92.8  7e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.264378  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3293  ABC branched-chain amino acid transporter, inner membrane subunit  29.73 
 
 		 332 aa  92.4  8e-18  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.11625  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0851  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  30 
 
 		 333 aa  92.4  8e-18  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.589569  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0482  ABC transporter permease  30.82 
 
 		 324 aa  92.4  8e-18  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0836  inner-membrane translocator  31.96 
 
 		 318 aa  92.4  9e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.997362 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_4025  inner-membrane translocator  29.73 
 
 		 332 aa  92.4  1e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0957  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  29.26 
 
 		 331 aa  92.4  1e-17  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.834531  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6433  inner-membrane translocator  31.1 
 
 		 344 aa  92  1e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0224691  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0535  inner-membrane translocator  29.07 
 
 		 401 aa  91.7  2e-17  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000217655 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5828  branched chain amino acid ABC transporter inner membrane protein  35.38 
 
 		 389 aa  90.9  2e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.944679  normal  0.156755 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1944  inner-membrane translocator  30.94 
 
 		 297 aa  91.7  2e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3483  inner-membrane translocator  28.12 
 
 		 328 aa  90.9  2e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.742895  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2893  inner-membrane translocator  29.25 
 
 		 652 aa  91.3  2e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3375  inner-membrane translocator  29.59 
 
 		 390 aa  90.9  2e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0104917 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0908  inner-membrane translocator  31.74 
 
 		 338 aa  91.3  2e-17  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.579851  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0261  inner-membrane translocator  27.64 
 
 		 324 aa  90.5  3e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0547  inner-membrane translocator  31.73 
 
 		 337 aa  90.9  3e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2543  inner-membrane translocator  35.64 
 
 		 389 aa  90.5  3e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.548123  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0089  inner-membrane translocator  30.31 
 
 		 324 aa  90.5  3e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.828472 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1750  inner-membrane translocator  29.8 
 
 		 452 aa  90.5  4e-17  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.40589  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4079  inner-membrane translocator  27.45 
 
 		 323 aa  90.5  4e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0078  inner-membrane translocator  29.94 
 
 		 324 aa  90.1  4e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1084  inner-membrane translocator  30.84 
 
 		 435 aa  90.1  4e-17  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0450701  normal  0.660313 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2439  amino-acid transmembrane ABC transporter protein  32.85 
 
 		 378 aa  89.7  5e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.703384  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0936  branched chain amino acid ABC transporter inner membrane protein  30.03 
 
 		 656 aa  90.1  5e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0175058  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2308  inner-membrane translocator  27.91 
 
 		 372 aa  89.7  6e-17  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20620  ABC-type branched-chain amino acid transport system, permease component  30 
 
 		 439 aa  89.7  6e-17  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.585319  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2587  inner-membrane translocator  33.46 
 
 		 317 aa  89.7  6e-17  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.629922  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5395  inner-membrane translocator  30.77 
 
 		 463 aa  89.7  6e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.118271 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1618  ABC transporter related  29.41 
 
 		 616 aa  89.4  7e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.103337  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1968  ABC transporter related  36.76 
 
 		 827 aa  89.4  7e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.140835  normal  0.0336357 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3055  inner-membrane translocator  31.94 
 
 		 324 aa  89.4  7e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1079  inner-membrane translocator  27.64 
 
 		 333 aa  89.4  7e-17  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.710188  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2283  inner-membrane translocator  27.59 
 
 		 318 aa  89.4  7e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2007  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  29.71 
 
 		 357 aa  89.4  8e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.551976  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1448  inner-membrane translocator  31.25 
 
 		 337 aa  89.4  8e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  decreased coverage  0.00412694  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2865  inner-membrane translocator  34.86 
 
 		 384 aa  89.4  8e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.267921  normal  0.620309 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1286  inner-membrane translocator  31.25 
 
 		 337 aa  89.4  8e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.20936  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2899  ABC transporter related  31.23 
 
 		 852 aa  89.4  8e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3772  inner-membrane translocator  28 
 
 		 372 aa  89.4  8e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.00496124  hitchhiker  0.00284039 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1246  leucine/isoleucine/valine transporter permease subunit  31.13 
 
 		 418 aa  89  9e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.6169 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6413  inner-membrane translocator  34.66 
 
 		 389 aa  89.4  9e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3393  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  29.29 
 
 		 307 aa  89  1e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3307  inner-membrane translocator  27.5 
 
 		 314 aa  88.6  1e-16  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1837  leucine/isoleucine/valine transporter permease subunit  30.13 
 
 		 423 aa  89  1e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.53398  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0786  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  33.94 
 
 		 389 aa  88.6  1e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3838  inner-membrane translocator  30.92 
 
 		 315 aa  88.6  1e-16  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.242692  normal  0.204744 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3967  inner-membrane translocator  30.64 
 
 		 322 aa  88.6  1e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2977  inner-membrane translocator  30.59 
 
 		 454 aa  88.6  1e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1395  inner-membrane translocator  31.1 
 
 		 293 aa  89  1e-16  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>