More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GSU2007 on replicon NC_002939
Organism: Geobacter sulfurreducens PCA



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU2007  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  100 
 
 		 357 aa  707    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.551976  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1532  inner-membrane translocator  58.89 
 
 		 368 aa  394  1e-108  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.378741  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1437  inner-membrane translocator  58.89 
 
 		 368 aa  394  1e-108  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1453  inner-membrane translocator  60.6 
 
 		 366 aa  372  1e-102  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.230295  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2426  ABC branched-chain amino acid transporter, inner membrane subunit  58.6 
 
 		 368 aa  352  4e-96  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1828  inner-membrane translocator  53.82 
 
 		 331 aa  336  3.9999999999999995e-91  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000769607  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0851  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  53 
 
 		 333 aa  329  3e-89  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.589569  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0312  inner-membrane translocator  44.58 
 
 		 326 aa  267  2e-70  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.950676  normal  0.481983 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1582  inner-membrane translocator  39.04 
 
 		 313 aa  238  1e-61  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1663  inner-membrane translocator  39.01 
 
 		 326 aa  223  3e-57  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3750  ABC transporter related  35.91 
 
 		 603 aa  221  9.999999999999999e-57  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.408417  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1618  ABC transporter related  35.8 
 
 		 616 aa  211  1e-53  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.103337  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1950  inner-membrane translocator  37.85 
 
 		 328 aa  211  1e-53  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1849  inner-membrane translocator  37.73 
 
 		 328 aa  210  3e-53  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.200349 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3618  inner-membrane translocator  37.2 
 
 		 328 aa  208  1e-52  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.466346  normal  0.345258 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2128  inner-membrane translocator  39.81 
 
 		 344 aa  207  2e-52  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.212047  normal  0.208516 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1100  inner-membrane translocator  36.87 
 
 		 343 aa  207  3e-52  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0111942  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0337  branched-chain amino acid ABC transporter, permease/ATP-binding protein  35.11 
 
 		 609 aa  206  4e-52  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2886  putative ABC transporter permiase component  36.11 
 
 		 334 aa  203  3e-51  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0441971 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0006  inner-membrane translocator  34.9 
 
 		 344 aa  202  9.999999999999999e-51  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.273042  hitchhiker  0.0000215345 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1708  inner-membrane translocator  37.64 
 
 		 348 aa  201  1.9999999999999998e-50  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.550604  normal  0.0112984 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0897  inner-membrane translocator  38.05 
 
 		 357 aa  198  1.0000000000000001e-49  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1500  inner-membrane translocator  36.31 
 
 		 336 aa  195  9e-49  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.101712  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1090  inner-membrane translocator  34.81 
 
 		 359 aa  194  2e-48  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.538994  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2301  inner-membrane translocator  33.44 
 
 		 328 aa  166  4e-40  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.281867 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4441  ABC transporter related  31.71 
 
 		 603 aa  160  3e-38  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2283  inner-membrane translocator  29.97 
 
 		 318 aa  160  4e-38  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3398  inner-membrane translocator  32.49 
 
 		 335 aa  159  7e-38  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0288037 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2365  high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  33.02 
 
 		 339 aa  158  1e-37  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.554509  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3647  inner-membrane translocator  30.16 
 
 		 315 aa  155  1e-36  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0606167  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0361  inner-membrane translocator  36.39 
 
 		 333 aa  150  4e-35  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3820  inner-membrane translocator  30.88 
 
 		 328 aa  149  1.0000000000000001e-34  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0270491  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0835  inner-membrane translocator  32.3 
 
 		 335 aa  147  3e-34  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0400978  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0143  inner-membrane translocator  30.91 
 
 		 311 aa  144  2e-33  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1929  inner-membrane translocator  35.16 
 
 		 318 aa  144  2e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.456236  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1564  inner-membrane translocator  33.55 
 
 		 339 aa  140  3e-32  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1140  inner-membrane translocator  33.23 
 
 		 328 aa  139  4.999999999999999e-32  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.129861 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1259  inner-membrane translocator  32.14 
 
 		 357 aa  139  1e-31  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1482  inner-membrane translocator  31.19 
 
 		 360 aa  138  1e-31  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2587  inner-membrane translocator  32.39 
 
 		 317 aa  137  3.0000000000000003e-31  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.629922  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5993  putative branched-chain amino acid ABC transporter (permease protein)  33.03 
 
 		 323 aa  137  4e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.329288  normal  0.170989 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2128  inner-membrane translocator  28.81 
 
 		 337 aa  137  4e-31  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0587  inner-membrane translocator  28.19 
 
 		 398 aa  136  6.0000000000000005e-31  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0794  inner-membrane translocator  31.87 
 
 		 327 aa  136  7.000000000000001e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.605525  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3838  inner-membrane translocator  31.3 
 
 		 315 aa  135  8e-31  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.242692  normal  0.204744 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0908  inner-membrane translocator  31.65 
 
 		 338 aa  135  8e-31  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.579851  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4055  ABC transporter related  30.28 
 
 		 663 aa  135  9e-31  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1863  inner-membrane translocator  29.13 
 
 		 321 aa  135  9e-31  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2142  inner-membrane translocator  31.44 
 
 		 324 aa  135  9.999999999999999e-31  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.711821 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0115  inner-membrane translocator  30.93 
 
 		 325 aa  134  3e-30  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1906  inner-membrane translocator  31.49 
 
 		 326 aa  134  3e-30  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.257462 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0863  branched chain amino acid ABC transporter inner membrane protein  33.61 
 
 		 334 aa  133  5e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0562534  normal  0.217688 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0670  inner-membrane translocator  31.75 
 
 		 335 aa  132  7.999999999999999e-30  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1839  inner-membrane translocator  31.27 
 
 		 350 aa  132  7.999999999999999e-30  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1097  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  28.16 
 
 		 315 aa  131  2.0000000000000002e-29  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.701299  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0801  inner-membrane translocator  28.75 
 
 		 326 aa  131  2.0000000000000002e-29  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.950338 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1602  inner-membrane translocator  33.68 
 
 		 336 aa  130  3e-29  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.47347  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0261  inner-membrane translocator  28.44 
 
 		 324 aa  130  4.0000000000000003e-29  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0221  branched chain amino acid ABC transporter inner membrane protein  30.94 
 
 		 328 aa  130  4.0000000000000003e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.126663  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0643  inner-membrane translocator  30 
 
 		 347 aa  130  4.0000000000000003e-29  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6413  inner-membrane translocator  28.32 
 
 		 389 aa  128  1.0000000000000001e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3659  inner-membrane translocator  29.25 
 
 		 341 aa  128  1.0000000000000001e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0527  inner-membrane translocator  31.01 
 
 		 562 aa  129  1.0000000000000001e-28  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.142697  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1673  inner-membrane translocator  28.21 
 
 		 319 aa  128  1.0000000000000001e-28  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3393  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  29.13 
 
 		 307 aa  128  2.0000000000000002e-28  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5835  inner-membrane translocator  30.33 
 
 		 344 aa  127  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.825187  hitchhiker  0.0031354 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1821  inner-membrane translocator  31.13 
 
 		 328 aa  128  2.0000000000000002e-28  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3688  inner-membrane translocator  31.65 
 
 		 330 aa  127  4.0000000000000003e-28  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0272  inner-membrane translocator  31.67 
 
 		 353 aa  126  6e-28  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.337151  normal  0.772291 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2609  inner-membrane translocator  28.1 
 
 		 415 aa  126  6e-28  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3103  inner-membrane translocator  30.6 
 
 		 354 aa  126  7e-28  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1944  inner-membrane translocator  29.17 
 
 		 297 aa  125  8.000000000000001e-28  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2422  inner-membrane translocator  28.28 
 
 		 355 aa  125  9e-28  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.892613  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3327  inner-membrane translocator  31.76 
 
 		 463 aa  125  9e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.630335 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4183  inner-membrane translocator  26.98 
 
 		 358 aa  125  1e-27  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.708738  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2977  inner-membrane translocator  29.25 
 
 		 454 aa  124  2e-27  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5640  inner-membrane translocator  27.92 
 
 		 317 aa  124  2e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2015  inner-membrane translocator  28.43 
 
 		 287 aa  124  2e-27  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.60727  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3772  inner-membrane translocator  29.29 
 
 		 372 aa  123  4e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.00496124  hitchhiker  0.00284039 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0354  inner-membrane translocator  33.08 
 
 		 311 aa  123  4e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.112024  normal  0.284931 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0934  inner-membrane translocator  27.49 
 
 		 327 aa  123  4e-27  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000000511533  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5694  inner-membrane translocator  32.2 
 
 		 348 aa  123  5e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00469436 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5160  inner-membrane translocator  30.92 
 
 		 332 aa  123  5e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.767449  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1424  inner-membrane translocator  32.53 
 
 		 381 aa  123  6e-27  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.132982  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3071  inner-membrane translocator  32.89 
 
 		 463 aa  123  6e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.730301  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3483  inner-membrane translocator  29.61 
 
 		 328 aa  122  7e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.742895  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1746  inner-membrane translocator  30.29 
 
 		 474 aa  122  8e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2501  inner-membrane translocator  28.7 
 
 		 345 aa  122  9e-27  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3367  inner-membrane translocator  31 
 
 		 342 aa  122  9.999999999999999e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3514  ABC transporter membrane spanning protein (branched chain amino acid)  30.5 
 
 		 463 aa  122  9.999999999999999e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3011  inner-membrane translocator  31.94 
 
 		 370 aa  121  1.9999999999999998e-26  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000152809  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1113  inner-membrane translocator  31.13 
 
 		 460 aa  121  1.9999999999999998e-26  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1124  putative transport system permease protein  33.33 
 
 		 368 aa  121  1.9999999999999998e-26  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.101102  normal  0.0627537 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1724  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  31.46 
 
 		 459 aa  121  1.9999999999999998e-26  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0400  ABC transporter permease  31.09 
 
 		 316 aa  121  1.9999999999999998e-26  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1679  inner-membrane translocator  26.45 
 
 		 317 aa  121  1.9999999999999998e-26  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1850  inner-membrane translocator  30.29 
 
 		 340 aa  120  3e-26  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.2267  normal  0.119632 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3708  branched chain amino acid ABC transporter ATPase/inner membrane protein  28.77 
 
 		 646 aa  120  3.9999999999999996e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.400523  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0997  inner-membrane translocator  26.32 
 
 		 321 aa  120  3.9999999999999996e-26  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.915307  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1480  inner-membrane translocator  28.57 
 
 		 407 aa  120  3.9999999999999996e-26  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>