More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rxyl_0361 on replicon NC_008148
Organism: Rubrobacter xylanophilus DSM 9941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008148  Rxyl_0361  inner-membrane translocator  100 
 
 		 333 aa  632  1e-180  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1090  inner-membrane translocator  45.92 
 
 		 359 aa  232  9e-60  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.538994  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1663  inner-membrane translocator  38.67 
 
 		 326 aa  210  3e-53  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0006  inner-membrane translocator  40.38 
 
 		 344 aa  206  3e-52  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.273042  hitchhiker  0.0000215345 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3618  inner-membrane translocator  37.31 
 
 		 328 aa  206  4e-52  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.466346  normal  0.345258 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1708  inner-membrane translocator  40.56 
 
 		 348 aa  204  1e-51  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.550604  normal  0.0112984 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1950  inner-membrane translocator  36.39 
 
 		 328 aa  200  1.9999999999999998e-50  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0897  inner-membrane translocator  39.27 
 
 		 357 aa  201  1.9999999999999998e-50  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1849  inner-membrane translocator  38.34 
 
 		 328 aa  200  3.9999999999999996e-50  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.200349 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1929  inner-membrane translocator  43.88 
 
 		 318 aa  198  1.0000000000000001e-49  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.456236  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2886  putative ABC transporter permiase component  36.28 
 
 		 334 aa  195  8.000000000000001e-49  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0441971 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0794  inner-membrane translocator  44.26 
 
 		 327 aa  193  3e-48  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.605525  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1618  ABC transporter related  37.3 
 
 		 616 aa  191  1e-47  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.103337  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1828  inner-membrane translocator  36.97 
 
 		 331 aa  189  8e-47  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000769607  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5993  putative branched-chain amino acid ABC transporter (permease protein)  41.89 
 
 		 323 aa  188  1e-46  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.329288  normal  0.170989 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1906  inner-membrane translocator  42.86 
 
 		 326 aa  187  2e-46  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.257462 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2128  inner-membrane translocator  39.73 
 
 		 344 aa  187  2e-46  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.212047  normal  0.208516 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0312  inner-membrane translocator  36.59 
 
 		 326 aa  186  5e-46  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.950676  normal  0.481983 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1582  inner-membrane translocator  35.5 
 
 		 313 aa  184  1.0000000000000001e-45  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0863  branched chain amino acid ABC transporter inner membrane protein  38.58 
 
 		 334 aa  185  1.0000000000000001e-45  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0562534  normal  0.217688 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1500  inner-membrane translocator  40.4 
 
 		 336 aa  181  2e-44  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.101712  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1100  inner-membrane translocator  36.91 
 
 		 343 aa  174  2.9999999999999996e-42  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0111942  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0851  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  33.53 
 
 		 333 aa  174  2.9999999999999996e-42  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.589569  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0337  branched-chain amino acid ABC transporter, permease/ATP-binding protein  36.63 
 
 		 609 aa  172  6.999999999999999e-42  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3398  inner-membrane translocator  37.67 
 
 		 335 aa  171  1e-41  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0288037 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3750  ABC transporter related  37.38 
 
 		 603 aa  169  6e-41  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.408417  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1602  inner-membrane translocator  36.36 
 
 		 336 aa  165  1.0000000000000001e-39  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.47347  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1453  inner-membrane translocator  36.2 
 
 		 366 aa  163  5.0000000000000005e-39  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.230295  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2007  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  36.39 
 
 		 357 aa  161  1e-38  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.551976  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3647  inner-membrane translocator  34.43 
 
 		 315 aa  158  1e-37  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0606167  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1532  inner-membrane translocator  34.62 
 
 		 368 aa  157  2e-37  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.378741  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1437  inner-membrane translocator  34.62 
 
 		 368 aa  157  2e-37  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2301  inner-membrane translocator  34.53 
 
 		 328 aa  157  3e-37  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.281867 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1140  inner-membrane translocator  34.53 
 
 		 328 aa  157  3e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.129861 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1564  inner-membrane translocator  39.66 
 
 		 339 aa  154  1e-36  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2283  inner-membrane translocator  31 
 
 		 318 aa  152  7e-36  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1097  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  33.96 
 
 		 315 aa  147  3e-34  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.701299  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2426  ABC branched-chain amino acid transporter, inner membrane subunit  35.89 
 
 		 368 aa  147  3e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0328  inner-membrane translocator  37.28 
 
 		 325 aa  147  3e-34  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.286891  normal  0.171553 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0801  inner-membrane translocator  35.1 
 
 		 326 aa  141  1.9999999999999998e-32  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.950338 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2365  high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  32.38 
 
 		 339 aa  138  2e-31  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.554509  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2395  inner-membrane translocator  33.76 
 
 		 407 aa  136  5e-31  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4071  inner-membrane translocator  31.82 
 
 		 327 aa  136  5e-31  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.23992 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2128  inner-membrane translocator  31.53 
 
 		 337 aa  135  9.999999999999999e-31  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4441  ABC transporter related  32.59 
 
 		 603 aa  135  9.999999999999999e-31  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0997  inner-membrane translocator  33.85 
 
 		 321 aa  134  1.9999999999999998e-30  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.915307  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0908  inner-membrane translocator  34.98 
 
 		 338 aa  134  3e-30  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.579851  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1424  inner-membrane translocator  34.4 
 
 		 381 aa  133  3.9999999999999996e-30  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.132982  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1863  inner-membrane translocator  31.13 
 
 		 321 aa  132  9e-30  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3820  inner-membrane translocator  32.79 
 
 		 328 aa  131  2.0000000000000002e-29  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0270491  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2238  inner-membrane translocator  31.43 
 
 		 326 aa  130  3e-29  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2951  inner-membrane translocator  34.04 
 
 		 323 aa  130  4.0000000000000003e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0213557  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2111  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  35.09 
 
 		 298 aa  130  4.0000000000000003e-29  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4183  inner-membrane translocator  31.85 
 
 		 358 aa  129  5.0000000000000004e-29  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.708738  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2609  inner-membrane translocator  31.78 
 
 		 415 aa  128  1.0000000000000001e-28  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1673  inner-membrane translocator  31.76 
 
 		 319 aa  129  1.0000000000000001e-28  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0221  branched chain amino acid ABC transporter inner membrane protein  31.17 
 
 		 328 aa  126  4.0000000000000003e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.126663  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1395  inner-membrane translocator  35.62 
 
 		 293 aa  126  5e-28  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3055  inner-membrane translocator  32.24 
 
 		 324 aa  125  1e-27  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1944  inner-membrane translocator  31.29 
 
 		 297 aa  125  1e-27  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0835  inner-membrane translocator  31.27 
 
 		 335 aa  125  1e-27  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0400978  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0527  inner-membrane translocator  31.07 
 
 		 562 aa  124  2e-27  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.142697  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4096  inner-membrane translocator  33.76 
 
 		 358 aa  124  2e-27  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.949458  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3535  inner-membrane translocator  31.44 
 
 		 334 aa  123  4e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0298292 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3500  inner-membrane translocator  32.25 
 
 		 358 aa  123  4e-27  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.674248  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1679  inner-membrane translocator  30.96 
 
 		 317 aa  123  4e-27  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0115  inner-membrane translocator  30.67 
 
 		 325 aa  123  5e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1821  inner-membrane translocator  31.71 
 
 		 328 aa  122  6e-27  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0512  inner-membrane translocator  30.58 
 
 		 307 aa  122  6e-27  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0951798  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1480  inner-membrane translocator  29.71 
 
 		 407 aa  122  6e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2754  branched chain amino acid ABC transporter inner membrane protein  31.4 
 
 		 325 aa  122  7e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.129032  normal  0.265528 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0934  inner-membrane translocator  29.34 
 
 		 327 aa  122  7e-27  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000000511533  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0643  inner-membrane translocator  32.42 
 
 		 347 aa  122  8e-27  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5640  inner-membrane translocator  31.92 
 
 		 317 aa  122  8e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3393  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  31.91 
 
 		 307 aa  122  9.999999999999999e-27  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0261  inner-membrane translocator  28.76 
 
 		 324 aa  121  1.9999999999999998e-26  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6433  inner-membrane translocator  32.99 
 
 		 344 aa  120  1.9999999999999998e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0224691  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0535  inner-membrane translocator  32.31 
 
 		 401 aa  121  1.9999999999999998e-26  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000217655 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3027  inner-membrane translocator  32.2 
 
 		 393 aa  120  1.9999999999999998e-26  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.56847  normal  0.739943 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2501  inner-membrane translocator  31.41 
 
 		 345 aa  120  3.9999999999999996e-26  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1595  inner-membrane translocator  35.05 
 
 		 355 aa  119  4.9999999999999996e-26  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0957  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  34.43 
 
 		 331 aa  119  7.999999999999999e-26  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.834531  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3103  inner-membrane translocator  31.91 
 
 		 354 aa  118  9.999999999999999e-26  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0065  inner-membrane translocator  35.25 
 
 		 282 aa  118  9.999999999999999e-26  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.123483 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3556  inner-membrane translocator  33.88 
 
 		 340 aa  118  9.999999999999999e-26  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0669576  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1652  inner-membrane translocator  32.17 
 
 		 336 aa  117  1.9999999999999998e-25  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4098  inner-membrane translocator:ABC transporter related  32.76 
 
 		 950 aa  117  1.9999999999999998e-25  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0143  inner-membrane translocator  29.91 
 
 		 311 aa  117  1.9999999999999998e-25  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1850  inner-membrane translocator  31.92 
 
 		 340 aa  118  1.9999999999999998e-25  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.2267  normal  0.119632 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3759  hypothetical protein  30.98 
 
 		 322 aa  118  1.9999999999999998e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.232972  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1471  inner-membrane translocator  30.89 
 
 		 376 aa  117  3e-25  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.959824  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3531  inner-membrane translocator  34.33 
 
 		 340 aa  117  3e-25  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.696528 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3293  ABC branched-chain amino acid transporter, inner membrane subunit  35.54 
 
 		 332 aa  116  3.9999999999999997e-25  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.11625  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2500  inner-membrane translocator  29.97 
 
 		 317 aa  116  3.9999999999999997e-25  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.193513 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_4025  inner-membrane translocator  35.54 
 
 		 332 aa  116  3.9999999999999997e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2167  inner-membrane translocator  31.72 
 
 		 325 aa  116  5e-25  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3367  inner-membrane translocator  31.16 
 
 		 342 aa  116  6e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2868  inner-membrane translocator  31.87 
 
 		 330 aa  116  6e-25  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1407  inner-membrane translocator  30.63 
 
 		 332 aa  116  6e-25  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.14353  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5160  inner-membrane translocator  31.94 
 
 		 332 aa  116  6e-25  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.767449  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>