More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acry_2203 on replicon NC_009484
Organism: Acidiphilium cryptum JF-5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009484  Acry_2203  inner-membrane translocator  100 
 
 		 302 aa  575  1.0000000000000001e-163  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0779  inner-membrane translocator  50.87 
 
 		 336 aa  235  7e-61  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2301  inner-membrane translocator  37.91 
 
 		 328 aa  154  2.9999999999999998e-36  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.281867 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5640  inner-membrane translocator  39.58 
 
 		 317 aa  149  4e-35  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2587  inner-membrane translocator  32.26 
 
 		 317 aa  134  1.9999999999999998e-30  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.629922  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0115  inner-membrane translocator  34.41 
 
 		 325 aa  130  2.0000000000000002e-29  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1097  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  32.01 
 
 		 315 aa  126  4.0000000000000003e-28  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.701299  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2142  inner-membrane translocator  36.36 
 
 		 324 aa  126  4.0000000000000003e-28  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.711821 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1828  inner-membrane translocator  30 
 
 		 331 aa  125  1e-27  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000769607  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3647  inner-membrane translocator  33.72 
 
 		 315 aa  124  2e-27  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0606167  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3750  ABC transporter related  34.4 
 
 		 603 aa  120  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.408417  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1480  inner-membrane translocator  30.23 
 
 		 407 aa  118  9.999999999999999e-26  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2365  high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  31.08 
 
 		 339 aa  116  3.9999999999999997e-25  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.554509  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2128  inner-membrane translocator  33.56 
 
 		 344 aa  115  7.999999999999999e-25  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.212047  normal  0.208516 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0337  branched-chain amino acid ABC transporter, permease/ATP-binding protein  32.98 
 
 		 609 aa  113  5e-24  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3393  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  32.3 
 
 		 307 aa  112  6e-24  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1950  inner-membrane translocator  31.29 
 
 		 328 aa  112  1.0000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1849  inner-membrane translocator  31.23 
 
 		 328 aa  111  2.0000000000000002e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.200349 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0403  inner-membrane translocator  32.71 
 
 		 346 aa  110  3e-23  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0801  inner-membrane translocator  33.86 
 
 		 326 aa  109  5e-23  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.950338 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1944  inner-membrane translocator  33.58 
 
 		 297 aa  109  7.000000000000001e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3618  inner-membrane translocator  31.58 
 
 		 328 aa  108  8.000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.466346  normal  0.345258 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0851  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  30.77 
 
 		 333 aa  108  2e-22  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.589569  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1156  inner-membrane translocator  30.25 
 
 		 354 aa  107  2e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.412429  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2283  inner-membrane translocator  31.14 
 
 		 318 aa  107  3e-22  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3838  inner-membrane translocator  31.9 
 
 		 315 aa  105  6e-22  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.242692  normal  0.204744 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2609  inner-membrane translocator  30.49 
 
 		 415 aa  105  1e-21  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0448  inner-membrane translocator  31.34 
 
 		 320 aa  105  1e-21  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2128  inner-membrane translocator  32.37 
 
 		 337 aa  105  1e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1618  ABC transporter related  30.82 
 
 		 616 aa  104  2e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.103337  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6000  branched-chain amino acid transport system permease protein  32.46 
 
 		 321 aa  104  2e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.108703  normal  0.0256137 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4795  inner-membrane translocator  30.88 
 
 		 319 aa  104  2e-21  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.341671  normal  0.137989 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3735  putative branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  30.86 
 
 		 333 aa  103  3e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1673  inner-membrane translocator  35.38 
 
 		 319 aa  103  3e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2358  inner-membrane translocator  31.69 
 
 		 348 aa  103  4e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.165636  normal  0.556674 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4064  inner-membrane translocator  32.52 
 
 		 345 aa  103  4e-21  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2886  putative ABC transporter permiase component  29.29 
 
 		 334 aa  103  5e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0441971 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1663  inner-membrane translocator  29.87 
 
 		 326 aa  103  5e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0261  inner-membrane translocator  30.89 
 
 		 324 aa  102  6e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2395  inner-membrane translocator  30.23 
 
 		 407 aa  102  7e-21  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS01987  amino-acid transmembrane ABC transporter protein  34.68 
 
 		 299 aa  102  8e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.130303  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0846  inner-membrane translocator  31.62 
 
 		 321 aa  102  8e-21  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.643705 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1259  inner-membrane translocator  31.35 
 
 		 357 aa  101  1e-20  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0030  inner-membrane translocator  31.43 
 
 		 345 aa  101  1e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1839  inner-membrane translocator  31.43 
 
 		 350 aa  101  1e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1677  inner-membrane translocator  34.51 
 
 		 302 aa  101  2e-20  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.0846907 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3556  inner-membrane translocator  31.36 
 
 		 340 aa  100  2e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0669576  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1582  inner-membrane translocator  30.74 
 
 		 313 aa  100  2e-20  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0527  inner-membrane translocator  27.4 
 
 		 562 aa  100  2e-20  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.142697  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0312  inner-membrane translocator  30.1 
 
 		 326 aa  101  2e-20  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.950676  normal  0.481983 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2025  inner-membrane translocator  31.32 
 
 		 339 aa  101  2e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3507  inner-membrane translocator  31.18 
 
 		 373 aa  100  4e-20  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3820  inner-membrane translocator  28.62 
 
 		 328 aa  100  4e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0270491  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2754  branched chain amino acid ABC transporter inner membrane protein  31.43 
 
 		 325 aa  99.4  6e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.129032  normal  0.265528 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3055  inner-membrane translocator  29.59 
 
 		 324 aa  99.4  6e-20  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1286  inner-membrane translocator  31.71 
 
 		 337 aa  99  8e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.20936  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1448  inner-membrane translocator  31.71 
 
 		 337 aa  99  8e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  decreased coverage  0.00412694  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2271  inner-membrane translocator  31.82 
 
 		 297 aa  99  9e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.900398 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0997  inner-membrane translocator  34.96 
 
 		 321 aa  98.6  1e-19  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.915307  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1722  inner-membrane translocator  32.7 
 
 		 300 aa  99  1e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0174624  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0366  inner-membrane translocator  30.13 
 
 		 310 aa  97.8  2e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00000392686  unclonable  0.0000000558621 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1595  inner-membrane translocator  34.72 
 
 		 355 aa  98.2  2e-19  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3659  inner-membrane translocator  31.54 
 
 		 341 aa  97.4  2e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0143  inner-membrane translocator  32.97 
 
 		 311 aa  97.4  2e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3840  inner-membrane translocator  28.77 
 
 		 349 aa  97.4  2e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0125888  normal  0.96964 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1679  inner-membrane translocator  32.36 
 
 		 317 aa  97.8  2e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1090  inner-membrane translocator  28 
 
 		 359 aa  97.1  3e-19  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.538994  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4062  ABC transporter related  29.61 
 
 		 606 aa  96.7  4e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1100  inner-membrane translocator  31.99 
 
 		 343 aa  96.7  4e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0111942  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3688  inner-membrane translocator  31.4 
 
 		 330 aa  97.1  4e-19  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2429  putative high-affinity branched-chain amino acid transport system permease  29.43 
 
 		 628 aa  96.3  6e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1621  inner-membrane translocator  28.99 
 
 		 445 aa  95.9  7e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0814712  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5859  inner-membrane translocator  30.9 
 
 		 342 aa  95.9  7e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0455278 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1500  inner-membrane translocator  31.42 
 
 		 336 aa  95.9  7e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.101712  normal  1 
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4480  inner-membrane translocator  32.72 
 
 		 291 aa  95.9  7e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1517  inner-membrane translocator  31.54 
 
 		 309 aa  95.9  8e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1732  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  32.83 
 
 		 326 aa  95.5  1e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0957  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  32.32 
 
 		 331 aa  95.1  1e-18  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.834531  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1821  inner-membrane translocator  32.17 
 
 		 328 aa  95.1  1e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6016  ABC transporter related  31.52 
 
 		 611 aa  95.1  1e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.604136  decreased coverage  0.00266342 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1522  inner-membrane translocator  33.67 
 
 		 321 aa  95.5  1e-18  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  hitchhiker  0.0000276655  normal  0.429613 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0678  inner-membrane translocator  30 
 
 		 314 aa  94.7  2e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.297461  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2269  inner-membrane translocator  33.73 
 
 		 281 aa  94.4  2e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.458004  normal  0.0109079 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4183  inner-membrane translocator  30.8 
 
 		 358 aa  94  2e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.708738  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5097  inner-membrane translocator  33.44 
 
 		 330 aa  94.7  2e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.282354  normal  0.971195 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1427  inner-membrane translocator  34.38 
 
 		 286 aa  94  3e-18  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.732914  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3772  inner-membrane translocator  30.74 
 
 		 372 aa  94  3e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.00496124  hitchhiker  0.00284039 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1850  inner-membrane translocator  30.07 
 
 		 340 aa  94  3e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.2267  normal  0.119632 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0021  branched chain amino acid ABC transporter inner membrane protein  34.52 
 
 		 323 aa  94  3e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.901563  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1652  inner-membrane translocator  29.43 
 
 		 336 aa  93.6  4e-18  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0272  inner-membrane translocator  28.06 
 
 		 353 aa  93.2  4e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.337151  normal  0.772291 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0547  inner-membrane translocator  31.05 
 
 		 337 aa  93.2  4e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3206  inner-membrane translocator  28.89 
 
 		 318 aa  93.6  4e-18  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4071  inner-membrane translocator  30.07 
 
 		 327 aa  93.6  4e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.23992 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3708  branched chain amino acid ABC transporter ATPase/inner membrane protein  31.2 
 
 		 646 aa  93.2  5e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.400523  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2235  inner-membrane translocator  31.49 
 
 		 327 aa  93.2  5e-18  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.344649  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3911  inner-membrane translocator  34.13 
 
 		 323 aa  92.8  6e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.658147  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0828  inner-membrane translocator  29.35 
 
 		 350 aa  92.8  6e-18  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0333  inner-membrane translocator  33.33 
 
 		 281 aa  92.8  6e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1129  inner-membrane translocator  33.85 
 
 		 299 aa  92.8  7e-18  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>