More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrub_1677 on replicon NC_013946
Organism: Meiothermus ruber DSM 1279



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013946  Mrub_1677  inner-membrane translocator  100 
 
 		 302 aa  558  1e-158  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.0846907 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2332  inner-membrane translocator  84.93 
 
 		 313 aa  381  1e-105  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.631407  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0801  inner-membrane translocator  51.93 
 
 		 326 aa  248  7e-65  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.950338 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1090  inner-membrane translocator  38.18 
 
 		 359 aa  144  2e-33  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.538994  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1708  inner-membrane translocator  37.16 
 
 		 348 aa  142  6e-33  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.550604  normal  0.0112984 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2301  inner-membrane translocator  35.25 
 
 		 328 aa  134  3e-30  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.281867 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0065  inner-membrane translocator  39.84 
 
 		 282 aa  132  5e-30  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.123483 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1618  ABC transporter related  38.52 
 
 		 616 aa  132  1.0000000000000001e-29  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.103337  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS01987  amino-acid transmembrane ABC transporter protein  40.39 
 
 		 299 aa  130  2.0000000000000002e-29  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.130303  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0006  inner-membrane translocator  32.17 
 
 		 344 aa  130  4.0000000000000003e-29  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.273042  hitchhiker  0.0000215345 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0337  branched-chain amino acid ABC transporter, permease/ATP-binding protein  33.09 
 
 		 609 aa  129  5.0000000000000004e-29  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3647  inner-membrane translocator  34.33 
 
 		 315 aa  128  1.0000000000000001e-28  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0606167  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1564  inner-membrane translocator  39.66 
 
 		 339 aa  127  2.0000000000000002e-28  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1944  inner-membrane translocator  35.92 
 
 		 297 aa  126  5e-28  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0115  inner-membrane translocator  35.48 
 
 		 325 aa  125  1e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1582  inner-membrane translocator  33.68 
 
 		 313 aa  124  2e-27  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1663  inner-membrane translocator  32.86 
 
 		 326 aa  123  3e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3618  inner-membrane translocator  32.98 
 
 		 328 aa  122  9e-27  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.466346  normal  0.345258 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3820  inner-membrane translocator  37.27 
 
 		 328 aa  121  9.999999999999999e-27  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0270491  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2283  inner-membrane translocator  34.75 
 
 		 318 aa  121  9.999999999999999e-27  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3795  inner-membrane translocator  40.23 
 
 		 302 aa  120  1.9999999999999998e-26  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.189427 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3908  inner-membrane translocator  40.23 
 
 		 302 aa  120  1.9999999999999998e-26  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1722  inner-membrane translocator  35.38 
 
 		 300 aa  120  3e-26  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0174624  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1097  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  32.46 
 
 		 315 aa  120  3e-26  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.701299  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3750  ABC transporter related  35.14 
 
 		 603 aa  119  7e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.408417  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2919  inner-membrane translocator  36.26 
 
 		 332 aa  119  7e-26  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2886  putative ABC transporter permiase component  32.49 
 
 		 334 aa  119  7.999999999999999e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0441971 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1950  inner-membrane translocator  32.62 
 
 		 328 aa  119  9e-26  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0897  inner-membrane translocator  32.09 
 
 		 357 aa  118  9.999999999999999e-26  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1828  inner-membrane translocator  31.63 
 
 		 331 aa  118  9.999999999999999e-26  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000769607  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1849  inner-membrane translocator  32.37 
 
 		 328 aa  117  1.9999999999999998e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.200349 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0312  inner-membrane translocator  33.84 
 
 		 326 aa  117  1.9999999999999998e-25  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.950676  normal  0.481983 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0261  inner-membrane translocator  32.78 
 
 		 324 aa  117  1.9999999999999998e-25  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3838  inner-membrane translocator  34.52 
 
 		 315 aa  117  3e-25  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.242692  normal  0.204744 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0333  inner-membrane translocator  37.4 
 
 		 281 aa  117  3e-25  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1500  inner-membrane translocator  33.11 
 
 		 336 aa  116  3.9999999999999997e-25  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.101712  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2128  inner-membrane translocator  31.76 
 
 		 344 aa  115  8.999999999999998e-25  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.212047  normal  0.208516 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0512  inner-membrane translocator  34.05 
 
 		 307 aa  114  2.0000000000000002e-24  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0951798  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2587  inner-membrane translocator  33.66 
 
 		 317 aa  114  2.0000000000000002e-24  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.629922  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2238  inner-membrane translocator  34.4 
 
 		 326 aa  113  3e-24  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0851  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  30 
 
 		 333 aa  113  4.0000000000000004e-24  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.589569  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1129  inner-membrane translocator  37.02 
 
 		 299 aa  113  5e-24  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2128  inner-membrane translocator  32.12 
 
 		 337 aa  112  5e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3531  inner-membrane translocator  35.79 
 
 		 340 aa  112  5e-24  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.696528 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3393  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  33.47 
 
 		 307 aa  112  6e-24  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0143  inner-membrane translocator  34 
 
 		 311 aa  112  6e-24  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4660  inner-membrane translocator  35.21 
 
 		 343 aa  112  6e-24  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.886685 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3027  inner-membrane translocator  32.81 
 
 		 393 aa  112  8.000000000000001e-24  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.56847  normal  0.739943 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2269  inner-membrane translocator  37.59 
 
 		 281 aa  111  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.458004  normal  0.0109079 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2271  inner-membrane translocator  34.29 
 
 		 297 aa  111  2.0000000000000002e-23  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.900398 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3055  inner-membrane translocator  31.68 
 
 		 324 aa  111  2.0000000000000002e-23  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1386  inner-membrane translocator  34.48 
 
 		 312 aa  110  2.0000000000000002e-23  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2266  inner-membrane translocator  35.8 
 
 		 288 aa  110  3e-23  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0901269  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2111  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  34.63 
 
 		 298 aa  110  3e-23  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1929  inner-membrane translocator  41.45 
 
 		 318 aa  108  7.000000000000001e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.456236  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2365  high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  33.77 
 
 		 339 aa  108  8.000000000000001e-23  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.554509  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6491  ABC transporter related  37.28 
 
 		 608 aa  108  8.000000000000001e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.133272  normal  0.2359 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1100  inner-membrane translocator  30.32 
 
 		 343 aa  108  9.000000000000001e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0111942  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1821  inner-membrane translocator  36.4 
 
 		 328 aa  108  1e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0794  inner-membrane translocator  34.88 
 
 		 327 aa  108  1e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.605525  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4911  inner-membrane translocator  35.04 
 
 		 316 aa  108  1e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.38743 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1471  inner-membrane translocator  31.83 
 
 		 376 aa  108  2e-22  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.959824  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1407  inner-membrane translocator  34.92 
 
 		 332 aa  107  2e-22  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.14353  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1079  inner-membrane translocator  34.67 
 
 		 333 aa  107  2e-22  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.710188  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0535  inner-membrane translocator  33.71 
 
 		 401 aa  107  2e-22  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000217655 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1532  inner-membrane translocator  30.72 
 
 		 368 aa  107  2e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.378741  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4369  inner-membrane translocator  35.56 
 
 		 346 aa  107  2e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0543124  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0733  inner-membrane translocator  36.78 
 
 		 313 aa  107  2e-22  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.73446 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1437  inner-membrane translocator  30.72 
 
 		 368 aa  107  2e-22  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6433  inner-membrane translocator  34.31 
 
 		 344 aa  107  3e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0224691  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1480  inner-membrane translocator  31.65 
 
 		 407 aa  107  3e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2284  inner-membrane translocator  35.85 
 
 		 349 aa  107  3e-22  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.98813  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1732  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  34.45 
 
 		 326 aa  106  4e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4071  inner-membrane translocator  31.43 
 
 		 327 aa  106  5e-22  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.23992 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1673  inner-membrane translocator  32.77 
 
 		 319 aa  106  5e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1424  inner-membrane translocator  35.77 
 
 		 381 aa  106  6e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.132982  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1906  inner-membrane translocator  37.55 
 
 		 326 aa  105  9e-22  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.257462 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6269  inner-membrane translocator  34.8 
 
 		 339 aa  105  1e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6585  inner-membrane translocator  36.96 
 
 		 611 aa  105  1e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4079  inner-membrane translocator  33.69 
 
 		 323 aa  105  1e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1863  inner-membrane translocator  31.6 
 
 		 321 aa  105  1e-21  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2395  inner-membrane translocator  35.25 
 
 		 407 aa  105  1e-21  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0527  inner-membrane translocator  32 
 
 		 562 aa  104  2e-21  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.142697  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0030  inner-membrane translocator  35.21 
 
 		 345 aa  104  2e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0999  branched chain amino acid ABC transporter inner membrane protein  36.3 
 
 		 328 aa  103  3e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.203493  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0504  inner-membrane translocator  33.46 
 
 		 571 aa  103  3e-21  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.92013  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0462  inner-membrane translocator  29.48 
 
 		 331 aa  103  4e-21  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0658  branched chain amino acid ABC transporter inner membrane protein  34.38 
 
 		 646 aa  103  4e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.755349  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0997  inner-membrane translocator  31.92 
 
 		 321 aa  103  5e-21  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.915307  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3659  inner-membrane translocator  32.03 
 
 		 341 aa  103  5e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5640  inner-membrane translocator  34.65 
 
 		 317 aa  103  5e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5993  putative branched-chain amino acid ABC transporter (permease protein)  37.35 
 
 		 323 aa  103  5e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.329288  normal  0.170989 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0366  inner-membrane translocator  32.79 
 
 		 310 aa  102  6e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00000392686  unclonable  0.0000000558621 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0328  inner-membrane translocator  33.78 
 
 		 325 aa  102  6e-21  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.286891  normal  0.171553 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4462  inner-membrane translocator  38.12 
 
 		 633 aa  102  6e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.906456  normal  0.226245 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1893  branched-chain amino acid ABC transporter permease  32.16 
 
 		 362 aa  102  8e-21  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  decreased coverage  0.00991478  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7595  branched chain amino acid ABC transporter inner membrane protein  36.33 
 
 		 315 aa  102  8e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0612  inner-membrane translocator  30.03 
 
 		 347 aa  102  8e-21  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0863  branched chain amino acid ABC transporter inner membrane protein  34.25 
 
 		 334 aa  102  1e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0562534  normal  0.217688 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0403  inner-membrane translocator  34.44 
 
 		 346 aa  102  1e-20  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>