More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcal_0316 on replicon NC_009073
Organism: Pyrobaculum calidifontis JCM 11548



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009073  Pcal_0316  cystathionine gamma-synthase  100 
 
 		 410 aa  821    Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1485  cystathionine gamma-synthase  75.72 
 
 		 383 aa  591  1e-168  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.923651 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0881  cystathionine gamma-synthase  72.06 
 
 		 386 aa  588  1e-167  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.473462 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0243  cystathionine gamma-synthase  72.58 
 
 		 383 aa  585  1e-166  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.814419 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1364  cystathionine gamma-synthase  51.7 
 
 		 385 aa  420  1e-116  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  decreased coverage  0.00282102  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0180  Cystathionine gamma-synthase  42.59 
 
 		 376 aa  283  4.0000000000000003e-75  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0100206  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0592  O-succinylhomoserine (thiol)-lyase  41.62 
 
 		 394 aa  280  4e-74  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.19345  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2677  cystathionine gamma-synthase  40.68 
 
 		 394 aa  276  3e-73  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.181267  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4398  methionine gamma-lyase  40.78 
 
 		 392 aa  273  4.0000000000000004e-72  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.011495  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1667  Cystathionine gamma-synthase  43.68 
 
 		 386 aa  273  5.000000000000001e-72  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.441842  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0472  methionine gamma-lyase  40.52 
 
 		 391 aa  272  6e-72  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0367851  hitchhiker  1.0145e-18 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4553  methionine gamma-lyase  41.04 
 
 		 391 aa  272  9e-72  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.299968  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4906  methionine gamma-lyase  41.04 
 
 		 391 aa  272  9e-72  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3821  Cystathionine gamma-synthase  41.44 
 
 		 408 aa  272  9e-72  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4388  methionine gamma-lyase  40.78 
 
 		 392 aa  272  1e-71  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4772  methionine gamma-lyase  40.52 
 
 		 392 aa  271  2e-71  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0684  O-succinylhomoserine (thiol)-lyase  41.55 
 
 		 422 aa  271  2e-71  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.228137  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0710  cystathionine gamma-lyase  38.6 
 
 		 380 aa  270  4e-71  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4763  methionine gamma-lyase  40.67 
 
 		 391 aa  269  8e-71  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00296748  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0673  hypothetical protein  42.71 
 
 		 374 aa  268  1e-70  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000849749 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4791  methionine gamma-lyase  40 
 
 		 392 aa  267  2e-70  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.113128  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0455  cystathionine gamma-synthase  38.23 
 
 		 388 aa  267  2e-70  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1963  Cystathionine gamma-lyase  39.4 
 
 		 392 aa  266  2.9999999999999995e-70  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.86057  normal  0.364371 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4789  methionine gamma-lyase  40 
 
 		 392 aa  266  4e-70  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000018806  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2799  cystathionine gamma-synthase  40.74 
 
 		 386 aa  266  5.999999999999999e-70  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000029873  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0802  cystathionine beta-lyase  43.28 
 
 		 394 aa  266  7e-70  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2587  Cystathionine gamma-synthase  44.54 
 
 		 390 aa  266  7e-70  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0857878 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2455  cystathionine gamma-synthase  40.85 
 
 		 392 aa  265  1e-69  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.250511  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1156  Cystathionine gamma-lyase  39.52 
 
 		 386 aa  265  1e-69  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2474  cystathionine beta-lyase  40.67 
 
 		 378 aa  264  2e-69  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1227  cystathionine gamma-synthase  40 
 
 		 384 aa  264  2e-69  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0189  cystathionine gamma-synthase  40.16 
 
 		 425 aa  264  2e-69  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0177  cystathionine gamma-synthase  39.58 
 
 		 386 aa  263  3e-69  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0165  cystathionine beta-lyase  38.18 
 
 		 384 aa  263  4e-69  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0520  O-succinylhomoserine (thiol)-lyase  40.59 
 
 		 388 aa  263  4.999999999999999e-69  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0169  cystathionine beta-lyase  38.6 
 
 		 384 aa  262  8.999999999999999e-69  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03157  cystathionine gamma-synthase (CGS) (O-succinylhomoserine(Thiol)-lyase)  40.89 
 
 		 397 aa  261  1e-68  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0779579  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4484  methionine gamma-lyase  39.48 
 
 		 392 aa  261  1e-68  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0011  methionine gamma-lyase  47.07 
 
 		 401 aa  261  1e-68  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4268  cystathionine beta-lyase  38.96 
 
 		 377 aa  261  2e-68  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3986  Cystathionine gamma-lyase  40.64 
 
 		 390 aa  261  2e-68  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.891529 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4600  cystathionine beta-lyase  38.96 
 
 		 377 aa  261  2e-68  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0163  O-succinylhomoserine (thiol)-lyase  38.96 
 
 		 387 aa  261  2e-68  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.574145  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0745  cystathionine beta-lyase  38.7 
 
 		 377 aa  260  2e-68  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11097  cystathionine gamma-synthase  41.87 
 
 		 388 aa  261  2e-68  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00214161  normal  0.379656 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1985  cystathionine gamma-synthase  42.16 
 
 		 405 aa  260  3e-68  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.674412  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0611  Cystathionine gamma-synthase  42.47 
 
 		 382 aa  260  3e-68  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2831  cystathionine gamma-lyase  39.74 
 
 		 381 aa  260  3e-68  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.10022  normal  0.0538673 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3067  O-succinylhomoserine (thiol)-lyase  43.6 
 
 		 385 aa  260  3e-68  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0408285  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4454  cystathionine beta-lyase  38.96 
 
 		 377 aa  259  4e-68  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1668  cystathionine beta-lyase  43.17 
 
 		 392 aa  260  4e-68  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3084  cystathionine beta-lyase  38.7 
 
 		 377 aa  260  4e-68  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.966725  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4035  cystathionine gamma-synthase  39.22 
 
 		 386 aa  259  5.0000000000000005e-68  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.478973 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0976  cystathionine gamma-lyase  41.18 
 
 		 387 aa  259  6e-68  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.307995  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3791  O-succinylhomoserine (thiol)-lyase  39.22 
 
 		 386 aa  259  7e-68  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1914  cystathionine gamma-synthase  42.19 
 
 		 400 aa  259  8e-68  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.145632  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1860  cystathionine gamma-synthase  39.17 
 
 		 393 aa  258  1e-67  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4452  cystathionine beta-lyase  38.7 
 
 		 377 aa  258  1e-67  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4105  cystathionine beta-lyase  38.7 
 
 		 377 aa  258  1e-67  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4491  cystathionine beta-lyase  38.7 
 
 		 377 aa  258  1e-67  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3070  Cystathionine gamma-synthase  40.87 
 
 		 378 aa  258  1e-67  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.1956  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3326  methionine gamma-lyase  40.92 
 
 		 396 aa  258  1e-67  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000189507  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4116  cystathionine beta-lyase  38.7 
 
 		 377 aa  257  2e-67  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4505  cystathionine beta-lyase  38.7 
 
 		 377 aa  258  2e-67  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.304774  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1383  Cystathionine gamma-synthase  41.13 
 
 		 376 aa  258  2e-67  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000104291  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2126  cystathionine gamma-lyase  38.9 
 
 		 387 aa  256  4e-67  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4317  cystathionine gamma-synthase  39.28 
 
 		 386 aa  256  4e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0801  cystathionine gamma-synthase  40.49 
 
 		 367 aa  256  4e-67  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4371  cystathionine beta-lyase  40.91 
 
 		 387 aa  256  5e-67  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1989  cysteine synthase / cystathionine gamma-synthase  43.6 
 
 		 378 aa  256  5e-67  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.485291  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02525  Cystathionine gamma-synthase  37.63 
 
 		 380 aa  256  5e-67  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4347  cystathionine gamma-synthase  39.28 
 
 		 386 aa  256  6e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5069  O-succinylhomoserine (thiol)-lyase  40.81 
 
 		 385 aa  256  6e-67  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03825  cystathionine gamma-synthase  39.79 
 
 		 386 aa  256  7e-67  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.24888  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0560  O-succinylhomoserine (thiol)-lyase  38.93 
 
 		 386 aa  256  7e-67  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03774  hypothetical protein  39.79 
 
 		 386 aa  256  7e-67  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.272027  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4431  cystathionine gamma-synthase  39.28 
 
 		 386 aa  255  8e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0979  cystathionine beta-lyase  40 
 
 		 377 aa  255  9e-67  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4479  cystathionine gamma-synthase  39.53 
 
 		 386 aa  255  9e-67  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.146972  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4046  O-succinylhomoserine (thiol)-lyase  39.53 
 
 		 386 aa  254  1.0000000000000001e-66  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4219  cystathionine beta-lyase  38.69 
 
 		 377 aa  255  1.0000000000000001e-66  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4501  cystathionine gamma-synthase  39.28 
 
 		 386 aa  255  1.0000000000000001e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0840458  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08000  Cystathionine gamma-synthase  37.77 
 
 		 392 aa  255  1.0000000000000001e-66  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.272555  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4076  cystathionine gamma-synthase  39.53 
 
 		 386 aa  254  1.0000000000000001e-66  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4434  cystathionine gamma-synthase  39.28 
 
 		 386 aa  255  1.0000000000000001e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.188504  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4172  cystathionine gamma-synthase  39.53 
 
 		 386 aa  254  1.0000000000000001e-66  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0058  putative O-succinylhomoserine (thiol)-lyase  38.48 
 
 		 387 aa  254  2.0000000000000002e-66  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0536  O-succinylhomoserine (thiol)-lyase  40.32 
 
 		 387 aa  254  2.0000000000000002e-66  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0831  cystathionine gamma-synthase/cystathionine beta-lyase  40.11 
 
 		 380 aa  254  2.0000000000000002e-66  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0291716  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4541  methionine gamma-lyase  38.7 
 
 		 398 aa  254  2.0000000000000002e-66  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2737  Cystathionine gamma-synthase  39.69 
 
 		 391 aa  254  2.0000000000000002e-66  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00149474  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5399  cystathionine gamma-synthase  39.53 
 
 		 386 aa  253  3e-66  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.735878 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3551  O-succinylhomoserine (thiol)-lyase  40.48 
 
 		 389 aa  254  3e-66  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4416  methionine gamma-lyase  38.96 
 
 		 398 aa  253  4.0000000000000004e-66  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.510937 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0616  O-succinylhomoserine (thiol)-lyase  40.48 
 
 		 387 aa  253  4.0000000000000004e-66  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4425  cystathionine gamma-synthase  39.53 
 
 		 386 aa  253  4.0000000000000004e-66  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3117  cystathionine gamma-lyase  40.05 
 
 		 379 aa  253  5.000000000000001e-66  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000114351 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4381  cystathionine gamma-synthase  39.53 
 
 		 386 aa  253  5.000000000000001e-66  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.89633 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01681  cystathionine gamma-synthase  41.42 
 
 		 405 aa  253  5.000000000000001e-66  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.613044  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0863  cystathionine beta-lyase  40.37 
 
 		 387 aa  253  5.000000000000001e-66  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>