193 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Patl_1188 on replicon NC_008228
Organism: Pseudoalteromonas atlantica T6c



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008228  Patl_1188  glycosyl transferase, group 1  100 
 
 		 360 aa  741    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4909  group 1 glycosyl transferase  31.92 
 
 		 364 aa  176  7e-43  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3679  glycosyl transferase group 1  29.62 
 
 		 375 aa  120  3e-26  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.568294 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4124  glycosyl transferase, group 1  24.35 
 
 		 349 aa  116  6e-25  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0821  glycosyl transferase group 1  29.23 
 
 		 351 aa  112  1.0000000000000001e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.534399  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2015  glycosyl transferase, group 1  29.43 
 
 		 382 aa  100  3e-20  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01298  predicted glycosyltransferase  28.08 
 
 		 361 aa  99  1e-19  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.65788  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4450  GumI protein  23.86 
 
 		 350 aa  90.9  4e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0590  glycosyl transferase, group 1  26.17 
 
 		 380 aa  86.7  5e-16  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.248802  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01399  exopolysaccharide xanthan biosynthesis glycosyltransferase GumI  24.44 
 
 		 349 aa  84.7  0.000000000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.490868  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3140  zinc carboxypeptidase A metalloprotease (M14)  25 
 
 		 357 aa  83.2  0.000000000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0299032 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3496  Zinc carboxypeptidase A metalloprotease (M14)  24.56 
 
 		 503 aa  75.9  0.000000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0395  glycosyl transferase group 1  24.18 
 
 		 378 aa  75.5  0.000000000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.988234  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0743  putative glycosyl transferase  32.11 
 
 		 421 aa  74.7  0.000000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.136224  hitchhiker  0.00617937 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2715  glycosyl transferase group 1  22.06 
 
 		 375 aa  75.1  0.000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0582  glycosyl transferase group 1  24.38 
 
 		 374 aa  70.5  0.00000000004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.838889  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2856  glycosyl transferase, group 1  26.79 
 
 		 388 aa  70.1  0.00000000006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.258995 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1868  glycosyl transferase  25.36 
 
 		 375 aa  69.7  0.00000000008  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3116  glycosyl transferase group 1  24.48 
 
 		 377 aa  68.9  0.0000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.304233 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0095  glycosyl transferase group 1  27.1 
 
 		 378 aa  68.9  0.0000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.844499 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0168  glycosyl transferase  24.01 
 
 		 374 aa  67.4  0.0000000004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.627515 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0241  lipopolysaccharide transferase family protein  28.22 
 
 		 384 aa  66.6  0.0000000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2306  glycosyl transferase group 1  22.43 
 
 		 379 aa  65.5  0.000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.455622  normal  0.0637665 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1652  glycosyl transferase group 1  27.16 
 
 		 382 aa  61.2  0.00000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2571  glycosyl transferase group 1  24.3 
 
 		 386 aa  62  0.00000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3942  glycosyl transferase group 1  28.46 
 
 		 395 aa  61.2  0.00000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.484579  normal  0.520896 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0723  glycosyltransferase-like protein  26.74 
 
 		 396 aa  61.2  0.00000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1785  glycosyl transferase group 1  28.35 
 
 		 380 aa  60.8  0.00000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.296483 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3774  glycosyl transferase group 1  22.26 
 
 		 372 aa  60.8  0.00000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.291858  normal  0.904998 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2186  glycosyl transferase group 1  22.22 
 
 		 377 aa  60.5  0.00000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1808  glycosyl transferase group 1  26.79 
 
 		 373 aa  60.5  0.00000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1916  glycosyltransferase  25.27 
 
 		 390 aa  60.1  0.00000006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3449  glycosyl transferase group 1  24.38 
 
 		 394 aa  59.7  0.00000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3515  glycosyl transferase group 1  24.38 
 
 		 393 aa  59.3  0.00000009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000186871 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4438  glycosyl transferase group 1  25.12 
 
 		 381 aa  58.2  0.0000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1623  glycosyl transferase group 1  25.81 
 
 		 386 aa  58.2  0.0000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0932889  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1786  glycosyl transferase, group 1  30.58 
 
 		 391 aa  57.8  0.0000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1923  glycosyl transferase, group 1  28.32 
 
 		 368 aa  57  0.0000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.80295  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3353  glycosyl transferase group 1  28 
 
 		 381 aa  57  0.0000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.207762  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1638  glycosyl transferase group 1  25.68 
 
 		 378 aa  56.6  0.0000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000167998  hitchhiker  0.00440424 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3605  glycosyl transferase, group 1  27.45 
 
 		 405 aa  56.6  0.0000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.1788 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0621  glycosyl transferase group 1  22.07 
 
 		 342 aa  56.2  0.0000008  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.152612  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1996  glycosyl transferase group 1  27.62 
 
 		 364 aa  55.5  0.000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.55506 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2522  glycosyl transferase  23.14 
 
 		 364 aa  54.7  0.000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.810552  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0294  hypothetical protein  23.87 
 
 		 395 aa  55.1  0.000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1104  glycosyl transferase, group 1  25.38 
 
 		 396 aa  54.7  0.000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0552505  hitchhiker  0.00694846 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5602  glycosyl transferase group 1  24.52 
 
 		 399 aa  53.9  0.000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.115159  normal  0.982088 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0245  glycosyl transferase group 1  24.27 
 
 		 396 aa  53.5  0.000005  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0172332  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1080  glycosyl transferase group 1  24.57 
 
 		 394 aa  53.5  0.000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.184829  normal  0.928063 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4446  glycosyl transferase, group 1  26.28 
 
 		 426 aa  53.9  0.000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.342615  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4489  glycosyl transferase group 1  25.52 
 
 		 417 aa  53.1  0.000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5093  glycosyl transferase group 1  31.25 
 
 		 388 aa  53.1  0.000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0880  glycosyl transferase group 1  25.41 
 
 		 376 aa  53.1  0.000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0960108 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4294  glycosyl transferase group 1  25.39 
 
 		 405 aa  52.8  0.000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.458687 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2383  glycosyl transferase group 1  23.95 
 
 		 398 aa  52.4  0.00001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.501705  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4092  glycosyl transferase group 1  22.91 
 
 		 359 aa  52.4  0.00001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6430  glycosyl transferase group 1  25.58 
 
 		 366 aa  52.4  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.706841  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0895  a-glycosyltransferase  26.04 
 
 		 390 aa  52.4  0.00001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.0000533271  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3364  glycosyl transferase, group 1  24.33 
 
 		 822 aa  52.4  0.00001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3867  glycosyl transferase group 1  24.33 
 
 		 819 aa  52  0.00001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.709637 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3213  glycosyl transferase group 1  25.76 
 
 		 411 aa  52  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.312231  normal  0.69629 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0428  glycogen synthase  22.75 
 
 		 404 aa  52.4  0.00001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.743156  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0798  glycosyl transferase group 1  25.79 
 
 		 396 aa  52  0.00001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.607654  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0042  glycosyl transferase group 1  26.53 
 
 		 366 aa  52  0.00001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0171  glycosyl transferase, group 1  28.7 
 
 		 389 aa  51.6  0.00002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6234  glycosyl transferase group 1  23.85 
 
 		 366 aa  51.2  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.130468  normal  0.465121 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4553  group 1 glycosyl transferase  26.03 
 
 		 423 aa  51.2  0.00002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4416  glycosyl transferase group 1  22.43 
 
 		 398 aa  51.2  0.00002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4608  glycosyl transferase group 1  24.7 
 
 		 821 aa  52  0.00002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5324  glycosyltransferase  26.6 
 
 		 759 aa  52  0.00002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0255  glycosyl transferase group 1  23.43 
 
 		 358 aa  50.8  0.00003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5249  glycosyl transferase group 1  25.38 
 
 		 386 aa  50.8  0.00003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4100  lipopolysaccharide 1,2-N-acetylglucosaminetransferase  24.23 
 
 		 381 aa  51.2  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.564193  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1969  glycosyl transferase group 1  27.04 
 
 		 372 aa  51.2  0.00003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1498  glycosyl transferase, group 1  28.31 
 
 		 373 aa  50.4  0.00004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6340  glycosyl transferase group 1  24.42 
 
 		 377 aa  50.4  0.00004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0334  glycosyl transferase group 1  29.66 
 
 		 411 aa  50.8  0.00004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.145244 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0772  glycosyl transferase, group 1 family protein  29.3 
 
 		 397 aa  50.4  0.00005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1547  glycosyl transferase, group 1  31.96 
 
 		 397 aa  50.4  0.00005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.104847  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3932  lipopolysaccharide 1,2-N-acetylglucosaminetransferase  24.23 
 
 		 381 aa  50.1  0.00006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4039  lipopolysaccharide 1,2-N-acetylglucosaminetransferase  23.71 
 
 		 381 aa  50.1  0.00006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4282  glycosyl transferase group 1  27.49 
 
 		 405 aa  50.1  0.00006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.870736  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4490  hypothetical protein  25.19 
 
 		 332 aa  50.1  0.00006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.063235  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0587  glycosyl transferase group 1  23.13 
 
 		 387 aa  49.7  0.00008  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0104  glycosyl transferase group 1  29.63 
 
 		 377 aa  49.7  0.00008  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3913  lipopolysaccharide 1,2-N-acetylglucosaminetransferase  23.71 
 
 		 381 aa  49.7  0.00008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.735836  normal  0.0414199 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2111  glycosyl transferase, group 1  23.75 
 
 		 821 aa  49.3  0.00009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.356512 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2442  glycosyl transferase, group 1  20.28 
 
 		 382 aa  49.3  0.00009  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1803  glycosyl transferase, group 1  29.93 
 
 		 409 aa  49.3  0.00009  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0571  glycosyl transferase group 1  29.24 
 
 		 197 aa  49.7  0.00009  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0430219  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1780  mannosyltransferase, putative  22.49 
 
 		 1635 aa  49.3  0.0001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.731336  decreased coverage  0.0078788 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3641  hypothetical protein  22.33 
 
 		 384 aa  48.9  0.0001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.802577  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0958  glycosyl transferase, group 1  21.73 
 
 		 401 aa  48.9  0.0001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3120  glycosyl transferase, group 1  28.87 
 
 		 366 aa  48.9  0.0001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.0017817  unclonable  0.0000176244 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3369  glycosyl transferase, group 1  22.77 
 
 		 417 aa  48.9  0.0001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00689338 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3994  lipopolysaccharide 1,2-N-acetylglucosaminetransferase  23.71 
 
 		 381 aa  48.1  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2537  putative lipopolysaccharide biosynthesis- related glycosyltransferase  23.22 
 
 		 468 aa  48.5  0.0002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.252035 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1162  glycosyl transferase group 1  23.26 
 
 		 790 aa  48.5  0.0002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2202  glycosyl transferase, group 1  26.76 
 
 		 394 aa  48.5  0.0002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2517  glycosyl transferase group 1  25 
 
 		 405 aa  48.5  0.0002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.587179  normal  0.0541201 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>