48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PXO_04059 on replicon NC_010717
Organism: Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010717  PXO_04059  O-Antigen Polymerase family  100 
 
 		 425 aa  830    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0980  hypothetical protein  51.61 
 
 		 409 aa  356  3.9999999999999996e-97  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0861  O-antigen polymerase  52.3 
 
 		 409 aa  355  6.999999999999999e-97  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2712  O-antigen polymerase  32.93 
 
 		 413 aa  155  1e-36  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0646679  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2401  O-antigen polymerase  28.75 
 
 		 426 aa  84.3  0.000000000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0523174  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2478  O-antigen polymerase  29.88 
 
 		 415 aa  84  0.000000000000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2006  O-antigen polymerase  30.39 
 
 		 426 aa  81.6  0.00000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.188841  normal  0.439827 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2204  hypothetical protein  30.63 
 
 		 435 aa  74.7  0.000000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.556953  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0759  O-antigen polymerase  26.41 
 
 		 430 aa  72  0.00000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.402812  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0206  O-antigen polymerase  29.3 
 
 		 444 aa  71.2  0.00000000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0267  O-antigen polymerase  29.93 
 
 		 430 aa  70.9  0.00000000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0160  O-antigen ligase WaaL  28.14 
 
 		 408 aa  67.4  0.0000000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0263  O-antigen ligase WaaL  28.14 
 
 		 408 aa  67.4  0.0000000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0319  O-antigen polymerase  27.45 
 
 		 422 aa  67  0.0000000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0184  O-antigen polymerase  31.29 
 
 		 435 aa  65.9  0.000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.146439  normal  0.684402 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2638  O-antigen polymerase  23.29 
 
 		 428 aa  62.8  0.00000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3581  O-antigen polymerase  30.66 
 
 		 429 aa  60.8  0.00000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.143797  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2813  O-antigen polymerase  22.98 
 
 		 773 aa  56.2  0.000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.192356  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1511  O-antigen polymerase  23.99 
 
 		 436 aa  54.7  0.000003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.995807  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2617  hypothetical protein  22.22 
 
 		 399 aa  53.1  0.000008  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0969  O-antigen polymerase  24.44 
 
 		 446 aa  52.8  0.00001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.948168  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0853  hypothetical protein  22.98 
 
 		 416 aa  52.4  0.00002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3018  O-antigen polymerase  28.37 
 
 		 446 aa  50.8  0.00004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0884  hypothetical protein  23.18 
 
 		 416 aa  50.8  0.00005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3774  O-antigen polymerase  26.97 
 
 		 439 aa  50.1  0.00007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4049  O-antigen polymerase  26.25 
 
 		 417 aa  50.1  0.00008  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0576542  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3959  O-antigen polymerase  25.75 
 
 		 417 aa  50.1  0.00008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0194478  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0069  O-antigen polymerase  30.06 
 
 		 443 aa  50.1  0.00009  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03430  hypothetical protein  30 
 
 		 417 aa  49.7  0.0001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0910551  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0087  O-antigen polymerase  26.25 
 
 		 417 aa  49.7  0.0001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0556509  normal  0.17743 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03479  Lipid A-core, surface polymer ligase  30 
 
 		 417 aa  49.7  0.0001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.120571  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4125  O-antigen polymerase  26.25 
 
 		 417 aa  49.7  0.0001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.314741  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3833  O-antigen polymerase  26.25 
 
 		 417 aa  49.7  0.0001  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000244631  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0083  membrane protein  30.06 
 
 		 443 aa  48.9  0.0002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.735968  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0368  O-antigen polymerase  25.78 
 
 		 579 aa  48.9  0.0002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0338  O-antigen ligase  30.83 
 
 		 436 aa  48.1  0.0003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1851  hypothetical protein  32.84 
 
 		 429 aa  47.4  0.0004  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0333  O-antigen polymerase  25.08 
 
 		 416 aa  47.4  0.0005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1123  O-antigen polymerase  22.88 
 
 		 442 aa  47.4  0.0006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.801174  normal  0.617722 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0142  O-antigen polymerase  25.41 
 
 		 496 aa  46.6  0.0009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0300218 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2333  O-antigen polymerase  29.01 
 
 		 426 aa  46.2  0.001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0425881 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2310  O-antigen polymerase  29.01 
 
 		 426 aa  45.8  0.001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1698  O-antigen polymerase  29.01 
 
 		 426 aa  45.8  0.001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1691  O-antigen polymerase  25.46 
 
 		 512 aa  46.2  0.001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.121195  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6488  O-antigen polymerase  22.51 
 
 		 442 aa  44.7  0.003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02624  membrane protein  30.38 
 
 		 431 aa  43.5  0.008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5652  O-antigen polymerase  28.85 
 
 		 426 aa  43.5  0.008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0257  O-antigen polymerase  25.19 
 
 		 419 aa  43.1  0.01  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>