More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PXO_03033 on replicon NC_010717
Organism: Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010717  PXO_03033  transcriptional regulator protein  100 
 
 		 165 aa  330  5e-90  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0421  two component transcriptional regulator, LytTR family  66.38 
 
 		 256 aa  166  1e-40  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.268274 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000974  response regulator of the LytR/AlgR family  51.26 
 
 		 263 aa  124  5e-28  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.728867  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_07024  transcriptional regulator  51.26 
 
 		 263 aa  124  7e-28  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0387  response regulator  54.78 
 
 		 261 aa  123  1e-27  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1381  LytR/AlgR family transcriptional regulator  52.63 
 
 		 273 aa  120  8e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.557466 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1290  two component transcriptional regulator, LytTR family  50 
 
 		 277 aa  115  3e-25  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.212023 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1965  response regulator receiver:LytTr DNA-binding region  49.12 
 
 		 273 aa  115  3e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.864475  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1352  two-component response regulator transcription regulator protein  52.94 
 
 		 270 aa  114  3.9999999999999997e-25  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1227  two component transcriptional regulator, LytTR family  48.33 
 
 		 277 aa  112  2.0000000000000002e-24  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.299238  normal  0.813842 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0671  two component transcriptional regulator, LytTR family  46.09 
 
 		 251 aa  109  2.0000000000000002e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1373  DNA-binding response regulator  47.93 
 
 		 300 aa  108  4.0000000000000004e-23  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.648551  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1860  two component transcriptional regulator, LytTR family  47.01 
 
 		 266 aa  107  7.000000000000001e-23  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1151  response regulator receiver protein  42.86 
 
 		 276 aa  106  1e-22  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0480  response regulator receiver domain-containing protein  47.06 
 
 		 265 aa  105  2e-22  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10420  two component transcriptional regulator, LytTR family  45.69 
 
 		 253 aa  105  2e-22  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000460621  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2262  LytTR family two component transcriptional regulator  51.15 
 
 		 269 aa  105  3e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.192742  normal  0.0894174 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2035  response regulator receiver protein  48.8 
 
 		 282 aa  105  3e-22  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.150352  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2443  LytTR family two component transcriptional regulator  47.83 
 
 		 279 aa  104  7e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1400  response regulator  46.28 
 
 		 243 aa  103  8e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6684  LytR/AlgR family transcriptional regulator  46.73 
 
 		 243 aa  103  1e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3416  putative two-component response-regulatory protein YehT  46.22 
 
 		 237 aa  103  1e-21  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.329348  normal  0.0577965 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04138  two-component system regulatory protein  43.31 
 
 		 245 aa  103  1e-21  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.739319  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2282  response regulator receiver protein  46.83 
 
 		 276 aa  103  1e-21  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.81  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0119  response regulator receiver protein  44.92 
 
 		 249 aa  102  2e-21  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1458  DNA-binding response regulator  46.96 
 
 		 140 aa  103  2e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5734  two component transcriptional regulator, LytTR family  47.47 
 
 		 257 aa  102  3e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01918  putative response regulator in two-component regulatory system  44.44 
 
 		 275 aa  102  3e-21  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.159199  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2603  response regulator  49.53 
 
 		 243 aa  102  3e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0224  putative two-component response-regulatory protein YehT  40.82 
 
 		 237 aa  102  3e-21  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5142  two component transcriptional regulator, LytTR family  43.22 
 
 		 244 aa  101  4e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.546377  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3679  LytR/AlgR family transcriptional regulator  44.92 
 
 		 262 aa  100  1e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1964  LytR/AlgR family transcriptional regulator  43.7 
 
 		 255 aa  100  1e-20  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.777054 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0190  LytR/AlgR family transcriptional regulator  41.61 
 
 		 244 aa  100  1e-20  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.625509  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3900  response regulator receiver domain-containing protein  42.52 
 
 		 261 aa  100  1e-20  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0031  response regulator receiver protein  43.86 
 
 		 243 aa  99.4  2e-20  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2883  putative two-component response-regulatory protein YehT  42.74 
 
 		 236 aa  99.4  2e-20  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000000903631  unclonable  0.0000000000401288 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2328  LytTR family two component transcriptional regulator  42.75 
 
 		 255 aa  99.4  2e-20  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.261765  decreased coverage  0.00199939 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1765  putative two-component response-regulatory protein YehT  44.25 
 
 		 232 aa  99  2e-20  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.199181  hitchhiker  0.00544661 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4134  LytTR family two component transcriptional regulator  40.83 
 
 		 243 aa  99.8  2e-20  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.291369  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3613  two component transcriptional regulator, LytTR family  46.72 
 
 		 281 aa  98.6  3e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3733  response regulator receiver domain-containing protein  45 
 
 		 249 aa  98.6  3e-20  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.766169 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6623  two component transcriptional regulator, LytTR family  39.83 
 
 		 258 aa  98.6  3e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0991065  normal  0.080317 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1542  LytTr DNA-binding region  41.38 
 
 		 245 aa  99  3e-20  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.300206 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3773  two component transcriptional regulator, LytTR family  43.7 
 
 		 260 aa  98.6  4e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.10961  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2385  response regulator receiver protein  40 
 
 		 272 aa  98.2  4e-20  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4495  LytTR family two component transcriptional regulator  44.92 
 
 		 245 aa  97.8  6e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.17015 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0898  two component transcriptional regulator, LytTR family  45.69 
 
 		 265 aa  97.8  6e-20  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3221  putative two-component response-regulatory protein YehT  39.01 
 
 		 238 aa  97.8  6e-20  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3485  putative two-component response-regulatory protein YehT  39.01 
 
 		 238 aa  97.4  7e-20  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.159726 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3358  putative two-component response-regulatory protein YehT  39.01 
 
 		 238 aa  97.4  7e-20  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0227  LytR/AlgR family transcriptional regulator  40.52 
 
 		 265 aa  97.4  8e-20  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.312706  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0036  LytR/AlgR family transcriptional regulator  42.47 
 
 		 248 aa  97.1  1e-19  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2723  putative two-component response-regulatory protein YehT  39.31 
 
 		 239 aa  96.7  1e-19  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4129  two component transcriptional regulator, LytTR family  46.55 
 
 		 271 aa  97.1  1e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004414  response regulator of the LytR/AlgR family  45.38 
 
 		 242 aa  95.9  2e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4408  two component transcriptional regulator, LytTR family  40.5 
 
 		 268 aa  96.3  2e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1259  response regulator receiver protein  42.74 
 
 		 252 aa  96.3  2e-19  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4710  two component transcriptional regulator, LytTR family  41.18 
 
 		 254 aa  95.9  2e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0765  LytR/AlgR family transcriptional regulator  41.38 
 
 		 247 aa  95.9  2e-19  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.584976  normal  0.255142 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3487  LytR/AlgR family transcriptional regulator  41.18 
 
 		 253 aa  95.9  2e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.76921  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2432  putative two-component response-regulatory protein YehT  42.48 
 
 		 236 aa  95.9  2e-19  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000158974  hitchhiker  0.00361478 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0704  LytTR family two component transcriptional regulator  43.44 
 
 		 276 aa  96.3  2e-19  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.674394 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3594  two component transcriptional regulator, LytTR family  42.74 
 
 		 260 aa  95.5  3e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.833136  normal  0.0457058 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00984  putative two-component response-regulatory protein YehT  44.54 
 
 		 242 aa  95.5  3e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0495  response regulator receiver and SARP domain protein  39.06 
 
 		 365 aa  95.5  3e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000108458  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2673  response regulator receiver protein  42.86 
 
 		 268 aa  95.5  3e-19  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.587227  normal  0.606797 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2594  putative two-component response-regulatory protein YehT  41.59 
 
 		 236 aa  95.1  3e-19  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0103906  hitchhiker  0.00157605 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1226  LytTR family two component transcriptional regulator  42.74 
 
 		 252 aa  95.5  3e-19  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1318  putative two-component response-regulatory protein YehT  39.39 
 
 		 238 aa  95.5  3e-19  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2502  putative two-component response-regulatory protein YehT  41.59 
 
 		 236 aa  95.1  4e-19  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.00178929  normal  0.0452702 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2791  LytTR family two component transcriptional regulator  41.82 
 
 		 250 aa  95.1  4e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.073585  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2329  LytTR family two component transcriptional regulator  42.37 
 
 		 255 aa  94.7  5e-19  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0531557  decreased coverage  0.00207881 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2278  LytTr DNA-binding response regulator  42.5 
 
 		 280 aa  94.4  6e-19  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.421967  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0865  putative two-component response-regulatory protein YehT  37.24 
 
 		 239 aa  94.4  6e-19  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2685  putative two-component response-regulatory protein YehT  42.48 
 
 		 236 aa  94.4  7e-19  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0538398  hitchhiker  0.000367908 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1695  putative two-component response-regulatory protein YehT  42.48 
 
 		 236 aa  94.4  7e-19  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.00000884824  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1658  putative two-component response-regulatory protein YehT  42.48 
 
 		 236 aa  94.4  7e-19  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000000153786  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1673  putative two-component response-regulatory protein YehT  42.48 
 
 		 236 aa  94.4  7e-19  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000537167  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3544  two component transcriptional regulator, LytTR family  42.74 
 
 		 251 aa  94  8e-19  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0394969  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2575  two-component response regulator  41.74 
 
 		 241 aa  94  8e-19  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2920  LytTR family two component transcriptional regulator  36.64 
 
 		 245 aa  94  9e-19  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.106094 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3718  response regulator  41.53 
 
 		 275 aa  93.6  1e-18  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1621  LytR/AlgR family transcriptional regulator  38.4 
 
 		 245 aa  93.2  1e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3341  putative two-component response-regulatory protein YehT  42.24 
 
 		 244 aa  93.6  1e-18  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.798853 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3291  LytR/AlgR family transcriptional regulator  42.61 
 
 		 258 aa  93.6  1e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.393667  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0388  two component transcriptional regulator, LytTR family  40.17 
 
 		 233 aa  93.6  1e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2393  putative two-component response-regulatory protein YehT  37.24 
 
 		 239 aa  92.8  2e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2505  putative two-component response-regulatory protein YehT  37.24 
 
 		 239 aa  92.8  2e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2304  putative two-component response-regulatory protein YehT  37.24 
 
 		 239 aa  92.8  2e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2348  putative two-component response-regulatory protein YehT  37.24 
 
 		 239 aa  92.8  2e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1069  two component transcriptional regulator, LytTR family  44.93 
 
 		 276 aa  92.8  2e-18  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.257927  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2397  putative two-component response-regulatory protein YehT  37.24 
 
 		 239 aa  92.8  2e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.423362  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0374  two component transcriptional regulator, LytTR family  41.38 
 
 		 242 aa  92.8  2e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0488  response regulator receiver protein  44.74 
 
 		 252 aa  92.8  2e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0055  LytTR family two component transcriptional regulator  36.97 
 
 		 243 aa  92.4  2e-18  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.868518  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0161  LytR/AlgR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 270 aa  92.4  3e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3531  two component transcriptional regulator, LytTR family  47.12 
 
 		 243 aa  92  3e-18  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4846  LytTR family two component transcriptional regulator  41.38 
 
 		 246 aa  92.4  3e-18  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.568582  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2957  response regulator receiver protein  49.09 
 
 		 236 aa  92  3e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00954821  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>