71 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPTO_2431 on replicon NC_004578
Organism: Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004578  PSPTO_2431  hypothetical protein  100 
 
 		 305 aa  631  1e-180  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.000928736  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1620  hypothetical protein  29.32 
 
 		 398 aa  123  3e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.376452 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3865  hypothetical protein  28.95 
 
 		 398 aa  116  6e-25  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.999918  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3455  aminotransferase class I and II  28.63 
 
 		 377 aa  99  9e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.36612  hitchhiker  0.000000549175 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1405  aminotransferase, class I and II  32.43 
 
 		 362 aa  53.9  0.000004  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.269129  normal  0.550876 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1495  aspartate aminotransferase  24.58 
 
 		 400 aa  53.5  0.000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1014  aspartate aminotransferase  24.58 
 
 		 400 aa  53.5  0.000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1723  L-threonine O-3-phosphate decarboxylase  28.57 
 
 		 362 aa  51.2  0.00002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2825  aspartate aminotransferase  27.59 
 
 		 408 aa  50.4  0.00003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1471  aspartate aminotransferase  24.72 
 
 		 400 aa  50.8  0.00003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.219389  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0346  aspartate aminotransferase  26.72 
 
 		 399 aa  50.4  0.00004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.550604  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0405  aspartate aminotransferase  29.91 
 
 		 403 aa  49.3  0.00008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.152588  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2605  LL-diaminopimelate aminotransferase  34.18 
 
 		 385 aa  48.5  0.0001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.121492  normal  0.427052 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1377  aspartate aminotransferase  23.56 
 
 		 400 aa  48.9  0.0001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.489913  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1096  histidinol-phosphate aminotransferase  29.71 
 
 		 365 aa  48.9  0.0001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0578719  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3262  aspartate aminotransferase  26.72 
 
 		 395 aa  48.5  0.0001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3706  aminotransferase  26.64 
 
 		 460 aa  48.1  0.0002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1417  aspartate aminotransferase  24.18 
 
 		 400 aa  48.1  0.0002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.557805 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0624  aspartate aminotransferase  20 
 
 		 395 aa  48.1  0.0002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.68726  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5370  aminotransferase class I and II  28.92 
 
 		 340 aa  48.1  0.0002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1466  L-threonine-O-3-phosphate decarboxylase  32.98 
 
 		 362 aa  47.8  0.0002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1627  aspartate aminotransferase  27.97 
 
 		 408 aa  47.4  0.0003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0411376 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07891  aspartate aminotransferase  29.73 
 
 		 409 aa  47.4  0.0003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0655  histidinol-phosphate aminotransferase, putative  29.51 
 
 		 368 aa  47.4  0.0003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0689  histidinol-phosphate aminotransferase, putative  29.51 
 
 		 368 aa  47.4  0.0003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01913  aspartate aminotransferase  25.86 
 
 		 395 aa  47.4  0.0003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0779024 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0650  L-threonine O-3-phosphate decarboxylase  30.5 
 
 		 366 aa  47  0.0004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.000240372  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3007  hypothetical protein  27.56 
 
 		 390 aa  45.4  0.001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1277  LL-diaminopimelate aminotransferase  34.18 
 
 		 390 aa  45.8  0.001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.306005  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0487  LL-diaminopimelate aminotransferase  41.07 
 
 		 391 aa  45.1  0.001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.727411 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2622  cobalamin biosynthetic protein  23.53 
 
 		 337 aa  45.4  0.001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0228702  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0420  L-threonine-O-3-phosphate decarboxylase  29.59 
 
 		 356 aa  45.4  0.001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1104  L-threonine O-3-phosphate decarboxylase  31.03 
 
 		 375 aa  45.4  0.001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1760  aspartate aminotransferase  29.46 
 
 		 402 aa  45.8  0.001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.801832  normal  0.0251287 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3089  L-threonine-O-3-phosphate decarboxylase  28.18 
 
 		 366 aa  45.4  0.001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00022777  hitchhiker  0.00208232 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4926  aminotransferase class I and II  22.45 
 
 		 406 aa  45.1  0.001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00335974 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3209  aspartate aminotransferase  26.76 
 
 		 410 aa  44.7  0.002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.053672  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1734  aspartate aminotransferase  27.12 
 
 		 410 aa  45.1  0.002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1013  LL-diaminopimelate aminotransferase  40 
 
 		 385 aa  45.1  0.002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1495  aspartate aminotransferase  36 
 
 		 388 aa  45.1  0.002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00201329 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1156  histidinol-phosphate aminotransferase  33.33 
 
 		 355 aa  45.1  0.002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3537  L-threonine-O-3-phosphate decarboxylase  30.22 
 
 		 379 aa  44.7  0.002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1507  aspartate aminotransferase  37.29 
 
 		 400 aa  44.3  0.002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.283909 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3603  L-threonine-O-3-phosphate decarboxylase  28.29 
 
 		 370 aa  43.9  0.003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_593  histidinol-phosphate aminotransferase  28.69 
 
 		 368 aa  44.3  0.003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.28275  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2087  L-threonine O-3-phosphate decarboxylase  26.85 
 
 		 498 aa  43.9  0.003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.787862  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4666  transcriptional regulator  24.2 
 
 		 511 aa  44.3  0.003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0633  aminotransferase  31.65 
 
 		 384 aa  43.9  0.003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0043  putative L-threonine-O-3-phosphate decarboxylase  27.74 
 
 		 357 aa  43.9  0.003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3453  L-threonine O-3-phosphate decarboxylase  26.36 
 
 		 496 aa  43.9  0.004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.131993 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0704  L,L-diaminopimelate aminotransferase  28.42 
 
 		 407 aa  43.9  0.004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.167221  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1679  histidinol-phosphate aminotransferase  25.4 
 
 		 362 aa  43.9  0.004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1309  aminotransferase class I and II  28.32 
 
 		 378 aa  43.9  0.004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000234222  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2584  putative aminotransferase  24.81 
 
 		 374 aa  43.5  0.004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.975598  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3101  L,L-diaminopimelate aminotransferase  23.01 
 
 		 410 aa  43.1  0.005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2782  aminotransferase  27.93 
 
 		 406 aa  43.5  0.005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1520  histidinol-phosphate aminotransferase  30.34 
 
 		 375 aa  43.5  0.005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2208  L-threonine-O-3-phosphate decarboxylase  25.4 
 
 		 356 aa  43.1  0.006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2861  hypothetical protein  27.27 
 
 		 390 aa  42.7  0.007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1456  histidinol-phosphate aminotransferase  23.08 
 
 		 371 aa  42.7  0.008  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.591481  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0625  L-threonine O-3-phosphate decarboxylase  27.12 
 
 		 368 aa  42.7  0.008  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.027617  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0254  aspartate aminotransferase  21.28 
 
 		 388 aa  42.7  0.008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.144129  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1592  L,L-diaminopimelate aminotransferase  24.18 
 
 		 408 aa  42.4  0.009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.518523  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31820  putative aminotransferase  30.48 
 
 		 374 aa  42.4  0.009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.437419  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3811  transcriptional regulator  24.51 
 
 		 507 aa  42.4  0.009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3136  aminotransferase  36 
 
 		 343 aa  42.4  0.009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.258747  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3295  GntR family transcriptional regulator  24.51 
 
 		 507 aa  42.4  0.009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.761418 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0487  L-threonine O-3-phosphate decarboxylase  29.37 
 
 		 399 aa  42.4  0.01  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1397  aspartate aminotransferase  41.03 
 
 		 388 aa  42.4  0.01  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.991404 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1418  aspartate aminotransferase  25 
 
 		 384 aa  42.4  0.01  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6129  aminotransferase class I and II  37.62 
 
 		 390 aa  42.4  0.01  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.849535  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>