More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPTO_0995 on replicon NC_004578
Organism: Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_004578  PSPTO_0995  methyl-accepting chemotaxis protein  100 
 
 
557 aa  1100    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.467879  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0860  histidine kinase, HAMP region: chemotaxis sensory transducer  91.76 
 
 
558 aa  971    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.572392 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3291  methyl-accepting chemotaxis protein  43.54 
 
 
542 aa  373  1e-102  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.470345  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1630  chemotaxis sensory transducer  43.43 
 
 
541 aa  367  1e-100  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0250136 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1418  chemotaxis sensory transducer  46.48 
 
 
541 aa  363  4e-99  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0447  chemotaxis sensory transducer  41.54 
 
 
541 aa  362  7.0000000000000005e-99  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2907  chemotaxis sensory transducer  43.07 
 
 
541 aa  362  1e-98  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.300582 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2878  histidine kinase, HAMP region: chemotaxis sensory transducer  42.62 
 
 
542 aa  356  7.999999999999999e-97  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.425048  normal  0.909341 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0466  methyl-accepting chemotaxis protein  40.99 
 
 
541 aa  347  3e-94  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2997  methyl-accepting chemotaxis protein  42.44 
 
 
542 aa  344  2e-93  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.686035  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4706  histidine kinase, HAMP region: chemotaxis sensory transducer  40.44 
 
 
541 aa  337  5e-91  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4541  methyl-accepting chemotaxis protein  41.47 
 
 
541 aa  336  5.999999999999999e-91  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.726322  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5569  methyl-accepting chemotaxis protein  40.3 
 
 
541 aa  326  6e-88  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4218  histidine kinase, HAMP region: chemotaxis sensory transducer  39.52 
 
 
541 aa  326  6e-88  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.599163 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0317  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  40.11 
 
 
541 aa  324  2e-87  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.365849  decreased coverage  0.0000342214 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0339  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  40.11 
 
 
541 aa  325  2e-87  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.722367  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3666  chemotaxis transducer  41.09 
 
 
541 aa  322  8e-87  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.260935  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3577  methyl-accepting chemotaxis protein  39.44 
 
 
542 aa  320  5e-86  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43710  putative methyl-accepting chemotaxis transducer  40.73 
 
 
541 aa  319  1e-85  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4890  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  41.33 
 
 
541 aa  315  9.999999999999999e-85  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.452969  normal  0.355365 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0340  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  40.3 
 
 
541 aa  315  9.999999999999999e-85  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.582352  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4624  methyl-accepting chemotaxis protein  40.15 
 
 
539 aa  314  2.9999999999999996e-84  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.140064  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1491  histidine kinase, HAMP region: chemotaxis sensory transducer  40.15 
 
 
539 aa  313  3.9999999999999997e-84  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3114  histidine kinase, HAMP region: chemotaxis sensory transducer  38.84 
 
 
541 aa  313  4.999999999999999e-84  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.860602  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2091  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  39.96 
 
 
541 aa  313  5.999999999999999e-84  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.596764  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4833  chemotaxis sensory transducer  40.04 
 
 
541 aa  311  1e-83  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000956827  normal  0.082646 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2263  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  39.44 
 
 
541 aa  310  2.9999999999999997e-83  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2471  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  49.74 
 
 
425 aa  307  3e-82  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.817651  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_48030  putative methyl-accepting chemotaxis transducer  39.64 
 
 
541 aa  307  3e-82  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.478475 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2268  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  39.11 
 
 
541 aa  306  5.0000000000000004e-82  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.255239  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0931  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  37.04 
 
 
541 aa  305  1.0000000000000001e-81  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.476721 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3348  histidine kinase, HAMP region: chemotaxis sensory transducer  38.33 
 
 
542 aa  305  1.0000000000000001e-81  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.946905  normal  0.024921 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2593  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  38.64 
 
 
540 aa  304  3.0000000000000004e-81  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.591477 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0921  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.78 
 
 
541 aa  304  4.0000000000000003e-81  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4141  chemotaxis transducer  40.88 
 
 
541 aa  302  1e-80  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3441  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.86 
 
 
541 aa  302  1e-80  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0897  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.86 
 
 
541 aa  301  2e-80  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2319  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  39.07 
 
 
546 aa  298  2e-79  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.217936  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3279  methyl-accepting chemotaxis protein  38.67 
 
 
541 aa  298  2e-79  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.149652  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2634  histidine kinase, HAMP region: chemotaxis sensory transducer  36.79 
 
 
542 aa  294  3e-78  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.917034  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3580  methyl-accepting chemotaxis protein  38.52 
 
 
546 aa  291  2e-77  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4266  chemotaxis sensory transducer  36.93 
 
 
546 aa  291  2e-77  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.261421  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3351  histidine kinase, HAMP region: chemotaxis sensory transducer  38.25 
 
 
570 aa  283  7.000000000000001e-75  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0540062  normal  0.0241334 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3323  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  37.45 
 
 
539 aa  273  7e-72  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1150  chemotaxis sensory transducer  44.06 
 
 
551 aa  271  2e-71  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3322  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  37.66 
 
 
539 aa  270  4e-71  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.910778 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0868  histidine kinase, HAMP region: chemotaxis sensory transducer  36.33 
 
 
546 aa  268  2e-70  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.872643 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2054  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  37.32 
 
 
539 aa  268  2.9999999999999995e-70  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1334  methyl-accepting chemotaxis protein  43.59 
 
 
550 aa  264  3e-69  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1438  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.17 
 
 
540 aa  259  1e-67  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2643  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  44.63 
 
 
550 aa  253  8.000000000000001e-66  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0855376  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2109  histidine kinase, HAMP region: chemotaxis sensory transducer  38.01 
 
 
539 aa  251  2e-65  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.950044  normal  0.0787865 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2149  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  44.35 
 
 
541 aa  251  2e-65  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.608007  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3184  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  45.67 
 
 
541 aa  241  2.9999999999999997e-62  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.799555  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2773  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  32.78 
 
 
540 aa  239  1e-61  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2616  methyl-accepting chemotaxis protein  39.66 
 
 
633 aa  224  4e-57  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00438795  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2356  histidine kinase, HAMP region: chemotaxis sensory transducer  38.98 
 
 
619 aa  223  7e-57  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0809243  normal  0.398562 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3139  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  41.27 
 
 
640 aa  222  9.999999999999999e-57  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.753261  normal  0.0120166 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1426  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  38.2 
 
 
634 aa  222  9.999999999999999e-57  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0167  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35.18 
 
 
540 aa  216  9.999999999999999e-55  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0106  methyl-accepting chemotaxis protein  28.81 
 
 
546 aa  213  5.999999999999999e-54  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.827543  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4894  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  41.16 
 
 
638 aa  213  9e-54  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.291281  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5020  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  41.16 
 
 
638 aa  213  1e-53  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003886  methyl-accepting chemotaxis protein  32.54 
 
 
542 aa  211  2e-53  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0445  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  40.85 
 
 
638 aa  212  2e-53  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.455391  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5070  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  40.85 
 
 
638 aa  211  3e-53  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0380  histidine kinase, HAMP region: chemotaxis sensory transducer  37.16 
 
 
638 aa  210  6e-53  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1937  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  41.48 
 
 
541 aa  210  7e-53  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.158854  normal  0.960341 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3284  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  38.86 
 
 
522 aa  209  1e-52  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4895  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.41 
 
 
739 aa  207  3e-52  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.247309  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1672  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  39.12 
 
 
544 aa  207  3e-52  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5092  histidine kinase, HAMP region: chemotaxis sensory transducer  35.71 
 
 
640 aa  207  4e-52  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1939  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  37.82 
 
 
638 aa  207  4e-52  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.573171  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0444  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  37.41 
 
 
647 aa  207  5e-52  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.414929  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5071  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  38.92 
 
 
647 aa  206  6e-52  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1098  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  37.75 
 
 
637 aa  206  8e-52  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0167241  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0379  histidine kinase, HAMP region: chemotaxis sensory transducer  39.46 
 
 
647 aa  206  8e-52  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.454626  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1963  putative methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  40.3 
 
 
637 aa  206  9e-52  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.870205  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0443  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  38.4 
 
 
541 aa  206  1e-51  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5021  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  38.64 
 
 
647 aa  205  2e-51  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0828859  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43220  putative methyl-accepting chemotaxis transducer  38.64 
 
 
652 aa  204  4e-51  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.625872 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5160  methyl-accepting chemotaxis protein  39.46 
 
 
647 aa  202  9.999999999999999e-51  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.391343  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000055  methyl-accepting chemotaxis protein  29.73 
 
 
543 aa  202  9.999999999999999e-51  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.000458726  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4715  chemotaxis sensory transducer  37.79 
 
 
713 aa  201  3.9999999999999996e-50  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.233277  normal  0.171171 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1254  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  37.63 
 
 
639 aa  199  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.523103  normal  0.0331864 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0931  methyl-accepting chemotaxis protein  29.34 
 
 
543 aa  199  1.0000000000000001e-49  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2000  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  39.49 
 
 
560 aa  198  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0144557  normal  0.0324669 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0732  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.29 
 
 
555 aa  198  2.0000000000000003e-49  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.177926 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5553  methyl-accepting chemotaxis protein  35.18 
 
 
640 aa  197  3e-49  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1674  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  29.56 
 
 
543 aa  197  4.0000000000000005e-49  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67010  putative chemotaxis transducer  39.94 
 
 
647 aa  197  4.0000000000000005e-49  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0905  histidine kinase, HAMP region: chemotaxis sensory transducer  37.92 
 
 
640 aa  197  6e-49  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.746842  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5159  methyl-accepting chemotaxis protein  38.62 
 
 
638 aa  196  7e-49  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29760  putative chemotaxis transducer  38.53 
 
 
714 aa  195  2e-48  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0210  methyl-accepting chemotaxis protein  28.73 
 
 
543 aa  195  2e-48  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000824359  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2546  putative chemotaxis transducer  38.24 
 
 
714 aa  194  3e-48  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.410637  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2284  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  38.15 
 
 
653 aa  194  3e-48  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00297466 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3611  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  38.03 
 
 
634 aa  194  5e-48  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2316  putative methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.57 
 
 
548 aa  194  5e-48  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.0208981 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2346  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  37.78 
 
 
564 aa  193  7e-48  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>