232 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPTO_0943 on replicon NC_004578
Organism: Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004578  PSPTO_0943  tellurium resistance protein TerC  100 
 
 		 344 aa  683    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0811  integral membrane protein TerC  98.26 
 
 		 344 aa  674    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.13057  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3786  tellurite resistance protein  70.88 
 
 		 345 aa  498  1e-140  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  0.0000358727  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1353  tellurium resistance protein TerC  69.36 
 
 		 346 aa  497  1e-139  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000658877  normal  0.538332 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0271  integral membrane protein TerC  77.88 
 
 		 331 aa  494  1e-139  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.398373 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3874  integral membrane protein TerC  70.88 
 
 		 345 aa  497  1e-139  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00122311  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0665  tellurium resistance protein  70.59 
 
 		 345 aa  494  1e-139  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.0010291  normal  0.444043 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3697  Integral membrane protein TerC  68.7 
 
 		 347 aa  483  1e-135  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0862662  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3904  integral membrane protein TerC  65.49 
 
 		 342 aa  453  1.0000000000000001e-126  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0625  membrane protein  55.65 
 
 		 334 aa  358  6e-98  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.039209  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0890  integral membrane protein TerC  52.38 
 
 		 338 aa  347  2e-94  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0691  tellurium resistance protein  48.19 
 
 		 331 aa  306  3e-82  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.000269141  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1367  TerC family integral membrane protein  36.68 
 
 		 311 aa  218  1e-55  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.536325  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3448  Integral membrane protein TerC  39.16 
 
 		 360 aa  215  7e-55  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000597859  hitchhiker  0.00065247 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1897  Integral membrane protein TerC  37.97 
 
 		 339 aa  210  3e-53  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0567869  normal  0.451222 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0016  integral membrane protein TerC  35.8 
 
 		 328 aa  202  8e-51  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0168  integral membrane protein TerC  35.87 
 
 		 321 aa  201  1.9999999999999998e-50  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  unclonable  0.0000000120388  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05912  hypothetical protein  36.44 
 
 		 343 aa  198  9e-50  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1094  protein alx  36.66 
 
 		 314 aa  197  2.0000000000000003e-49  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.901246  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0027  protein alx  36.66 
 
 		 314 aa  197  2.0000000000000003e-49  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000188  membrane protein TerC  37.3 
 
 		 339 aa  197  3e-49  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.0000121417  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0184  TerC family membrane protein  34.65 
 
 		 321 aa  194  1e-48  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.36035  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_173  membrane protein, TerC family  35.19 
 
 		 308 aa  195  1e-48  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000225812  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3680  integral membrane protein TerC  36.51 
 
 		 330 aa  193  3e-48  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2343  integral membrane protein TerC  37.26 
 
 		 324 aa  193  3e-48  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.912158  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3366  Integral membrane protein TerC  37.98 
 
 		 440 aa  192  8e-48  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.404586  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2416  Integral membrane protein TerC  36.47 
 
 		 313 aa  191  1e-47  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2511  integral membrane protein TerC  38.1 
 
 		 335 aa  191  2e-47  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.168713  normal  0.0111876 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0781  integral membrane protein TerC  39.27 
 
 		 314 aa  190  2e-47  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00541452  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1438  integral membrane protein TerC  35.93 
 
 		 329 aa  190  2.9999999999999997e-47  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0390  integral membrane protein TerC  36.36 
 
 		 354 aa  189  7e-47  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0875594  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0331  integral membrane protein TerC  34.72 
 
 		 325 aa  189  8e-47  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5015  Integral membrane protein TerC  36.19 
 
 		 344 aa  189  8e-47  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2303  integral membrane protein TerC  35.4 
 
 		 314 aa  188  1e-46  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2543  integral membrane protein TerC  35.42 
 
 		 327 aa  188  1e-46  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2610  integral membrane protein TerC  35.42 
 
 		 327 aa  188  1e-46  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1153  integral membrane protein TerC  37.46 
 
 		 334 aa  188  1e-46  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1025  Integral membrane protein TerC  36.2 
 
 		 327 aa  187  3e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.237996  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1943  Integral membrane protein TerC  37.54 
 
 		 332 aa  186  4e-46  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00153344 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1628  integral membrane protein TerC  38.39 
 
 		 334 aa  186  5e-46  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1004  Integral membrane protein TerC  40.66 
 
 		 312 aa  186  5e-46  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.144845  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0968  Integral membrane protein TerC  36.88 
 
 		 306 aa  186  6e-46  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.562577 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2710  integral membrane protein TerC  35.89 
 
 		 325 aa  186  6e-46  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0811  Integral membrane protein TerC  36.28 
 
 		 313 aa  185  9e-46  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2919  Integral membrane protein TerC  33.83 
 
 		 331 aa  185  1.0000000000000001e-45  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.000105664  normal  0.323377 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2440  integral membrane protein TerC  36.28 
 
 		 327 aa  185  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.127814  normal  0.55186 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0550  Integral membrane protein TerC  34.65 
 
 		 312 aa  184  2.0000000000000003e-45  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0040107  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3281  Integral membrane protein TerC  36.88 
 
 		 307 aa  183  3e-45  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1747  hypothetical protein  35.28 
 
 		 325 aa  183  4.0000000000000006e-45  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0923  integral membrane protein TerC  33.13 
 
 		 322 aa  183  4.0000000000000006e-45  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10498  membrane protein, TerC family protein  34.12 
 
 		 322 aa  182  6e-45  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0747324  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2946  integral membrane protein TerC  36.69 
 
 		 322 aa  182  8.000000000000001e-45  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0216006  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4279  hypothetical protein  34.97 
 
 		 325 aa  181  1e-44  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2793  Integral membrane protein TerC  34.97 
 
 		 328 aa  181  1e-44  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.611411  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2016  integral membrane protein TerC  36.94 
 
 		 320 aa  182  1e-44  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5098  integral membrane protein TerC  36.46 
 
 		 322 aa  182  1e-44  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.137745  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5186  integral membrane protein TerC  36.46 
 
 		 322 aa  182  1e-44  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0800835  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1557  integral membrane protein TerC  34.97 
 
 		 328 aa  181  1e-44  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5477  integral membrane protein TerC  36.46 
 
 		 322 aa  182  1e-44  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.409981  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1553  integral membrane protein TerC  34.97 
 
 		 328 aa  181  1e-44  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.729834  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1570  TerC family membrane protein  35.65 
 
 		 314 aa  181  2e-44  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0056  integral membrane protein TerC  38.87 
 
 		 329 aa  181  2e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.963752 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1926  transporter  35.05 
 
 		 352 aa  181  2e-44  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0285  integral membrane protein TerC  37.19 
 
 		 337 aa  180  2.9999999999999997e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5359  TerC family protein  38.11 
 
 		 325 aa  180  2.9999999999999997e-44  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.114229  hitchhiker  0.00169974 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0083  Integral membrane protein TerC  36.5 
 
 		 344 aa  180  4e-44  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1155  integral membrane protein TerC  34.51 
 
 		 311 aa  179  4.999999999999999e-44  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000825766  normal  0.0331018 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3305  TerC family membrane protein  35.02 
 
 		 327 aa  179  5.999999999999999e-44  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0231665 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2086  integral membrane protein TerC  34.52 
 
 		 354 aa  179  5.999999999999999e-44  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0479  hypothetical protein  34.78 
 
 		 318 aa  179  5.999999999999999e-44  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000001102  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2667  integral membrane protein TerC  33.93 
 
 		 318 aa  179  7e-44  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2438  hypothetical protein  34.89 
 
 		 354 aa  178  1e-43  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3632  Integral membrane protein TerC  33.97 
 
 		 321 aa  178  1e-43  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.443887  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3568  integral membrane protein TerC  35.2 
 
 		 312 aa  178  1e-43  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00256618  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1443  integral membrane protein TerC  34.77 
 
 		 305 aa  178  1e-43  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.145143  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2384  integral membrane protein TerC  34.71 
 
 		 359 aa  178  1e-43  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0331794  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1862  Integral membrane protein TerC  36.62 
 
 		 320 aa  178  1e-43  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.201743  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0265  Integral membrane protein TerC  36.53 
 
 		 320 aa  177  2e-43  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1705  integral membrane protein TerC  34.02 
 
 		 320 aa  178  2e-43  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1144  integral membrane protein TerC  34.63 
 
 		 310 aa  177  2e-43  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000129998  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0855  TerC family membrane protein  32.85 
 
 		 311 aa  177  3e-43  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0835081  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1586  integral membrane protein TerC  34.36 
 
 		 328 aa  177  3e-43  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3257  integral membrane protein TerC  35.53 
 
 		 354 aa  177  3e-43  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.677602 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1947  Integral membrane protein TerC  36.31 
 
 		 320 aa  176  4e-43  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.204992  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3062  integral membrane protein TerC  34.87 
 
 		 354 aa  176  4e-43  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0416562  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3507  Integral membrane protein TerC  36.59 
 
 		 317 aa  176  5e-43  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1566  integral membrane protein TerC  35.16 
 
 		 320 aa  176  6e-43  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1576  Integral membrane protein TerC  35.59 
 
 		 325 aa  176  6e-43  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2053  integral membrane protein TerC  38.14 
 
 		 373 aa  175  8e-43  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.2838  normal  0.603844 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1451  integral membrane protein TerC  34.56 
 
 		 328 aa  176  8e-43  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2034  Integral membrane protein TerC  34.09 
 
 		 334 aa  175  9.999999999999999e-43  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2606  integral membrane protein TerC  35.56 
 
 		 327 aa  174  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.271005 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2297  Integral membrane protein TerC  34.97 
 
 		 286 aa  173  3.9999999999999995e-42  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.610971  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5754  Integral membrane protein TerC  31.78 
 
 		 354 aa  173  3.9999999999999995e-42  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0534  Integral membrane protein TerC  36.34 
 
 		 317 aa  172  9e-42  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1472  integral membrane protein TerC  33.12 
 
 		 318 aa  172  9e-42  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0736705  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31610  TerC family protein  36.42 
 
 		 347 aa  172  1e-41  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0594051 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3613  integral membrane protein TerC  34.6 
 
 		 342 aa  171  1e-41  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3415  inner membrane protein alx  35.87 
 
 		 322 aa  171  2e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0291  integral membrane protein TerC  38.02 
 
 		 308 aa  171  2e-41  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>