More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PMT9312_1110 on replicon NC_007577
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9312



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007335  PMN2A_0649  ATPase  64.12 
 
 		 596 aa  786    Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.110083  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4426  ABC transporter related  56.78 
 
 		 603 aa  691    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.368028  normal  0.0987215 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3017  ABC transporter, transmembrane region  55.52 
 
 		 602 aa  661    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0138128  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3174  ABC transporter related  59.01 
 
 		 601 aa  690    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1402  ATPase  59.9 
 
 		 619 aa  734    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.387875  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1643  ATPase  59.01 
 
 		 601 aa  754    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1110  ATPase  100 
 
 		 590 aa  1177    Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.551514  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2109  ATPase  56.7 
 
 		 591 aa  704    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.265654  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10871  multidrug ABC transporter  63.33 
 
 		 596 aa  780    Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.405422 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0828  ABC transporter related  59.29 
 
 		 596 aa  642    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.61579  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4432  ABC transporter related  57.72 
 
 		 601 aa  676    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_12051  multidrug ABC transporter  96.27 
 
 		 590 aa  1140    Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_11901  multidrug ABC transporter  86.61 
 
 		 590 aa  1040    Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_14811  multidrug ABC transporter  64.29 
 
 		 596 aa  791    Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.25024  normal  0.341749 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_12061  multidrug ABC transporter  96.95 
 
 		 590 aa  1123    Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2944  ABC transporter related  58.83 
 
 		 601 aa  690    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.631806 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5646  ABC transporter related protein  51.75 
 
 		 596 aa  625  1e-178  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0115  ABC transporter, transmembrane region  52.11 
 
 		 625 aa  606  9.999999999999999e-173  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2187  ABC transporter related  52.37 
 
 		 595 aa  605  1.0000000000000001e-171  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0306  ABC transporter related protein  47.72 
 
 		 620 aa  565  1e-160  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.233124 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1520  hypothetical protein  45.94 
 
 		 595 aa  505  9.999999999999999e-143  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0417  ABC transporter related  38.67 
 
 		 660 aa  448  1.0000000000000001e-124  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.899046 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0441  ABC transporter related protein  39.6 
 
 		 650 aa  447  1.0000000000000001e-124  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1262  ABC transporter related  42.22 
 
 		 644 aa  442  1e-123  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1375  ABC transporter related  36.32 
 
 		 651 aa  421  1e-116  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.250681  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2242  ABC transporter related protein  42.1 
 
 		 658 aa  420  1e-116  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.406073  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4471  ABC transporter related protein  36.82 
 
 		 629 aa  417  9.999999999999999e-116  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0660374  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0078  ABC transporter related  38.77 
 
 		 648 aa  417  9.999999999999999e-116  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.213516  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2936  ABC transporter related  36.29 
 
 		 638 aa  404  1e-111  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3017  ABC transporter related protein  35.33 
 
 		 639 aa  396  1e-109  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4137  ABC transporter related protein  32.24 
 
 		 718 aa  391  1e-107  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2998  ABC transporter related protein  40.85 
 
 		 575 aa  391  1e-107  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000215819  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3174  ABC transporter related  34.75 
 
 		 750 aa  385  1e-106  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3603  ABC transporter related  35.83 
 
 		 962 aa  385  1e-105  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0813652  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0975  ABC transporter related  35.07 
 
 		 585 aa  366  1e-100  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.685046  hitchhiker  0.000181513 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0402  ABC transporter related  33.33 
 
 		 645 aa  360  5e-98  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.176731  normal  0.164805 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0913  ABC transporter related  34.18 
 
 		 678 aa  357  3.9999999999999996e-97  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00146704 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1550  ABC transporter related  36.45 
 
 		 589 aa  346  5e-94  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.759268  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0466  ABC transporter related  38 
 
 		 588 aa  344  2e-93  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4974  ABC transporter related  33.73 
 
 		 571 aa  341  2e-92  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5030  ABC transporter ATP-binding/permease  33.39 
 
 		 571 aa  338  1.9999999999999998e-91  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0487117  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5411  ABC transporter permease/ATP-binding protein  33.39 
 
 		 571 aa  338  1.9999999999999998e-91  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4860  multidrug resistance ABC transporter, ATP-binding and permease  33.39 
 
 		 571 aa  337  2.9999999999999997e-91  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.201042  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4875  multidrug resistance ABC transporter, ATP-binding and permease  33.39 
 
 		 571 aa  337  2.9999999999999997e-91  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.259113  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5268  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  33.39 
 
 		 571 aa  337  2.9999999999999997e-91  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5298  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  33.39 
 
 		 571 aa  337  5e-91  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0247  ABC transporter related  38.39 
 
 		 586 aa  336  9e-91  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.306695  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5658  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  33.22 
 
 		 571 aa  335  1e-90  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18960  ABC transporter related  36.66 
 
 		 556 aa  335  1e-90  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5343  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  33.5 
 
 		 571 aa  334  2e-90  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3781  ABC transporter related  33.84 
 
 		 588 aa  333  4e-90  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000284212  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21520  ABC transporter related  39.57 
 
 		 468 aa  333  7.000000000000001e-90  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5285  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  33.05 
 
 		 571 aa  332  8e-90  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1525  ABC transporter related  33.57 
 
 		 581 aa  330  3e-89  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.628149  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2922  ABC transporter related protein  35.01 
 
 		 581 aa  329  7e-89  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.364865  normal  0.717354 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1429  ABC transporter related  33.81 
 
 		 581 aa  328  2.0000000000000001e-88  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3351  ABC transporter related  35.41 
 
 		 579 aa  327  3e-88  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.773989  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2283  ABC transporter related  34.79 
 
 		 589 aa  324  3e-87  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0185  ABC transporter related  33.75 
 
 		 611 aa  322  9.999999999999999e-87  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.821513  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3025  ABC transporter related  35.56 
 
 		 582 aa  320  3.9999999999999996e-86  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3627  ABC transporter related  32.38 
 
 		 617 aa  318  1e-85  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2733  ABC transporter related  31.26 
 
 		 631 aa  318  2e-85  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.021846  normal  0.190322 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0494  ABC transporter related  33.45 
 
 		 611 aa  315  9.999999999999999e-85  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1942  ABC transporter, transmembrane region  34.14 
 
 		 594 aa  315  1.9999999999999998e-84  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30570  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  32.57 
 
 		 1257 aa  315  1.9999999999999998e-84  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1201  ABC transporter related protein  33.91 
 
 		 594 aa  315  1.9999999999999998e-84  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0684  ABC transporter related  35.55 
 
 		 598 aa  315  1.9999999999999998e-84  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.000210902  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0981  ABC transporter related  30.87 
 
 		 576 aa  314  2.9999999999999996e-84  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1954  ABC transporter related  30.8 
 
 		 610 aa  314  3.9999999999999997e-84  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.111523 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1166  ABC transporter related protein  35.05 
 
 		 588 aa  313  4.999999999999999e-84  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0838  ABC transporter related  30.62 
 
 		 640 aa  313  4.999999999999999e-84  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0047  ABC transporter related  34.66 
 
 		 580 aa  313  5.999999999999999e-84  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00438981  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3501  ABC transporter related  34.38 
 
 		 575 aa  313  5.999999999999999e-84  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1259  ATP-binding transport protein; multicopy suppressor of HtrB  32.86 
 
 		 579 aa  313  6.999999999999999e-84  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1890  ABC transporter related  32.12 
 
 		 586 aa  313  7.999999999999999e-84  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0664725  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1896  ABC transporter related  33.95 
 
 		 572 aa  312  9e-84  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.332587  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0048  ABC transporter related  35.83 
 
 		 598 aa  312  1e-83  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000163685  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2826  ABC transporter, ATP-binding protein MsbA  34.58 
 
 		 604 aa  312  1e-83  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.070781 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1001  ABC transporter related protein  34.83 
 
 		 598 aa  311  2e-83  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.710389  normal  0.620497 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1080  ABC transporter related  32.48 
 
 		 601 aa  311  2e-83  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00169898 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3334  ABC transporter related  30.9 
 
 		 584 aa  311  2e-83  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.3583  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2497  ABC transporter related  32.01 
 
 		 614 aa  310  4e-83  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1305  ABC transporter related  33.82 
 
 		 598 aa  310  5e-83  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2264  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  33.62 
 
 		 596 aa  310  5.9999999999999995e-83  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.828033  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3714  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  34.65 
 
 		 587 aa  309  1.0000000000000001e-82  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.207401  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0506  ABC transporter, ATP-binding protein/permease  34.75 
 
 		 612 aa  308  1.0000000000000001e-82  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.740474 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2189  ABC transporter related protein  32.01 
 
 		 572 aa  309  1.0000000000000001e-82  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.480877  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1782  Lipid A export ATP-binding/permease protein MsbA  37.35 
 
 		 588 aa  308  2.0000000000000002e-82  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1526  ABC transporter related  31.2 
 
 		 597 aa  308  2.0000000000000002e-82  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00462588  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2444  ABC transporter related  36.14 
 
 		 580 aa  308  2.0000000000000002e-82  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.385044 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2528  ABC transporter related  32.94 
 
 		 580 aa  308  2.0000000000000002e-82  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000757065  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3231  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  35.29 
 
 		 572 aa  308  2.0000000000000002e-82  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.659501  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3719  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  34.46 
 
 		 587 aa  308  2.0000000000000002e-82  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2627  ABC transporter related  33.75 
 
 		 592 aa  307  4.0000000000000004e-82  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3466  ABC transporter ATP-binding/permease  34.26 
 
 		 587 aa  307  5.0000000000000004e-82  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.197712  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3432  ABC transporter, ATP-binding protein  34.26 
 
 		 587 aa  307  5.0000000000000004e-82  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000147455  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6252  ABC transporter related  32.01 
 
 		 1436 aa  306  5.0000000000000004e-82  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3740  ABC transporter permease/ATP-binding protein  34.26 
 
 		 587 aa  307  5.0000000000000004e-82  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.037622  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3695  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  34.26 
 
 		 587 aa  307  5.0000000000000004e-82  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000106018 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3384  ABC transporter, ATP-binding protein  34.06 
 
 		 587 aa  306  6e-82  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.603869  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>