More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PMT9312_0873 on replicon NC_007577
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9312



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007577  PMT9312_0873  hypothetical protein  100 
 
 		 347 aa  656    Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.475897  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_09331  permease  89.34 
 
 		 347 aa  569  1e-161  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_09321  permease  89.05 
 
 		 347 aa  544  1e-154  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_10101  permease  78.03 
 
 		 347 aa  484  1e-135  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_07191  permease  45.77 
 
 		 359 aa  310  2.9999999999999997e-83  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.626992  normal  0.434396 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0134  hypothetical protein  45.27 
 
 		 358 aa  282  6.000000000000001e-75  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.980357  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_07661  permease  44.76 
 
 		 358 aa  280  3e-74  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.0677332 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_16391  permease  42.51 
 
 		 360 aa  234  2.0000000000000002e-60  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.216071 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1196  hypothetical protein  43.12 
 
 		 359 aa  224  2e-57  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1274  hypothetical protein  42.86 
 
 		 359 aa  182  5.0000000000000004e-45  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.094175  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0518  hypothetical protein  34.99 
 
 		 387 aa  181  2e-44  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3926  protein of unknown function UPF0118  33.53 
 
 		 340 aa  180  2.9999999999999997e-44  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4793  hypothetical protein  34.53 
 
 		 344 aa  175  9e-43  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.560868 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3009  protein of unknown function UPF0118  38.3 
 
 		 382 aa  172  6.999999999999999e-42  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2392  hypothetical protein  36.12 
 
 		 349 aa  172  9e-42  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.89361 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2806  hypothetical protein  31.96 
 
 		 372 aa  169  6e-41  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.217461  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2233  hypothetical protein  33.04 
 
 		 379 aa  167  2e-40  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.195735  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3863  hypothetical protein  31.86 
 
 		 347 aa  159  7e-38  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.596541  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3434  protein of unknown function UPF0118  32.41 
 
 		 345 aa  157  3e-37  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1078  protein of unknown function UPF0118  31.74 
 
 		 336 aa  155  8e-37  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.359333 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2670  protein of unknown function UPF0118  32.1 
 
 		 345 aa  154  2e-36  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3369  protein of unknown function UPF0118  30.64 
 
 		 344 aa  134  1.9999999999999998e-30  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2742  protein of unknown function UPF0118  30.64 
 
 		 344 aa  134  1.9999999999999998e-30  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0922989  unclonable  0.00000000268058 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1195  hypothetical protein  25.74 
 
 		 329 aa  113  5e-24  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5210  protein of unknown function UPF0118  29.97 
 
 		 345 aa  108  9.000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000144016 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0581  protein of unknown function UPF0118  33.13 
 
 		 357 aa  108  1e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.96457  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_16401  permease  26.73 
 
 		 333 aa  102  1e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.199558 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1275  hypothetical protein  25.66 
 
 		 329 aa  100  3e-20  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3199  hypothetical protein  24.47 
 
 		 349 aa  100  5e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0020334  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1488  hypothetical protein  27.5 
 
 		 341 aa  96.3  6e-19  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000137756  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3895  hypothetical protein  24.17 
 
 		 340 aa  96.3  8e-19  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0467618  normal  0.207617 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2554  hypothetical protein  24.49 
 
 		 356 aa  95.5  1e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1450  hypothetical protein  26.8 
 
 		 350 aa  91.7  2e-17  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.996482  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0915  hypothetical protein  27.55 
 
 		 346 aa  91.3  2e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0244  protein of unknown function UPF0118  24.18 
 
 		 376 aa  87.4  3e-16  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3832  protein of unknown function UPF0118  23.21 
 
 		 372 aa  87.8  3e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1330  protein of unknown function UPF0118  25.17 
 
 		 351 aa  86.7  6e-16  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1235  protein of unknown function UPF0118  27.36 
 
 		 354 aa  84.3  0.000000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1508  protein of unknown function UPF0118  30.41 
 
 		 395 aa  84.3  0.000000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.634886  normal  0.895228 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1196  protein of unknown function UPF0118  23.96 
 
 		 349 aa  84.3  0.000000000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0956  hypothetical protein  22.56 
 
 		 349 aa  83.6  0.000000000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0392869 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3439  hypothetical protein  19.81 
 
 		 370 aa  83.2  0.000000000000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.190134  normal  0.242294 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1787  protein of unknown function UPF0118  30.41 
 
 		 392 aa  82  0.00000000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.190485  normal  0.0890558 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1508  hypothetical protein  30.41 
 
 		 401 aa  82  0.00000000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0662165  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4216  hypothetical protein  28.73 
 
 		 346 aa  81.6  0.00000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.329203  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4585  putative transport protein/permease  26.21 
 
 		 382 aa  80.9  0.00000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2262  hypothetical protein  26.9 
 
 		 381 aa  80.5  0.00000000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0141033  normal  0.407022 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1905  hypothetical protein  24.41 
 
 		 379 aa  78.6  0.0000000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.358826 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1194  hypothetical protein  23.8 
 
 		 396 aa  78.2  0.0000000000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1411  hypothetical protein  25.75 
 
 		 369 aa  78.2  0.0000000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0340  hypothetical protein  21.38 
 
 		 340 aa  77.4  0.0000000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0783  hypothetical protein  24.2 
 
 		 365 aa  77.8  0.0000000000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.930721  normal  0.646408 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2541  protein of unknown function UPF0118  28.08 
 
 		 392 aa  77.8  0.0000000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.407102  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3381  membrane protein YubA  27.35 
 
 		 373 aa  76.6  0.0000000000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00559166  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1984  hypothetical protein  21.38 
 
 		 340 aa  75.9  0.0000000000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.372704  normal  0.185401 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0929  hypothetical protein  25.91 
 
 		 405 aa  75.5  0.000000000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3161  hypothetical protein  26.94 
 
 		 376 aa  74.7  0.000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.0000118258  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3145  permease  26.94 
 
 		 376 aa  74.7  0.000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.000000000188051  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3055  permease  26.56 
 
 		 376 aa  74.7  0.000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0055436  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3410  hypothetical protein  26.94 
 
 		 376 aa  74.7  0.000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.38657  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3083  hypothetical protein  27.35 
 
 		 373 aa  75.1  0.000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.000376158  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3380  hypothetical protein  26.94 
 
 		 373 aa  74.7  0.000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3895  protein of unknown function UPF0118  20.66 
 
 		 529 aa  74.3  0.000000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.374859  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2868  protein of unknown function UPF0118  20.61 
 
 		 400 aa  74.3  0.000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.579917  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1647  hypothetical protein  21.71 
 
 		 345 aa  73.9  0.000000000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0171139 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0908  hypothetical protein  24.04 
 
 		 355 aa  73.9  0.000000000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0708322  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3380  hypothetical protein  26.94 
 
 		 376 aa  73.6  0.000000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.300528  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2165  hypothetical protein  27.5 
 
 		 414 aa  73.2  0.000000000006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.128502  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13163  permease  26.33 
 
 		 362 aa  73.2  0.000000000007  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5351  protein of unknown function UPF0118  27.62 
 
 		 364 aa  72.8  0.000000000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0138969  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2329  protein of unknown function UPF0118  24.49 
 
 		 436 aa  72  0.00000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000385102 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1871  membrane protein YubA  26.53 
 
 		 373 aa  71.2  0.00000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3355  hypothetical protein  26.53 
 
 		 373 aa  71.6  0.00000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1420  hypothetical protein  22.22 
 
 		 402 aa  71.2  0.00000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0644646  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1448  hypothetical protein  22.22 
 
 		 402 aa  71.2  0.00000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000360654  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2800  hypothetical protein  24.75 
 
 		 425 aa  70.5  0.00000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0330256  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15290  predicted permease  27.18 
 
 		 415 aa  70.9  0.00000000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2065  protein of unknown function UPF0118  24.18 
 
 		 358 aa  70.1  0.00000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.742659  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2596  hypothetical protein  23.39 
 
 		 371 aa  70.1  0.00000000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3129  hypothetical protein  21.55 
 
 		 418 aa  70.1  0.00000000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1561  putative transport protein  29.69 
 
 		 352 aa  70.1  0.00000000006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.421411  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1669  putative transport protein  29.69 
 
 		 352 aa  70.1  0.00000000006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1709  putative transport protein  29.69 
 
 		 352 aa  70.1  0.00000000006  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0814358  hitchhiker  0.000224346 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0467  hypothetical protein  24.76 
 
 		 339 aa  70.1  0.00000000006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000010449  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2955  hypothetical protein  25.51 
 
 		 373 aa  68.9  0.0000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0331656  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2637  permease  25.42 
 
 		 348 aa  68.9  0.0000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.386693  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1773  hypothetical protein  27.38 
 
 		 357 aa  68.6  0.0000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000027115  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1751  hypothetical protein  26.67 
 
 		 353 aa  68.9  0.0000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.903333  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2961  hypothetical protein  25.51 
 
 		 361 aa  68.9  0.0000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0186622  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2029  putative transport protein  32.8 
 
 		 344 aa  68.2  0.0000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.854402  normal  0.642454 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2042  protein of unknown function UPF0118  32.8 
 
 		 344 aa  68.2  0.0000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.230614  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01560  hypothetical protein  32.8 
 
 		 344 aa  68.2  0.0000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1675  putative transport protein  32.8 
 
 		 344 aa  68.6  0.0000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1808  putative transport protein  32.8 
 
 		 344 aa  68.6  0.0000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.791182  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2311  putative transport protein  32.8 
 
 		 344 aa  68.6  0.0000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1787  putative transport protein  32.8 
 
 		 344 aa  68.2  0.0000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.619529  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3110  protein of unknown function UPF0118  23.15 
 
 		 383 aa  68.2  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1598  putative transport protein  32.03 
 
 		 344 aa  68.2  0.0000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2700  hypothetical protein  25.56 
 
 		 368 aa  68.2  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0306531  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1910  putative transport protein  26.77 
 
 		 344 aa  68.2  0.0000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>