264 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_71203 on replicon NC_009043
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009043  PICST_71203  threonine aldolase  100 
 
 		 373 aa  783    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.200501  normal  1 
 
 
-
 
NC_009048  PICST_74130  threonine aldolase  62.5 
 
 		 369 aa  475  1e-133  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07564  threonine aldolase or alanine racemase, putative (Eurofung)  46.43 
 
 		 411 aa  307  2.0000000000000002e-82  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.10201 
 
 
-
 
NC_006685  CNC04680  threonine aldolase, putative  44.71 
 
 		 458 aa  284  2.0000000000000002e-75  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05426  threonine aldolase, putative (Eurofung)  37.54 
 
 		 328 aa  224  2e-57  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.142364  normal  0.232688 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4745  Threonine aldolase  39.79 
 
 		 339 aa  209  6e-53  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.285459 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6238  Threonine aldolase  36.39 
 
 		 340 aa  207  2e-52  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1663  L-threonine aldolase  35.24 
 
 		 338 aa  199  5e-50  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.469796  normal  0.726429 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000046  low-specificity L-threonine aldolase  36.89 
 
 		 334 aa  199  7.999999999999999e-50  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0582  L-allo-threonine aldolase  35.87 
 
 		 366 aa  198  1.0000000000000001e-49  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.519824  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3290  Threonine aldolase  35.5 
 
 		 344 aa  197  2.0000000000000003e-49  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.170768 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05668  L-allo-threonine aldolase  36.28 
 
 		 334 aa  197  2.0000000000000003e-49  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3740  threonine aldolase  36.07 
 
 		 343 aa  197  3e-49  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.848875 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4276  L-threonine aldolase  35.12 
 
 		 334 aa  196  4.0000000000000005e-49  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1039  threonine aldolase  38.64 
 
 		 343 aa  192  5e-48  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1081  threonine aldolase  38.64 
 
 		 343 aa  192  5e-48  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0706  L-allo-threonine aldolase  35.12 
 
 		 343 aa  192  8e-48  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2461  L-threonine aldolase  36.75 
 
 		 333 aa  192  8e-48  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.994155  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1729  Threonine aldolase  37.37 
 
 		 343 aa  191  1e-47  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.446616  normal  0.527107 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2772  Threonine aldolase  34.15 
 
 		 333 aa  191  2e-47  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.826971  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1841  threonine aldolase, low-specificity  36.84 
 
 		 334 aa  191  2e-47  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0899  L-threonine aldolase  36.75 
 
 		 333 aa  190  2.9999999999999997e-47  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.859325 
 
 
-
 
NC_011690  PHATRDRAFT_49372  predicted protein  34.01 
 
 		 400 aa  190  2.9999999999999997e-47  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1386  L-threonine aldolase  34.24 
 
 		 333 aa  190  2.9999999999999997e-47  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3338  L-allo-threonine aldolase  35.33 
 
 		 337 aa  190  2.9999999999999997e-47  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0943  L-threonine aldolase  33.84 
 
 		 333 aa  190  2.9999999999999997e-47  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.59  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0974  L-threonine aldolase  33.84 
 
 		 333 aa  190  2.9999999999999997e-47  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2726  L-threonine aldolase  33.84 
 
 		 333 aa  190  2.9999999999999997e-47  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00875  L-allo-threonine aldolase, PLP-dependent  33.84 
 
 		 333 aa  189  5e-47  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.533076  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00881  hypothetical protein  33.84 
 
 		 333 aa  189  5e-47  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.554159  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1031  L-threonine aldolase  33.84 
 
 		 333 aa  189  5.999999999999999e-47  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3557  threonine aldolase  36.84 
 
 		 334 aa  189  7e-47  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.443725  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3317  Threonine aldolase  36.93 
 
 		 338 aa  189  9e-47  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0969  L-threonine aldolase  36.04 
 
 		 333 aa  187  2e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3444  Threonine aldolase  35.46 
 
 		 359 aa  187  3e-46  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0251232 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1001  L-threonine aldolase  33.53 
 
 		 333 aa  186  5e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.13566  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0934  L-threonine aldolase  36.04 
 
 		 333 aa  186  5e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52610  hypothetical protein  38.25 
 
 		 334 aa  186  5e-46  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1051  L-threonine aldolase  36.04 
 
 		 333 aa  186  5e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1032  L-threonine aldolase  33.53 
 
 		 333 aa  186  7e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4613  hypothetical protein  38.6 
 
 		 334 aa  186  7e-46  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.255712  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2205  threonine aldolase  34.81 
 
 		 337 aa  186  8e-46  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.250112  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2705  L-threonine aldolase  32.07 
 
 		 351 aa  185  1.0000000000000001e-45  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2620  L-threonine aldolase  32.53 
 
 		 339 aa  185  1.0000000000000001e-45  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0449  Threonine aldolase  33.14 
 
 		 343 aa  184  2.0000000000000003e-45  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000000078963  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0206  aromatic amino acid beta-eliminating lyase/threonine aldolase  33.24 
 
 		 345 aa  184  2.0000000000000003e-45  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1588  L-threonine aldolase  32.53 
 
 		 339 aa  184  2.0000000000000003e-45  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3482  threonine aldolase  37.85 
 
 		 343 aa  184  3e-45  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.022519 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1278  L-threonine aldolase  34.23 
 
 		 337 aa  184  3e-45  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00000270333  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1208  L-threonine aldolase  34.43 
 
 		 337 aa  184  3e-45  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.0000000586474  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1347  threonine aldolase  39.61 
 
 		 336 aa  183  5.0000000000000004e-45  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.0000000974839  decreased coverage  0.000000417727 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0105  threonine aldolase  33.83 
 
 		 344 aa  182  6e-45  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0310789  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1361  threonine aldolase  34.42 
 
 		 342 aa  182  8.000000000000001e-45  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.0000000000121527  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1207  L-threonine aldolase  34.23 
 
 		 337 aa  182  8.000000000000001e-45  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000000862399  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5037  Threonine aldolase  37.76 
 
 		 337 aa  181  1e-44  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.258099 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3255  threonine aldolase  35.02 
 
 		 348 aa  182  1e-44  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.248349 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3094  L-threonine aldolase  35.62 
 
 		 331 aa  181  1e-44  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.646059  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2292  threonine aldolase  34.64 
 
 		 337 aa  182  1e-44  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.899538  normal  1 
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_33121  predicted protein  32.43 
 
 		 368 aa  181  2e-44  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.752316  normal  0.13405 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1281  aromatic amino acid beta-eliminating lyase/threonine aldolase  35.93 
 
 		 348 aa  181  2e-44  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2367  L-threonine aldolase  35.24 
 
 		 359 aa  181  2e-44  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1142  threonine aldolase  40 
 
 		 338 aa  181  2e-44  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.000000000636367  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1535  Threonine aldolase  37.37 
 
 		 342 aa  180  2.9999999999999997e-44  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.619548  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2673  threonine aldolase  34.64 
 
 		 337 aa  180  4e-44  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.0000000371505  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2904  L-threonine aldolase  35.44 
 
 		 334 aa  180  4e-44  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0643317  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0699  threonine aldolase  33.33 
 
 		 353 aa  180  4e-44  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.715932 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1781  Threonine aldolase  35.06 
 
 		 337 aa  179  5.999999999999999e-44  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1115  aromatic amino acid beta-eliminating lyase/threonine aldolase  33.14 
 
 		 344 aa  179  1e-43  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3162  L-allo-threonine aldolase  36.18 
 
 		 348 aa  178  2e-43  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0618  L-allo-threonine aldolase, putative  36.72 
 
 		 350 aa  177  2e-43  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.164351  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3011  threonine aldolase  33.93 
 
 		 337 aa  177  2e-43  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.00000000665478  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3026  threonine aldolase  33.93 
 
 		 337 aa  177  2e-43  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.000000000104832  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6047  Threonine aldolase  32.84 
 
 		 348 aa  176  4e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4499  Threonine aldolase  33.24 
 
 		 348 aa  176  4e-43  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2462  threonine aldolase  36.05 
 
 		 336 aa  176  5e-43  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.0000000261845  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1352  Threonine aldolase  33.63 
 
 		 337 aa  176  8e-43  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000000809376  unclonable  0.00000000000146629 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3169  threonine aldolase  33.63 
 
 		 337 aa  175  9.999999999999999e-43  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000533874  unclonable  0.00000438048 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1448  L-threonine aldolase  35.21 
 
 		 339 aa  175  9.999999999999999e-43  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0796  L-threonine aldolase  36.33 
 
 		 340 aa  175  9.999999999999999e-43  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.199246  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3647  Threonine aldolase  35.99 
 
 		 334 aa  175  9.999999999999999e-43  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.87063 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2345  threonine aldolase  33.63 
 
 		 337 aa  174  1.9999999999999998e-42  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08076  L-allo-threonine aldolase  33.77 
 
 		 340 aa  174  1.9999999999999998e-42  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  decreased coverage  0.00986668  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2554  threonine aldolase  35.62 
 
 		 339 aa  173  3.9999999999999995e-42  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3310  threonine aldolase  34.84 
 
 		 337 aa  173  5e-42  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.124779  normal  0.12149 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1247  threonine aldolase  35.65 
 
 		 336 aa  172  6.999999999999999e-42  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0103654  normal  0.613699 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1686  threonine aldolase  33.7 
 
 		 356 aa  172  6.999999999999999e-42  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.782503 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2147  L-allo-threonine aldolase  32.78 
 
 		 461 aa  172  7.999999999999999e-42  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2053  Threonine aldolase  36.46 
 
 		 349 aa  172  7.999999999999999e-42  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2159  Beta-eliminating lyase  33.91 
 
 		 386 aa  171  1e-41  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2023  L-allo-threonine aldolase  33.91 
 
 		 386 aa  171  1e-41  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.181196  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19940  threonine aldolase  33.53 
 
 		 343 aa  171  2e-41  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0178  L-threonine aldolase  36.4 
 
 		 337 aa  171  2e-41  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.250867 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3793  threonine aldolase  32.24 
 
 		 334 aa  171  2e-41  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.912828 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4817  threonine aldolase  35.63 
 
 		 337 aa  171  2e-41  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2003  L-allo-threonine aldolase  33.91 
 
 		 356 aa  171  2e-41  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1282  Threonine aldolase  33.89 
 
 		 357 aa  171  2e-41  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.12103  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1771  L-allo-threonine aldolase  33.44 
 
 		 397 aa  170  4e-41  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.444188  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0270  L-threonine aldolase  32.56 
 
 		 339 aa  170  4e-41  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5364  threonine aldolase  35.25 
 
 		 337 aa  170  4e-41  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5968  Threonine aldolase  36 
 
 		 335 aa  170  4e-41  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.904259  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>