270 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_74130 on replicon NC_009048
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009048  PICST_74130  threonine aldolase  100 
 
 		 369 aa  768    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_71203  threonine aldolase  62.5 
 
 		 373 aa  475  1e-133  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.200501  normal  1 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07564  threonine aldolase or alanine racemase, putative (Eurofung)  43.93 
 
 		 411 aa  297  2e-79  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.10201 
 
 
-
 
NC_006685  CNC04680  threonine aldolase, putative  44.12 
 
 		 458 aa  274  2.0000000000000002e-72  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05426  threonine aldolase, putative (Eurofung)  39.56 
 
 		 328 aa  222  7e-57  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.142364  normal  0.232688 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6238  Threonine aldolase  38.64 
 
 		 340 aa  222  8e-57  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3290  Threonine aldolase  37.86 
 
 		 344 aa  219  7e-56  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.170768 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4745  Threonine aldolase  35.31 
 
 		 339 aa  218  1e-55  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.285459 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1729  Threonine aldolase  38.51 
 
 		 343 aa  214  1.9999999999999998e-54  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.446616  normal  0.527107 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1663  L-threonine aldolase  36.75 
 
 		 338 aa  211  1e-53  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.469796  normal  0.726429 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4276  L-threonine aldolase  38.11 
 
 		 334 aa  208  1e-52  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05668  L-allo-threonine aldolase  39.04 
 
 		 334 aa  206  6e-52  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1081  threonine aldolase  39.19 
 
 		 343 aa  204  2e-51  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_33121  predicted protein  35.81 
 
 		 368 aa  204  2e-51  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.752316  normal  0.13405 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1039  threonine aldolase  39.19 
 
 		 343 aa  204  2e-51  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3557  threonine aldolase  36.89 
 
 		 334 aa  203  3e-51  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.443725  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3317  Threonine aldolase  39.45 
 
 		 338 aa  202  5e-51  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1841  threonine aldolase, low-specificity  36.28 
 
 		 334 aa  202  7e-51  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011690  PHATRDRAFT_49372  predicted protein  35.71 
 
 		 400 aa  202  7e-51  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2772  Threonine aldolase  39.58 
 
 		 333 aa  201  9.999999999999999e-51  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.826971  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0899  L-threonine aldolase  39.58 
 
 		 333 aa  201  9.999999999999999e-51  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.859325 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2620  L-threonine aldolase  36.28 
 
 		 339 aa  201  1.9999999999999998e-50  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0969  L-threonine aldolase  39.08 
 
 		 333 aa  201  1.9999999999999998e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2705  L-threonine aldolase  36.28 
 
 		 351 aa  200  3e-50  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1588  L-threonine aldolase  36.28 
 
 		 339 aa  200  3e-50  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1001  L-threonine aldolase  39.44 
 
 		 333 aa  200  3e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.13566  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2726  L-threonine aldolase  39.22 
 
 		 333 aa  200  3.9999999999999996e-50  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0974  L-threonine aldolase  39.22 
 
 		 333 aa  200  3.9999999999999996e-50  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0934  L-threonine aldolase  39.08 
 
 		 333 aa  200  3.9999999999999996e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0943  L-threonine aldolase  39.22 
 
 		 333 aa  200  3.9999999999999996e-50  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.59  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1051  L-threonine aldolase  39.08 
 
 		 333 aa  200  3.9999999999999996e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000046  low-specificity L-threonine aldolase  40.7 
 
 		 334 aa  199  5e-50  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1032  L-threonine aldolase  39.44 
 
 		 333 aa  199  5e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00875  L-allo-threonine aldolase, PLP-dependent  39.22 
 
 		 333 aa  199  6e-50  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.533076  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1031  L-threonine aldolase  38.87 
 
 		 333 aa  199  6e-50  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00881  hypothetical protein  39.22 
 
 		 333 aa  199  6e-50  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.554159  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0582  L-allo-threonine aldolase  36.42 
 
 		 366 aa  198  1.0000000000000001e-49  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.519824  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0449  Threonine aldolase  35.38 
 
 		 343 aa  197  2.0000000000000003e-49  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000000078963  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2461  L-threonine aldolase  38.87 
 
 		 333 aa  197  2.0000000000000003e-49  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.994155  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0706  L-allo-threonine aldolase  41.98 
 
 		 343 aa  197  3e-49  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3482  threonine aldolase  38.01 
 
 		 343 aa  196  6e-49  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.022519 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0796  L-threonine aldolase  37.84 
 
 		 340 aa  196  7e-49  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.199246  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3740  threonine aldolase  39.31 
 
 		 343 aa  194  1e-48  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.848875 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0206  aromatic amino acid beta-eliminating lyase/threonine aldolase  34.99 
 
 		 345 aa  195  1e-48  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3094  L-threonine aldolase  38.46 
 
 		 331 aa  195  1e-48  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.646059  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3444  Threonine aldolase  35.08 
 
 		 359 aa  194  2e-48  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0251232 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3255  threonine aldolase  35.01 
 
 		 348 aa  194  2e-48  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.248349 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2904  L-threonine aldolase  37.5 
 
 		 334 aa  194  2e-48  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0643317  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1448  L-threonine aldolase  36.45 
 
 		 339 aa  194  3e-48  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1386  L-threonine aldolase  34.74 
 
 		 333 aa  193  3e-48  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0699  threonine aldolase  35.44 
 
 		 353 aa  193  3e-48  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.715932 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2147  L-allo-threonine aldolase  35.65 
 
 		 461 aa  192  8e-48  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3310  threonine aldolase  37 
 
 		 337 aa  192  9e-48  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.124779  normal  0.12149 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1451  threonine aldolase  36.02 
 
 		 345 aa  192  1e-47  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0328469  normal  0.0951386 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2292  threonine aldolase  35.37 
 
 		 337 aa  190  4e-47  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.899538  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2462  threonine aldolase  38.73 
 
 		 336 aa  189  5.999999999999999e-47  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.0000000261845  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5037  Threonine aldolase  38.46 
 
 		 337 aa  189  7e-47  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.258099 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1535  Threonine aldolase  34.12 
 
 		 342 aa  189  8e-47  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.619548  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0105  threonine aldolase  34.19 
 
 		 344 aa  189  9e-47  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0310789  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1347  threonine aldolase  37.05 
 
 		 336 aa  187  2e-46  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.0000000974839  decreased coverage  0.000000417727 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52610  hypothetical protein  37.8 
 
 		 334 aa  187  2e-46  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4794  threonine aldolase  37.35 
 
 		 337 aa  187  4e-46  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.331333  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3186  Threonine aldolase  34.41 
 
 		 338 aa  186  5e-46  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.685174  normal  0.935882 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5386  threonine aldolase  37.04 
 
 		 337 aa  186  6e-46  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5475  threonine aldolase  37.04 
 
 		 337 aa  186  6e-46  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.309073  normal  0.398909 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3162  L-allo-threonine aldolase  36.06 
 
 		 348 aa  185  1.0000000000000001e-45  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4613  hypothetical protein  38.11 
 
 		 334 aa  185  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.255712  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3647  Threonine aldolase  35.86 
 
 		 334 aa  185  1.0000000000000001e-45  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.87063 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2205  threonine aldolase  34.55 
 
 		 337 aa  185  1.0000000000000001e-45  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.250112  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0178  L-threonine aldolase  37.04 
 
 		 337 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.250867 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4817  threonine aldolase  36.42 
 
 		 337 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1115  aromatic amino acid beta-eliminating lyase/threonine aldolase  35.22 
 
 		 344 aa  184  3e-45  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5364  threonine aldolase  36.42 
 
 		 337 aa  183  4.0000000000000006e-45  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0430  low-specificity L-threonine aldolase  35.05 
 
 		 337 aa  183  4.0000000000000006e-45  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0337  low-specificity L-threonine aldolase  35.05 
 
 		 337 aa  183  4.0000000000000006e-45  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.400783  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6047  Threonine aldolase  34.6 
 
 		 348 aa  183  4.0000000000000006e-45  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1142  threonine aldolase  39.12 
 
 		 338 aa  183  5.0000000000000004e-45  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.000000000636367  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1771  L-allo-threonine aldolase  35.05 
 
 		 397 aa  182  5.0000000000000004e-45  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.444188  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3026  threonine aldolase  35.29 
 
 		 337 aa  182  6e-45  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.000000000104832  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1834  L-allo-threonine aldolase  35.05 
 
 		 337 aa  182  7e-45  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0852562  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0834  L-allo-threonine aldolase  35.05 
 
 		 337 aa  182  7e-45  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0108221  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3011  threonine aldolase  35.29 
 
 		 337 aa  182  7e-45  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.00000000665478  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2098  L-allo-threonine aldolase  35.05 
 
 		 458 aa  182  7e-45  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1208  L-threonine aldolase  35.15 
 
 		 337 aa  182  9.000000000000001e-45  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.0000000586474  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1125  L-allo-threonine aldolase  35.05 
 
 		 397 aa  182  9.000000000000001e-45  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.628839  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1281  aromatic amino acid beta-eliminating lyase/threonine aldolase  34.36 
 
 		 348 aa  182  1e-44  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0162  L-threonine aldolase  37.07 
 
 		 367 aa  181  1e-44  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2554  threonine aldolase  36.96 
 
 		 339 aa  181  2e-44  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0270  L-threonine aldolase  36.06 
 
 		 339 aa  181  2e-44  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1352  Threonine aldolase  35 
 
 		 337 aa  181  2e-44  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000000809376  unclonable  0.00000000000146629 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3169  threonine aldolase  35 
 
 		 337 aa  181  2e-44  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000533874  unclonable  0.00000438048 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3338  L-allo-threonine aldolase  35.24 
 
 		 337 aa  180  2.9999999999999997e-44  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1361  threonine aldolase  35.08 
 
 		 342 aa  180  2.9999999999999997e-44  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.0000000000121527  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3793  threonine aldolase  34.52 
 
 		 334 aa  180  2.9999999999999997e-44  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.912828 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2168  Threonine aldolase  34.52 
 
 		 349 aa  180  2.9999999999999997e-44  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0097  threonine aldolase  36.34 
 
 		 339 aa  180  2.9999999999999997e-44  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.435466  normal  0.448781 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3480  Threonine aldolase  35.91 
 
 		 339 aa  180  2.9999999999999997e-44  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000277913 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0162  threonine aldolase  37.5 
 
 		 343 aa  180  4e-44  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.687717  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08076  L-allo-threonine aldolase  36.95 
 
 		 340 aa  180  4e-44  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  decreased coverage  0.00986668  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4499  Threonine aldolase  35.37 
 
 		 348 aa  179  4.999999999999999e-44  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>