106 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_61569 on replicon NC_009046
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009046  PICST_61569  cation efflux family protein  100 
 
 		 489 aa  1014    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.208698  normal  0.14589 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_05049  CDF divalent metal cation transporter (Eurofung)  38.48 
 
 		 558 aa  283  6.000000000000001e-75  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  decreased coverage  0.000185539  hitchhiker  0.0000107231 
 
 
-
 
NC_006683  CNN00470  conserved hypothetical protein  37.24 
 
 		 573 aa  231  2e-59  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_33926  CDF family transporter: cation efflux  31.62 
 
 		 378 aa  186  8e-46  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.119133  normal  0.083968 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_10155  cation diffusion facilitator 1 (AFU_orthologue; AFUA_1G14440)  27.97 
 
 		 401 aa  127  5e-28  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.0281763 
 
 
-
 
NC_011688  PHATRDRAFT_48955  predicted protein  30.77 
 
 		 1852 aa  114  3e-24  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.398934  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0076  cation diffusion facilitator family transporter  26.51 
 
 		 315 aa  85.5  0.000000000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.097535  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1199  cation diffusion facilitator family transporter  23.51 
 
 		 315 aa  79  0.0000000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  unclonable  0.0000000135405  hitchhiker  0.00000509926 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1774  cation diffusion facilitator family transporter  24.31 
 
 		 293 aa  69.7  0.0000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000103729  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0374  cation diffusion facilitator family transporter  24.03 
 
 		 303 aa  67.8  0.0000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1513  cation diffusion facilitator family transporter  24.56 
 
 		 302 aa  66.2  0.000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.5227 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3583  cation diffusion facilitator family transporter  25.52 
 
 		 392 aa  65.9  0.000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000126728  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0074  cation diffusion facilitator family transporter  23.3 
 
 		 313 aa  61.6  0.00000003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2184  cation diffusion facilitator family transporter  24.01 
 
 		 303 aa  61.6  0.00000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.478077  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3430  cation efflux family protein  25.61 
 
 		 289 aa  60.8  0.00000006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.038315  normal  0.371724 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1366  cation diffusion facilitator family transporter  21.95 
 
 		 422 aa  59.3  0.0000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0051  cation diffusion facilitator family transporter  22.06 
 
 		 306 aa  56.6  0.0000009  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0867  cation diffusion facilitator family transporter  21.26 
 
 		 295 aa  55.8  0.000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.851238 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0051  cation diffusion facilitator family transporter  21.71 
 
 		 306 aa  55.8  0.000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1026  cation diffusion facilitator family transporter  22.87 
 
 		 323 aa  55.5  0.000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0936  cation diffusion facilitator family transporter  22.08 
 
 		 300 aa  54.7  0.000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0663  cation diffusion facilitator family transporter  22.85 
 
 		 312 aa  54.3  0.000005  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0132428  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0634  cation efflux family protein  22.64 
 
 		 314 aa  53.9  0.000006  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1668  cation diffusion facilitator family transporter  24.15 
 
 		 291 aa  53.9  0.000007  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0340924  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0282  cation diffusion facilitator family transporter  21.94 
 
 		 385 aa  53.5  0.000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.369403  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0044  cation diffusion facilitator family transporter  20.79 
 
 		 381 aa  53.5  0.000008  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2613  cation efflux family protein  21.52 
 
 		 296 aa  53.5  0.000009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0586  cation efflux family protein  24.43 
 
 		 393 aa  53.5  0.000009  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0440871  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4947  cation diffusion facilitator family transporter  22.99 
 
 		 312 aa  53.5  0.000009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.723787  normal  0.395043 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0847  cation efflux protein  25.18 
 
 		 297 aa  53.1  0.00001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0576  cation efflux family protein  24.43 
 
 		 393 aa  53.1  0.00001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0264  cation diffusion facilitator family transporter  21.94 
 
 		 385 aa  53.1  0.00001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.56079 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2245  cation diffusion facilitator family transporter  24.81 
 
 		 483 aa  52.4  0.00002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2446  cation diffusion facilitator family transporter  21.88 
 
 		 304 aa  52  0.00002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.526861  normal  0.400869 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1051  putative cation efflux system protein  23.99 
 
 		 319 aa  52.4  0.00002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0960  cation diffusion facilitator family transporter  24.83 
 
 		 291 aa  51.2  0.00004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1450  cobalt-zinc-cadmium resistance protein  22.38 
 
 		 378 aa  51.2  0.00004  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.59644  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1517  cation diffusion facilitator family transporter  22.38 
 
 		 378 aa  51.2  0.00004  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_273  cation efflux protein  23.4 
 
 		 311 aa  51.2  0.00004  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.02572  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3537  cation diffusion facilitator family transporter  22.49 
 
 		 294 aa  51.6  0.00004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3385  cation efflux protein  21.82 
 
 		 385 aa  50.4  0.00006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0196  cation diffusion facilitator family transporter  21.07 
 
 		 404 aa  50.8  0.00006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.831911  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2824  cation diffusion facilitator family transporter  21.61 
 
 		 385 aa  50.4  0.00007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.74147  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0791  cation diffusion facilitator family transporter  24.87 
 
 		 312 aa  50.4  0.00007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.536733 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0210  cation diffusion facilitator family transporter  21.07 
 
 		 404 aa  50.4  0.00008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.904407 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3813  ferrous iron efflux protein F  26.4 
 
 		 298 aa  49.7  0.0001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.70191  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2100  cation diffusion facilitator family transporter  21.12 
 
 		 310 aa  49.7  0.0001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.70845  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2147  cation efflux system protein  22.74 
 
 		 380 aa  48.9  0.0002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.809019  normal  0.389636 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4307  ferrous iron efflux protein F  26.56 
 
 		 300 aa  48.9  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3459  cation diffusion facilitator family transporter  23.17 
 
 		 295 aa  48.1  0.0003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000668227  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4390  ferrous iron efflux protein F  26.56 
 
 		 300 aa  48.5  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.228028 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4392  ferrous iron efflux protein F  26.56 
 
 		 300 aa  48.5  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.123338  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4278  ferrous iron efflux protein F  26.56 
 
 		 300 aa  48.1  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.546202  normal  0.887398 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4459  ferrous iron efflux protein F  26.56 
 
 		 300 aa  48.5  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.709567  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1178  cation diffusion facilitator family transporter  18.87 
 
 		 300 aa  48.5  0.0003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00185198  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0618  cation diffusion facilitator family transporter  27.46 
 
 		 411 aa  48.1  0.0004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.0000000865863  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0339  cation diffusion facilitator family transporter  22.56 
 
 		 293 aa  48.1  0.0004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000143188  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1036  cation diffusion facilitator family transporter  20.77 
 
 		 387 aa  48.1  0.0004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.246594  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0311  cation diffusion facilitator family transporter  22.7 
 
 		 311 aa  47.8  0.0004  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3095  putative cation-efflux pump  25.11 
 
 		 462 aa  48.1  0.0004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04870  cation diffusion facilitator family transporter  29.03 
 
 		 374 aa  48.1  0.0004  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG2090  cation efflux family protein  25 
 
 		 302 aa  47.8  0.0005  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0858  cation efflux system protein  20.32 
 
 		 331 aa  47.8  0.0005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1683  cation diffusion facilitator family transporter  25.89 
 
 		 308 aa  47.4  0.0005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000676071  normal  0.070124 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0710  cation diffusion facilitator family transporter  22.53 
 
 		 476 aa  47.4  0.0005  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4808  ferrous iron efflux protein F  26.06 
 
 		 300 aa  47.4  0.0006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000185831 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3261  cation efflux system protein  20.22 
 
 		 305 aa  47.4  0.0006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.826048  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0491  cation diffusion facilitator family transporter  20.39 
 
 		 354 aa  47  0.0007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0566502 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1276  cation diffusion facilitator family transporter  20.41 
 
 		 416 aa  47.4  0.0007  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3568  cation diffusion facilitator family transporter  28.22 
 
 		 289 aa  47  0.0008  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000153022  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0272  MMT1 protein  20.74 
 
 		 372 aa  47  0.0008  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00381399  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3075  cation diffusion facilitator family transporter  20.29 
 
 		 304 aa  47  0.0008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.553073  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0331  cation efflux family protein  21.48 
 
 		 311 aa  46.2  0.001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2871  cation efflux protein  24.74 
 
 		 317 aa  46.6  0.001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1509  putative transport system permease protein  25.7 
 
 		 314 aa  46.2  0.001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000073133  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1952  cation diffusion facilitator family transporter  22.3 
 
 		 298 aa  46.2  0.001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.110398  normal  0.0228516 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0281  cation diffusion facilitator family transporter  29.45 
 
 		 289 aa  46.6  0.001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.0000230949  unclonable  0.000000000100578 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2809  cation diffusion facilitator family transporter  20.33 
 
 		 304 aa  46.6  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.252612  normal  0.010552 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2329  cation diffusion facilitator family transporter  21.45 
 
 		 343 aa  46.2  0.001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08140  cation diffusion facilitator family transporter  25 
 
 		 369 aa  46.2  0.001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.150714  normal  0.172071 
 
 
-
 
NC_006670  CNA07060  iron ion homeostasis-related protein, putative  30.43 
 
 		 501 aa  45.4  0.002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0241  cation diffusion facilitator family transporter  26.9 
 
 		 310 aa  45.8  0.002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000961232  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1715  cation transport protein  20.59 
 
 		 305 aa  45.4  0.002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1722  cation diffusion facilitator family transporter  23.45 
 
 		 299 aa  45.4  0.002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0191  cation diffusion facilitator family transporter  21.84 
 
 		 384 aa  45.4  0.002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.114126  hitchhiker  0.0000000345826 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0087  ferrous iron efflux protein F  24.21 
 
 		 300 aa  45.8  0.002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4127  ferrous iron efflux protein F  24.21 
 
 		 300 aa  45.8  0.002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2795  ferrous iron efflux protein F  26.29 
 
 		 301 aa  45.4  0.002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.00102947  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3105  cation diffusion facilitator family transporter  23.01 
 
 		 306 aa  45.4  0.002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2381  cation diffusion facilitator family transporter  23.53 
 
 		 388 aa  45.8  0.002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000223883  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3015  cation diffusion facilitator family transporter  23.01 
 
 		 306 aa  45.4  0.002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.68136  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_20770  cation diffusion facilitator family transporter  28.57 
 
 		 380 aa  45.4  0.003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.799337  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4790  cation efflux family protein  24.04 
 
 		 297 aa  44.7  0.004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0117  cation diffusion facilitator family transporter  19.81 
 
 		 400 aa  44.7  0.004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4020  ferrous iron efflux protein F  26.06 
 
 		 300 aa  44.7  0.004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1582  cation diffusion facilitator family transporter  24.59 
 
 		 299 aa  44.7  0.004  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0088  ferrous iron efflux protein F  24.21 
 
 		 300 aa  44.3  0.005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4333  cation efflux protein  25 
 
 		 297 aa  43.9  0.006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2889  cation diffusion facilitator family transporter  22.37 
 
 		 388 aa  43.9  0.006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000320508  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09106  cobalt-zinc-cadmium resistance protein czcD  24.29 
 
 		 313 aa  43.9  0.006  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.341807  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>