135 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_48955 on replicon NC_011688
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011688  PHATRDRAFT_48955  predicted protein  100 
 
 		 1852 aa  3821    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.398934  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_33926  CDF family transporter: cation efflux  30.82 
 
 		 378 aa  173  2e-41  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.119133  normal  0.083968 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_61569  cation efflux family protein  30.84 
 
 		 489 aa  145  9.999999999999999e-33  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.208698  normal  0.14589 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_05049  CDF divalent metal cation transporter (Eurofung)  32.62 
 
 		 558 aa  140  3.0000000000000003e-31  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  decreased coverage  0.000185539  hitchhiker  0.0000107231 
 
 
-
 
NC_009373  OSTLU_42308  predicted protein  45.6 
 
 		 151 aa  130  3e-28  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006683  CNN00470  conserved hypothetical protein  29.12 
 
 		 573 aa  130  4.0000000000000003e-28  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_42794  predicted protein  46.09 
 
 		 490 aa  117  2.0000000000000002e-24  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_10155  cation diffusion facilitator 1 (AFU_orthologue; AFUA_1G14440)  27.51 
 
 		 401 aa  113  4.0000000000000004e-23  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.0281763 
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_25091  predicted protein  50.52 
 
 		 510 aa  109  5e-22  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.063384 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_32462  predicted protein  39.45 
 
 		 455 aa  83.6  0.00000000000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0076  cation diffusion facilitator family transporter  26.3 
 
 		 315 aa  82.4  0.00000000000007  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.097535  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1513  cation diffusion facilitator family transporter  29.3 
 
 		 302 aa  79.3  0.0000000000006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.5227 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0258  cation diffusion facilitator family transporter  22.81 
 
 		 296 aa  73.2  0.00000000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0238617  decreased coverage  0.0000137847 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0263  cation diffusion facilitator family transporter  22.5 
 
 		 296 aa  72  0.00000000009  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000665998  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0263  cation diffusion facilitator family transporter  22.5 
 
 		 296 aa  72  0.00000000009  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.089523  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0369  cation diffusion facilitator family transporter  23.12 
 
 		 293 aa  72  0.0000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000868845  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3430  cation efflux family protein  24.46 
 
 		 289 aa  71.2  0.0000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.038315  normal  0.371724 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0256  cation diffusion facilitator family transporter  24.69 
 
 		 290 aa  70.9  0.0000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.015822  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1582  cation diffusion facilitator family transporter  22.69 
 
 		 299 aa  68.6  0.000000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1127  cation diffusion facilitator family transporter  22.88 
 
 		 323 aa  68.2  0.000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.197623  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0255  cation diffusion facilitator family transporter  23.75 
 
 		 299 aa  67.4  0.000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000211411  hitchhiker  0.0000000259918 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1794  cation diffusion facilitator family transporter  21.23 
 
 		 299 aa  67  0.000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1668  cation diffusion facilitator family transporter  24.31 
 
 		 291 aa  65.9  0.000000007  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0340924  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3767  cation diffusion facilitator family transporter  23.44 
 
 		 297 aa  65.9  0.000000008  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0281724  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2613  cation efflux family protein  25.6 
 
 		 296 aa  65.5  0.000000009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0847  cation efflux protein  20.88 
 
 		 297 aa  64.7  0.00000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1199  cation diffusion facilitator family transporter  22.45 
 
 		 315 aa  64.3  0.00000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  unclonable  0.0000000135405  hitchhiker  0.00000509926 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0960  cation diffusion facilitator family transporter  29.03 
 
 		 291 aa  64.7  0.00000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2184  cation diffusion facilitator family transporter  23.55 
 
 		 303 aa  64.7  0.00000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.478077  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2795  ferrous iron efflux protein F  23.95 
 
 		 301 aa  64.3  0.00000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.00102947  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4475  cation efflux family protein  22.88 
 
 		 296 aa  63.9  0.00000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3300  iron and zinc efflux system protein  23.91 
 
 		 318 aa  63.9  0.00000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.831799  normal  0.0946092 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0245  cation diffusion facilitator family transporter  20.74 
 
 		 291 aa  63.5  0.00000003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00146  ferrous iron efflux protein F  23.08 
 
 		 302 aa  63.2  0.00000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0254  cation diffusion facilitator family transporter  22.81 
 
 		 297 aa  63.2  0.00000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00100286  hitchhiker  0.000434478 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0139  ferrous iron efflux protein F  25.51 
 
 		 300 aa  63.2  0.00000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.205512  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2871  cation efflux protein  23.73 
 
 		 317 aa  62.8  0.00000006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1113  hypothetical protein  24.38 
 
 		 307 aa  62.8  0.00000006  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.416676  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002221  cobalt-zinc-cadmium resistance protein  23.79 
 
 		 302 aa  62.8  0.00000006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000518265  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0314  cation diffusion facilitator family transporter  23.68 
 
 		 289 aa  62.4  0.00000007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000499164  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2262  ferrous iron efflux protein F  23.88 
 
 		 302 aa  62.8  0.00000007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000896639  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09970  Cation efflux protein  26.89 
 
 		 293 aa  61.6  0.0000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.907578  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3931  cation diffusion facilitator family transporter  20.92 
 
 		 289 aa  61.6  0.0000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000000146752  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04060  cation diffusion facilitator family transporter  23.1 
 
 		 292 aa  61.2  0.0000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0339  cation diffusion facilitator family transporter  21.45 
 
 		 293 aa  61.6  0.0000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000143188  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1774  cation diffusion facilitator family transporter  26.26 
 
 		 293 aa  61.2  0.0000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000103729  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0087  ferrous iron efflux protein F  22.18 
 
 		 300 aa  60.5  0.0000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4127  ferrous iron efflux protein F  22.18 
 
 		 300 aa  60.5  0.0000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0088  ferrous iron efflux protein F  21.16 
 
 		 300 aa  59.7  0.0000005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4307  ferrous iron efflux protein F  22.3 
 
 		 300 aa  59.7  0.0000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4278  ferrous iron efflux protein F  22.3 
 
 		 300 aa  59.7  0.0000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.546202  normal  0.887398 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2628  cation efflux protein  21.6 
 
 		 325 aa  58.9  0.0000008  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.620911  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4390  ferrous iron efflux protein F  22.3 
 
 		 300 aa  59.3  0.0000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.228028 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4392  ferrous iron efflux protein F  22.3 
 
 		 300 aa  59.3  0.0000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.123338  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4459  ferrous iron efflux protein F  22.3 
 
 		 300 aa  59.3  0.0000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.709567  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0044  cation diffusion facilitator family transporter  19.75 
 
 		 381 aa  58.9  0.0000009  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4020  ferrous iron efflux protein F  22.46 
 
 		 300 aa  58.9  0.0000009  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2005  cation diffusion facilitator family transporter  24.2 
 
 		 299 aa  58.9  0.0000009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_37072  predicted protein  36.78 
 
 		 381 aa  58.5  0.000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.730274  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1360  cation diffusion facilitator family transporter  21.59 
 
 		 396 aa  58.5  0.000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2008  cation efflux family protein  20.5 
 
 		 293 aa  57.8  0.000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.536733  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4394  ferrous iron efflux protein F  23.47 
 
 		 300 aa  58.2  0.000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0858  cation efflux protein  23.2 
 
 		 299 aa  57  0.000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4355  ferrous iron efflux protein F  23.47 
 
 		 300 aa  57  0.000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.363052 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03800  ferrous iron efflux protein F  23.47 
 
 		 300 aa  56.6  0.000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.769582  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4070  cation diffusion facilitator family transporter  23.47 
 
 		 300 aa  56.6  0.000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03749  hypothetical protein  23.47 
 
 		 300 aa  56.6  0.000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.859371  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4790  cation efflux family protein  23.6 
 
 		 297 aa  56.6  0.000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5369  ferrous iron efflux protein F  23.47 
 
 		 300 aa  56.6  0.000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4145  ferrous iron efflux protein F  23.47 
 
 		 300 aa  56.6  0.000004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4448  ferrous iron efflux protein F  23.47 
 
 		 300 aa  56.6  0.000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4103  ferrous iron efflux protein F  23.47 
 
 		 300 aa  56.6  0.000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0484  cation efflux protein  21.43 
 
 		 298 aa  56.2  0.000005  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2443  cation diffusion facilitator family transporter  21.14 
 
 		 288 aa  55.8  0.000008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2491  cation diffusion facilitator family transporter  21.14 
 
 		 288 aa  55.8  0.000008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1549  cation diffusion facilitator family transporter  22.22 
 
 		 290 aa  55.8  0.000008  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0374  cation diffusion facilitator family transporter  22.53 
 
 		 303 aa  55.5  0.00001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0241  cation diffusion facilitator family transporter  20.46 
 
 		 310 aa  55.1  0.00001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000961232  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4057  ferrous iron efflux protein F  22.76 
 
 		 300 aa  55.1  0.00001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.3408  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0646  cation diffusion facilitator family transporter  23.29 
 
 		 289 aa  55.5  0.00001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.186266  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0491  cation diffusion facilitator family transporter  25.23 
 
 		 354 aa  55.5  0.00001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0566502 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1511  cation diffusion facilitator family transporter  24.34 
 
 		 314 aa  54.7  0.00002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00242761  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1521  cation diffusion facilitator family transporter  21.36 
 
 		 309 aa  54.7  0.00002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1722  cation diffusion facilitator family transporter  23.87 
 
 		 299 aa  54.3  0.00002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0074  cation diffusion facilitator family transporter  21.52 
 
 		 313 aa  54.7  0.00002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3459  cation diffusion facilitator family transporter  19.69 
 
 		 295 aa  53.9  0.00003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000668227  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1554  cation diffusion facilitator family transporter  30.5 
 
 		 301 aa  53.9  0.00003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.199907  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3813  ferrous iron efflux protein F  22.38 
 
 		 298 aa  52.4  0.00007  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.70191  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1509  putative transport system permease protein  21.41 
 
 		 314 aa  52.4  0.00008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000073133  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4333  cation efflux protein  22.67 
 
 		 297 aa  51.6  0.0001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2198  cation diffusion facilitator family transporter  25.14 
 
 		 293 aa  51.6  0.0001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.776966  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3741  cation diffusion facilitator family transporter  24.69 
 
 		 292 aa  51.6  0.0001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3458  cation diffusion facilitator family transporter  21.82 
 
 		 413 aa  51.6  0.0001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1171  cation efflux family protein  19.76 
 
 		 295 aa  51.6  0.0001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4808  ferrous iron efflux protein F  23 
 
 		 300 aa  51.6  0.0001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000185831 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0084  pantothenate metabolism flavoprotein  21.55 
 
 		 311 aa  50.8  0.0002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00694286  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0051  cation diffusion facilitator family transporter  20.19 
 
 		 306 aa  51.2  0.0002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010683  Rpic_4982  cation diffusion facilitator family transporter  21.78 
 
 		 307 aa  51.2  0.0002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0279964 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3537  cation diffusion facilitator family transporter  21.45 
 
 		 294 aa  50.4  0.0003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0051  cation diffusion facilitator family transporter  20.51 
 
 		 306 aa  50.4  0.0003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>