134 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CNN00470 on replicon NC_006683
Organism: Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006683  CNN00470  conserved hypothetical protein  100 
 
 
573 aa  1174    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_61569  cation efflux family protein  36.94 
 
 
489 aa  245  9.999999999999999e-64  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.208698  normal  0.14589 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_05049  CDF divalent metal cation transporter (Eurofung)  43 
 
 
558 aa  226  1e-57  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  decreased coverage  0.000185539  hitchhiker  0.0000107231 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_33926  CDF family transporter: cation efflux  35.71 
 
 
378 aa  181  2e-44  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.119133  normal  0.083968 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_10155  cation diffusion facilitator 1 (AFU_orthologue; AFUA_1G14440)  31.01 
 
 
401 aa  127  8.000000000000001e-28  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.0281763 
 
 
-
 
NC_011688  PHATRDRAFT_48955  predicted protein  26.45 
 
 
1852 aa  100  1e-19  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.398934  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1199  cation diffusion facilitator family transporter  25.84 
 
 
315 aa  79  0.0000000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  unclonable  0.0000000135405  hitchhiker  0.00000509926 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0076  cation diffusion facilitator family transporter  23.61 
 
 
315 aa  73.6  0.000000000009  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.097535  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4790  cation efflux family protein  27.27 
 
 
297 aa  68.2  0.0000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0191  cation diffusion facilitator family transporter  22.25 
 
 
384 aa  67.8  0.0000000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.114126  hitchhiker  0.0000000345826 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4333  cation efflux protein  26.39 
 
 
297 aa  66.2  0.000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2871  cation efflux protein  22.74 
 
 
317 aa  65.9  0.000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2005  cation diffusion facilitator family transporter  23.73 
 
 
299 aa  63.5  0.00000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0282  cation diffusion facilitator family transporter  22.87 
 
 
385 aa  62.8  0.00000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.369403  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1513  cation diffusion facilitator family transporter  22.65 
 
 
302 aa  62.8  0.00000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.5227 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0264  cation diffusion facilitator family transporter  23.13 
 
 
385 aa  62.4  0.00000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.56079 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3150  cation diffusion facilitator family transporter  22.84 
 
 
401 aa  62  0.00000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.0321624 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2795  ferrous iron efflux protein F  24.41 
 
 
301 aa  60.8  0.00000006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.00102947  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3385  cation efflux protein  22.53 
 
 
385 aa  60.8  0.00000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1051  putative cation efflux system protein  24.83 
 
 
319 aa  60.5  0.00000007  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4937  cation efflux protein  24.74 
 
 
298 aa  60.1  0.0000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.451266 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2824  cation diffusion facilitator family transporter  23.29 
 
 
385 aa  59.7  0.0000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.74147  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0634  cation efflux family protein  28.04 
 
 
314 aa  58.9  0.0000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1549  cation diffusion facilitator family transporter  22.45 
 
 
290 aa  59.3  0.0000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1774  cation diffusion facilitator family transporter  21.11 
 
 
293 aa  58.2  0.0000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000103729  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0210  cation diffusion facilitator family transporter  22.18 
 
 
404 aa  58.2  0.0000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.904407 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0196  cation diffusion facilitator family transporter  22.18 
 
 
404 aa  58.2  0.0000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.831911  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4774  cation diffusion facilitator family transporter  25.52 
 
 
290 aa  57.4  0.0000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00437993 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5170  cation efflux protein  23.16 
 
 
303 aa  57  0.0000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0847  cation efflux protein  25.7 
 
 
297 aa  56.6  0.000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09970  Cation efflux protein  25.42 
 
 
293 aa  56.6  0.000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.907578  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4650  cation diffusion facilitator family transporter  25.76 
 
 
290 aa  56.6  0.000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.188299 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0646  cation diffusion facilitator family transporter  26.72 
 
 
289 aa  56.6  0.000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.186266  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0791  cation diffusion facilitator family transporter  21.93 
 
 
312 aa  55.5  0.000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.536733 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4947  cation diffusion facilitator family transporter  27.07 
 
 
312 aa  55.5  0.000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.723787  normal  0.395043 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1177  cation diffusion facilitator family transporter  23.3 
 
 
308 aa  55.8  0.000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3537  cation diffusion facilitator family transporter  22.33 
 
 
294 aa  55.8  0.000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0960  cation diffusion facilitator family transporter  24.64 
 
 
291 aa  54.7  0.000004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0374  cation diffusion facilitator family transporter  26.94 
 
 
303 aa  54.3  0.000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0663  cation diffusion facilitator family transporter  23.94 
 
 
312 aa  54.3  0.000006  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0132428  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0245  cation diffusion facilitator family transporter  22.38 
 
 
291 aa  54.3  0.000006  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3154  cation efflux family protein  22.22 
 
 
418 aa  53.5  0.00001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2184  cation diffusion facilitator family transporter  24.22 
 
 
303 aa  53.1  0.00001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.478077  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1410  cation diffusion facilitator family transporter  26.67 
 
 
333 aa  53.1  0.00001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0044  cation diffusion facilitator family transporter  20.74 
 
 
381 aa  53.1  0.00001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0087  ferrous iron efflux protein F  23.85 
 
 
300 aa  53.1  0.00001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4127  ferrous iron efflux protein F  23.85 
 
 
300 aa  53.1  0.00001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0047  cation efflux family protein  22.34 
 
 
396 aa  52.4  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1531  cation diffusion facilitator family transporter  21.75 
 
 
317 aa  52.4  0.00002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3907  cation efflux family protein  22.34 
 
 
396 aa  52.4  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1668  cation diffusion facilitator family transporter  23.47 
 
 
291 aa  52.4  0.00002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0340924  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04060  cation diffusion facilitator family transporter  24.22 
 
 
292 aa  52.4  0.00002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2906  cation efflux family protein  22.34 
 
 
396 aa  52  0.00003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.313592  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3403  cation efflux family protein  22.34 
 
 
396 aa  52  0.00003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.843377  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1635  cation efflux family protein  22.34 
 
 
396 aa  52  0.00003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.504056  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3825  cation efflux family protein  22.34 
 
 
396 aa  52  0.00003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2966  cation efflux family protein  22.34 
 
 
396 aa  52  0.00003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0570  cation diffusion facilitator family transporter  21.43 
 
 
298 aa  52  0.00003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.712384  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0088  ferrous iron efflux protein F  24.71 
 
 
300 aa  52  0.00003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0399  cation diffusion facilitator family transporter  23.16 
 
 
418 aa  52  0.00003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.329701  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1617  cation diffusion facilitator family transporter  24.4 
 
 
313 aa  51.6  0.00004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.795948  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0970  cation diffusion facilitator family transporter  23.73 
 
 
390 aa  51.6  0.00004  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.000000558459  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2428  cation diffusion facilitator family transporter  23.19 
 
 
299 aa  50.8  0.00006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000439977  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3931  cation diffusion facilitator family transporter  25.19 
 
 
289 aa  51.2  0.00006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000000146752  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2008  cation efflux family protein  23.24 
 
 
293 aa  50.8  0.00007  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.536733  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1146  putative transporter  25.96 
 
 
298 aa  50.4  0.00009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3406  cation diffusion facilitator family transporter  20.89 
 
 
337 aa  50.1  0.0001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12610  putative transporter  25.61 
 
 
298 aa  50.1  0.0001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.686969  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4808  ferrous iron efflux protein F  23.02 
 
 
300 aa  50.1  0.0001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000185831 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0980  cation diffusion facilitator family transporter  22.76 
 
 
305 aa  49.7  0.0001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2446  cation diffusion facilitator family transporter  21.62 
 
 
304 aa  49.3  0.0002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.526861  normal  0.400869 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0553  cation diffusion facilitator family transporter  19.28 
 
 
388 aa  48.9  0.0002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0311  cation diffusion facilitator family transporter  20.43 
 
 
311 aa  49.7  0.0002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0051  cation diffusion facilitator family transporter  22.34 
 
 
306 aa  49.3  0.0002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0117  cation diffusion facilitator family transporter  22.48 
 
 
400 aa  48.9  0.0002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0577  cation diffusion facilitator family transporter  23.26 
 
 
308 aa  48.9  0.0002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.215169 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0069  cation efflux family protein  20.8 
 
 
318 aa  48.5  0.0003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0331  cation efflux family protein  21.45 
 
 
311 aa  48.1  0.0004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0858  cation efflux system protein  18.94 
 
 
331 aa  48.1  0.0004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1788  cation diffusion facilitator family transporter  22.46 
 
 
299 aa  48.1  0.0004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0431575 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_08791  CDF iron transporter (Eurofung)  23.9 
 
 
490 aa  48.1  0.0005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.221743  normal  0.15756 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03800  ferrous iron efflux protein F  22.64 
 
 
300 aa  48.1  0.0005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.769582  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4070  cation diffusion facilitator family transporter  22.64 
 
 
300 aa  48.1  0.0005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3245  cation efflux protein  25.29 
 
 
309 aa  48.1  0.0005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03749  hypothetical protein  22.64 
 
 
300 aa  48.1  0.0005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.859371  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5369  ferrous iron efflux protein F  22.64 
 
 
300 aa  48.1  0.0005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4145  ferrous iron efflux protein F  22.64 
 
 
300 aa  48.1  0.0005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4448  ferrous iron efflux protein F  22.64 
 
 
300 aa  48.1  0.0005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4103  ferrous iron efflux protein F  22.64 
 
 
300 aa  48.1  0.0005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1587  cation diffusion facilitator family transporter  23.68 
 
 
307 aa  47.8  0.0005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.697729  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0051  cation diffusion facilitator family transporter  22.34 
 
 
306 aa  47.8  0.0006  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1127  cation diffusion facilitator family transporter  20.07 
 
 
323 aa  47.4  0.0006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.197623  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4828  cation diffusion facilitator family transporter  25.86 
 
 
290 aa  47.4  0.0007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4355  ferrous iron efflux protein F  22.26 
 
 
300 aa  47.4  0.0007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.363052 
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_45119  predicted protein  21.84 
 
 
591 aa  47.4  0.0008  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.170034  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1146  cation efflux family protein  25.84 
 
 
411 aa  47  0.001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00680044  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4475  cation efflux family protein  24.06 
 
 
296 aa  47  0.001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3476  putative cation efflux family protein, CzcD-like protein  20.53 
 
 
296 aa  47  0.001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.606573  normal  0.771262 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4278  ferrous iron efflux protein F  22.75 
 
 
300 aa  46.6  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.546202  normal  0.887398 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4394  ferrous iron efflux protein F  22.64 
 
 
300 aa  47  0.001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>