More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_58181 on replicon NC_009044
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009042  PICST_35069  long-chain fatty acid CoA ligase  74.79 
 
 		 718 aa  1145    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.193785  normal  0.930837 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_58181  long-chain fatty acid CoA ligase  100 
 
 		 753 aa  1562    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_89450  long-chain-fatty-acid CoA ligase  49.65 
 
 		 720 aa  686    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.67886  normal  1 
 
 
-
 
NC_009047  PICST_49655  Long-chain-fatty-acid--CoA ligase 2 (Long-chain acyl-CoA synthetase 2) (Fatty acid activator 2)  44.79 
 
 		 751 aa  618  1e-175  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_55002  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  42.8 
 
 		 752 aa  588  1e-166  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.538226  normal  1 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_08280  AMP-binding enzyme, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G04270)  34.91 
 
 		 708 aa  399  1e-109  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006685  CNC00660  long-chain-fatty-acid-CoA ligase, putative  31.77 
 
 		 727 aa  332  1e-89  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.665335  n/a   
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_26758  predicted protein  32.58 
 
 		 630 aa  322  1.9999999999999998e-86  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.0405652 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_17720  precursor of ligase long chain acyl-coa ligase  29.67 
 
 		 678 aa  286  1.0000000000000001e-75  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_24496  predicted protein  27.53 
 
 		 667 aa  221  3.9999999999999997e-56  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_65071  long-chain fatty acid--CoA ligase and synthetase 4  29.77 
 
 		 699 aa  196  1e-48  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.418644  normal  0.491736 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2236  AMP-dependent synthetase and ligase  25.32 
 
 		 660 aa  196  2e-48  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.83669 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1894  AMP-dependent synthetase and ligase  27.41 
 
 		 613 aa  195  3e-48  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.391707  n/a   
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_20143  long chain acyl-coa synthetase  26.88 
 
 		 721 aa  193  1e-47  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06014  fatty acid activator Faa4, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G09910)  24.28 
 
 		 698 aa  192  2e-47  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.547026 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3514  AMP-dependent synthetase and ligase  27.82 
 
 		 612 aa  191  5e-47  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006694  CNI00710  long-chain-fatty-acid-CoA-ligase, putative  26.07 
 
 		 706 aa  189  1e-46  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2127  AMP-dependent synthetase and ligase  24.59 
 
 		 620 aa  188  3e-46  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.148266  normal  0.516077 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1114  AMP-dependent synthetase and ligase  28.65 
 
 		 596 aa  186  1.0000000000000001e-45  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.164574 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0972  long-chain fatty-acid-CoA ligase  26.62 
 
 		 610 aa  184  4.0000000000000006e-45  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2212  AMP-dependent synthetase and ligase  25.34 
 
 		 685 aa  184  4.0000000000000006e-45  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.169636 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0314  AMP-dependent synthetase and ligase  27.44 
 
 		 597 aa  183  9.000000000000001e-45  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000490287  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4574  AMP-dependent synthetase and ligase  25.94 
 
 		 649 aa  179  3e-43  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0925  AMP-dependent synthetase and ligase  28.13 
 
 		 606 aa  176  1.9999999999999998e-42  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0673  AMP-dependent synthetase and ligase  26.72 
 
 		 602 aa  176  1.9999999999999998e-42  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0141445 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2186  AMP-dependent synthetase and ligase  26.32 
 
 		 669 aa  174  6.999999999999999e-42  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.197211  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1168  AMP-dependent synthetase and ligase  27.08 
 
 		 616 aa  173  1e-41  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.549582  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3057  AMP-dependent synthetase and ligase  26.8 
 
 		 605 aa  172  2e-41  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4099  AMP-dependent synthetase and ligase  26.33 
 
 		 623 aa  172  2e-41  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.16111  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0984  AMP-dependent synthetase and ligase  27.96 
 
 		 606 aa  171  4e-41  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.423354  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1145  long-chain-fatty-acid--CoA ligase, putative  29.03 
 
 		 607 aa  171  5e-41  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3882  AMP-dependent synthetase and ligase  26.61 
 
 		 551 aa  171  6e-41  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.000000026311  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2618  AMP-dependent synthetase and ligase  27.18 
 
 		 610 aa  171  6e-41  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2259  AMP-dependent synthetase and ligase  25.55 
 
 		 616 aa  171  7e-41  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000000572274  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0981  AMP-dependent synthetase and ligase  27.74 
 
 		 606 aa  171  7e-41  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1519  AMP-dependent synthetase and ligase  27.43 
 
 		 610 aa  170  8e-41  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.924461  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4869  AMP-dependent synthetase and ligase  26.74 
 
 		 600 aa  169  1e-40  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.424656  normal  0.600956 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4936  AMP-dependent synthetase and ligase  27.09 
 
 		 626 aa  169  2e-40  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.457065  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4459  AMP-dependent synthetase and ligase  28.54 
 
 		 598 aa  169  2e-40  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.704147 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2680  AMP-dependent synthetase and ligase  26.03 
 
 		 601 aa  168  2.9999999999999998e-40  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.487535  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1594  AMP-dependent synthetase and ligase  25.97 
 
 		 617 aa  168  2.9999999999999998e-40  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.129447  normal  0.216287 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3502  AMP-dependent synthetase and ligase  27.87 
 
 		 551 aa  168  4e-40  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0080  AMP-dependent synthetase and ligase  26.45 
 
 		 597 aa  167  5e-40  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0335816 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1090  AMP-dependent synthetase and ligase  26.62 
 
 		 555 aa  167  5e-40  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.022153  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0076  AMP-dependent synthetase and ligase  26.12 
 
 		 597 aa  167  5.9999999999999996e-40  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0077  AMP-dependent synthetase and ligase  29.36 
 
 		 601 aa  167  6.9999999999999995e-40  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0075  AMP-dependent synthetase and ligase  29.36 
 
 		 601 aa  167  6.9999999999999995e-40  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15760  AMP-forming long-chain acyl-CoA synthetase  25.95 
 
 		 606 aa  167  6.9999999999999995e-40  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.120658  normal  0.270208 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1021  AMP-dependent synthetase and ligase  27.12 
 
 		 607 aa  167  8e-40  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.336741 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4274  AMP-dependent synthetase and ligase  29.36 
 
 		 601 aa  166  1.0000000000000001e-39  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1560  AMP-dependent synthetase and ligase  27.29 
 
 		 637 aa  166  1.0000000000000001e-39  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.564435 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3751  AMP-dependent synthetase and ligase  27 
 
 		 647 aa  166  1.0000000000000001e-39  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.28391  normal  0.673702 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0377  AMP-dependent synthetase and ligase  26.43 
 
 		 652 aa  166  1.0000000000000001e-39  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0968  AMP-dependent synthetase and ligase  28.55 
 
 		 607 aa  166  1.0000000000000001e-39  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.114084  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0080  AMP-dependent synthetase and ligase  29.36 
 
 		 601 aa  166  2.0000000000000002e-39  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3437  AMP-dependent synthetase and ligase  27.85 
 
 		 555 aa  166  2.0000000000000002e-39  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.915272  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2060  AMP-dependent synthetase and ligase  25.21 
 
 		 592 aa  165  2.0000000000000002e-39  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14230  AMP-forming long-chain acyl-CoA synthetase  25.65 
 
 		 602 aa  166  2.0000000000000002e-39  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0331  AMP-dependent synthetase and ligase  27.21 
 
 		 555 aa  166  2.0000000000000002e-39  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.167581 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0075  AMP-binding family protein  25.04 
 
 		 568 aa  165  3e-39  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4860  AMP-dependent synthetase and ligase  25.13 
 
 		 598 aa  165  3e-39  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2556  AMP-dependent synthetase and ligase  25.04 
 
 		 660 aa  165  3e-39  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3776  AMP-dependent synthetase and ligase  26.46 
 
 		 598 aa  165  3e-39  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.218056  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0164  AMP-dependent synthetase and ligase  27.44 
 
 		 658 aa  164  4.0000000000000004e-39  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1988  AMP-dependent synthetase and ligase  27.05 
 
 		 595 aa  164  4.0000000000000004e-39  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.627511  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0355  AMP-binding protein  27.16 
 
 		 554 aa  164  5.0000000000000005e-39  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0078  AMP-dependent synthetase and ligase  26.28 
 
 		 597 aa  164  5.0000000000000005e-39  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4587  AMP-dependent synthetase and ligase  27.21 
 
 		 551 aa  164  6e-39  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.00000231553  unclonable  0.0000000387525 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2962  AMP-dependent synthetase and ligase  25.74 
 
 		 601 aa  164  6e-39  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.746636  normal  0.609279 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1391  AMP-dependent synthetase and ligase  25.21 
 
 		 610 aa  164  7e-39  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2888  AMP-dependent synthetase and ligase  26.58 
 
 		 560 aa  164  7e-39  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0719534  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0351  AMP-dependent synthetase and ligase  27.43 
 
 		 554 aa  164  7e-39  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.597598  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4186  AMP-dependent synthetase and ligase  29.58 
 
 		 598 aa  163  9e-39  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1920  putative long-chain-fatty-acid--CoA ligase  25.61 
 
 		 563 aa  163  1e-38  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.022094  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1901  AMP-dependent synthetase and ligase  24.53 
 
 		 606 aa  163  1e-38  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.122495  hitchhiker  0.0000327223 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0061  AMP-dependent synthetase and ligase  25.5 
 
 		 598 aa  163  1e-38  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.783683  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2081  AMP-dependent synthetase and ligase  25 
 
 		 598 aa  163  1e-38  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.39737  normal  0.0103069 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2355  AMP-dependent synthetase and ligase  26.22 
 
 		 610 aa  162  2e-38  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.115359  normal  0.295722 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3732  AMP-dependent synthetase and ligase  27.49 
 
 		 590 aa  162  2e-38  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3508  AMP-dependent synthetase and ligase  25.44 
 
 		 607 aa  162  2e-38  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0185945  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2120  AMP-dependent synthetase and ligase  25.73 
 
 		 672 aa  162  2e-38  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.342483  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3729  AMP-dependent synthetase and ligase  25.68 
 
 		 594 aa  162  2e-38  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0359  AMP-dependent synthetase and ligase  27.43 
 
 		 554 aa  162  2e-38  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00409412  decreased coverage  0.000000000100216 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0095  AMP-dependent synthetase and ligase  24.75 
 
 		 663 aa  161  4e-38  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2310  thioester reductase domain-containing protein  25.41 
 
 		 1174 aa  161  4e-38  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.992099 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3571  AMP-binding family protein  26.59 
 
 		 597 aa  161  4e-38  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0027  AMP-dependent synthetase and ligase  25.95 
 
 		 611 aa  161  5e-38  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1856  AMP-dependent synthetase and ligase  25.26 
 
 		 622 aa  161  5e-38  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3503  AMP-dependent synthetase and ligase  26.42 
 
 		 618 aa  160  8e-38  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.129901  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2271  thioester reductase  24.44 
 
 		 1174 aa  160  8e-38  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2318  thioester reductase domain-containing protein  24.44 
 
 		 1174 aa  160  8e-38  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.662408 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3607  AMP-dependent synthetase and ligase  26.03 
 
 		 602 aa  160  8e-38  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.12071  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2060  putative long-chain-fatty-acid--CoA ligase  25.47 
 
 		 601 aa  159  1e-37  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24920  AMP-forming long-chain acyl-CoA synthetase  25.86 
 
 		 599 aa  159  1e-37  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.485954 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3617  AMP-dependent synthetase and ligase  27.16 
 
 		 554 aa  159  1e-37  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0326  AMP-dependent synthetase and ligase  27.16 
 
 		 554 aa  159  1e-37  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.87525  normal  0.942531 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1487  AMP-dependent synthetase and ligase  26.7 
 
 		 610 aa  159  1e-37  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3814  AMP-dependent synthetase and ligase  27.16 
 
 		 554 aa  160  1e-37  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.354824  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3330  AMP-dependent synthetase and ligase  26.06 
 
 		 616 aa  160  1e-37  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0356  AMP-dependent synthetase and ligase  27.21 
 
 		 554 aa  159  2e-37  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000116911  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>