More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_35069 on replicon NC_009042
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009045  PICST_89450  long-chain-fatty-acid CoA ligase  47.16 
 
 		 720 aa  653    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.67886  normal  1 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_35069  long-chain fatty acid CoA ligase  100 
 
 		 718 aa  1489    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.193785  normal  0.930837 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_58181  long-chain fatty acid CoA ligase  74.79 
 
 		 753 aa  1145    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009047  PICST_49655  Long-chain-fatty-acid--CoA ligase 2 (Long-chain acyl-CoA synthetase 2) (Fatty acid activator 2)  45.42 
 
 		 751 aa  623  1e-177  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_55002  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  42.78 
 
 		 752 aa  575  1.0000000000000001e-162  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.538226  normal  1 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_08280  AMP-binding enzyme, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G04270)  34.98 
 
 		 708 aa  397  1e-109  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006685  CNC00660  long-chain-fatty-acid-CoA ligase, putative  32.69 
 
 		 727 aa  340  8e-92  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.665335  n/a   
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_26758  predicted protein  32.4 
 
 		 630 aa  315  1.9999999999999998e-84  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.0405652 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_17720  precursor of ligase long chain acyl-coa ligase  31.14 
 
 		 678 aa  276  6e-73  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_24496  predicted protein  26.92 
 
 		 667 aa  212  2e-53  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06014  fatty acid activator Faa4, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G09910)  27.32 
 
 		 698 aa  204  4e-51  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.547026 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_65071  long-chain fatty acid--CoA ligase and synthetase 4  29.45 
 
 		 699 aa  201  3e-50  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.418644  normal  0.491736 
 
 
-
 
NC_006694  CNI00710  long-chain-fatty-acid-CoA-ligase, putative  27.25 
 
 		 706 aa  199  2.0000000000000003e-49  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2127  AMP-dependent synthetase and ligase  27.46 
 
 		 620 aa  189  2e-46  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.148266  normal  0.516077 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2212  AMP-dependent synthetase and ligase  26.13 
 
 		 685 aa  186  2.0000000000000003e-45  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.169636 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2618  AMP-dependent synthetase and ligase  27.24 
 
 		 610 aa  184  3e-45  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3514  AMP-dependent synthetase and ligase  28.25 
 
 		 612 aa  184  6e-45  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1894  AMP-dependent synthetase and ligase  27.29 
 
 		 613 aa  183  9.000000000000001e-45  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.391707  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3751  AMP-dependent synthetase and ligase  28.05 
 
 		 647 aa  182  2e-44  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.28391  normal  0.673702 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1594  AMP-dependent synthetase and ligase  26.99 
 
 		 617 aa  182  2e-44  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.129447  normal  0.216287 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0673  AMP-dependent synthetase and ligase  27.65 
 
 		 602 aa  182  2e-44  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0141445 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4574  AMP-dependent synthetase and ligase  25.23 
 
 		 649 aa  182  2.9999999999999997e-44  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2236  AMP-dependent synthetase and ligase  25.51 
 
 		 660 aa  181  2.9999999999999997e-44  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.83669 
 
 
-
 
NC_002950  PG1145  long-chain-fatty-acid--CoA ligase, putative  28.16 
 
 		 607 aa  181  4.999999999999999e-44  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_20143  long chain acyl-coa synthetase  25.24 
 
 		 721 aa  180  8e-44  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0972  long-chain fatty-acid-CoA ligase  27.21 
 
 		 610 aa  179  1e-43  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1168  AMP-dependent synthetase and ligase  29.22 
 
 		 616 aa  179  2e-43  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.549582  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0406  AMP-dependent synthetase and ligase  26.98 
 
 		 609 aa  178  3e-43  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3057  AMP-dependent synthetase and ligase  28.2 
 
 		 605 aa  177  6e-43  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4936  AMP-dependent synthetase and ligase  27.65 
 
 		 626 aa  176  9.999999999999999e-43  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.457065  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0314  AMP-dependent synthetase and ligase  26.6 
 
 		 597 aa  176  9.999999999999999e-43  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000490287  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4099  AMP-dependent synthetase and ligase  26.78 
 
 		 623 aa  176  1.9999999999999998e-42  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.16111  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0925  AMP-dependent synthetase and ligase  26.38 
 
 		 606 aa  174  5e-42  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0779  putative long-chain-fatty-acid--CoA ligase  28.91 
 
 		 614 aa  174  5.999999999999999e-42  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.546194  hitchhiker  0.00265448 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0984  AMP-dependent synthetase and ligase  26.54 
 
 		 606 aa  174  5.999999999999999e-42  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.423354  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0095  AMP-dependent synthetase and ligase  28.81 
 
 		 663 aa  173  9e-42  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2355  AMP-dependent synthetase and ligase  27.53 
 
 		 610 aa  172  1e-41  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.115359  normal  0.295722 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1988  AMP-dependent synthetase and ligase  28.57 
 
 		 595 aa  173  1e-41  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.627511  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1114  AMP-dependent synthetase and ligase  28.15 
 
 		 596 aa  172  2e-41  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.164574 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3555  AMP-dependent synthetase and ligase  26.64 
 
 		 509 aa  172  2e-41  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.429001  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0968  AMP-dependent synthetase and ligase  25.4 
 
 		 607 aa  171  4e-41  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.114084  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1708  AMP-dependent synthetase and ligase  26.48 
 
 		 630 aa  171  4e-41  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.179311  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2970  AMP-dependent synthetase and ligase  27.18 
 
 		 546 aa  171  4e-41  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.383632  normal  0.0772174 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2556  AMP-dependent synthetase and ligase  26.14 
 
 		 660 aa  169  1e-40  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3503  AMP-dependent synthetase and ligase  26.85 
 
 		 618 aa  169  2e-40  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.129901  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3729  AMP-dependent synthetase and ligase  26.39 
 
 		 594 aa  169  2e-40  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2038  AMP-dependent synthetase and ligase  29.61 
 
 		 609 aa  169  2e-40  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3437  AMP-dependent synthetase and ligase  27.13 
 
 		 555 aa  168  2.9999999999999998e-40  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.915272  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1090  AMP-dependent synthetase and ligase  27.34 
 
 		 555 aa  168  2.9999999999999998e-40  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.022153  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14230  AMP-forming long-chain acyl-CoA synthetase  26.64 
 
 		 602 aa  168  4e-40  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15760  AMP-forming long-chain acyl-CoA synthetase  27.13 
 
 		 606 aa  167  5e-40  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.120658  normal  0.270208 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0981  AMP-dependent synthetase and ligase  26.28 
 
 		 606 aa  167  5e-40  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2259  AMP-dependent synthetase and ligase  24.89 
 
 		 616 aa  167  5e-40  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000000572274  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2060  AMP-dependent synthetase and ligase  25.16 
 
 		 592 aa  167  5.9999999999999996e-40  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0675  AMP-binding protein  27.95 
 
 		 547 aa  167  8e-40  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2606  AMP-dependent synthetase and ligase  28.74 
 
 		 592 aa  167  8e-40  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.254378  normal  0.619309 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4869  AMP-dependent synthetase and ligase  26.42 
 
 		 600 aa  167  9e-40  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.424656  normal  0.600956 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3882  AMP-dependent synthetase and ligase  26.8 
 
 		 551 aa  165  2.0000000000000002e-39  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.000000026311  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0377  AMP-dependent synthetase and ligase  26.5 
 
 		 652 aa  166  2.0000000000000002e-39  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0631  putative AMP-binding acetyl-CoA synthetase  27.19 
 
 		 558 aa  166  2.0000000000000002e-39  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.365879  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2888  AMP-dependent synthetase and ligase  26.06 
 
 		 560 aa  166  2.0000000000000002e-39  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0719534  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1070  AMP-dependent synthetase and ligase  26.76 
 
 		 547 aa  165  3e-39  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2962  AMP-dependent synthetase and ligase  27.26 
 
 		 601 aa  165  3e-39  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.746636  normal  0.609279 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3196  AMP-dependent synthetase and ligase  25.7 
 
 		 622 aa  164  4.0000000000000004e-39  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1560  AMP-dependent synthetase and ligase  28.71 
 
 		 637 aa  164  6e-39  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.564435 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3794  AMP-dependent synthetase and ligase  26.38 
 
 		 601 aa  164  7e-39  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1417  AMP-dependent synthetase and ligase  29.35 
 
 		 645 aa  164  7e-39  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.000978143  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3502  AMP-dependent synthetase and ligase  27.15 
 
 		 551 aa  164  7e-39  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0027  AMP-dependent synthetase and ligase  25.51 
 
 		 611 aa  163  9e-39  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0812  AMP-binding enzyme  25.47 
 
 		 679 aa  163  1e-38  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3509  AMP-dependent synthetase and ligase  26.71 
 
 		 599 aa  163  1e-38  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.889293  normal  0.0246515 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2186  AMP-dependent synthetase and ligase  26.02 
 
 		 669 aa  163  1e-38  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.197211  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2886  AMP-dependent synthetase and ligase  27.27 
 
 		 633 aa  163  1e-38  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1383  AMP-dependent synthetase and ligase  25.73 
 
 		 602 aa  162  2e-38  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.321435  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3006  AMP-dependent synthetase and ligase  25.67 
 
 		 607 aa  162  2e-38  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000854556  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4459  AMP-dependent synthetase and ligase  28.24 
 
 		 598 aa  162  2e-38  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.704147 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1519  AMP-dependent synthetase and ligase  25.55 
 
 		 610 aa  162  2e-38  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.924461  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3571  AMP-binding family protein  25.9 
 
 		 597 aa  162  2e-38  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1856  AMP-dependent synthetase and ligase  25.69 
 
 		 622 aa  162  3e-38  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0080  AMP-dependent synthetase and ligase  28.22 
 
 		 601 aa  161  3e-38  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2680  AMP-dependent synthetase and ligase  25.69 
 
 		 601 aa  161  4e-38  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.487535  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1847  AMP-dependent synthetase and ligase  29.22 
 
 		 609 aa  160  5e-38  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002639  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  26.85 
 
 		 563 aa  161  5e-38  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.409821  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2310  thioester reductase domain-containing protein  27.33 
 
 		 1174 aa  160  7e-38  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.992099 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3330  AMP-dependent synthetase and ligase  26.29 
 
 		 616 aa  160  7e-38  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4860  AMP-dependent synthetase and ligase  26.85 
 
 		 598 aa  160  8e-38  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12610  fatty-acid-CoA ligase fadD9  26.95 
 
 		 1168 aa  160  8e-38  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.945549  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0747  AMP-dependent synthetase and ligase  28.28 
 
 		 602 aa  160  9e-38  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2081  AMP-dependent synthetase and ligase  24.57 
 
 		 598 aa  160  9e-38  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.39737  normal  0.0103069 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6067  AMP-dependent synthetase and ligase  25.96 
 
 		 615 aa  159  1e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0351  AMP-dependent synthetase and ligase  25.22 
 
 		 554 aa  159  2e-37  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.597598  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2597  long-chain fatty-acid-CoA ligase  25.74 
 
 		 602 aa  159  2e-37  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.366446 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3776  AMP-dependent synthetase and ligase  28.76 
 
 		 598 aa  159  2e-37  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.218056  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4067  AMP-dependent synthetase and ligase  26.05 
 
 		 603 aa  159  2e-37  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.675218  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0077  AMP-dependent synthetase and ligase  27.39 
 
 		 601 aa  159  2e-37  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24920  AMP-forming long-chain acyl-CoA synthetase  25.26 
 
 		 599 aa  159  2e-37  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.485954 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0076  AMP-dependent synthetase and ligase  25.74 
 
 		 597 aa  159  2e-37  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1391  AMP-dependent synthetase and ligase  26.24 
 
 		 610 aa  159  2e-37  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0075  AMP-dependent synthetase and ligase  27.39 
 
 		 601 aa  159  2e-37  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0078  AMP-dependent synthetase and ligase  28 
 
 		 597 aa  158  3e-37  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>