250 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_9701 on replicon NC_011670
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011670  PHATRDRAFT_9701  predicted protein  100 
 
 
125 aa  261  3e-69  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006694  CNI03180  conserved hypothetical protein  59.65 
 
 
373 aa  145  2.0000000000000003e-34  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.213275  n/a   
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_8830  predicted protein  47.41 
 
 
122 aa  122  2e-27  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.0913376 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04665  hypothetical protein  50 
 
 
279 aa  121  4e-27  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0330259  normal  0.410978 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_48043  predicted protein  43.59 
 
 
233 aa  111  4.0000000000000004e-24  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.111526  normal  0.12113 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0803  RNP-1 like RNA-binding protein  39.74 
 
 
85 aa  65.5  0.0000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.296791  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0493  RNP-1 like RNA-binding protein  41.03 
 
 
88 aa  65.1  0.0000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.547596  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1753  RNP-1 like RNA-binding protein  38.55 
 
 
87 aa  65.1  0.0000000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.787076 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_39629  predicted protein  37.97 
 
 
86 aa  64.7  0.0000000004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1118  RNP-1 like RNA-binding protein  36.84 
 
 
101 aa  64.7  0.0000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.761285  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0014  RNA recognition motif-containing protein  39.47 
 
 
173 aa  63.9  0.0000000006  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1525  RNP-1 like RNA-binding protein  38.36 
 
 
92 aa  63.9  0.0000000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1552  RNP-1 like RNA-binding protein  38.36 
 
 
92 aa  63.9  0.0000000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.863608 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4532  RNP-1 like RNA-binding protein  34.21 
 
 
98 aa  63.5  0.0000000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.319676 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2020  RNP-1 like RNA-binding protein  39.77 
 
 
88 aa  63.5  0.0000000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.0000000834021  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4705  RNP-1 like RNA-binding protein  34.67 
 
 
99 aa  63.5  0.0000000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.433444  normal  0.441649 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1274  glycine-rich RNA-binding protein  39.73 
 
 
112 aa  63.2  0.000000001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  unclonable  0.00000000837257  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0341  RNP-1 like RNA-binding protein  38.36 
 
 
94 aa  63.2  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0348  RNP-1 like RNA-binding protein  38.36 
 
 
94 aa  63.2  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00121  RNA recognition motif-containing protein  38.16 
 
 
250 aa  62.8  0.000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0705626  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1340  RNA recognition motif-containing protein  38.16 
 
 
250 aa  62.8  0.000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_00131  RNA recognition motif-containing protein  38.16 
 
 
245 aa  62  0.000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00821888 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_00131  RNA recognition motif-containing protein  36.84 
 
 
202 aa  62.4  0.000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1332  RNA-binding protein  39.73 
 
 
107 aa  62.8  0.000000002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  unclonable  5.534120000000001e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_00121  RNA recognition motif-containing protein  36.84 
 
 
222 aa  62  0.000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.239184  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00121  RNA recognition motif-containing protein  39.47 
 
 
203 aa  61.6  0.000000003  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.3683  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0013  RNA-binding region RNP-1 (RNA recognition motif)  38.16 
 
 
222 aa  61.6  0.000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_8451  predicted protein  42.47 
 
 
76 aa  61.6  0.000000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0309329  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00121  RNA recognition motif-containing protein  38.16 
 
 
217 aa  61.2  0.000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.044748  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0014  RNA-binding region RNP-1  38.16 
 
 
196 aa  61.2  0.000000005  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0890039  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2093  RNP-1 like RNA-binding protein  35.9 
 
 
91 aa  60.8  0.000000006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1984  RNA-binding region RNP-1  32.89 
 
 
109 aa  60.1  0.000000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0195  RNP-1 like RNA-binding protein  35.23 
 
 
88 aa  60.1  0.00000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00308169 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1024  RNP-1 like RNA-binding protein  33.73 
 
 
89 aa  60.1  0.00000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.107096  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG0627  RNA-binding protein  32.63 
 
 
97 aa  58.9  0.00000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.236494 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1679  RNA-binding region RNP-1  36.84 
 
 
94 aa  58.9  0.00000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1240  RNA-binding region RNP-1  33.78 
 
 
82 aa  58.9  0.00000002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009045  PICST_32340  predicted protein  36.11 
 
 
314 aa  58.5  0.00000003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.46857  normal  0.27086 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4663  RNP-1 like RNA-binding protein  34.15 
 
 
101 aa  58.5  0.00000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.783898  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0027  RNA-binding region RNP-1  34.67 
 
 
99 aa  58.5  0.00000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.128331  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1085  RNP-1 like RNA-binding protein  40.26 
 
 
99 aa  58.5  0.00000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1345  RNP-1 like RNA-binding protein  33.33 
 
 
104 aa  58.5  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1489  RNP-1 like RNA-binding protein  34.67 
 
 
86 aa  58.2  0.00000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000000000319103  unclonable  0.0000000000203081 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2332  RNP-1 like RNA-binding protein  31.51 
 
 
108 aa  58.2  0.00000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.200874 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2364  RNP-1 like RNA-binding protein  36.84 
 
 
89 aa  58.2  0.00000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  unclonable  0.000000000400721  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1863  RNA-binding region RNP-1  34.67 
 
 
89 aa  57.8  0.00000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.253261  normal  0.255815 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00917  RNA splicing factor (Pad-1), putative (AFU_orthologue; AFUA_1G15810)  32.35 
 
 
552 aa  57  0.00000007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.373895 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1392  RNP-1 like RNA-binding protein  29.33 
 
 
89 aa  57  0.00000008  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000190115  unclonable  0.00000764419 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1009  glycine-rich RNA binding protein  41.67 
 
 
128 aa  57  0.00000009  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000973374  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0803  RNP-1 like RNA-binding protein  37.84 
 
 
88 aa  57  0.00000009  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19341  hypothetical protein  37.5 
 
 
82 aa  56.2  0.0000001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.39481  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1139  RNA binding protein  41.67 
 
 
129 aa  56.6  0.0000001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  decreased coverage  0.00000522116  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1059  RNA recognition motif-containing protein  37.5 
 
 
82 aa  56.2  0.0000001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1175  RNA-binding region RNP-1  29.33 
 
 
114 aa  56.2  0.0000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00471275  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0679  RNA-binding region RNP-1  34.21 
 
 
107 aa  56.2  0.0000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0251  RNA-binding protein, RNP-1  30.67 
 
 
107 aa  56.6  0.0000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.425967  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1038  RNP-1 like RNA-binding protein  30.67 
 
 
98 aa  56.2  0.0000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06681  splicing factor u2af large subunit (AFU_orthologue; AFUA_7G05310)  36.11 
 
 
547 aa  55.8  0.0000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.502661 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0252  RNP-1 like RNA-binding protein  35.53 
 
 
90 aa  55.5  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.313784 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0050  RNP-1 like RNA-binding protein  34.48 
 
 
88 aa  55.5  0.0000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2119  RNP-1 like RNA-binding protein  27.63 
 
 
90 aa  55.5  0.0000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_09671  RNA-binding protein RbpD  33.33 
 
 
104 aa  55.8  0.0000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0150  RNP-1 like RNA-binding protein  32 
 
 
175 aa  55.8  0.0000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0106  RNP-1 like RNA-binding protein  28 
 
 
90 aa  55.8  0.0000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1927  RNP-1 like RNA-binding protein  35.8 
 
 
88 aa  55.5  0.0000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_20857  predicted protein  32.39 
 
 
687 aa  55.5  0.0000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.821409  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_6047  RNP-1 like RNA-binding protein  34.67 
 
 
176 aa  55.1  0.0000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.240011  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4331  RNP-1 like RNA-binding protein  34.48 
 
 
83 aa  54.7  0.0000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  8.3829e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0128  RNA-binding region RNP-1  32.89 
 
 
103 aa  54.7  0.0000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1471  RNP-1 like RNA-binding protein  30.67 
 
 
104 aa  54.7  0.0000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0175415  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0980  RNA-binding region RNP-1  34.18 
 
 
81 aa  54.7  0.0000004  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  hitchhiker  0.000651233  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1999  RNA-binding region RNP-1  40.28 
 
 
95 aa  54.7  0.0000004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1236  RNP-1 like RNA-binding protein  26.32 
 
 
90 aa  54.3  0.0000005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.05811 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2407  RNA binding protein  30.26 
 
 
143 aa  54.3  0.0000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_11941  peptidylprolyl isomerase  30.38 
 
 
97 aa  54.3  0.0000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.408542  normal  0.27768 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1050  RNP-1 like RNA-binding protein  31.58 
 
 
111 aa  53.9  0.0000006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.423415  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3132  RNA-binding region RNP-1  32.89 
 
 
103 aa  53.9  0.0000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0195  RNA-binding protein  31.18 
 
 
151 aa  53.9  0.0000007  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000000237988  normal  0.0118199 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0124  RNP-1 like RNA-binding protein  31.65 
 
 
94 aa  53.9  0.0000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.0000000291811  decreased coverage  0.0000109119 
 
 
-
 
NC_006692  CNG02940  glycine-rich RNA binding protein, putative  36.99 
 
 
182 aa  53.5  0.0000009  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1499  RNA-binding region RNP-1  30.12 
 
 
100 aa  53.5  0.0000009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.212691  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4702  RNA-binding region RNP-1  30.26 
 
 
102 aa  53.5  0.0000009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  decreased coverage  0.000166798  normal  0.614105 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0321  hypothetical protein  36.11 
 
 
91 aa  53.1  0.000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1050  RNP-1 like RNA-binding protein  34.67 
 
 
98 aa  53.5  0.000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3438  RNP-1 like RNA-binding protein  26.32 
 
 
125 aa  53.1  0.000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0963576  normal  0.0234751 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2964  RNP-1 like RNA-binding protein  34.48 
 
 
88 aa  53.1  0.000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0793  RNA-binding region RNP-1  29.76 
 
 
87 aa  53.5  0.000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  unclonable  0.000000000000424033  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4701  RNA-binding region RNP-1  29.55 
 
 
97 aa  53.1  0.000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  hitchhiker  0.000966249  normal  0.61972 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1079  RNP-1 like RNA-binding protein  34.67 
 
 
98 aa  53.5  0.000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.0000508915  normal 
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4579  RNP-1 like RNA-binding protein  30.67 
 
 
148 aa  53.5  0.000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4731  RNP-1 like RNA-binding protein  30.67 
 
 
150 aa  53.5  0.000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.384433  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4044  RNP-1 like RNA-binding protein  31.58 
 
 
102 aa  53.1  0.000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4128  RNP-1 like RNA-binding protein  32 
 
 
149 aa  53.1  0.000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2100  RNP-1 like RNA-binding protein  26.32 
 
 
90 aa  52.8  0.000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1023  RNA recognition motif-containing protein  27.63 
 
 
90 aa  52  0.000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.0000000024568  normal  0.0362085 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1551  RNA recognition motif-containing protein  27.63 
 
 
90 aa  52.4  0.000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.000000000189829  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3486  RNP-1 like RNA-binding protein  32 
 
 
155 aa  52.8  0.000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1273  RNP-1 like RNA-binding protein  25 
 
 
90 aa  52.4  0.000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  unclonable  0.00000000138361  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_5724  predicted protein  29.63 
 
 
291 aa  52.4  0.000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.181544  normal  0.149739 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1806  RNP-1 like RNA-binding protein  34.48 
 
 
90 aa  52.4  0.000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>